Entry information : GbPrx59
Entry ID 13151
Creation 2015-04-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-04-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx59
Name GbPrx59
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx59
start..stop
S start..stop
PtaPrx20 450 1e-160 11..328 5..325
PabPrx84 433 8e-154 9..328 3..325
PtaPrx33 426 2e-151 14..328 2..319
PabPrx137 407 9e-144 9..317 3..314
Literature and cross-references GbPrx59
Protein sequence: GbPrx59
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (70)
PWM (Da):   %s   35615.54 (7588.8)  
PI (pH):   %s   4.99 (4.96) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-98
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKAMLNCRA NLSLISFGIL CICTVSRAEL TANFYEKSCP NVLTIVREVV RRAIIDETRM AASLVRLHFH DCFVNGCDGS LLLDGTDGEK TAGPNVNSAR GFEVIDTAKT ALENACNQTV  SCADILAIAA QYSVHFSGGP TWPVLLGRRD GLTANKSGAN SGIPSPFDPL ETINSKFENV GLNATDVVIL SGAHTFGRAR CATFSSRLFD FNSTGNPDVT IETTFLSELQ SLCPQGGDSS 
TLAPLDRNSI DWFDNHYFKN LQNNIGILQS DQELYSTTDA ATKSLVDFYS SNQDSFYQDF KFSMIKLANI NPLTGTDGEI RKNCRFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no prediction from SymDB, scaffold33781) and RNA seq (gba_locus_72815_iso_1_len_320_ver_2, short 5'end and gba_locus_74026_iso_1_len_418_ver_2, fragment). No EST found.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAATAACTT ATAATAACAA TGATGATGCA TGTAATTATG AAATAAAAAA TCATTACATA TATGAAAATT AGTTATGCTT AAAAATAAGT AGAGTTTTTT TCACTTGGAT ACTAAATTTT  CACATTTTGA GAATGAGCTT TGGATAATCC TTGCTTACTA GATCAAATGA TATTTTAAAT TTATAATGAT GCATTTATAA ATGTTTGTAA TTAAAGAATA CATTGAAAAT GATTTGAAAT  ATATTTTTTA CTAATTTGAT AATGCATTTA TTTGTTGATT GTAATATAAA TAGATTAATT TCTACCTAGT GTTTAATTAT TATAATTAAT AATAATATAA CATAATAGTA TTTGTTCACT  AGTGGGACAT GATGGTGCCT AATATAGACA ACATCATACC CTTTTTGTCA TAAAATAAGA ACAAACATGG TACCACTTAG CTCACAACCT TGTTGTGCCT TTCTTTTTTT ATACATTAAA  TAAAATATGA CGTAATAACA AATAACATGT TTCATCATTG CACATCATAT GCCACATTAC AATAGAATTT ATAACTTTGG AGAGTCTAAG AAGCTTATTT AATCCACTTT ATTTATAACA  TATAATTATT TAGTGCCGCA ATGACACAAA TCTTATAAAT TGTGGTACAC ATGTGACATA TTATGTAGCA AAATTGTGGC ATATATATGA CACATAAATG CCCTAATATG ACATCTATAT  GACGCACATA TGGCATATAC AAGGCATGTA TTTGTAACTA TAATGTGGCA CATGTATACA TGATGCACAT GCACCTTGCT AACTCAAGGT ATAAATGAGT GTGGTTGTTA CATTATGACA  TATAATGTGG CATAGTGCGA TAAATATATG TGACACTATG CCACCTTTTA TGATATTCGC GTAGTAATAA AGGTGTGATA AGGAGGCATC TAGATTATAG ATTTTTTCGA ACACAAAAAT  AAATTAAAAT TGTACCGTTG ATGTGCCATA AATTGATCCC AAATTTAGCA TTGTTTCTAT AAACTAATAC TTATAATGAC TTTTGTGCAC ACACATTATC ATTTATGATC ATGAAGTATA  TTGTATGCTA TTGCTATTAA AAAAGAAAAA TAAATAGTGG CTATAGGTTA TTAAAGTAAT GGCATCTAGA TGCATAGTAC TAGAATTATA TAGATTATTA AAGTAATGGC ATCTAGATGC  ATAGTACTAG AATTATCATA GAAGAGGTCA AAAGTTGTAG TTGAATCTAT TCTTTACAAT AAAATTTGGT TTTCAATATT GGAAATAAAT AAATTAAATT TTGATGGTCC TTTAAATTAT  TTCCATGCAA GTGCGCATTG AGCTATCACC TTGCAAGTGC CTCTTGACTT ATAAAATTGG GAAAAAATGT TAATGCGATG AAACCACCTA AACACATGAA CTTGGGCTGA TAAAAAAATT  TACAAACTAA ATCTTAATAT ATCAAAGATA CGAAGAAGTC CACTATGCGA AACACGACTT TCGTCATACA ACGCAATTGT ATTTTTGGAA ATGTGGATGA ATAATAATGC TCCAATATTT  CGTTATCGTT ATCGAATAGG GAATTAGTGG GGAGGTGTTA AATCTAAGAA