Entry information : PabPrx24(PAB00002067 / PAB00021074 / MA_10201061g0010 / MA_125874g0020)
Entry ID 12759
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx24(PAB00002067 / PAB00021074 / MA_10201061g0010 / MA_125874g0020)
Name PabPrx24(PAB00002067 / PAB00021074 / MA_10201061g0010 / MA_125874g0020)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx24
start..stop
S start..stop
PabPrx156 597 0 1..367 1..358
PtaPrx80 597 0 1..367 1..358
AtrPrx22 404 1e-141 65..366 25..323
AcoPrx73 399 9e-140 70..367 25..319
Literature and cross-references PabPrx24(PAB00002067 / PAB00021074 / MA_10201061g0010 / MA_125874g0020)
Protein sequence: PabPrx24(PAB00002067 / PAB00021074 / MA_10201061g0010 / MA_125874g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   367 (348)
PWM (Da):   %s   40787.07 (38800.9) Transmb domain:   %s   i3-25o
PI (pH):   %s   8.53 (8.53) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-367
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTLLHLVPII LLLFGGALAL PLPAIDKIIQ KKVPSPSVSH VVTSKPNNTY KPINKPTTPA KRIRGPAQVF LSPIYYAQSC PNAEQIIHNR VQYWVQQDFT LAASLIRMHF HDCIVRGCDA  SILLNYPGSE RESTASRTLR GFYVIDDIKR QLEKACPRTV SCADILTTVA RDASLVLGGP FWSVPFGRKD GHISLARETN IVPQGHESVT TLIQLFQSKG LSILDLVILS GAHTIGRSVC  SVIQDRLYNF NGTHKPDPSM DPIYVKYLQN KCSYGRNWGS NLVSLDPTTP NVLDAVYYEN LQSKKGPFVT DQLLYSDDRT QFLINTLASN PELFYQQFSV SMVNLGNVQV LTGDEGEVRT 
NCNYWNH 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTTGC TACATCTAGT GCCAATAATA TTGCTTCTGT TTGGAGGAGC ACTTGCATTG CCATTGCCGG CGATTGACAA AATAATCCAG AAAAAGGTTC CATCACCTTC GGTTTCCCAC  GTTGTGACAT CCAAGCCCAA CAACACTTAC AAGCCCATAA ACAAACCAAC CACGCCTGCG AAGAGGATAC GGGGGCCAGC GCAAGTGTTT CTATCACCCA TCTACTACGC TCAGAGCTGC  CCGAACGCCG AACAGATAAT TCATAACAGG GTTCAATATT GGGTGCAGCA GGACTTCACA CTTGCTGCCA GCCTTATACG CATGCACTTC CACGATTGCA TCGTTCGAGT AAGTTCCTCA  TCTCCCTCCG TATCTGTAAA TAATTTCATT CCTTAATAGA TTTGTTTGTA TTAATAGATT GGGGAGTGGG TTAATTAGGG AGCAATATTT TCTTCGAGTT ATTTTTTGGT AGGTTTTTTG  AGGGTCTGCT TTTAAATTTC TTGTCAATCC ATAACTTTGA TCGATTTTCT GAGTATTTGG GTTGGTTTAA AATGGGGCAA AATTCTGGGG AAAGGTTCTA AAATGCATGG AACTTTGATC  CATGCAAAAC TCATACTACC CCTGAAAATT TGACTGGATT CAGATCCATT TTTGCCTGAA AAATGAAATT TCGGAGGGAA GATTGCTTCC TAGATAGCCT ACTCCATAGA TTGGTTGAAA  AAATTTCTGT ATTAACTATT TGGGAATTGT GTAATTGGAT GTTTTCTAGT GATATAGTGC TTGTATTAAT GGGATGTTAA AGAATACCCT TAATTTCACT AGATATTGAT AAATACCTCT  CTAAATCAGT TTATTGAATC CCCTCCCAAT ACATCTTTTC AATAAAATAA ACCTCTATCT TAACTACATG TCTTTTTTTA TACCTATAAA CTGTTTGACA CCTCACATCC CCAATACTTA  CAATATATTG ACTTTATTTT TCATAACTAA AAAACCTCAC TTATAAATGA ATATGATAAG ATATTGATAA CAATATGAAA TCCATGATGT CATGACAGAG ATTGTAAAAT TCTTCAATGG  ATTGGATTCT TTATAGATCT TAATTACAAT TTCAATTGCA TTTGCGATAT GGGAATGTCT GAGTTATCAA ATTCTTTTAA ATACTTATAA TTTTTTTTAA TAGATTCTCA CAATAAATTA  AGAAGAAATT TGTGAAAAAA TTAGGGAGAG ACAAAATTGA TGCAACACAC TACATTATTG ATGTGATGTG TATTCTATTA CTCGCACATT CGACTCACGG TTGGAGAATG CTAGTTGAAA  AAACACCCAT GCTAGTTGAA ACAACACCCA GCTTCCACTC CGTCTATCTC AAGGAAAGTG GCAATGCAAA GTTTTATACA TATTAATTTT TCTTAATCAG