Entry information : PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Entry ID 12788
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Name PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx53
start..stop
S start..stop
PtaPrx29 573 0 4..329 3..328
GbPrx16 481 1e-172 1..329 1..323
WnoPrx03 479 3e-172 9..329 5..322
GbPrx26 445 1e-158 27..329 25..327
Literature and cross-references PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Protein sequence: PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   34409.93  
PI (pH):   %s   4.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGATSMFGII KLLVVISVGL VLGSSFSEGG LQTGFYSSTC PTAESVVLST VQQSVQADPT LAAGLLRLHY HDCFVQGCDA SILIAGASAE QTASGHSGLR GFDVIENAKK QLERICPGVV  SCADIVALAA RDAVALSNGP NYDVPTGRRD GMRSSAGDAS DMPDPTDSVD VLKRKFAAKG LSASDLVVLN GAHTIGTTAC FFIEDRLYNF AADGDADPSI NPEYLTELRS TCPKGGDVNT 
RLALDRGSEF QFDKEFLENM REGNVALQSD SSMYQDGSTR GYIDSYFGLL GGLLGPSFES DFADAIVKMG QVGVKTGSNG KIRTVCSAF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic, EST and RNA seq. Incorrect prediction (exon 1 and start of exon 2 are missing due to scaffold border). Sequence completed (stop in frame, start is missing and mismatches between EST and DNA for the 5' end)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCGTGATTA GTGTTGGCTT GGTCTTGGGT TCGAATTTCA GTGAGGGTAG TTTACAAATG GGATTTTACT CTTCGACTTG TCCCACAGCA GAATCTGTGG TGCTCTCGAC CATTTAGCAG  AGTGTCCAAG CCGATCCAAC TCTAGCGGTA GGGCTTCTGC ATTTACATGA CCATGACTGT TTCGTTCAAG GTTGCGATGC ATCAATCCTG ATTGTCGGTG CTAGTGTTGA ACAAACGATG  CCGAGCCATT TCAGATTGCA GGGCTTTGAT GTCATAGAAA ATGCCAAGAA ACAACTCGAG AGAATCTGTC CCAGAGTCAT TTCCTACACC GACATCGTTG CATTGGCAGC CATAGATGCC  GTAGCACTGA GTAACGGACC CAACTATGAT GTACCCACTA GACGAAGAGA TGGAATGAGG TCGTCTATTG GGGACGCTTC AGACATGCCA GACCCTACGG ATTCAGTCGA TGTCCTCAAG  CGTAAATTTG CTGCAAAGGG TCTATCTGCA TCAGATCTTG TTGTTCTCAA TGGTAGGTCT ATATCATTCT TCAATTCAGT TACATAGATT AATGGCTAGA TATCCACTAG ATCTGTTATA  CATTTCCTAA AATGTGCTTT AGGATTGTTA GCATAATAAT GATAATATAT TTAATCGAAT AGAAAGTAAA AACATTATTT ATGTTAGTGG AAAACCCTTT ATGATGTATA CGACAGAGTA  ACCCTGAAAA TACTATCAGC CTAGAACCTT GAAGGACACA ACTATCTATA CCTTAGGTTT TGGGTCTGAC TAGTAAAGCA AGGGTTTGGA TGCAAGGAAA GTTTGAACTA TTCAATATGC  GTTACCTGTC AGATTGAGGC CATGGGCAGA ATTTCTGTAT GTGGAATGCT ATAGTTCACA GAAATCTATT AGGTGAACAA TATCTACGGT GTTGTGTAGC ATTCAATGCT GTGAATGTTG  TGTAGAGTGG TCTCTATTGA