Entry information : PabPrx88(PAB00018594 / MA_111431g0010)
Entry ID 12814
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-05-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx88(PAB00018594 / MA_111431g0010)
Name PabPrx88(PAB00018594 / MA_111431g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx88
start..stop
S start..stop
PtaPrx16 624 0 7..333 4..331
PtaPrx61 601 0 1..333 1..336
PpPrx20 562 0 30..333 1..304
PabPrx95 527 0 59..333 1..275
Literature and cross-references PabPrx88(PAB00018594 / MA_111431g0010)
Protein sequence: PabPrx88(PAB00018594 / MA_111431g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (304)
PWM (Da):   %s   35814.8 (32894.2) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   6.23 (5.03) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKKTMRASLS IVVIAVLGML QHLAGGASGQ LVYNFYRSTC PYVENIVLNV VRSAVQNDTR MAASLLRLHF HDCIVNGCDA SVLLDDTDSI TGEKNALPNL NSARGFEVID AIKTALENSC  NATVSCADIL TLAARDSVYL SGGPYWQVQL GRRDGTTASI TAANNNIPSP IESLSSLISK FQGVGLSAQD LVVLSGAHTI GRAHCGTFSS RLFNFSGSNS PDPTIQDSLL QDLQSLCPDG 
NSDANTLAPL DPVTKDRFDN VYFKNLQNNT GLLQSDQVLF STTNASTTFF VNYYSSFPYA FSRDFPTSMV KMANISVHTG SDGEIRKNCR FVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic, RNA seq and EST. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAAA CAATGAGAGC ATCTTTATCT ATTGTTGTTA TTGCAGTACT GGGCATGCTG CAGCATCTAG CTGGAGGTGC CAGCGGCCAG CTTGTCTACA ATTTCTACAG ATCTACTTGT  CCTTATGTTG AGAATATCGT CTTAAACGTC GTTCGATCCG CTGTACAAAA TGATACCCGA ATGGCAGCTT CGCTCCTTCG TCTCCATTTC CACGACTGCA TTGTTAATGT AACTATACAT  ATCATGATTC TCCAGTTTCG GTATCATTTT ATATAATTGA TCTGACTTAA ATGAAGCTAC ATGTCAGTTT AGGCAGGATT TGATCTTTGG TTGTTTATAT GGTAGCTTCT CATTTCATAG  TTAAACATAT TAGGTATTGG TAGCTTCCCA TCTGAACCAT TAAATTACAG CTAAACAGAT TAAGTAACAA AACCAAATCA AACTTTCAGA ACACAAATTT CAAATATTTT ATTAGATAAA  TTTTACATAA AATTAGTGTT ATAATACTTT AGATTTTTTA AATGGATATT TATCCAATTT TATTTATTAG TTGAGTTTAG TTTGAATGAT TAGGGGAGGG AGATAGTTAT CCAATTTTGT  TTATCATTTG AGTTTAATTT GAATAATTAT AAGATGAAGT GTGTTTTATG CATTCAATTT TTATTCTTAT AACTAACCTA TTAAGTTCAT ATTTATGAAA AAACAACTTT GATATTTACT  TTTTGGTTTA TGAAAAACAC AACTTCGATA TATTTTTTTT TGGGTTTTGT TTGACATATA TTTTTAATAC TTATTTCTAT ATATATTGAA TGTTTTACTT ATCTGTAATA GTCTGTATAT  GTATATCATG AAAAGAAGCA ACTTTTAAAT TTACTAGTAC TTTATTTTGT GTGTTGTGGC AATAATTTAT TTATTTATTA TTTAATATGA TATATCCTGT GTAATATATA TCTTGTGTAA  TGAAAAGAAG CTTCATTTTG TGTGTTGTGG TTTTAAACTT TTTATTTATT ATTTAATATG ATATAGAGTT TATATAAGTT TCAAATCTTT TCCATGTTTA ATATGATATA GAGTTTATAT  AAGTTTCAAA TCTTTTCCAT GTTTAATATG ATATAGAGTT TATATCAGTT TCAAATCTTT TCCATGTTTA TGGAATTTTT TGAAACATAA TTTTTGGTAT TATTGTTTAA TATGGTATCG  AGTTTAGATC AGTCTCAGCT CTTTCCCATA ATCATATAGA TTTTTTAAAA TTTTTATTTA TTAAATTTGA TTTATTATTT AATGAATGAA ATTTACACAA AATCTGAAAT ATGTATTATA  CAATGTAAAC TATTATTATT TGGTGCATAT CAGATACTAA CTTTTTTGTT CAGTGTTGAT AAGTAAAATT TGTAACTGTA AGTAAGTTGT AAATAAAATG GTGCATATTG TATTTCAATT  CTTTTAGGAG GTGATTAAAT ATCTCAATAA TTTAATACTT AGTTTATATT TCAATGTCTT AGGAGGTGAT TTAATACTTC TGTAATTTAA TACTTAGTTT CACAGGCTTT ATTGGGAAGA  AGTTCCTGAT AAAGAGTAAC AGTTTTGAAG TTTAGTTTTT TAATTAATGC TTTATCAAAT TGTGCTCTGG TTGCAATTTT TTTATTTACC CAATTTTTGT TTAACTCAAT TAGATTACTT  