Entry information : CbraAPx01 (g540.t1 / CHBRA100g00470)
| Entry ID | 12952 |
|---|---|
| Creation | 2014-09-09 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2016-02-16 (Achraf Jemmat) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2016-06-08 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CbraAPx01 (g540.t1 / CHBRA100g00470)
| Name (synonym) | CbraAPx01 (g540.t1 / CHBRA100g00470) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Charophyceae Characeae Chara | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Chara braunii [TaxId: 69332 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '12952' 'complement(join(1538406..1538564,1546940..1547041,1548185..1548289,1551162..1551239,1552199..1552273,1555675..1555761,1557001..1557068,1559773..1559860,1564009..1564137,1565602..1565769,1581041..1581298))' |
Exons►
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Literature and cross-references CbraAPx01 (g540.t1 / CHBRA100g00470)
Protein sequence: CbraAPx01 (g540.t1 / CHBRA100g00470)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from RNA seq and genomic (scaffold_100, 10 introns). First and last introns are very long (undetermined nucleotides) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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