Entry information : AeuRboh03_Ae201684 (Ae201684_16673.1)
Entry ID 12901
Creation 2014-03-26 (Catherine Mathe)
Last sequence changes 2014-03-26 (Catherine Mathe)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AeuRboh03_Ae201684 (Ae201684_16673.1)
Name (synonym) AeuRboh03_Ae201684 (Ae201684_16673.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Eukaryota Saprolegniaceae Aphanomyces
Organism Aphanomyces euteiches    [TaxId: 100861 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AeuRboh03_Ae201684
start..stop
S start..stop
PraRboh02 879 0 162..865 2..705
PiRboh02 875 0 162..865 2..705
PiRboh01 870 0 175..865 179..868
PraRboh01 869 0 175..865 182..871
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 245845..248442 2598  
join(245845..248442)


exon

Literature and cross-references AeuRboh03_Ae201684 (Ae201684_16673.1)
Protein sequence: AeuRboh03_Ae201684 (Ae201684_16673.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   866
PWM (Da):   %s   97476.54 Transmb domain:   %s   i350-372o486-508i521-543o
PI (pH):   %s   8.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MATRAAPDRR KIKSNLSFIN EGEEKNASFY NRPRPTGRGA APGGDTVINV STEYNESITP QTPQLLRPMG PSSVTSSRIS SYHKSPHSTR TSFMLQSSAL HGRLSTMSWN DGILGGEVGR  TPVLGESKQS SMFSFDSSTS ALDSRQYRGG AKSHLLSSVR SSHDLESIRG MKPSMAKLHA LRDLLGSISD VHGHIDRETF SHTFDIADTT AFGNDKGVID AKTLLVESCV ELDIEEEEKL  IFIFETLDVE GRGFITRAQL ASLLEANFAS FKLVAVGTNF SEMAAALFVK SRITVDKMSY PQFREVFGPF LTTIEEEDDE GEANFASQKP DPDEGRSKLS IFYERNHLRI LWLILYFLLN  AIVFLYKWQM YAVDPALGYG IKIARGCAQV CMLNFGIVLL PMCRSVIQAM KRSPLLWHMI PFDDHIEFHK IVGTVLLTAG LIHTGAHVAN EINLYCIATP DQIARSIFVT RNVSMFAHGR  PPFTSMLLAL PVWTGVILLL ITLIAFPLAA IPKFRQGNFN LFWYSHMLFF PFMLFACVHG LTGWLSKPQS FFWIGPPLLL YLLERRLRFT KMFTTPLKIV RAQMLDGTVA LYIEKPRRFH  YRPGMYLYLN VPALSSHEWH PFTISSAPGD QYISLHIRNA GDWTQALHRL INKVHKNGDA YPPVHIDGPV GAPTQDYHRF KTIVMIGGGI GVTPFASILK DIVYMWEDYR CLNCQHVRHP  ASFQIQKMYF HWVTRGQESL GWFQETMNSI TEMDKDNIIE VHQYLSTVKT TDKTAQLKMI QAVVHDATGR DVVSGLNSKQ MAHFGRPNWD AIFSTLARKH RGEEVGVFFC GPHALDKILS 
DMCHKYSSDP DTGGVYFDYH SEKFA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron). scaffold63:245845..248442
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGACTC GCGCCGCGCC GGATCGGCGA AAGATCAAGA GCAATTTATC CTTCATCAAT GAAGGCGAAG AGAAGAATGC CTCGTTTTAC AACCGTCCCC GCCCGACAGG TCGAGGGGCT  GCTCCTGGGG GCGATACGGT CATCAATGTA TCGACCGAAT ACAACGAATC GATCACCCCA CAAACGCCAC AGCTTCTACG ACCGATGGGT CCATCCTCGG TAACAAGCTC ACGAATCAGT  AGCTATCACA AGTCGCCCCA TTCCACAAGG ACATCCTTCA TGCTCCAATC GAGCGCCCTC CATGGACGCT TGTCAACAAT GTCGTGGAAC GATGGGATCC TCGGTGGCGA AGTTGGACGC  ACCCCCGTCT TGGGGGAGAG CAAACAGAGC TCAATGTTCT CGTTCGACTC GTCGACGTCA GCCCTTGATA