AAAGCATCTG GTTTTCCAAA TGAATTAATG CAACCTGCTT TTACAGGGAT GCGACGCCTC AGTGTTGCTT GATGATACAG ATAGCATCAC AGGAGAGAAG AACGCTCTTC CTAATCTTAA  TTCTGCCAGA GGGTTTGAGG TCATCGATGC TATCAAGACA GCCCTGGAGA ATTCTTGCAA CGCCACTGTT TCTTGCGCAG ATATTCTCAC TCTTGCAGCT CGGGATTCAG TCTACCTTGT  AATATATATT TTACATTTTC CATATAATGT TCATGTCAAC TGATGGTCAT CTCCATCCAA CAAACCGATT CAAATATACT TACTGTGTTT TTTGTCTTTT ATACAAGAGC GGTGGGCCTT  ACTGGCAAGT GCAGCTGGGA AGAAGAGATG GCACGACTGC CAGCATAACT GCAGCAAATA ACAACATCCC TTCTCCCATC GAGTCGCTCA GTTCACTCAT ATCCAAATTC CAAGGTGTTG  GGCTTTCTGC TCAAGATCTT GTAGTGCTCT CAGGTATGAT CCATACCGGA TTTACATAGT CTAAAGTTTA AACTGGCCTA GATTATTTCA ATATGCAGGT TTTTGCATAT TGTCACCAAC  TCTTTCTGGT AAAAGTCTGT AGTATTTTAG TATGGGCCGT TTCAACTGAA CATTTCATTT ATTCGTACTC GAAGTGTTAT TTTAATACTG AGTATTTAGA ATAAGGATGT TGGATAAACA  GTAAGTTGAA GGTTTAGAAA GGATTAACTT TTCTAGTGGA CATTCCATTC ATTATCATGG ATACTTCACT TTTAGTTCAC TTTTAGTGGA GACTTTTCCA TCATCATTCT TGACACTTCA  TTTTTAGTGG AGACTTCTTC ATCATCATTA TATGGACACT TATTTTTTTT AGTGGAAACT CTTTCATCAT CATTATCATG GACACTTCAC CAGCTTTGAA ATGTTTCTGA TGATGAAATG  TTCCTGATGA TAAGTGGAAT ATCAATGGAA ATTTTGAAAG TTTCGAAACC TTCTACACAG TTTTTATCCA AAAATTTCTC AACATCATGA CTAACTTACA TAGAAATACA TCATGACTAA  CTTACATAGA CATAGTTAAG ATTTAAATAA GTATGGTTGT AATTTTAAAA GTTAGTTTCG CTGATTGATA ACTGTTATAA CAATTTTTAA TTAGATTTTA GTTGGAATTA TTTATAAGAT  GAAGTTTTAG TTAGAAAGAA GAAATTAAAA CTGATATAGA TTGTGAGTGT CAGTGTTTGA AGAAACACTA ACCCTAAAAA AGCTTGAAGA CCTCCCTTCC TACAGCAATG AACACATGTC  ACTTGTACTG TTCAGGGGCT CACACCATAG GCCGTGCCCA CTGCGGCACT TTCAGCTCAC GTCTCTTCAA TTTCAGCGGC TCAAACAGTC CGGACCCAAC GATCCAGGAT TCTCTACTCC  AAGACCTGCA AAGCTTATGC CCAGATGGAA ACAGTGATGC AAATACCCTG GCGCCATTGG ACCCTGTGAC TAAAGACAGA TTCGATAATG TGTATTTCAA AAATCTTCAG AACAATACGG  GGCTTCTCCA GTCGGATCAG GTTCTCTTCT CCACCACAAA TGCGTCGACT ACGTTTTTTG TGAATTACTA CAGCAGCTTT CCCTATGCCT TCTCCAGAGA CTTTCCTACT TCTATGGTGA 
AGATGGCCAA CATAAGTGTG CATACTGGAT CAGACGGAGA AATCAGAAAA AATTGTAGGT TTGTCAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAAA CAATGAGAGC ATCTTTATCT ATTGTTGTTA TTGCAGTACT GGGCATGCTG CAGCATCTAG CTGGAGGTGC CAGCGGCCAG CTTGTCTACA ATTTCTACAG ATCTACTTGT  CCTTATGTTG AGAATATCGT CTTAAACGTC GTTCGATCCG CTGTACAAAA TGATACCCGA ATGGCAGCTT CGCTCCTTCG TCTCCATTTC CACGACTGCA TTGTTAATGG ATGCGACGCC  TCAGTGTTGC TTGATGATAC AGATAGCATC ACAGGAGAGA AGAACGCTCT TCCTAATCTT AATTCTGCCA GAGGGTTTGA GGTCATCGAT GCTATCAAGA CAGCCCTGGA GAATTCTTGC  AACGCCACTG TTTCTTGCGC AGATATTCTC ACTCTTGCAG CTCGGGATTC AGTCTACCTT AGCGGTGGGC CTTACTGGCA AGTGCAGCTG GGAAGAAGAG ATGGCACGAC TGCCAGCATA  ACTGCAGCAA ATAACAACAT CCCTTCTCCC ATCGAGTCGC TCAGTTCACT CATATCCAAA TTCCAAGGTG TTGGGCTTTC TGCTCAAGAT CTTGTAGTGC TCTCAGGGGC TCACACCATA  GGCCGTGCCC ACTGCGGCAC TTTCAGCTCA CGTCTCTTCA ATTTCAGCGG CTCAAACAGT CCGGACCCAA CGATCCAGGA TTCTCTACTC CAAGACCTGC AAAGCTTATG CCCAGATGGA  AACAGTGATG CAAATACCCT GGCGCCATTG GACCCTGTGA CTAAAGACAG ATTCGATAAT GTGTATTTCA AAAATCTTCA GAACAATACG GGGCTTCTCC AGTCGGATCA GGTTCTCTTC  TCCACCACAA ATGCGTCGAC TACGTTTTTT GTGAATTACT ACAGCAGCTT TCCCTATGCC TTCTCCAGAG ACTTTCCTAC TTCTATGGTG AAGATGGCCA ACATAAGTGT GCATACTGGA 
TCAGACGGAG AAATCAGAAA AAATTGTAGG TTTGTCAACT GA 

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