ATGCATGTTG TGTAGGATGG TCTCTATTGT ATGAGGTGGT TTATAAGTTG TTGGATTTGA AAAAAATTCA AATCCAATGA CCTATACATC TGTAACAACC  CTAGTTGTAT TCATATTTCA CTTGTTTTAC TTTGGTAAAT TTGTTTTTAC ATTTTCAATT CGTATTGTTT nnnnnnnnnn AAGTTATGAA GAATAAATCA CATTCATTGA TTTGGGAGGA  CGACTAAGAA TATTCCAGCA TTTCTATTGT TAGTCATCAA ATTAAAATTT TAGATTAAAA AATGATTAAT TGTACCCATC TTCAATAGAT ATACACCTTT TGACATAACT TTCGAAGTAA  TAATATATTT AATCAAATAA AAAGTAAAAA CATTATTTGT TAGTGGCATA CCCTTTATGA TCTATACGAC AGATTAACCC TGAAAATACT ATCAGCCAGA ACCTTGAAGG ACACAACTAT  CTGTACCTTA GGTTTTGGGT CTGCCCAGTA AAGCAAGGCT CTGAATGCAA GGCAGGTTTG AACTATTCAA TATGCGTTAC CTGTCAGATT GAGACCATGG GCAGAATTTC TGTATGTGGA  ACGCTGTAGT TCACATAAAT CTATTAGGTG AACAATACCT AAGGTGCTGT GCAGCATTGA ATGCTGTGTA GGGTGGTCTC TATTGAATGA GGTGGTTTAC AAGTTGTTGA ATTGAATGCT  GTGTAGGGTG GTCTCTATTG TATAAGGTGG TTTATAAGTT GTTGGATTTG AAAACAATTC AAATCCAATG ACCTATACAT CATCCCCACA ACATATTCCT ATACATCATC CCCACAGCAT  ATTCCACAGC CTTTATATCT AACCCATCCC CACAGCATAT TCCTATACAT CATCCCTACA GCATATTCCA CAGCCTTTAT ATCAAACCCA TCCCCACAGC ATATTCCTAT ACATCATCCC  CACAGCATAT TCCACAGCCT TTAAGCTGTT GAATTGAAAA CAATTAAAAT CCTATAACCT ACATCATCCC CGCAGCATAT TCGACAACTT ACACACCACC CCACTCAGCA TTGAACCCTG  ATATTGACTG CTGTTGAATT TGAAAGCAAT TCAAACTCTA CAACCTACAT CATCCCCACA GCATATTCGA CAGCCTACAC ACCACCCTAC TCAGCATTAA ACCCTGCAGA GCAAGGTGGA  TGTTGGCTGC CAATTTATAA GAACCAGTCA ACGCTGTATT AATTGCAGTC AATGCTGTAT TAATTGCAAT TTTGAAGGGA CAGGTACTGT AGGTTGGAAC AGTTCCCGCC AATCCATCAA  ACCTGTCCGT CATCAAACCT GTCAGTTTAA GGTTATGGAT ATGATAAAAA CAGGGTTGGC AGGCAGGTTG AAAAGGGGCA ATGGCTATCC ATCATGTAGA CTCTGCATGG TGGATAGCAA  TTCCGGTTGA ACTGATTCCA ACGTGCATTG CCCATCACTT CATATGTGGA GAGCAGTTAC TTACACAATG GATAAGCACC GAGCAACTCT GTGCTGATTG CAATGTACAT TGATATATAT  ACGGACCTAG TCTGAGATGC TTCAGATATT ATGGTACATA TCCTGGTATA GTCTGAGCTG ATTGAAATGT ACATTGATAT ATATACAATT TGCATTGATA TATATATACG ATCCTAGTCT  GAGATGCTTC AGATATTATG GTACATATTC TGGTATAGTC TGAGCTGATT AAAATGTGCA TTGATATATA TACGGTCCTA GTCTGAGATG CTTCAGATAT TATGGTACAT ATCCTGGTAT  AGTCTGAGCT GATTGAAATG TACATTGATA TATATACAAT TTGCATTGAT ATATATACGA TCCTAGTCTG AGATGCTTCA GATATTATTG TACATATTCT GGTATAGTCT GAGCTGATTA  AAATGTACAT TGATATATAT ACGATCCTAG TCTGAGATGC TTCAGATATT ATGGTACATA TCCTTGGATA GTCTTGAGCT GCTTCCGATA TTATGGTACA TATCCAATGC AACATAGCTG  GGTGTATAAT GCTTGCCCCA ATCCACCTGT TATAATGAAG TTGTATAGTC TTGAGCTGCT TCAGATATTA TGGTACATAC CCTGGTTGTA TAATGCTTGT CCCGATCCAC CTGGTATAAT  