GCAGACAGTA TCGAGGAGGT GCGAAGTCTC ACCTCCTAAG CTCTGTGCGG  AGCTCCCATG ACCTGGAGAG TATCCGCGGC ATGAAGCCTT CCATGGCAAA ACTTCATGCC TTGCGTGATT TGCTGGGAAG CATCTCTGAT GTTCACGGCC ACATTGACCG AGAGACGTTT  TCGCACACGT TTGACATTGC AGATACGACC GCCTTCGGCA ACGACAAGGG GGTGATTGAT GCCAAGACGT TGCTTGTCGA ATCCTGTGTC GAACTCGACA TTGAAGAGGA AGAGAAGCTC  ATTTTCATCT TTGAAACGCT TGATGTGGAA GGCCGTGGAT TCATCACACG AGCTCAACTC GCCTCCTTGC TTGAAGCCAA CTTTGCGTCG TTCAAGCTTG TGGCTGTCGG AACCAACTTT  TCTGAAATGG CTGCTGCTCT CTTTGTCAAA TCGCGCATTA CGGTCGACAA GATGAGCTAC CCTCAATTCC GTGAAGTCTT TGGTCCCTTT TTGACTACCA TCGAGGAAGA AGATGACGAA  GGTGAAGCCA ACTTTGCGTC GCAAAAGCCC GATCCTGATG AGGGACGAAG CAAGTTGTCT ATCTTTTATG AACGCAACCA CCTGCGCATC CTCTGGCTCA TCCTCTACTT CCTCCTCAAT  GCCATTGTGT TCCTCTACAA GTGGCAAATG TACGCTGTTG ATCCTGCCCT TGGCTACGGT ATCAAGATTG CTCGTGGTTG TGCTCAAGTG TGTATGCTCA ACTTTGGTAT TGTCCTCTTG  CCCATGTGCC GATCGGTAAT CCAAGCCATG AAGCGCAGTC CGCTTCTCTG GCATATGATT CCATTTGACG ACCATATCGA GTTCCACAAG ATTGTTGGCA CGGTTCTCTT GACGGCGGGT  TTGATTCACA CGGGGGCTCA CGTCGCCAAC GAAATCAATC TGTACTGCAT CGCGACCCCC GACCAAATCG CTCGATCGAT CTTTGTCACG CGCAATGTGA GCATGTTTGC CCATGGCCGG  CCTCCGTTTA CTTCGATGTT GCTTGCTCTC CCAGTGTGGA CTGGTGTGAT CCTCCTCCTC ATCACTTTGA TTGCATTCCC CCTTGCAGCG ATTCCCAAGT TTCGCCAAGG CAATTTCAAT  CTCTTCTGGT ATAGCCACAT GCTCTTCTTT CCGTTCATGC TGTTTGCTTG TGTCCATGGC TTGACGGGCT GGCTCTCGAA GCCCCAATCG TTCTTTTGGA TCGGACCTCC GCTCCTCCTG  TACCTCTTGG AACGCCGCCT TCGCTTTACA AAGATGTTCA CCACACCTCT TAAGATTGTC CGTGCTCAAA TGCTTGATGG CACCGTCGCC TTGTACATTG AAAAGCCACG ACGATTCCAC  TACCGTCCTG GCATGTACTT GTACTTGAAC GTCCCGGCGT TGAGCTCCCA CGAGTGGCAT CCGTTCACCA TCTCATCAGC CCCTGGCGAT CAGTACATCA GCTTGCATAT TCGCAATGCT  GGTGACTGGA CTCAGGCTCT CCATCGATTG ATCAACAAAG TCCACAAGAA CGGCGACGCG TACCCACCCG TGCACATTGA TGGCCCCGTG GGAGCCCCTA CGCAAGACTA CCATCGATTC  AAGACGATTG TCATGATCGG CGGTGGTATT GGTGTGACTC CGTTTGCGTC CATTTTGAAG GATATCGTGT ATATGTGGGA AGACTACCGC TGCCTCAATT GCCAACACGT GCGCCACCCT  GCTTCGTTTC AAATCCAAAA GATGTACTTT CACTGGGTTA CGCGTGGCCA AGAGTCGCTT GGGTGGTTCC AGGAGACAAT GAACTCGATC ACTGAGATGG ACAAGGACAA TATCATTGAA  GTCCATCAGT ATTTGAGTAC CGTCAAGACG ACCGACAAGA CGGCCCAGCT CAAGATGATC CAAGCTGTTG TGCACGATGC CACCGGTCGA GATGTTGTCT CGGGCCTCAA CTCCAAGCAA  ATGGCACACT TTGGGCGACC CAATTGGGAC GCCATCTTTT CAACCCTGGC ACGTAAGCAC CGTGGCGAAG AAGTCGGCGT ATTCTTCTGT GGCCCGCACG CCCTGGACAA AATCCTCAGT 