TTAACCTATC AATTAATGGT  TAGAGAAGTA ATTTCTTAAT CATATTAAGT AAATGTGAAA AAGTAAACAA GGTAACAGAA GTATTCAAAA ATGCAAAGAA CTTATGAGCA TTAAATTTCA TCCATTGATT AGAGAGTAGG  ACTAAGAATA TGCCAGCATC TTCAATTGTT AGCCATAAAA TTAGAATTTT AGATTAAAAG TGATTAATTA TGCCCATTGT CAAAAGGTGT AAATATAAAC ATGTATAGTT ACACAATATG  GTTACAAGAA GTTAAAAAGC TACAAACTCC TAGAACAGTA AACTAACTAA TTAACTAGTT AAAAATATAA TTAGGTATTT TCCTTAACAA TTTGATATTC TATAACTCTG GTCAAGCTGT  ATCCCATCGC CGTATCCCTA TCAGTAAAGT AAAGATGGCA AAACAACTCT GAATAGGTCA TAGATCTGAA TAGGTCATAC ATAGACTGTT TTAAATATTT GTGAAAATCA TTGATTTTCC  TACTTCATCT TTACAGGGAT GCGACGCGTC AATTCTCTTG AATTATCCAG GAAGCGAGAG AGAATCTACA GCAAGCAGAA CACTGCGCGG TTTTTATGTC ATCGATGACA TCAAGCGACA  GCTGGAGAAA GCATGCCCTC GAACAGTTTC CTGCGCCGAT ATCCTGACAA CAGTTGCACG TGATGCATCG CTTGTGGTAT CCATATCTCC TGTTACTTTT TTACTTCCAT CCCTTGAAAA  ATATTCAGTG GAAATGCTTT CCTGTACCGA GTTCTCGTGC GTGAATGGAA GGATAATTAC ATTTATTTCA TTTGCTACAG TTGGGAGGGC CATTCTGGAG CGTTCCGTTT GGTAGGAAAG  ACGGTCATAT TTCCCTAGCC AGGGAAACAA ATATCGTTCC ACAAGGCCAT GAAAGTGTGA CTACACTGAT TCAACTGTTC CAGTCAAAGG GACTCAGTAT CCTTGATTTA GTTATTCTTT  CAGGTTAAGT GCTCTACAGT CTGCTGTGGG CAGAACTCTA GTGTTTTTCT GTCTGTTTTT TTCTTTTTCA TGTTTAATTT TGTTTCAAAT TAAGTACAGA TTCATGCTAA TATTTTACAT  ATGTTTGGTT TCTATGTCTT CTCAGGTGCA CACACAATCG GAAGAAGCGT TTGCAGTGTG ATACAGGACA GGCTTTACAA CTTCAACGGC ACCCACAAAC CTGATCCAAG CATGGATCCT  ATATACGTTA AGTACTTGCA AAATAAGTGC TCATATGGAC GTAATTGGGG ATCAAATTTA GTGAGCTTAG ATCCCACAAC TCCGAATGTT TTGGATGCTG TCTACTACGA AAATCTGCAG  AGTAAAAAAG GGCCATTTGT TACAGACCAA CTTCTTTACA GCGACGATAG AACACAATTT CTGATTAACA CGCTTGCATC TAATCCAGAA TTGTTCTACC AGCAATTCAG TGTGTCAATG 
GTGAACTTAG GAAACGTCCA AGTCCTGACT GGAGATGAAG GAGAAGTTCG CACTAACTGC AACTACTGGA ACCATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTTGC TACATCTAGT GCCAATAATA TTGCTTCTGT TTGGAGGAGC ACTTGCATTG CCATTGCCGG CGATTGACAA AATAATCCAG AAAAAGGTTC CATCACCTTC GGTTTCCCAC  GTTGTGACAT CCAAGCCCAA CAACACTTAC AAGCCCATAA ACAAACCAAC CACGCCTGCG AAGAGGATAC GGGGGCCAGC GCAAGTGTTT CTATCACCCA TCTACTACGC TCAGAGCTGC  CCGAACGCCG AACAGATAAT TCATAACAGG GTTCAATATT GGGTGCAGCA GGACTTCACA CTTGCTGCCA GCCTTATACG CATGCACTTC CACGATTGCA TCGTTCGAGG ATGCGACGCG  TCAATTCTCT TGAATTATCC AGGAAGCGAG AGAGAATCTA CAGCAAGCAG AACACTGCGC GGTTTTTATG TCATCGATGA CATCAAGCGA CAGCTGGAGA AAGCATGCCC TCGAACAGTT  TCCTGCGCCG ATATCCTGAC AACAGTTGCA CGTGATGCAT CGCTTGTGTT GGGAGGGCCA TTCTGGAGCG TTCCGTTTGG TAGGAAAGAC GGTCATATTT CCCTAGCCAG GGAAACAAAT  ATCGTTCCAC AAGGCCATGA AAGTGTGACT ACACTGATTC AACTGTTCCA GTCAAAGGGA CTCAGTATCC TTGATTTAGT TATTCTTTCA GGTGCACACA CAATCGGAAG AAGCGTTTGC  AGTGTGATAC AGGACAGGCT TTACAACTTC AACGGCACCC ACAAACCTGA TCCAAGCATG GATCCTATAT ACGTTAAGTA CTTGCAAAAT AAGTGCTCAT ATGGACGTAA TTGGGGATCA  AATTTAGTGA GCTTAGATCC CACAACTCCG AATGTTTTGG ATGCTGTCTA CTACGAAAAT CTGCAGAGTA AAAAAGGGCC ATTTGTTACA GACCAACTTC TTTACAGCGA CGATAGAACA  CAATTTCTGA TTAACACGCT TGCATCTAAT CCAGAATTGT TCTACCAGCA ATTCAGTGTG TCAATGGTGA ACTTAGGAAA CGTCCAAGTC CTGACTGGAG ATGAAGGAGA AGTTCGCACT 
AACTGCAACT ACTGGAACCA TTAA 

Retrieve as FASTA