Entry information : GrPrx39 (Gorai.012G046400)
Entry ID 13270
Creation 2015-06-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx39 (Gorai.012G046400)
Name (synonym) GrPrx39 (Gorai.012G046400)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx026]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx39
start..stop
S start..stop
GhPrx39 670 0 1..323 1..323
CsPrx05 565 0 3..323 7..326
CclPrx38 559 0 11..323 1..313
MePrx119 545 0 5..323 1..318
Literature and cross-references GrPrx39 (Gorai.012G046400)
Protein sequence: GrPrx39 (Gorai.012G046400)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324
PWM (Da):   %s   35688.5 Transmb domain:   %s   i13-32o
PI (pH):   %s   5.22
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVLNLVKMIT MANLLSMFIL MEVVAGGFRF GVDGLRMDYY IMSCPFAESI VKNTVNRALQ DDPTLAAALV RMHFHDCFVE GCDGSILIDS TKDNTAEKDS PGNLSLRGYE VIDDAKEQLE  DQCPGIVSCA DIVAMAARDA IFWSEGPVYD IPKGRKDGRR SKIEDTINLP FPTFNTSELI SAFGKRGFSA QEMVALSGAH TLGVARCSSF KNRLSNADAN LDSNFAKTLS KTCSAGDNAE 
QPFDATQNTF DNFYFNALIR KSGVLFSDQV LYTTPRTRNI VNGYAMNQAM FFFDFQQAMV KMGKVDVKEG SNGEVRQNCR KIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGTTGA ACTTAGTGAA GATGATAACG ATGGCTAATC TGCTAAGTAT GTTTATATTA ATGGAGGTGG TGGCGGGTGG GTTTCGATTT GGAGTTGATG GTCTTCGCAT GGACTACTAC  ATAATGAGTT GCCCATTTGC TGAATCCATA GTGAAGAACA CTGTTAATAG AGCTTTGCAA GATGACCCAA CGTTGGCAGC AGCTTTGGTT AGGATGCATT TCCATGATTG CTTCGTTGAG  GTATCTCTTT TCTTCCTTGC TTTTCAACTT TCTTTTTTTT TCCCAATTTA TAGTAAAGTT TCAGCTTAAA TGGCATGGTA TAAATGTGTT TAATATTGGT ATTTTGGTGG GATTAGGGAT  GTGATGGCTC CATTCTGATT GACTCGACCA AGGACAACAC AGCAGAAAAA GACTCACCTG GAAACTTAAG CTTGCGAGGC TATGAAGTTA TTGATGATGC AAAGGAGCAG CTGGAAGATC  AGTGCCCTGG CATTGTCTCC TGCGCTGATA TTGTTGCAAT GGCTGCCAGA GATGCCATTT TCTGGGTAAC AATATATCTA TATAAATTTA TGGATACTAA AGTATTAATA GTAAAATTGT  ATTCTTTTGT CCCCTCTAAT AAAAAATAGA TAAATTAGTT ACTGAATGTT AAATCGAAGA GTAAATTGGT TATTTTTTAT TAAAAATTTT ATCTATTTGC ATTGTTAAAA ACTGACGTAC  TTGACGAAAT AATGTGGTTT CGTGTACTTC GTGCTACCAA TTTACTCTTT CATCAAAGAT TAATTTGCTT ATTTTTTGAA TAAAAGGATT AAAATGTAAT TCGACTCTTA ATAGAGGTGT  TTATGATACT TTTACTCATT ATCAACATGA TGGTGTTTGA GTTAATTATA ATTATAATTA TATGACAGTC AGAGGGACCT GTGTATGATA TACCAAAAGG AAGAAAAGAT GGAAGGAGGT  CCAAGATAGA AGACACCATA AACCTGCCAT TCCCCACCTT CAACACCTCA GAGCTCATCA GCGCCTTCGG CAAGCGAGGT TTCAGTGCTC AAGAAATGGT TGCTTTATCT GGTAACTAAA  TTGTGTCATA TAAAAATTAA TTTAAGTGTG GTTATCGCAC TTGATACACA GCTAAGACAT CCATCCAACT CGAGAGTGTG ATTGAATGTA ATGCAGGGGC ACATACGTTA GGAGTGGCAA  GGTGTTCATC CTTCAAAAAC AGATTGAGTA ACGCAGATGC TAACCTGGAT TCGAATTTCG CCAAGACGTT GTCCAAGACA TGCAGTGCCG GCGACAACGC AGAGCAACCG TTCGATGCCA  CGCAAAACAC CTTCGACAAC TTCTACTTCA ACGCATTGAT AAGGAAAAGT GGGGTTCTTT TCTCGGATCA AGTACTGTAT ACGACGCCGA GAACAAGAAA CATTGTGAAT GGTTACGCCA 
