Entry information : GrPrx40 (Gorai.010G127400)
Entry ID 13273
Creation 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx40 (Gorai.010G127400)
Name (synonym) GrPrx40 (Gorai.010G127400)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx40
start..stop
S start..stop
GhPrx40 707 0 1..345 1..345
PkPrx03 485 9e-174 7..340 6..340
PtPrx01 483 4e-173 7..340 5..338
PtPrx98 482 2e-172 7..340 6..342
Literature and cross-references GrPrx40 (Gorai.010G127400)
Protein sequence: GrPrx40 (Gorai.010G127400)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (318)
PWM (Da):   %s   37195.61 (34133.0)  
PI (pH):   %s   4.46 (4.48) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTEEMPSLRC IIATLFFALL LPPGSFPATT LSPSFYDETC PTVFSIIRGI IEQALLSDPR IGASLLRLHF HDCFVNGCDA SILLDNSATI ESEKEAAPNN NSARGFEVVD AMKIALEFEC  PGIVSCADIL AIAAQEAVNL AGGPSWLVLL GRRDSTTANR TLANLAIPAA FETLDILKSK FAAVGLNTST DLVALSGAHT FGRAQCTIVI ERLYNFNGTG KADPTLNATY LETLRKVCPQ 
GGNGSVLVNL DPTTPNTFDS NYYTNLQAQE GLLQSDQELF STSGADTIEI VERFSSNQIA FFESFVVSML KMGNISPVTG TEGEIRLSCR RVHMDYTSSN KWSSS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCGAGG AAATGCCTTC TCTCCGATGT ATAATAGCAA CCCTTTTCTT CGCCCTTTTG CTCCCACCAG GATCCTTTCC AGCCACCACA TTGAGTCCAT CATTTTATGA TGAAACATGC  CCCACGGTAT TTAGCATCAT TCGAGGAATC ATCGAACAAG CTTTGCTCTC TGATCCTAGG ATTGGTGCCA GCCTTCTTAG GCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTAATGT AATAACCAAA  ACGTTTGTTT TCCTTTTACC AAATCTCTTT CTCTTCCTTC CGTTTACCTT TTCAGCCATT TCACGTATTT AGCTTAGTTA TAGCTTTATA GTTGGTAAAT GTTGTGAACA TCATATCTAC  TTTCAATTTG TTTCTTTTCT GAATATAAGG ACTGAAACAA ATTCTTTTAC AGGGCTGTGA TGCATCGATT TTATTGGACA ACAGCGCTAC CATAGAAAGC GAGAAAGAAG CTGCGCCGAA  TAATAACTCA GCAAGAGGAT TTGAGGTTGT CGATGCCATG AAGATCGCAC TAGAATTTGA GTGTCCAGGC ATCGTTTCCT GTGCTGATAT TCTTGCTATT GCAGCTCAAG AGGCTGTCAA  TCTGGTACTT ATCTTAGCCA ATTTTTTCAA ACTTTTCTTG TTTTTACCAT AGATAGGTAG AGTACCATAA AATTATCTTC CATATTGAAC AATATCACTT CAGGCGGGAG GTCCTTCATG  GCTAGTTCTA TTGGGAAGAA GGGATAGCAC AACAGCAAAT CGAACACTGG CCAATTTAGC TATTCCAGCT GCCTTTGAAA CTCTTGATAT TCTCAAGTCC AAGTTTGCAG CCGTGGGGCT  CAATACCAGT ACCGATCTGG TTGCACTTTC AGGTAGGTCT TATAATGGAT TTGATGGTTA AAAGATATAT GTATGATATG TAATAGGGAT TTTACGCAAA AATATTTTCA GGTGCTCACA  CATTTGGACG GGCTCAATGT ACGATTGTCA TTGAACGATT ATATAATTTC AATGGTACCG GAAAAGCAGA CCCGACATTG AACGCAACAT ACTTAGAGAC GCTACGCAAA GTATGCCCTC  AAGGCGGAAA TGGTAGTGTT TTGGTGAATT TAGATCCTAC AACACCTAAT ACATTCGACA GTAACTACTA CACTAACCTT CAAGCTCAAG AAGGACTGCT CCAAAGTGAT CAAGAGCTGT  TTTCTACTAG TGGAGCTGAT ACCATTGAAA TTGTGGAGAG GTTCAGCAGC AATCAAATTG CTTTCTTTGA AAGCTTTGTG GTTTCCATGC TAAAAATGGG AAATATCAGT CCAGTAACAG 
