Entry information : PabPrx236(PAB00064912 / MA_96757g0010)
Entry ID 12756
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx236(PAB00064912 / MA_96757g0010)
Name PabPrx236(PAB00064912 / MA_96757g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx013]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx236
start..stop
S start..stop
PtaPrx26 563 0 2..317 1..316
PabPrx123 561 0 1..317 1..317
PabPrx05 540 0 1..317 2..320
PtaPrx28 525 0 2..317 1..317
Literature and cross-references PabPrx236(PAB00064912 / MA_96757g0010)
Protein sequence: PabPrx236(PAB00064912 / MA_96757g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317
PWM (Da):   %s   33478.46  
PI (pH):   %s   7.89
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMRSLVCISV IAFVCSINNA VHGQLSSTFY STSCPTVLSV VKAAVKQAVA SEKRMGASLV RLHFHDCFVN GCDGSVLLDD NSTFTGEKTA GPNNNSLRGF DVIDTIKTKV EAACSGVVSC  ADIVAIAARD SVVQLGGRTW TVLLGRRDST TASLSTANTN LPSPASTLSA LMTAFQAQNL STKDLVALSG AHTIGQARCT TFRNRIYNDS NINASFATSV KANCPSTGGD DTLSPLDVLT 
PTTFDNKYYS NLKSQKGLFH SDQELFNGGS TDSQVTTYSN NQNTFFTDFA TAMVNMGNIS PLTGTSGEIR TNCRKAN 

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Remarks Complete sequence from genomic and RNA seq (comp95587_c1_seq13). Incorrect prediction from genomic (PS and fragment in the last exon are missing).
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGGT CTCTCGTATG CATTTCTGTA ATAGCATTTG TATGCTCCAT TAATAACGCT GTGCATGGGC AACTGAGCTC AACGTTTTAT TCCACGTCGT GTCCGACGTG TGCATGGGCA  ACTGAGCTCA ACGTTTTATT CCACGTCGTG TCCGACGGTG CTGTCAGTCG TGAAAGCCGC GGTGAAGCAA GCAGTCGCCA GCGAGAAAAG GATGGGGGCG TCCTTGGTCC GCCTTCACTT  CCACGACTGC TTCGTTAATG TACAGAGAAA CAAGAATTTC ATTAAGGAGA TCATGAGTAA CAAATCACTT CTGCTTTTCT CGTCTCATCA TGTTGAATTT TGGCTTTTGT TTGCTGCAGG  GGTGTGATGG TTCGGTGTTG TTGGACGACA ACTCGACGTT TACAGGAGAA AAGACTGCAG GACCGAATAA CAATTCCCTG AGAGGATTCG ACGTAATCGA CACCATCAAA ACTAAAGTGG  AGGCAGCGTG CAGTGGAGTT GTGTCGTGTG CCGACATTGT CGCCATTGCT GCTCGTGATT CAGTCGTCCA AGTAATCATT ATTTCTTCTT TTCTATTGTC GATATATTTA ATTATGGCCA  AAGGCGTATG GACAATGGGT ATATTTAATT ATTTCTTCTT TTCTATTGTA GATATATTTA ATTATTGTCA AATATAATTA ATTATTGGAG TATGGAAAAT GGGTATATTT AGGTCGAAAG  GCGTACACCT ATTGACAATG GGCACATTTA ATAGGTTTnn nnnnnnnnnn nACCTAATCA TGTTTAAAAA TTACTGTGTT CACTAACTTA TTGCCAAGTC TCCCTGATTA AAAAATATTA  AGGTATTAAA