Entry information : PabPrx31(PAB00003011 / MA_102713g0010)
Entry ID 12770
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx31(PAB00003011 / MA_102713g0010)
Name PabPrx31(PAB00003011 / MA_102713g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx31
start..stop
S start..stop
PgPrx31 701 0 1..340 1..340
PtaPrx04 599 0 1..340 35..371
GbPrx37 455 3e-162 18..337 7..327
CmichPrx14 452 5e-161 39..337 42..343
Literature and cross-references PabPrx31(PAB00003011 / MA_102713g0010)
Protein sequence: PabPrx31(PAB00003011 / MA_102713g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   341 (328)
PWM (Da):   %s   36975.27 (29174.3) Transmb domain:   %s   i12-31o (i12-31o)
PI (pH):   %s   5.05 (5.17) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-359
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTVHNSSSDS SNGSLWMVVM GLIVTAQLVL AQQQQQQLLS VDYYKSSCPQ VENIISKVME RKQRDNPTTA AGTLRLFFHD CFVEGCDASV LVSSIGAGHK AERDADINLS LPGDGFDAVT  RAKTAVEAQC PGVVSCADIL AIATRDLISL IGGPKYQVKK GRKDGLISEA SRVAGNLPET TMSVDELNAL FESRGLNQSE MTTLSGAHTV GFSHCKEFMG RIYKEPMDPT IDPNYAVGLQ 
NVCPQQNLDP NMAAFNDVLS PRTFDNVFYQ NLPKGLGLLA SDQILYSDAR TRDLVETYAS NQDAFFRDFA LAMDKLGSVG VKTGYEGEIR KSCDAFNKHS x 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and RNA seq (comp76596_c0_seq1). Incorrect prediction (exon 2 is missing due to undetermined nucleotides + repeated aa in exon 3 between GRRD and VALSTIGH (GLNQSEMTVDERNALFESR).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAGTGC ATAACAGCAG CAGCGACAGT AGCAATGGCT CTTTGTGGAT GGTGGTCATG GGCTTAATAG TAACAGCACA GCTAGTTCTT GCTCAACAGC AACAGCAACA GTTGCTCTCA  GTCGATTACT ACAAGTCTTC ATGTCCGCAA GTGGAGAACA TCATTAGCAA AGTTATGGAA CGCAAGCAGA GGGACAACCC AACCACAGCA GCGGGGACGC TGCGCCTTTT CTTCCATGAC  TGCTTTGTTG AAGTAAGTGG CGTGGCGTGG CTTGGCTACG CTATTGCTGT TATTGAACGT GGCTTGGCTT GGCTATTGTT GGGTATTGAT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTACACG CCTCCCTCGC GCCATCAGAG ATGTGTATAA GAGACAGGGA TTTGACTGGA CATTTCAAGG GATTTGACTG  GACTTGAAAT TGAGACCCCT TCACTGTGCT TGAACTTGTT AACTCTTGAA CTTGTGACTT CTCTATGGAC TTGACCTTGT GATCTCTCCA TGGACCTCTC TCCATTTCCA TTACCAGGGC  CATCCATTGG CAATAGCAAA CATGCCCTTG ATATAACCAT GAAGCTAAAT CAATTTATGT