Entry information : MdPrx09 (MDP0000176436)
Entry ID 12892
Creation 2014-03-17 (Maxime Neel)
Last sequence changes 2014-06-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-06-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MdPrx09 (MDP0000176436)
Name (synonym) MdPrx09 (MDP0000176436)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rosaceae Malus
Organism Malus domestica (apple tree)    [TaxId: 3750 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MdPrx09
start..stop
S start..stop
PpePrx02 583 0 7..338 14..357
FvPrx01 578 0 1..338 5..355
PtPrx67 511 0 3..338 7..353
NnPrx26 491 3e-176 19..336 27..355
Literature and cross-references MdPrx09 (MDP0000176436)
DNA ref. Phytozome 12:   MDC008079.368 (546..4888)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Mdo.12543
Protein sequence: MdPrx09 (MDP0000176436)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (314)
PWM (Da):   %s   36950.55 (34270.2)  
PI (pH):   %s   5.41 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-338
Sequence 0
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLTSLLLV SSLFLSSFFC VSEAQSSAPV VQGLSWNFYE SSCPKVDDIV RKQLKKVFKA DIGQAAGLLR LHFHDCFVQC DGSVLLEGSA SGPSEQDAPP NLSLRAKAFE IINDLRDRVH  KKCGRVVSCS DIVALAARDS VFLWIKDGLN FATQNATLAN LPGPTSNTTK LLTDLAKKNL DATDVVALSG GHTIGLSHCS SFTGRLYPTQ DATMDKTFAN DLKTVCPASD TNATVPQDIR 
TPDIFDNKYY VDLMNRQGLF TSDQDLYTDK RTKEIVKSFA VNQTLFFEQF VKSMIKMGQL SVLTGSKGEI RADCSVRNSD NANYLASVVE DDESLSEF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 54 ESTs. Incorrect prediction from Phytozome (incorrect intron 2) confirmed with ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TAACCTCTCT GCTTCTGGTT TCATCTCTTT TCCTTTCTTC CTTCTTTTGT GTCTCGGAGG CACAGTCCTC TGCCCCCGTG GTTCAAGGAC TTTCATGGAA CTTCTATGAG  TCTAGCTGCC CTAAGGTTGA CGACATAGTC CGAAAGCAGC TTAAGAAAGT CTTCAAAGCG GACATTGGCC AAGCTGCTGG CTTGCTCCGT CTCCATTTCC ACGATTGTTT TGTTCAGGTA  ACATTTAGCA AAGATTATAC AGTTTTTGGT TCAGTGTCGA TTTTGAGAGC TATTATCGGC CCTTTAGTTT CACGATTGCT TTGTGTCAGC TGTTTTATTG TCTTTAGCGG TAACTAAGGT  TTTATTCCTT GAAGTTTATC CAACTTTTTG TATACTATGA TATTCTACTT TTAGAGATAA TTAAATTATT ATATAGTACA ATGTCATTTG GTAAGCTTAA TGGGAGTAAT TTAAATTATT  TTAAAAAAAT TGAAAATATT CAAAGGTGCT TTCTGAAGAA CACATGGGTT TGTCCATAAA ATTTTATGAT TCGTAAATGT TTTCTCTTAT AAACGTAGTT GGAAGATAGT TAGAAATACT  TGTAACCATT TTAGAAGCCG TCACAGAAAA TATAAGATCG ACTAATTAAA TTGAGAAAAT GATTAATGCA GGGTTGTGAT GGATCTGTGT TGCTTGAGGG ATCAGCCAGC GGACCAAGTG  AGCAGGATGC ACCTCCCAAC CTAAGCTTGA GGGCGAAGGC CTTTGAGATC ATCAATGACC TCCGCGACCG CGTTCACAAG AAGTGTGGAA GGGTCGTCTC TTGTTCTGAT ATCGTCGCCC  TCGCTGCTAG GGATTCTGTT TTCCTGGTAA TTTTTATATT TATTGATTGC CTAAATATTA TTATTTTCAC GACAGCTTTA ATTATCTTTT TCTAAAGCTG AAATTGCACG GCAATAAACC  CTATTTTTCA AAGCTTTTGA CTAAACTAAA