TTGGTGGGAC GCAATTGGTA AGAATCCGTG AAGTGATATT TTATTTGTAT ATGGTATCTC GCAATAGGTT  CGTTACAAAA GTAGCGTAAT TATTTAGTTT TGTGCTCGTG CATGTATGAC AAAAGCAATG CTTAATTGCA GAGCTAATTT GTCTTTGATA AGCTTTGGAA TACTTTGCAT TTGCACAGTC  TCAAGGGCTG AGTTGACGGC TAACTTCTAT GAGAAGTCCT GTCCAAACGT CCTCACTATC GTTCGAGAAG TTGTGAGGCG AGCAATTATA GACGAAACCC GTATGGCTGC GTCTCTCGTG  CGATTACACT TTCACGATTG TTTTGTGAAC GTGAGCACTC TCTTTACTTG GCAACAACAT ACGTCGTTTT CCTAATCATT ATTATATCGC TTACATTTAT ATTATCATTA CAATGCCCAA  CAATGTCATC AGCTAATCCT TATCGATTCT TACTTTTAAC ATCAAATGCC AAATATTAAC TGCCCTCGAG TCTCTCTTTT CTTGCTTCTA ACTTTTACGT TGCATGCCGT CTTTGGGATC  AGCTCAAGTT GATGCATAAG AAGCTCCCTG GCCATCTATT ATTGTTTTGG GTTTTTGCTT TCATATTCTC ATCATCATGT GAACAATCAT TTATTGCGTC ATGCGATGCG ATTTTCTTTG  GTAACATGTT TCTTAAATAA AACGTTTTAG TCGTTAACAC TGTTCGTAAG TTATTCTAAT GAAACTGTTT CACTGTGCCT CTGTAGGGTT GTGATGGATC TCTGTTGTTG GACGGCACGG  ATGGAGAAAA GACAGCTGGG CCAAATGTAA ATTCCGCGCG AGGGTTCGAA GTGATAGATA CAGCCAAGAC AGCTCTGGAG AACGCATGCA ACCAAACTGT TTCCTGCGCA GATATCCTCG  CTATTGCAGC GCAATACTCT GTTCACTTTG TACGTATCCA TGATTAATTT ATCGATTGAT ACACACAGTT TCCAATTATT TATATCAATT TATCAATCAA TTATTTATAA TAATTATTAC  TAATCTGTTG TCCAGAGCGG AGGTCCAACG TGGCCTGTCC TGCTAGGGAG AAGGGACGGC CTAACTGCAA ACAAGAGTGG AGCCAACAGC GGCATTCCAT CCCCGTTCGA TCCCCTAGAA  ACAATTAACT CCAAATTTGA GAACGTTGGC CTCAATGCAA CGGACGTTGT TATCTTGTCA GGTTTGTATC ATATCATCAT TTTTTAAAGT TGAACTCCGG CCAAAAAAAG GGTTTTTCTG  TTTTAAAAAA AATAAAAAAT TGATGGAGTT GCCTAAATTC AGGATGACAC TTACAATGAT CATCATTGAT ATTTGTGTCT TGTTCAGGAG CTCACACATT TGGGCGTGCC CGCTGTGCAA  CCTTTAGCAG CCGCCTATTC GATTTTAATA GCACTGGCAA CCCTGACGTG ACGATTGAAA CGACTTTTCT CTCTGAACTT CAGAGTCTTT GCCCCCAAGG TGGAGACAGC AGTACGTTGG  CACCTCTGGA TCGCAATTCA ATAGACTGGT TTGACAACCA CTATTTCAAA AATCTACAGA ACAATATTGG TATTTTGCAG TCTGATCAGG AGCTATACTC CACTACTGAC GCGGCAACTA  AATCCCTTGT AGACTTTTAT AGCAGCAATC AGGATAGTTT CTATCAAGAC TTCAAGTTCT CCATGATCAA ATTGGCAAAT ATAAATCCAC TTACTGGCAC AGATGGTGAG ATTCGGAAAA 
ATTGCAGATT TGTAAATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAAAG CAATGCTTAA TTGCAGAGCT AATTTGTCTT TGATAAGCTT TGGAATACTT TGCATTTGCA CAGTCTCAAG GGCTGAGTTG ACGGCTAACT TCTATGAGAA GTCCTGTCCA  AACGTCCTCA CTATCGTTCG AGAAGTTGTG AGGCGAGCAA TTATAGACGA AACCCGTATG GCTGCGTCTC TCGTGCGATT ACACTTTCAC GATTGTTTTG TGAACGGTTG TGATGGATCT  CTGTTGTTGG ACGGCACGGA TGGAGAAAAG ACAGCTGGGC CAAATGTAAA TTCCGCGCGA GGGTTCGAAG TGATAGATAC AGCCAAGACA GCTCTGGAGA ACGCATGCAA CCAAACTGTT  TCCTGCGCAG ATATCCTCGC TATTGCAGCG CAATACTCTG TTCACTTTAG CGGAGGTCCA ACGTGGCCTG TCCTGCTAGG GAGAAGGGAC GGCCTAACTG CAAACAAGAG TGGAGCCAAC  AGCGGCATTC CATCCCCGTT CGATCCCCTA GAAACAATTA ACTCCAAATT TGAGAACGTT GGCCTCAATG CAACGGACGT TGTTATCTTG TCAGGAGCTC ACACATTTGG GCGTGCCCGC  TGTGCAACCT TTAGCAGCCG CCTATTCGAT TTTAATAGCA CTGGCAACCC TGACGTGACG ATTGAAACGA CTTTTCTCTC TGAACTTCAG AGTCTTTGCC CCCAAGGTGG AGACAGCAGT  ACGTTGGCAC CTCTGGATCG CAATTCAATA GACTGGTTTG ACAACCACTA TTTCAAAAAT CTACAGAACA ATATTGGTAT TTTGCAGTCT GATCAGGAGC TATACTCCAC TACTGACGCG  GCAACTAAAT CCCTTGTAGA CTTTTATAGC AGCAATCAGG ATAGTTTCTA TCAAGACTTC AAGTTCTCCA TGATCAAATT GGCAAATATA AATCCACTTA CTGGCACAGA TGGTGAGATT 
CGGAAAAATT GCAGATTTGT AAATTAG 

Retrieve as FASTA