GATATGTGTC ACAAGTACTC CTCCGATCCC GATACAGGCG GCGTCTACTT TGACTACCAC TCGGAAAAGT TTGCATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGACTC GCGCCGCGCC GGATCGGCGA AAGATCAAGA GCAATTTATC CTTCATCAAT GAAGGCGAAG AGAAGAATGC CTCGTTTTAC AACCGTCCCC GCCCGACAGG TCGAGGGGCT  GCTCCTGGGG GCGATACGGT CATCAATGTA TCGACCGAAT ACAACGAATC GATCACCCCA CAAACGCCAC AGCTTCTACG ACCGATGGGT CCATCCTCGG TAACAAGCTC ACGAATCAGT  AGCTATCACA AGTCGCCCCA TTCCACAAGG ACATCCTTCA TGCTCCAATC GAGCGCCCTC CATGGACGCT TGTCAACAAT GTCGTGGAAC GATGGGATCC TCGGTGGCGA AGTTGGACGC  ACCCCCGTCT TGGGGGAGAG CAAACAGAGC TCAATGTTCT CGTTCGACTC GTCGACGTCA GCCCTTGATA GCAGACAGTA TCGAGGAGGT GCGAAGTCTC ACCTCCTAAG CTCTGTGCGG  AGCTCCCATG ACCTGGAGAG TATCCGCGGC ATGAAGCCTT CCATGGCAAA ACTTCATGCC TTGCGTGATT TGCTGGGAAG CATCTCTGAT GTTCACGGCC ACATTGACCG AGAGACGTTT  TCGCACACGT TTGACATTGC AGATACGACC GCCTTCGGCA ACGACAAGGG GGTGATTGAT GCCAAGACGT TGCTTGTCGA ATCCTGTGTC GAACTCGACA TTGAAGAGGA AGAGAAGCTC  ATTTTCATCT TTGAAACGCT TGATGTGGAA GGCCGTGGAT TCATCACACG AGCTCAACTC GCCTCCTTGC TTGAAGCCAA CTTTGCGTCG TTCAAGCTTG TGGCTGTCGG AACCAACTTT  TCTGAAATGG CTGCTGCTCT CTTTGTCAAA TCGCGCATTA CGGTCGACAA GATGAGCTAC CCTCAATTCC GTGAAGTCTT TGGTCCCTTT TTGACTACCA TCGAGGAAGA AGATGACGAA  GGTGAAGCCA ACTTTGCGTC GCAAAAGCCC GATCCTGATG AGGGACGAAG CAAGTTGTCT ATCTTTTATG AACGCAACCA CCTGCGCATC CTCTGGCTCA TCCTCTACTT CCTCCTCAAT  GCCATTGTGT TCCTCTACAA GTGGCAAATG TACGCTGTTG ATCCTGCCCT TGGCTACGGT ATCAAGATTG CTCGTGGTTG TGCTCAAGTG TGTATGCTCA ACTTTGGTAT TGTCCTCTTG  CCCATGTGCC GATCGGTAAT CCAAGCCATG AAGCGCAGTC CGCTTCTCTG GCATATGATT CCATTTGACG ACCATATCGA GTTCCACAAG ATTGTTGGCA CGGTTCTCTT GACGGCGGGT  TTGATTCACA CGGGGGCTCA CGTCGCCAAC GAAATCAATC TGTACTGCAT CGCGACCCCC GACCAAATCG CTCGATCGAT CTTTGTCACG CGCAATGTGA GCATGTTTGC CCATGGCCGG  CCTCCGTTTA CTTCGATGTT GCTTGCTCTC CCAGTGTGGA CTGGTGTGAT CCTCCTCCTC ATCACTTTGA TTGCATTCCC CCTTGCAGCG ATTCCCAAGT TTCGCCAAGG CAATTTCAAT  CTCTTCTGGT ATAGCCACAT GCTCTTCTTT CCGTTCATGC TGTTTGCTTG TGTCCATGGC TTGACGGGCT GGCTCTCGAA GCCCCAATCG TTCTTTTGGA TCGGACCTCC GCTCCTCCTG  TACCTCTTGG AACGCCGCCT TCGCTTTACA AAGATGTTCA CCACACCTCT TAAGATTGTC CGTGCTCAAA TGCTTGATGG CACCGTCGCC TTGTACATTG AAAAGCCACG ACGATTCCAC  TACCGTCCTG GCATGTACTT GTACTTGAAC GTCCCGGCGT TGAGCTCCCA CGAGTGGCAT CCGTTCACCA TCTCATCAGC CCCTGGCGAT CAGTACATCA GCTTGCATAT TCGCAATGCT  GGTGACTGGA CTCAGGCTCT CCATCGATTG ATCAACAAAG TCCACAAGAA CGGCGACGCG TACCCACCCG TGCACATTGA TGGCCCCGTG GGAGCCCCTA CGCAAGACTA CCATCGATTC  AAGACGATTG TCATGATCGG CGGTGGTATT GGTGTGACTC CGTTTGCGTC CATTTTGAAG GATATCGTGT ATATGTGGGA AGACTACCGC TGCCTCAATT GCCAACACGT GCGCCACCCT  GCTTCGTTTC AAATCCAAAA GATGTACTTT CACTGGGTTA CGCGTGGCCA AGAGTCGCTT GGGTGGTTCC AGGAGACAAT GAACTCGATC ACTGAGATGG ACAAGGACAA TATCATTGAA  GTCCATCAGT ATTTGAGTAC CGTCAAGACG ACCGACAAGA CGGCCCAGCT CAAGATGATC CAAGCTGTTG TGCACGATGC CACCGGTCGA GATGTTGTCT CGGGCCTCAA CTCCAAGCAA  ATGGCACACT TTGGGCGACC CAATTGGGAC GCCATCTTTT CAACCCTGGC ACGTAAGCAC CGTGGCGAAG AAGTCGGCGT ATTCTTCTGT GGCCCGCACG CCCTGGACAA AATCCTCAGT 
GATATGTGTC ACAAGTACTC CTCCGATCCC GATACAGGCG GCGTCTACTT TGACTACCAC TCGGAAAAGT TTGCATAG 

Retrieve as FASTA