Entry information : PtaPrx100(PTA00060379)
Entry ID 12809
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-02-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx100(PTA00060379)
Name PtaPrx100(PTA00060379)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx067]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx100
start..stop
S start..stop
PabPrx173 596 0 1..324 1..324
GbPrx69 487 3e-175 6..323 6..323
PtaPrx101 426 8e-151 1..323 1..329
PabPrx38 422 1e-149 1..323 1..329
Literature and cross-references PtaPrx100(PTA00060379)
Protein sequence: PtaPrx100(PTA00060379)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328
PWM (Da):   %s   35923.16  
PI (pH):   %s   7.32
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSAKFFCCLI LLIHGIQSID GQLSVDFYRV SCPAVDSIVF ETMRKLANES NVVAPSTLRL FFHDCFIEGC DASIMISSTL NNRAERDLPE NNIAQNAFDA IVQVKKAVDS VCPRVVSCAD  IIAMAARDAV RLLGGPNWDV PKGRLDGLVS QAVRARGKVP GANTNVSQLI NIFAALNLSV LDLVVLSGAH TVGFSHCDQF TNRLYNFSST TKTDPALNAT FVSALEQRCP AGGNPNEFQA 
FDIITPFNFD NQYFRNLKVG QGLLFSDQDL VHNRFTAELV NRFALSQDIF FSNFVVSMVK LGNVGVKTNS RQGNVRRDCT AFNPPAPH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCGA AATTCTTTTG CTGTCTAATA TTACTCATCC ATGGAATCCA GAGCATTGAC GGCCAGCTCT CAGTGGATTT CTACAGGGTT TCGTGCCCGG CCGTGGATTC GATAGTGTTC  GAGACCATGA GAAAACTGGC AAATGAATCG AATGTCGTTG CTCCTTCAAC ACTCCGGCTC TTTTTTCACG ACTGTTTTAT TGAGGTTATT GTAATTTCGC TAAATATTTG ACCTAGTTTT  TATTCATCTC AAAATATTCT AGAAATCGCC AAAATATACC ATCCAAATAA AATTAGAGAT TCTCTCAAAA AAAAAAAAAA AATTCCAAAC TCAAATTCTT GGACTTTGCA TTTTGACAGG  GATGCGATGC TTCCATCATG ATTAGCTCAA CGCTCAACAA TAGAGCAGAA AGGGATCTCC CTGAGAACAA TATAGCTCAG AATGCCTTCG ACGCTATCGT CCAGGTGAAG AAAGCTGTGG  ACAGTGTCTG CCCAAGGGTT GTATCGTGCG CTGACATTAT AGCTATGGCA GCCAGGGATG CTGTGAGATT GGTAATGAAT TCTCACTAAC ATAGTAGTTG AGATTAAAAC CAAGAATCAT  CTGTCAGATT TAAAGATGTT CTGGTTTATT TGTGACAGCT TGGAGGACCG AATTGGGATG TGCCCAAAGG AAGATTAGAT GGCCTGGTCT CGCAGGCTGT CAGAGCGCGC GGGAAGGTTC  CTGGGGCCAA CACTAATGTA AGCCAACTTA TCAACATATT TGCTGCTCTA AACTTGTCCG TGCTGGACTT GGTTGTCTTA TCAGGTATTT GTCCATTCAG TTGCAATGCT GATGTTATAG  TAGTGGGCAT TTATTCATTT AATTGCAATA ATATGGCAGT AGTGGTATAA CTGAAATTTT ACATATAGCA TTATGGTTAT GGGTGTGTTT TATCTATAAT AGTGGTTTTA GAATTCATAT  AGTATTATGG TTATGGGTGT GTTTTATTTA GAAGAGTGGT TTTAGATTTT TAATTTAATT ATTAATTAGA AGTAGTTAAA ATAGTTATGA AATAAATAAC AAGTATTTAG TTATTAnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn ATTTTTGTTT TTTAAATAAA CGTAATATTT TAAATTTAGA GAAGTTTTAG AGCACATCTC AATTGGCTAT TCTTCATGAT ATGATGTCTT TGTGAAGTGT  GTGGTTGGAA GTTCAAATTC CTTGTGAAAG CCTTGTGAGC CATGCATAGG GACAAGGTTG GAATTTCAAA ATAGACTCAA TGTCAAATTT GATGGTTTTC ACTCCTCAAC CTATTTTCAC  AATTTCAAAG AAGGATCTTC ACAGTTTTGT AAATTTTTAA ATTGTATTTG ATGGTTTTCA CTCCTCAACC TATTTTCACA ATTTCAAAGA AGGATCTTCA CAGTTTTGTA