GTATGATTTA ATGGAAAGAT ATCATCATTT CTTAGAACTC GGATCAATGA TCTGACCTTT AAAATTGATC AAAACAGTCA AATTATTAGA  ACTTTTAAAT TTTTTTACTA ACTTTTCAAT TTTAACTTGA TAAATTTTAA AAACTCGGAT CACAGATCTT TGGACTTTAG AGAATCCTTT CCAATTGATA ACTTGACCAT AGTGATGGAT  GTGGATATTT CGTTCCACTG GAATACTTGC TTTTACGTAG GAAATTTCAT TGATGACTTT TCGCTCTTTT TTCTCTTCTT TAAATTACAA GAATGCTTTT AGATTTTTCC TTTTCATTTT  TTAATTAAAG GCGCGTTCCA ACCATACATA TTGATATGAG AAAGAATAAT GCTTGTATTC TTTCGTGAAA CATATTTGTT TTCTCACTTA TGGGTAATGC TTTTTAATTG TATGAACAAT  AAATTTGGAA TTGTTCATTC TCTTTATTAT CATCAAAAAT TCATATTTAT AAAAATTAGT CATTTATATC TATCAAACAA ATAGATAATT TATACCAAAT CCGTTCACTT ATTGATGCAT  ATGATTATTA ACCGATCTTC AAATTAAATA ATATTTTACA GATATAATTT TTAGATGATT GTAAAAATGT AAAATATTCG ATTATAAGGT TCGTACGGAG AGATAATTTC ATTATAAAGG  AGGGTTTCCG GGAAACACAT GCAAGAATTT GTGTGGTGCA GATGTTTTTG ACAGAAGCGG ATACCTTCCC TGTTGTCCTT ATCGAACAAC CAACTGCATT CAATGTTCTA AAATATCTTA  CCATAGATCC CAGGGAACTA TTACTCTACA TGGTTCAATA TAGTTGGCTG TAAGTGGATA AATGATAATC AATATCTGCA TGTTAGCAAT TTTCTGGACA TTTATACATC CCATGCCATA  AGAGGTAGAA AAACTTAGAT ACAACGGATT CCATCACAGG TGTCATGATC AAATTTATAT ATTTATTGTT TTATTGAACG GAACTTGATG TTGACGGTAA ACCTGTTCCG TATAAATTAT  TTTCATAAGA GAAAGATATC ACAATCCTGT ATGCTACTGT GACATTACTA AAGGCTGGTT TGGTATTGCT GTATTTTGAA AAAAAAGCTG CTTCTCTGTG TTGTGAGAAT AAACGGCTGT  GAAATAAAGC AGTAGAGTGT TTGTTAAATT TTTTTGTAAA AATGCTTTTG AAAAAAAAAG TAGTATTAAT GTGGTAAACT TTTATGTAAA ACAAATGTGA AAAAAATCGG TTTTTCAAAG  CTGATTTTGC AGCTTCTTGT TTTTGGTTTT TTTTTACCCA AAATTGTGAA AAAAAAACTG AAGCTGAATG TTTACCAAAC ACAAAAAAAC TCTCAGCTTT TTTTATACCA ACTTTTTTCA  GAATACTTTA GTACCAAACA AATCAGACCT AAGTAATACT ACAGTAGTTT ATACGATTGT TGAACTCTAG ATGATAAATG TGATATCATT GCCTAGTTAG ACTCCTTCCA AGTGTTACTT  ATCTTATGCT TTGATATAAA CATTTTTAAA TGATTTACCT TCATGGATCT CATCTCATGG GCATCTGAAT GAACTAGTTA ATTCATTTCC ATATCCCCAG TCCATGTGTT ATAATTTAAA  TTAAAAAGTG TTCCCGTTTG TGGAGTTGGT AGAACCTTTA ATATATCACA ACAATATAGA AATATAAGAG AATCAAGACA CATGATAATC TATTGCATAT TTTTCGTTTT TACATTTTCC  TCTAGCACAT GACTATCTGT TTTTTAATTG TTTTACTTGA CAAGTAGTTA GTAGCTTTAC TTAATTAATG TAGTAGTTGG AGTGGTGTTA CTTTTTCATA TTAATGTACG AACCACTGAA  GATGCCCACG ATTAGGAACA AGTAGAAATT GTTAAATCTT AAACAATGAC CAAGACATTC TCTTTGGCGT GTACACATAA AATTTTAGCA CTAATTAAAT CTCTAATATT CCGCCACTTA  GAGCATTTCG ATGCAATCCA ATTGATGTTA AAGAAAATGG GACAATCCAT TGAATTATCT AAGGGCTTTA AATGACAAGA ATTTAATACT CCAGAGTACT AAAATGTCAC TCGAAACTTT  TTGTTACATG ATTAAGCGTT TGTTTTGAAT ATTGTTGATG CAGTCAGGTG GCCCGGACTA TGATGTGCCC TTGGGAAGAA AGGATGGACT AAACTTTGCC ACACAAAATG CAACCCTAGC  AAACCTTCCC GGACCAACCA GTAACACAAC CAAGCTTCTA ACAGATCTTG CCAAGAAAAA CTTAGATGCC ACTGATGTTG TAGCCCTGTC TGGAGGTCAC ACCATTGGCC TCAGCCATTG  TTCCTCCTTC ACCGGCAGGC TCTATCCGAC GCAAGATGCT ACCATGGACA AAACCTTTGC AAATGACCTC AAAACAGTTT GCCCTGCAAG CGATACTAAC GCTACCGTCC CGCAAGATAT  CCGTACCCCT GACATATTCG ACAACAAGTA CTATGTTGAT CTCATGAACC GCCAAGGTTT ATTCACGTCG GACCAAGATT TGTACACCGA TAAGAGGACT AAGGAAATTG TGAAAAGCTT  TGCCGTTAAC CAGACCTTGT TCTTTGAGCA GTTTGTCAAG TCCATGATCA AGATGGGGCA ACTTAGCGTG TTGACTGGCT CCAAGGGCGA AATTCGTGCA GATTGCTCGG TCAGGAATTC 