GAAGCAGTCT AATCATGTAT AGCAAACATC TTCTTTGGGT AGTTTGACTG AATCAAGACA ATGAACAATT GCAATTCTGA CAATGAGACT GTAGTTGGAT TCATCAATCC CATTTTCATT  GAATAACTCT AGTCTTCAAC TTTAGCAATC TAAACTTGAG ATCTATTCTT CAAGTTTAGC AATCTAAACT CGAGATTTGA AAATTTCAAT GAAATATAAG AAGAAAAGAC ACCGAAACAG  AAAATGTTTG CTATGTTATA CATTATTAGC TTATTCTCAA ATGATCTTTA AGGCATTGTA AACAGTTGTA AAGCCTGTAA AATTTTCAGT GGCTTAACTT CCACTTCCAT TTACTACAAG  GTAGATTCAT AACTCTTTAA GTCGGAGTAA ACACTGAAAA TTTTATATGA TCTATAGGAC AGAGTAACAG TTGTAAAGTC CGTACAATAA TTTTCGGGAG TTTCAACTTT CATTTATTGC  AAGGTTGTCT CTACCATTTA CTAGTTTAAC GTACATATAT TTCAAGGTAG GTATATAATG CTTGCCGTAA TCCCACATTT TATGATCTAT AGGACAGAGT TGTCTCTACC ATTTACTAGT  TTAACGTACA TTTATGTCAA GGTTGTGAAG GGTCACTTTC ATTTTTGTCA ATGTTGTTTG TATAAATTGT CTGTACTGGT TATATGTTTT TGGTTTTATC AATATTTAGT GTTTTGTATG  TTAAAATATA TATTGTTTAA TAAAACATAT ATAGCATATA TTTGTTGCTA CTAGTCTATA TTGTTTGTTT GTCATATTCG AAATTATTAT TTTTTGTTGT TTAAAATTTA TTTTGGAATG  TAAAAATGGA TTTAGCATAG TGAAAAACTT CTGCAACATT CAATTATATA GAAATAATCA CTCAAATTTG TGGATCTAAC AATTTCTTAC CAAATTATGA ATAAATGTCC CTTGAAAAAT  GACTGGAGAA AAATCGTTTA ATAGAACTTT AAACTACCAC TTTGTCTAGC CATAATTATC TTATTTTTTT AATGTTTTAG ATATCCTAAA CCTGTTTCAA ACCCAACTAA CGAAGTAAGC  TAGCATCCCA TGGCCCTCAA GTATAGATGC TCTTCTCCGT TCATGCTCTT TTCCTGTGCT AGTGGATGAG AGTTTAGCTT GAACCGCTAT TTTCTTTGAC AAGTTTTGTT GTCCTTCCAA  TGTTTCACAC ATCGATAAAT TTCTCATTTT CTTCAACGAT CTTGTTTATT ATTATTTTAC CAAAATCAGA AATGGCTAAT GGATTACGAA TATGAGCAGA ATGTAGTGTT TTTTTGGCAG  GAGCACACAC GATCGGAACA ACTGCATGTT TCTTTATCGA GGACCGTCTC TACAACTTCG CAGCCGATGG CGACGCAGAT CCCTCTATCA ATCCCGAATA CTTGACGGAA CTGAGATCAA  CTTGCCCCAA GGGCGGTGAT GTTAATACGA GGTTGGCTCT TGACAGGGGC TCCGAATTCC AATTTGACAA GGAATTCCTA GAAAACATGA GGGAGGGGAA CGTAGCGCTA CAGTCTGATT  CGAGCATGTA CCAAGACGGT TCTACCCGCG GATATATCGA CTCCTATTTT GGGCTGCTGG GCGGGCTTTT GGGGCCTTCA TTTGAATCCG ACTTTGCAGA TGCAATTGTT AAAATGGGGC 
AGGTCGGCGT CAAAACCGGT TCGAATGGAA AGATTCGTAC CGTCTGTTCG GCCTTTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGCAA CAAGTATGTT TGGGATTATA AAGCTTTTAG TCGTTATTAG TGTCGGCTTG GTCTTGGGTT CGAGTTTCAG TGAGGGCGGC TTACAAACGG GATTTTACTC TTCGACTTGT  CCCACAGCAG AATCCGTGGT GCTCTCGACC GTGCAGCAGA GCGTCCAAGC CGATCCAACT CTAGCGGCAG GGCTTCTGCG TTTACACTAC CATGACTGTT TCGTTCAGGG TTGCGATGCA  TCAATCCTGA TTGCCGGTGC CAGTGCTGAA CAAACGGCGT CGGGCCATTC CGGATTGCGG GGCTTTGATG TCATAGAAAA TGCCAAGAAA CAGCTCGAGA GAATCTGTCC CGGAGTCGTT  