GTACGGAAGG AGAGATTAGA TTGAGTTGTA GAAGGGTTCA TATGGATTAC ACAAGTTCAA ACAAATGGAG CTCTAGCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCGAGG AAATGCCTTC TCTCCGATGT ATAATAGCAA CCCTTTTCTT CGCCCTTTTG CTCCCACCAG GATCCTTTCC AGCCACCACA TTGAGTCCAT CATTTTATGA TGAAACATGC  CCCACGGTAT TTAGCATCAT TCGAGGAATC ATCGAACAAG CTTTGCTCTC TGATCCTAGG ATTGGTGCCA GCCTTCTTAG GCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTAATGG CTGTGATGCA  TCGATTTTAT TGGACAACAG CGCTACCATA GAAAGCGAGA AAGAAGCTGC GCCGAATAAT AACTCAGCAA GAGGATTTGA GGTTGTCGAT GCCATGAAGA TCGCACTAGA ATTTGAGTGT  CCAGGCATCG TTTCCTGTGC TGATATTCTT GCTATTGCAG CTCAAGAGGC TGTCAATCTG GCGGGAGGTC CTTCATGGCT AGTTCTATTG GGAAGAAGGG ATAGCACAAC AGCAAATCGA  ACACTGGCCA ATTTAGCTAT TCCAGCTGCC TTTGAAACTC TTGATATTCT CAAGTCCAAG TTTGCAGCCG TGGGGCTCAA TACCAGTACC GATCTGGTTG CACTTTCAGG TGCTCACACA  TTTGGACGGG CTCAATGTAC GATTGTCATT GAACGATTAT ATAATTTCAA TGGTACCGGA AAAGCAGACC CGACATTGAA CGCAACATAC TTAGAGACGC TACGCAAAGT ATGCCCTCAA  GGCGGAAATG GTAGTGTTTT GGTGAATTTA GATCCTACAA CACCTAATAC ATTCGACAGT AACTACTACA CTAACCTTCA AGCTCAAGAA GGACTGCTCC AAAGTGATCA AGAGCTGTTT  TCTACTAGTG GAGCTGATAC CATTGAAATT GTGGAGAGGT TCAGCAGCAA TCAAATTGCT TTCTTTGAAA GCTTTGTGGT TTCCATGCTA AAAATGGGAA ATATCAGTCC AGTAACAGGT 
ACGGAAGGAG AGATTAGATT GAGTTGTAGA AGGGTTCATA TGGATTACAC AAGTTCAAAC AAATGGAGCT CTAGCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTTCTCCG GTTGCATGAA TCAGGTATAT ATGGAACTTA ATTTGGCCCT TTAAATAGTC TCAAATAGCA GGCCCCGGTA CTCAAATATT TAGCGGTCTA CAGGGGAAAT GACCGAGGAA  ATGCCTTCTC TCCGATGTAT AATAGCAACC CTTTTCTTCG CCCTTTTGCT CCCACCAGGA TCCTTTCCAG CCACCACATT GAGTCCATCA TTTTATGATG AAACATGCCC CACGGTATTT  AGCATCATTC GAGGAATCAT CGAACAAGCT TTGCTCTCTG ATCCTAGGAT TGGTGCCAGC CTTCTTAGGC TTCACTTCCA TGACTGCTTT GTTAATGGCT GTGATGCATC GATTTTATTG  GACAACAGCG CTACCATAGA AAGCGAGAAA GAAGCTGCGC CGAATAATAA CTCAGCAAGA GGATTTGAGG TTGTCGATGC CATGAAGATC GCACTAGAAT TTGAGTGTCC AGGCATCGTT  TCCTGTGCTG ATATTCTTGC TATTGCAGCT CAAGAGGCTG TCAATCTGGC GGGAGGTCCT TCATGGCTAG TTCTATTGGG AAGAAGGGAT AGCACAACAG CAAATCGAAC ACTGGCCAAT  TTAGCTATTC CAGCTGCCTT TGAAACTCTT GATATTCTCA AGTCCAAGTT TGCAGCCGTG GGGCTCAATA CCAGTACCGA TCTGGTTGCA CTTTCAGGTG CTCACACATT TGGACGGGCT  CAATGTACGA TTGTCATTGA ACGATTATAT AATTTCAATG GTACCGGAAA AGCAGACCCG ACATTGAACG CAACATACTT AGAGACGCTA CGCAAAGTAT GCCCTCAAGG CGGAAATGGT  AGTGTTTTGG TGAATTTAGA TCCTACAACA CCTAATACAT TCGACAGTAA CTACTACACT AACCTTCAAG CTCAAGAAGG ACTGCTCCAA AGTGATCAAG AGCTGTTTTC TACTAGTGGA  GCTGATACCA TTGAAATTGT GGAGAGGTTC AGCAGCAATC AAATTGCTTT CTTTGAAAGC TTTGTGGTTT CCATGCTAAA AATGGGAAAT ATCAGTCCAG TAACAGGTAC GGAAGGAGAG  ATTAGATTGA GTTGTAGAAG GGTTCATATG GATTACACAA GTTCAAACAA ATGGAGCTCT AGCTAAGGTG TGTCTGTTGG AGACTGTAAT TTGAATTGTT CCAGATTCAT GCTTGTTGGG  TTTCTAGATA TTTCAGTTCA AGGTCTATCT AAAAGTCCAT ATAATATTTT AGTCAATGTG TAGTGTGTTA ACTAGGATTC GCTAAATAGT CAACTATTGT GCCTATATAT TCCCTCTGTA  CTTGGTGAAA GTAAGTCGGA AAAATTACAG ATACAACAGA GTTCAAGGAA ACTCATCTTT GAAAATTGAT TCTGCCTCTT CCTTTCCTGT AAAATGATAT CGGAGTTTAC TTCTAAAGTT 
CCAGAGATGT CATCAACCTC ACAAAATGTT AATGAATCAA TTGATACAAC TTCCGCTTTA CC 

Retrieve as FASTA