Entry information : LePrx77 (Solyc04g064690.2.1[2.3])
Entry ID 12972
Creation 2014-10-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-10-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-10-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx77 (Solyc04g064690.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx77 (Solyc04g064690.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx015]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Fruits
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx77
start..stop
S start..stop
StPrx45 667 0 1..334 48..381
GhPrx05 415 1e-146 17..332 10..323
NtPrx81-1A 398 3e-140 17..331 7..320
CcampPrx36 398 4e-140 14..332 7..323
Literature and cross-references LePrx77 (Solyc04g064690.2.1[2.3])
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Les.23932
Protein sequence: LePrx77 (Solyc04g064690.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334
PWM (Da):   %s   36578.54  
PI (pH):   %s   6.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALFNKDAKS FIKLISIICF LQISALNGQL RVGFYSESCH NVESIVSSMV KEASQREPRM PAILLRLHFH DCFVQGCDGS ILIDNVKEAE KNAFGHEGLG GFAEIQKAKT QLEVQCPGVV  SCADIVALAA RDAVVMAGGE SYEVETGRRD GRVSDLSFAS KMPDVDDSIE VLKEKFKTKG FSEKDLVTLS GAHTIGTTAC FFMPKRLYNF TGKSDADPSI NPKFLSELRS KCPKNGDVNV 
RISLDNLSER KFDDQIMHNI KNGFAVIASD ARLYDDNATR AVVDSYLEIT EKLNPNSSSF GTDFGLAMVK LGRLEVKTGL LGEIRKVCNS FNKM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo4, 3 introns) and 3 ESTs. Incorrect prediction from Phytozome: extra intron just after GEIR.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTGT TCAACAAAGA TGCAAAGAGT TTTATAAAAT TAATTTCAAT AATTTGTTTC CTACAAATAT CAGCTCTAAA TGGACAACTT AGAGTTGGGT TTTATTCTGA AAGTTGTCAT  AATGTAGAGT CCATTGTTAG TTCTATGGTT AAAGAAGCTT CACAAAGAGA ACCAAGAATG CCAGCCATCT TACTACGACT TCATTTCCAT GATTGCTTTG TTCAGGTTCT TTCTTATGTT  TTAAAAACTA ATTTTTAGTA TGTCAATTTT AACTCTTTCT GATTTTCATG TTGATTGGAA AATGGATTCA TATTTTGCTG ACATGGTCTT GGATAATTTT TGTACTGAGT TAGACATAAG  TGTCATATCT AAGCCAAGAT TCATTTTTGT TTGACTTTTG GTCCACACTT CAATAGGTCT GGGCATGAAA GATGTCAGAG TGATTTAGAC TTATAGTTTT GTTTATATAT TATGTATTTT  GAATCGTTCC TTTTTATGCG TTGATATATA AGGTTGAGTT AGACCTAACT ATCATATCTT ATATATAGTA TTGGAGTCTA GCCGATTCCT ATTTTGACTA CATACTAGTT CATACTTCAG  TGTGTTGGAA TTTCAAGCTA TTAAAAAATA GATCGATGAT TTGCTTATAT AGAATTGAAT ATTTTTTCTT TCTGAGCTCT TTTTTGGTTG AGTTAGAAAT AAATTGATTA TAATAATTTA  TACTATTATT TGTACCAAGA ACCTTAATTC TTCTTTTTGA AATGTGTTAG AAGGGTTGTG ATGGATCAAT TTTGATCGAT AATGTTAAAG AAGCTGAAAA AAATGCATTT GGTCATGAAG  GACTTGGAGG