TCCTGCGCCG ACATCGTTGC ATTGGCAGCC AGAGATGCCG TAGCACTGAG TAACGGACCC AACTATGATG TACCCACTGG ACGAAGAGAT GGAATGAGGT CGTCTGCTGG GGACGCTTCG  GACATGCCAG ACCCTACGGA TTCAGTCGAT GTCCTCAAGC GTAAATTTGC TGCAAAGGGT CTATCTGCAT CAGATCTTGT TGTTCTCAAT GGAGCACACA CGATCGGAAC AACTGCATGT  TTCTTTATCG AGGACCGTCT CTACAACTTC GCAGCCGATG GCGACGCAGA TCCCTCTATC AATCCCGAAT ACTTGACGGA ACTGAGATCA ACTTGCCCTA AGGGCGGTGA TGTTAATACG  AGGTTGGCTC TTGACAGGGG CTCCGAATTC CAATTTGACA AGGAATTCCT AGAAAACATG AGGGAGGGGA ACGTAGCCCT ACAGTCTGAT TCGAGCATGT ACCAAGACGG TTCTACCCGC  GGATATATCG ACTCCTATTT TGGGCTGCTG GGCGGGCTTT TGGGGCCTTC ATTTGAATCC GACTTTGCAG ATGCAATTGT TAAAATGGGG CAGGTCGGCG TCAAAACCGG TTCGAATGGA 
AAGATTCGTA CCGTCTGTTC AGCCTTTTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GACAGCTTAC AGTCAAGAAA AAGCGTGATA ATGCAATATT TGACTACGTA AAATGCCAGT GGACACTTTC TCAGATAAGT CCCGTCTCAT TACCTGTCGA TGCACGGATT TTATTGTTTT  TTGCAGTCAA TATGGCAGAG CTTCGGCCAG TGCGTACTAG TTTATTATTT AATTAGAGTG GGTTTATCAC TGGAGATTGT ATCGTTTGTT TGATATAAGG GAGCGCAATG GGAGCAACAA  GTATGTTTGG GATTATAAAG CTTTTAGTCG TTATTAGTGT CGGCTTGGTC TTGGGTTCGA GTTTCAGTGA GGGCGGCTTA CAAACGGGAT TTTACTCTTC GACTTGTCCC ACAGCAGAAT  CCGTGGTGCT CTCGACCGTG CAGCAGAGCG TCCAAGCCGA TCCAACTCTA GCGGCAGGGC TTCTGCGTTT ACACTACCAT GACTGTTTCG TTCAGGGTTG CGATGCATCA ATCCTGATTG  CCGGTGCCAG TGCTGAACAA ACGGCGTCGG GCCATTCCGG ATTGCGGGGC TTTGATGTCA TAGAAAATGC CAAGAAACAG CTCGAGAGAA TCTGTCCCGG AGTCGTTTCC TGCGCCGACA  TCGTTGCATT GGCAGCCAGA GATGCCGTAG CACTGAGTAA CGGACCCAAC TATGATGTAC CCACTGGACG AAGAGATGGA ATGAGGTCGT CTGCTGGGGA CGCTTCGGAC ATGCCAGACC  CTACGGATTC AGTCGATGTC CTCAAGCGTA AATTTGCTGC AAAGGGTCTA TCTGCATCAG ATCTTGTTGT TCTCAATGGA GCACACACGA TCGGAACAAC TGCATGTTTC TTTATCGAGG  ACCGTCTCTA CAACTTCGCA GCCGATGGCG ACGCAGATCC CTCTATCAAT CCCGAATACT TGACGGAACT GAGATCAACT TGCCCTAAGG GCGGTGATGT TAATACGAGG TTGGCTCTTG  ACAGGGGCTC CGAATTCCAA TTTGACAAGG AATTCCTAGA AAACATGAGG GAGGGGAACG TAGCCCTACA GTCTGATTCG AGCATGTACC AAGACGGTTC TACCCGCGGA TATATCGACT  CCTATTTTGG GCTGCTGGGC GGGCTTTTGG GGCCTTCATT TGAATCCGAC TTTGCAGATG CAATTGTTAA AATGGGGCAG GTCGGCGTCA AAACCGGTTC GAATGGAAAG ATTCGTACCG  TCTGTTCAGC CTTTTAGTAG TAGCCGCAGT CGATAATTGC AACGTTGATT TTGCTGTTTT CAAAATTGTA AAAGGAAGTT TATAGTATAA GCTAGATATA TTAAAAAATT TCTTTCGCCT  GTGGAATAAA CGAGGCCCGA GGCTGAGGCC ACGTTGCATG TATCGAGAAT AAGATTGTTA TCGTCATTGT GATGATAAGG TAAAGCTGTA ATCTTATCTT CTTCGAGCAC ATAAAACAAT 
AATAGAATAT A 

Retrieve as FASTA