TGCTTTTCTT TGTGACTTCC TTCTCCTCAT GCCAATATAC CTTTGGATCC AACTGATCCA  GCTAATTCTT AAACCTGATC CGTTTATATT GGTTCCCTTT GTGACCTCCT ATCTCCTCTG CATCCTCATT GAAAATGATC CAACAAATTG ACCCAATTCT TAAGGTTAAA TCAATTTATG  TTCATTTCCT CTGTGACCTC CCATCCCCAT GTCAACATGC CTTTGGCCAA TAGCCTGCTG GTTGTGATTG AGCTAATCAG CTATTCCTTA AGGCTAATCA ATTTATGTTC TTCTTTTGTG  ACCTCCCCAT CTCTTTAGTA TCTCTGTGAC AACATGTCCT TTCTAATGGT CCTATTGATT GAGATATTCT TTATGTGCCT TCCATCTACC CATCCACTCT ACAATATACC TTTGGCAAAT  GGTCCAGCAG ATTGAGCTAA TCAAGTTATG TCCCTTACCT TTATTTCTTT CATTGGTTTG TTTATGTGGC TATATTGTAC ATGATGGCAG ATAGGGGGGC CAAAATACCA GGTCAAGAAG  GGGCGCAAAG ACGGGCTCAT CTCAGAAGCA TCCCGAGTTG CGGGCAATCT CCCAGAAACA ACGATGAGTG TGGACGAGCT CAACGCCTTG TTCGAATCCA GGGGCTTGAA TCAGTCGGAA  ATGACGGTGG ACGAGCGCAA CGCCTTGTTC GAATCCAGGG GCTTGAATCA GTCGGAAATG ACGACTCTCT CGGGAGCCCA CACTGTGGGC TTCTCGCACT GCAAGGAGTT CATGGGGAGG  ATCTACAAGG AGCCCATGGA TCCCACCATC GATCCTAACT ACGCTGTGGG CCTGCAGAAC GTCTGCCCAC AGCAGAACCT GGATCCCAAT ATGGCCGCTT TCAACGATGT CCTTTCTCCC  AGGACTTTCG ATAATGTTTT CTATCAGAAT CTGCCCAAGG GTTTGGGCTT GCTGGCCTCT GATCAGATCC TCTACAGCGA TGCACGGACC AGAGGTCTCG TGGAAACATA CGCTTCCAAC  CAAGATGCTT TCTTCCGAGA CTTTGCGCTT GCCATGGATA AGCTCGGCAG CGTGGGCGTT AAAACAGGCT ACGAGGGAGA GATCAGAAAG TCCTGCGATG CTTTCAATAA ACACAGTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAGTGC ATAACAGCAG CAGCGACAGT AGCAATGGCT CTTTGTGGAT GGTGGTCATG GGCTTAATAG TAACAGCACA GCTAGTTCTT GCTCAACAGC AACAGCAACA GTTGCTCTCA  GTCGATTACT ACAAGTCTTC ATGTCCGCAA GTGGAGAACA TCATTAGCAA AGTTATGGAA CGCAAGCAGA GGGACAACCC AACCACAGCA GCGGGGACGC TGCGCCTTTT CTTCCATGAC  TGCTTTGTTG AAGGGTGCGA TGCATCGGTG CTGGTATCGT CGATCGGTGC CGGTCACAAG GCTGAGCGGG ACGCAGACAT CAATCTATCG TTGCCCGGCG ATGGATTCGA CGCCGTCACC  CGGGCGAAGA CCGCAGTCGA AGCTCAGTGC CCTGGCGTCG TCTCATGTGC AGACATTCTC GCCATTGCAA CCAGAGATCT CATTAGTCTG ATAGGGGGGC CAAAATACCA GGTCAAGAAG  GGGCGCAAAG ACGGGCTCAT CTCAGAAGCA TCCCGAGTTG CGGGCAATCT CCCAGAAACA ACGATGAGTG TGGACGAGCT CAACGCCTTG TTCGAATCCA GGGGCTTGAA TCAGTCGGAA  ATGACGACTC TCTCGGGAGC CCACACTGTG GGCTTCTCGC ACTGCAAGGA GTTCATGGGG AGGATCTACA AGGAGCCCAT GGATCCCACC ATCGATCCTA ACTACGCTGT GGGCCTGCAG  AACGTCTGCC CACAGCAGAA CCTGGATCCC AATATGGCCG CTTTCAACGA TGTCCTTTCT CCCAGGACTT TCGATAATGT TTTCTATCAG AATCTGCCCA AGGGTTTGGG CTTGCTGGCC  TCTGATCAGA TCCTCTACAG CGATGCACGG ACCAGAGATC TCGTGGAAAC ATACGCTTCC AACCAAGATG CTTTCTTCCG AGACTTTGCG CTTGCCATGG ATAAGCTCGG CAGCGTGGGC 