ATTTGCTGAG ATTCAGAAAG CCAAAACTCA ATTGGAAGTT CAATGTCCTG GTGTTGTATC TTGTGCTGAT ATTGTCGCTT TAGCGGCTAG AGACGCTGTC GTCATGGTAA  TACTATAGTA CTATTTTAAA ATTTTTTATG CATATATATT TTTTTGTGTG AGTTTTTTTT TTAATTTTGT AACAAAATTT CTAACTCCGT CAGGCTGGCG GAGAATCTTA TGAAGTAGAG  ACAGGTAGAA GAGATGGAAG AGTATCAGAT TTGTCATTTG CATCCAAAAT GCCAGATGTG GATGACTCAA TTGAAGTTCT CAAAGAAAAA TTCAAAACCA AAGGCTTTAG TGAGAAGGAT  CTCGTCACTT TGAGTGGTAT GTATGATGAT CATATAATTT TTCATCGTTA ACTAAAGATC TTGAATTTAA ATTCTAAGAA TCAATCAAAA AATAACTTTT GATAGAAAGT GTTTCCTTTT  TTAATAAATC TTACGTGATA CAAATCTGAA TTAGCCAATT CATGCTAGAA TAAATATATT TGACCAAGAC TAATAGTGCT TTACTGAAAA GGACAACATT ACTATAATAT ATTTAACGTA  ACGGACCACT TTGACACTAA CATTTTGTTT TCTAGCTACA ACAATGTCAT ACATTTTTGT CACTTTATTA TGATAACTTT TAACATATTA AAGTTTAAAC GTCTTTCATA ATTTAAGACT  CTGCCTTTAT TCCTGGTTCT ACCTCTAATC CTGGCTCTGC CTCGATCTGT TTTAAACATC TTGTAGGGGC ACATACAATT GGCACAACAG CTTGTTTTTT CATGCCTAAA AGACTATACA  ATTTTACTGG AAAATCAGAT GCAGATCCAA GTATAAATCC TAAATTCCTC TCAGAATTAA GAAGCAAATG TCCCAAAAAT GGGGACGTAA ACGTTCGAAT ATCGCTCGAT AACCTAAGTG  AAAGAAAATT TGATGATCAA ATAATGCACA ACATAAAGAA TGGATTTGCA GTTATAGCAT CAGATGCAAG GCTTTATGAT GATAATGCTA CAAGAGCAGT GGTTGATTCT TATCTTGAGA  TTACAGAGAA ATTAAATCCC AATTCATCTT CATTTGGGAC TGATTTTGGT TTAGCAATGG TTAAATTGGG AAGGCTTGAG GTTAAGACTG GATTACTAGG AGAGATTAGA AAGGTTTGTA 
ATTCTTTTAA TAAAATGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTGT TCAACAAAGA TGCAAAGAGT TTTATAAAAT TAATTTCAAT AATTTGTTTC CTACAAATAT CAGCTCTAAA TGGACAACTT AGAGTTGGGT TTTATTCTGA AAGTTGTCAT  AATGTAGAGT CCATTGTTAG TTCTATGGTT AAAGAAGCTT CACAAAGAGA ACCAAGAATG CCAGCCATCT TACTACGACT TCATTTCCAT GATTGCTTTG TTCAGGGTTG TGATGGATCA  ATTTTGATCG ATAATGTTAA AGAAGCTGAA AAAAATGCAT TTGGTCATGA AGGACTTGGA GGATTTGCTG AGATTCAGAA AGCCAAAACT CAATTGGAAG TTCAATGTCC TGGTGTTGTA  TCTTGTGCTG ATATTGTCGC TTTAGCGGCT AGAGACGCTG TCGTCATGGC TGGCGGAGAA TCTTATGAAG TAGAGACAGG TAGAAGAGAT GGAAGAGTAT CAGATTTGTC ATTTGCATCC  AAAATGCCAG ATGTGGATGA CTCAATTGAA GTTCTCAAAG AAAAATTCAA AACCAAAGGC TTTAGTGAGA AGGATCTCGT CACTTTGAGT GGGGCACATA CAATTGGCAC AACAGCTTGT  TTTTTCATGC CTAAAAGACT ATACAATTTT ACTGGAAAAT CAGATGCAGA TCCAAGTATA AATCCTAAAT TCCTCTCAGA ATTAAGAAGC AAATGTCCCA AAAATGGGGA CGTAAACGTT  CGAATATCGC TCGATAACCT AAGTGAAAGA AAATTTGATG ATCAAATAAT GCACAACATA AAGAATGGAT TTGCAGTTAT AGCATCAGAT GCAAGGCTTT ATGATGATAA TGCTACAAGA  GCAGTGGTTG ATTCTTATCT TGAGATTACA GAGAAATTAA ATCCCAATTC ATCTTCATTT GGGACTGATT TTGGTTTAGC AATGGTTAAA TTGGGAAGGC TTGAGGTTAA GACTGGATTA 
CTAGGAGAGA TTAGAAAGGT TTGTAATTCT TTTAATAAAA TGTAG 

Retrieve as FASTA