ATGGTCGGCT GGCATCACCA ACGGTCACTC AAAGTTTAAC AACCAGCCGC CTTTCGGCCT TCACCAGTCG CTAGTTAGCG GCTGTGCTAG GTTAATGATC TTTTAACCAT  AAATTTCAAT CATAAGATTA TCAATTGAAG ATACTACAAT ATTTTTAGTT GTCCTTCCAA ATCAATGAAT AAGATGTCAT GTTAGCATTT TTAAAAGTTC TGTTAAGCTG TTTACTTTTT  CACATTTATT TAATATGATT ACTTTTTCAC ATTTATTTAA TATGATTAAG AAATTACTAT GTTAACCTGT TTACTTTTTA ATATTTACTT AATATGATTA AGAAATTACT ATGTAATCTG  AAGACATTCA GCATTACACC TACTCAATCC TTGTGAAAAG AGTTCTCCAC CCAATTCACA ACACTTATTC TTGCAAGCAT GGAGTTATGT CTTCTCCCTA CTGAGGTAGA AAGTGATTGT  TCTTTTAGTT TTCTTCTCCT ACAAAATGAT TTCACGGGAT TACTCGAGCA AAAGCGGTTG CGATCAGCCT ATGGTGATAG ACCAGTTCTG GAGGGATAGA GGTTGAGGGA GATGGGAAGA  CCCCATAATT GTAAATGGGA GATGGGAGAA GCATTGGTTT ATACATTTTT GTTGTTACTG ATGTTAGTGA TAATTTTTTT AGTTATTTTT TTGGAGAAGC ATATTTAATT GTCATTTCAA  ATGATTAACA AATTTAATTG AAATTATAAA TTTAATTTAT TATTAATTTT TTATCATTTT ACAATAAGTC AGAATTTTAA GAATAGTAAG CCTTTCTAGA TTTACCATCA ACGACTTAAC  TGCTGTGCTA GTTATATTTA ACTATTCTTA AATAGAATAG CTCATCTCCT GCTAGTTCAG GGTTGTTTAA CTATTATGTT GTTGGACATT TCGTACTTTT GTGTCAGTAA TTATCCTCTC  TGAACTAGAG ACAGTATTCT ACTCCTATCC TAATTTACTA AAAATTGTCA TTTAGAATGA TAGAACTTTT TTTATGAAAG ACTTTTAATT TGCCACAACA TTTTCAAAAA AATTAGCCCT  CTCAAGATTT GGAATCAAAT AATGTTATTT GCAATTCGTT AGCTGGGTGG CCGAACATGG ACGGTACTGC TGGGAAGGCG AGACTCAACG ACTGCAAGTT TAAGCACTGC AAACACCAAC  CTTCCGTCAC CAGCTTCCAC TCTCAGCGCA CTCATGACAG CATTTCAAGC TCAGAATCTT TCTACGAAGG ACCTTGTCGC ACTCTCAGGT ATAATATTAT TCATTTAGCA ACATTCTTCA  ACCTTTCGCA CTGATCCAAA TGTATCAAAG GAATAATTAT CGTGCGCTCT TATTATCAAT GCAGGTGCTC ATACAATTGG CCAAGCACGG TGCACCACAT TCAGAAATCG CATCTACAAC  GATTCAAACA TTAATGCTTC ATTCGCCACT TCTGTGAAGG CAAACTGCCC AAGCACTGGT GGCGACGATA CCCTCTCCCC CTTAGATGTG CTTACTCCTA CCACATTTGA CAACAAGTAT  TACAGTAATC TGAAAAGCCA AAAGGGACTT Tnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnC AGCAGCCATG GTGAATATGG 
GTAATATCAG TCCCCTCACT GGCACCAGCG GAGAAATCCG CACAAACTGC AGGAAGGCCA ATTAGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGGT CTCTCGTATG CATTTCTGTA ATAGCATTTG TATGCTCCAT TAATAACGCT GTGCATGGGC AACTGAGCTC AACGTTTTAT TCCACGTCGT GTCCGACGGT GCTGTCAGTC  GTGAAAGCCG CGGTGAAGCA AGCAGTCGCC AGCGAGAAAA GGATGGGGGC GTCCTTGGTC CGCCTTCACT TCCACGACTG CTTCGTTAAT GGGTGTGATG GTTCGGTGTT GTTGGACGAC  AACTCGACGT TTACAGGAGA AAAGACTGCA GGACCGAATA ACAATTCCCT GAGAGGATTC GACGTAATCG