GTTAAAACAG GCTACGAGGG AGAGATCAGA AAGTCCTGCG ATGCTTTCAA TAAACACAGT TAGCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACATGGCAG GCTCTATTAT TTTTGTCACA GCGCCAACCG TCACACGGTT TCTGTCACAT CTTACGCGGC GCGGGCTTTC GTGAAGGCAA TGCCAGTGCC TTAACCCCCT GCACTGCATT  CCCTGAATGC CATTGCCATT GCCATTTTGC ATTCTCTATT GCCATTGCCC TTTGCAGAAT CGTAAGTCAA CAGGATGACA GTGCATAACA GCAGCAGCGA CAGTAGCAAT GGCTCTTTGT  GGATGGTGGT CATGGGCTTA ATAGTAACAG CACAGCTAGT TCTTGCTCAA CAGCAACAGC AACAGTTGCT CTCAGTCGAT TACTACAAGT CTTCATGTCC GCAAGTGGAG AACATCATTA  GCAAAGTTAT GGAACGCAAG CAGAGGGACA ACCCAACCAC AGCAGCGGGG ACGCTGCGCC TTTTCTTCCA TGACTGCTTT GTTGAAGGGT GCGATGCATC GGTGCTGGTA TCGTCGATCG  GTGCCGGTCA CAAGGCTGAG CGGGACGCAG ACATCAATCT ATCGTTGCCC GGCGATGGAT TCGACGCCGT CACCCGGGCG AAGACCGCAG TCGAAGCTCA GTGCCCTGGC GTCGTCTCAT  GTGCAGACAT TCTCGCCATT GCAACCAGAG ATCTCATTAG TCTGATAGGG GGGCCAAAAT ACCAGGTCAA GAAGGGGCGC AAAGACGGGC TCATCTCAGA AGCATCCCGA GTTGCGGGCA  ATCTCCCAGA AACAACGATG AGTGTGGACG AGCTCAACGC CTTGTTCGAA TCCAGGGGCT TGAATCAGTC GGAAATGACG ACTCTCTCGG GAGCCCACAC TGTGGGCTTC TCGCACTGCA  AGGAGTTCAT GGGGAGGATC TACAAGGAGC CCATGGATCC CACCATCGAT CCTAACTACG CTGTGGGCCT GCAGAACGTC TGCCCACAGC AGAACCTGGA TCCCAATATG GCCGCTTTCA  ACGATGTCCT TTCTCCCAGG ACTTTCGATA ATGTTTTCTA TCAGAATCTG CCCAAGGGTT TGGGCTTGCT GGCCTCTGAT CAGATCCTCT ACAGCGATGC ACGGACCAGA GATCTCGTGG  AAACATACGC TTCCAACCAA GATGCTTTCT TCCGAGACTT TGCGCTTGCC ATGGATAAGC TCGGCAGCGT GGGCGTTAAA ACAGGCTACG AGGGAGAGAT CAGAAAGTCC TGCGATGCTT  TCAATAAACA CAGTTAGCTA ATCGTTGCAT ACCCTCTTTG TCTGCCTGAG TGTAAATATA ATCTCCCCGG TATACGCTAT TTCCCAACTG CTACGTCTGG GTAGCAGATT AGAGTTCCCT  GAGATGGCCA GTTAATATAC TTATACTGTA CACGCAAAAT TTCACACGTC CGTCTTTATA TTTTTTCTGA GAAAATTGAT TTGTTGTAAA AGATCCAACA ATAAACTTTG AGCTGGTTTG  AGCCTATTAA TGCAGCAGCA TTTGATTGAT TTGCATTCCG GATGTATTTT CTCTTTTCTT TTGTGAAATC TGTTAATGCA AGAAATAGAA GTGGAATACA CAGGTAAGAA TAGAAAAGTA 
ATGGTGAATT GAAAATTCTG TTTGAATTTG GATATTAGCT TTAAGTGGAG TTTAGGTTAG ATGGTTGAGC AGGCATG 

Retrieve as FASTA