GGACAATGCT AACTACTTGG CCTCTGTGGT GGAAGATGAT GAGAGCTTGT CTGAGTTTTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TAACCTCTCT GCTTCTGGTT TCATCTCTTT TCCTTTCTTC CTTCTTTTGT GTCTCGGAGG CACAGTCCTC TGCCCCCGTG GTTCAAGGAC TTTCATGGAA CTTCTATGAG  TCTAGCTGCC CTAAGGTTGA CGACATAGTC CGAAAGCAGC TTAAGAAAGT CTTCAAAGCG GACATTGGCC AAGCTGCTGG CTTGCTCCGT CTCCATTTCC ACGATTGTTT TGTTCAGTGT  GATGGATCTG TGTTGCTTGA GGGATCAGCC AGCGGACCAA GTGAGCAGGA TGCACCTCCC AACCTAAGCT TGAGGGCGAA GGCCTTTGAG ATCATCAATG ACCTCCGCGA CCGCGTTCAC  AAGAAGTGTG GAAGGGTCGT CTCTTGTTCT GATATCGTCG CCCTCGCTGC TAGGGATTCT GTTTTCCTGT GGATAAAGGA TGGACTAAAC TTTGCCACAC AAAATGCAAC CCTAGCAAAC  CTTCCCGGAC CAACCAGTAA CACAACCAAG CTTCTAACAG ATCTTGCCAA GAAAAACTTA GATGCCACTG ATGTTGTAGC CCTGTCTGGA GGTCACACCA TTGGCCTCAG CCATTGTTCC  TCCTTCACCG GCAGGCTCTA TCCGACGCAA GATGCTACCA TGGACAAAAC CTTTGCAAAT GACCTCAAAA CAGTTTGCCC TGCAAGCGAT ACTAACGCTA CCGTCCCGCA AGATATCCGT  ACCCCTGACA TATTCGACAA CAAGTACTAT GTTGATCTCA TGAACCGCCA AGGTTTATTC ACGTCGGACC AAGATTTGTA CACCGATAAG AGGACTAAGG AAATTGTGAA AAGCTTTGCC  GTTAACCAGA CCTTGTTCTT TGAGCAGTTT GTCAAGTCCA TGATCAAGAT GGGGCAACTT AGCGTGTTGA CTGGCTCCAA GGGCGAAATT CGTGCAGATT GCTCGGTCAG GAATTCGGAC 
AATGCTAACT ACTTGGCCTC TGTGGTGGAA GATGATGAGA GCTTGTCTGA GTTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TAACCTCTCT GCTTCTGGTT TCATCTCTTT TCCTTTCTTC CTTCTTTTGT GTCTCGGAGG CACAGTCCTC TGCCCCCGTG GTTCAAGGAC TTTCATGGAA CTTCTATGAG  TCTAGCTGCC CTAAGGTTGA CGACATAGTC CGAAAGCAGC TTAAGAAAGT CTTCAAAGCG GACATTGGCC AAGCTGCTGG CTTGCTCCGT CTCCATTTCC ACGATTGTTT TGTTCAGTGT  GATGGATCTG TGTTGCTTGA GGGATCAGCC AGCGGACCAA GTGAGCAGGA TGCACCTCCC AACCTAAGCT TGAGGGCGAA GGCCTTTGAG ATCATCAATG ACCTCCGCGA CCGCGTTCAC  AAGAAGTGTG GAAGGGTCGT CTCTTGTTCT GATATCGTCG CCCTCGCTGC TAGGGATTCT GTTTTCCTGT GGATAAAGGA TGGACTAAAC TTTGCCACAC AAAATGCAAC CCTAGCAAAC  CTTCCCGGAC CAACCAGTAA CACAACCAAG CTTCTAACAG ATCTTGCCAA GAAAAACTTA GATGCCACTG ATGTTGTAGC CCTGTCTGGA GGTCACACCA TTGGCCTCAG CCATTGTTCC  TCCTTCACCG GCAGGCTCTA TCCGACGCAA GATGCTACCA TGGACAAAAC CTTTGCAAAT GACCTCAAAA CAGTTTGCCC TGCAAGCGAT ACTAACGCTA CCGTCCCGCA AGATATCCGT  ACCCCTGACA TATTCGACAA CAAGTACTAT GTTGATCTCA TGAACCGCCA AGGTTTATTC ACGTCGGACC AAGATTTGTA CACCGATAAG AGGACTAAGG AAATTGTGAA AAGCTTTGCC  GTTAACCAGA CCTTGTTCTT TGAGCAGTTT GTCAAGTCCA TGATCAAGAT GGGGCAACTT AGCGTGTTGA CTGGCTCCAA GGGCGAAATT CGTGCAGATT GCTCGGTCAG GAATTCGGAC 
AATGCTAACT ACTTGGCCTC TGTGGTGGAA GATGATGAGA GCTTGTCTGA GTTTTAA 

Retrieve as FASTA