ACACCATCAA AACTAAAGTG GAGGCAGCGT GCAGTGGAGT TGTGTCGTGT  GCCGACATTG TCGCCATTGC TGCTCGTGAT TCAGTCGTCC AACTGGGTGG CCGAACATGG ACGGTACTGC TGGGAAGGCG AGACTCAACG ACTGCAAGTT TAAGCACTGC AAACACCAAC  CTTCCGTCAC CAGCTTCCAC TCTCAGCGCA CTCATGACAG CATTTCAAGC TCAGAATCTT TCTACGAAGG ACCTTGTCGC ACTCTCAGGT GCTCATACAA TTGGCCAAGC ACGGTGCACC  ACATTCAGAA ATCGCATCTA CAACGATTCA AACATTAATG CTTCATTCGC CACTTCTGTG AAGGCAAACT GCCCAAGCAC TGGTGGCGAC GATACCCTCT CCCCCTTAGA TGTGCTTACT  CCTACCACAT TTGACAACAA GTATTACAGT AATCTGAAAA GCCAAAAGGG ACTTTTCCAC TCCGACCAGG AGCTATTTAA TGGAGGTTCT ACAGACTCTC AAGTTACTAC CTACAGCAAC 
AATCAGAACA CCTTCTTTAC TGACTTCGCA ACCGCCATGG TGAATATGGG TAATATCAGT CCCCTCACTG GCACCAGCGG AGAAATCCGC ACAAACTGCA GGAAGGCCAA TTAG 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACCGTCCTC CCAACATTCC ATCCCTTCAA TTCCGCTCCG TTCTTCTATT CTTTGAAGCG GGCAGCTTCT TCTAAATATG ATGAGGTCTC TCGTATGCAT TTCTGTAATA GCATTTGTAT  GCTCCATTAA TAACGCTGTG CATGGGCAAC TGAGCTCAAC GTTTTATTCC ACGTCGTGTC CGACGGTGCT GTCAGTCGTG AAAGCCGCGG TGAAGCAAGC AGTCGCCAGC GAGAAAAGGA  TGGGGGCGTC CTTGGTCCGC CTTCACTTCC ACGACTGCTT CGTTAATGGG TGTGATGGTT CGGTGTTGTT GGACGACAAC TCGACGTTTA CAGGAGAAAA GACTGCAGGA CCGAATAACA  ATTCCCTGAG AGGATTCGAC GTAATCGACA CCATCAAAAC TAAAGTGGAG GCAGCGTGCA GTGGAGTTGT GTCGTGTGCC GACATTGTCG CCATTGCTGC TCGTGATTCA GTCGTCCAAC  TGGGTGGCCG AACATGGACG GTACTGCTGG GAAGGCGAGA CTCAACGACT GCAAGTTTAA GCACTGCAAA CACCAACCTT CCGTCACCAG CTTCCACTCT CAGCGCACTC ATGACAGCAT  TTCAAGCTCA GAATCTTTCT ACGAAGGACC TTGTCGCACT CTCAGGTGCT CATACAATTG GCCAAGCACG GTGCACCACA TTCAGAAATC GCATCTACAA CGATTCAAAC ATTAATGCTT  CATTCGCCAC TTCTGTGAAG GCAAACTGCC CAAGCACTGG TGGCGACGAT ACCCTCTCCC CCTTAGATGT GCTTACTCCT ACCACATTTG ACAACAAGTA TTACAGTAAT CTGAAAAGCC  AAAAGGGACT TTTCCACTCC GACCAGGAGC TATTTAATGG AGGTTCTACA GACTCTCAAG TTACTACCTA CAGCAACAAT CAGAACACCT TCTTTACTGA CTTCGCAACC GCCATGGTGA  ATATGGGTAA TATCAGTCCC CTCACTGGCA CCAGCGGAGA AATCCGCACA AACTGCAGGA AGGCCAATTA GAATTTCTGA AGAATGTATT CTCTATATGT TTTTTCAGCG AAGCTTTACA  AGAAAGAAAT AAACTGCAGT TTAATTTATG CGGTCATGTT AAAGTTAAAT GCAATTTCAG ACAGCACGTG AAATATTTGA TATAGACCGC TGTCGAGTAC GCTGTGGATA AGGATCAGCT  ATATATGATT AGGATGATTA AGGACATGAC ACGTGTGAAT GCAATTCGTA TCATTTATAA CTAATTACTA TCTCTTTAGG TTACTGAATT TTATAATAGT AAGAGCCTTG TAAAACTAAC 
TGTCAG 

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