TGAACCAAGC TATGTTTTTC TTTGATTTCC AGCAGGCAAT GGTGAAAATG GGGAAGGTTG ATGTTAAGGA AGGATCTAAT GGGGAAGTTC GACAGAATTG CCGCAAAATT AACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGTTGA ACTTAGTGAA GATGATAACG ATGGCTAATC TGCTAAGTAT GTTTATATTA ATGGAGGTGG TGGCGGGTGG GTTTCGATTT GGAGTTGATG GTCTTCGCAT GGACTACTAC  ATAATGAGTT GCCCATTTGC TGAATCCATA GTGAAGAACA CTGTTAATAG AGCTTTGCAA GATGACCCAA CGTTGGCAGC AGCTTTGGTT AGGATGCATT TCCATGATTG CTTCGTTGAG  GGATGTGATG GCTCCATTCT GATTGACTCG ACCAAGGACA ACACAGCAGA AAAAGACTCA CCTGGAAACT TAAGCTTGCG AGGCTATGAA GTTATTGATG ATGCAAAGGA GCAGCTGGAA  GATCAGTGCC CTGGCATTGT CTCCTGCGCT GATATTGTTG CAATGGCTGC CAGAGATGCC ATTTTCTGGT CAGAGGGACC TGTGTATGAT ATACCAAAAG GAAGAAAAGA TGGAAGGAGG  TCCAAGATAG AAGACACCAT AAACCTGCCA TTCCCCACCT TCAACACCTC AGAGCTCATC AGCGCCTTCG GCAAGCGAGG TTTCAGTGCT CAAGAAATGG TTGCTTTATC TGGGGCACAT  ACGTTAGGAG TGGCAAGGTG TTCATCCTTC AAAAACAGAT TGAGTAACGC AGATGCTAAC CTGGATTCGA ATTTCGCCAA GACGTTGTCC AAGACATGCA GTGCCGGCGA CAACGCAGAG  CAACCGTTCG ATGCCACGCA AAACACCTTC GACAACTTCT ACTTCAACGC ATTGATAAGG AAAAGTGGGG TTCTTTTCTC GGATCAAGTA CTGTATACGA CGCCGAGAAC AAGAAACATT  GTGAATGGTT ACGCCATGAA CCAAGCTATG TTTTTCTTTG ATTTCCAGCA GGCAATGGTG AAAATGGGGA AGGTTGATGT TAAGGAAGGA TCTAATGGGG AAGTTCGACA GAATTGCCGC 
AAAATTAACT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGTGTATAT ATATATATGT ATCTCCAGCT AGCCTTGTAG CAAGCTAAGT GATCTCTCTT GTAGTAGTTG GTCATTGTAT ATACATAATG GTGTTGAACT TAGTGAAGAT GATAACGATG  GCTAATCTGC TAAGTATGTT TATATTAATG GAGGTGGTGG CGGGTGGGTT TCGATTTGGA GTTGATGGTC TTCGCATGGA CTACTACATA ATGAGTTGCC CATTTGCTGA ATCCATAGTG  AAGAACACTG TTAATAGAGC TTTGCAAGAT GACCCAACGT TGGCAGCAGC TTTGGTTAGG ATGCATTTCC ATGATTGCTT CGTTGAGGGA TGTGATGGCT CCATTCTGAT TGACTCGACC  AAGGACAACA CAGCAGAAAA AGACTCACCT GGAAACTTAA GCTTGCGAGG CTATGAAGTT ATTGATGATG CAAAGGAGCA GCTGGAAGAT CAGTGCCCTG GCATTGTCTC CTGCGCTGAT  ATTGTTGCAA TGGCTGCCAG AGATGCCATT TTCTGGTCAG AGGGACCTGT GTATGATATA CCAAAAGGAA GAAAAGATGG AAGGAGGTCC AAGATAGAAG ACACCATAAA CCTGCCATTC  CCCACCTTCA ACACCTCAGA GCTCATCAGC GCCTTCGGCA AGCGAGGTTT CAGTGCTCAA GAAATGGTTG CTTTATCTGG GGCACATACG TTAGGAGTGG CAAGGTGTTC ATCCTTCAAA  AACAGATTGA GTAACGCAGA TGCTAACCTG GATTCGAATT TCGCCAAGAC GTTGTCCAAG ACATGCAGTG CCGGCGACAA CGCAGAGCAA CCGTTCGATG CCACGCAAAA CACCTTCGAC  AACTTCTACT TCAACGCATT GATAAGGAAA AGTGGGGTTC TTTTCTCGGA TCAAGTACTG TATACGACGC CGAGAACAAG AAACATTGTG AATGGTTACG CCATGAACCA AGCTATGTTT  TTCTTTGATT TCCAGCAGGC AATGGTGAAA ATGGGGAAGG TTGATGTTAA GGAAGGATCT AATGGGGAAG TTCGACAGAA TTGCCGCAAA ATTAACTGAA GTTTATTATA CTAGTTTGAG 
TTCTACAGCT TGATTTTCTG TAATCTAAAT TGTATCAACC ACAAATTCTG GCATTTCTAT GTTTATGGTT ACATAAAAAC TAAATAATCC ATAAATTACT TTACCTACT 

Retrieve as FASTA