AATTTTTAAA  TTGTATTTGA TGGGCAAGTC ACCCGGTGAC AAGCAACCTC TCACTGTAGA TTTATGTGGA CAATAATTAA AAAAAATAAA AAATAAAATC ATGAGATTGT AGTGAATTGG ATTTATGTCT  AGTAATTGGG TGGTTGAGAG AAATGATTGA GATTCTCCCC TATTTAGATT CAATTGGTGC AAGTGACATG ATGAGTTTTG ATTTAATGAC TTCAATCACT GAGAATCAAT AGTCCTTGGA  TAACAAGAAC ATATATATTA TTTTTTCATA GTGGAAAAAC TTATCCTAAC TTAGTTGTCA AACCAACGGT AAAGACAAAC ATCACTAACT ACTATTTATA GATATCTTAG GTAAGTTGAC  TCATTACCAT TATTTAAGAA AAACCCATCA CCTAAAACTA TCCACTAATA ATATGGAAAG AATTAAACTT TCACTCCAAA TTTAAAATGT AAAAATATTT TCCACAAATT TATTATATTA  AAAAAAACAT TAACAAATAT ATCACTTTTT CAAAAATAAA TATAAACCTA ACCCCTAAAA TAATATTAAA AATTCACATT ATATTTATTT ACAAATTTAT TTAAATAAAA TTGTGATTTT  TTATTATTCC ATTTATATAG GTATATCCGA TAATTTTCCT GTACACAAAG CTTTTGTAGT TTCTGTCTTC TACTCATATG CTAATCTCAT TTTTGTATGA ATATGTCAAT ATTGCTGATA  ACAATTTGGA GTTTAGATGG CGGTTCCAAT ACATGTACTA TTAAGTCTTT ATATTGATTC AATATAAAAT ATTTCGTTTT TTTTCTCTTG AAAATTACAC CACTTAAACT TCAACATTTT  GAAAAATCTC CTATCACATT TCCAAATTAC ACAACCCCAA AAAGAGATCT CTTATTTTGA CTCCGTTTTT ATTTATTGCC ATGCTGACCA TTAATGCTCA TATTTATTAT TTTCACCCCG  CACCACCACC TTTAATGCTC TGACCAATAT ATTTAAGTGG CTTCATTAAT GTTTGCAGGT GCGCACACTG TAGGCTTTTC TCACTGCGAT CAATTTACGA ACCGCCTGTA CAATTTCTCC  TCCACCACAA AAACCGACCC GGCACTGAAT GCGACCTTTG TTTCGGCTCT CGAACAAAGA TGCCCAGCGG GCGGAAATCC CAACGAATTC CAGGCCTTCG ATATCATCAC GCCATTTAAT  TTCGACAACC AGTATTTCCG GAACTTGAAA GTTGGTCAGG GTCTCCTATT TTCCGATCAG GACCTCGTTC ATAACCGTTT TACCGCAGAG TTAGTCAACC GTTTCGCTCT CTCACAGGAC  ATTTTCTTCT CCAATTTCGT CGTGTCGATG GTCAAACTCG GCAATGTCGG AGTGAAAACT AATTCCAGAC AAGGAAACGT TCGGAGGGAC TGCACCGCAT TCAATCCTCC TGCTCCGCAT 
TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCGA AATTCTTTTG CTGTCTAATA TTACTCATCC ATGGAATCCA GAGCATTGAC GGCCAGCTCT CAGTGGATTT CTACAGGGTT TCGTGCCCGG CCGTGGATTC GATAGTGTTC  GAGACCATGA GAAAACTGGC AAATGAATCG AATGTCGTTG CTCCTTCAAC ACTCCGGCTC TTTTTTCACG ACTGTTTTAT TGAGGGATGC GATGCTTCCA TCATGATTAG CTCAACGCTC  AACAATAGAG CAGAAAGGGA TCTCCCTGAG AACAATATAG CTCAGAATGC CTTCGACGCT ATCGTCCAGG TGAAGAAAGC TGTGGACAGT GTCTGCCCAA GGGTTGTATC GTGCGCTGAC  ATTATAGCTA TGGCAGCCAG GGATGCTGTG AGATTGCTTG GAGGACCGAA TTGGGATGTG CCCAAAGGAA GATTAGATGG CCTGGTCTCG CAGGCTGTCA GAGCGCGCGG GAAGGTTCCT  GGGGCCAACA CTAATGTAAG CCAACTTATC AACATATTTG CTGCTCTAAA CTTGTCCGTG CTGGACTTGG TTGTCTTATC AGGTGCGCAC ACTGTAGGCT TTTCTCACTG CGATCAATTT  ACGAACCGCC TGTACAATTT CTCCTCCACC ACAAAAACCG ACCCGGCACT GAATGCGACC TTTGTTTCGG CTCTCGAACA AAGATGCCCA GCGGGCGGAA ATCCCAACGA ATTCCAGGCC  TTCGATATCA TCACGCCATT TAATTTCGAC AACCAGTATT TCCGGAACTT GAAAGTTGGT CAGGGTCTCC TATTTTCCGA TCAGGACCTC GTTCATAACC GTTTTACCGC AGAGTTAGTC  AACCGTTTCG CTCTCTCACA GGACATTTTC TTCTCCAATT TCGTCGTGTC GATGGTCAAA CTCGGCAATG TCGGAGTGAA AACTAATTCC AGACAAGGAA ACGTTCGGAG GGACTGCACC 
GCATTCAATC CTCCTGCTCC GCATTAA 

Retrieve as FASTA