Entry information : GrPrx41 (Gorai.004G093000)
Entry ID 13275
Creation 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx41 (Gorai.004G093000)
Name (synonym) GrPrx41 (Gorai.004G093000)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx41
start..stop
S start..stop
GhPrx41 655 0 1..332 1..331
MePrx135 505 0 14..332 11..328
CsPrx50 491 1e-176 1..332 1..328
CclPrx31 491 1e-176 1..332 1..328
Literature and cross-references GrPrx41 (Gorai.004G093000)
Protein sequence: GrPrx41 (Gorai.004G093000)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (307)
PWM (Da):   %s   35738.73 (32719.3)  
PI (pH):   %s   6.49 (5.69) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMKSPNNFKG YYYSLFMISL MLCLGARSQL TTDFYSQTCP SLLSTVRKQV QSAIKTEMRM AASLLRLHFH DCFVNGCDAS VLLDGDNSTE KFALANVNSA RGFEVIDAIK SAVESSCSGV  VSCADILAIA ARDSVVLSGG PTWRVLLGRR DGLVSNGTLA NAALPSPFEA LDAIIQKFVD VGLNITDVVS LSGGHTIGLA KCATFDNRLF NFSGTGAPDS TMEANMLADL QSFCPVNGDS 
NRFTALDRNS TDLFDNHYFK NLLNGKGLLG SDQILYSSDL AVSTTKSLVE SYSSNSKLFF NDFVNSMIKM GNISPLTGTN GEIRKNCRAV NS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAAGA GTCCAAACAA CTTTAAGGGT TATTATTATT CTCTGTTTAT GATCAGCTTG ATGCTTTGTT TAGGTGCGAG GTCCCAACTA ACTACTGATT TCTATTCACA AACATGTCCA  TCTCTCCTTT CAACGGTACG GAAACAAGTT CAGAGTGCGA TCAAGACCGA AATGCGAATG GCGGCCTCTC TGCTCCGGCT TCATTTCCAC GATTGCTTTG TGAATGTGAG CTTTGAAATG  CAGCTGCTTT TTTTATCAAT TTGATGATTA AACCATCATA TATAAATCGT ACAAGTTGGA CCCTTTTATT TTCACAGGGT TGTGATGCAT CAGTTTTGTT GGATGGAGAC AATAGTACTG  AGAAGTTTGC TCTTGCAAAT GTCAATTCGG CAAGAGGATT TGAAGTCATC GACGCAATAA AAAGCGCCGT AGAGAGCTCA TGCAGTGGAG TTGTATCATG TGCTGATATA TTAGCCATCG  CTGCTCGCGA TTCTGTTGTC TTAGTAAGTT AACACACACT CGCATATATA TATACCAAGC CAACTTTTTT TTGTGGGGTT AATTGGAAAT TAATCATTGG TAGAGTGGAG GTCCAACATG  GAGAGTTTTA TTAGGAAGGA GAGACGGACT AGTTTCCAAC GGGACACTAG CAAACGCTGC ACTTCCTTCT CCATTCGAGG CATTGGATGC CATCATTCAA AAGTTTGTCG ATGTTGGTCT  CAACATAACA GATGTAGTCT CTTTATCAGG TAACCTACTG TTGAGAGGGA ATGGTTTCCA GACTTCAAGC AGTTGGATAT TATTTTCAAG GTATTTATAC TCGATTTTAA ATTTAGGATT  TTGTCTCCCA ACTTCAAAGA GAACTCAAAA GAGTTCATGA AATTTATCAG GAGTCCCTAA GATTCATTAA AGCAATATTT TATCATTTTG ACAGTGTTTT ACCCTTTAAA GGCATGGGTT  TGAAACTCAC CAAAGCCAAA ATGATAAAAC ATTTCTTTGG TGGACCTTAA GCGCTCCCAA TAAATTTCGT GAACTTTTTT AGGTTCTTTT TAAAATTAAG AGACAAAATT CTGAAATTAA  AATAAAGTAT AAATACCTCA AATATAATAC TTTTACTGTT TGAAGTCTAA ATTGACTGTT CAAAAGATAA CACTCCAAAA ATTTCTCCAA ATAATAAAGT GAAACCCCTC AACACCTACC  TAAAGAGTTG TAATCATGGT TCCTACTAAA AGAATGTCAT TGCGACTAAA CTGGATAACA AATATTTGTT ATTTTAGGTG GCCATACAAT TGGATTGGCA AAGTGTGCCA CCTTCGACAA  TAGATTATTC AATTTCTCAG GAACTGGTGC TCCCGACAGT ACGATGGAGG CTAACATGTT GGCGGATTTG CAAAGCTTTT GTCCGGTTAA CGGTGACAGT AACAGGTTCA CTGCTCTTGA  TAGGAACTCA ACTGATCTAT TTGACAACCA TTATTTCAAG AACTTGTTAA ATGGGAAGGG CTTATTAGGT TCGGATCAGA TTTTATATTC TAGTGATTTG GCCGTTTCCA CAACTAAAAG  CCTTGTTGAA AGTTACAGCA GCAACTCAAA ACTTTTCTTC AATGACTTTG TCAACTCCAT GATCAAGATG GGGAATATAA GTCCACTTAC TGGGACTAAT GGAGAGATTA GGAAGAATTG 
CAGGGCTGTT AATTCTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAAGA GTCCAAACAA CTTTAAGGGT TATTATTATT CTCTGTTTAT GATCAGCTTG ATGCTTTGTT TAGGTGCGAG GTCCCAACTA ACTACTGATT TCTATTCACA AACATGTCCA  TCTCTCCTTT CAACGGTACG GAAACAAGTT CAGAGTGCGA TCAAGACCGA AATGCGAATG GCGGCCTCTC TGCTCCGGCT TCATTTCCAC GATTGCTTTG TGAATGGTTG TGATGCATCA  GTTTTGTTGG ATGGAGACAA TAGTACTGAG AAGTTTGCTC TTGCAAATGT CAATTCGGCA AGAGGATTTG AAGTCATCGA CGCAATAAAA AGCGCCGTAG AGAGCTCATG CAGTGGAGTT  GTATCATGTG CTGATATATT AGCCATCGCT GCTCGCGATT CTGTTGTCTT AAGTGGAGGT CCAACATGGA GAGTTTTATT AGGAAGGAGA GACGGACTAG TTTCCAACGG GACACTAGCA  AACGCTGCAC TTCCTTCTCC ATTCGAGGCA TTGGATGCCA TCATTCAAAA GTTTGTCGAT GTTGGTCTCA ACATAACAGA TGTAGTCTCT TTATCAGGTG GCCATACAAT TGGATTGGCA  AAGTGTGCCA CCTTCGACAA TAGATTATTC AATTTCTCAG GAACTGGTGC TCCCGACAGT ACGATGGAGG CTAACATGTT GGCGGATTTG CAAAGCTTTT GTCCGGTTAA CGGTGACAGT  AACAGGTTCA CTGCTCTTGA TAGGAACTCA ACTGATCTAT TTGACAACCA TTATTTCAAG AACTTGTTAA ATGGGAAGGG CTTATTAGGT TCGGATCAGA TTTTATATTC TAGTGATTTG  GCCGTTTCCA CAACTAAAAG CCTTGTTGAA AGTTACAGCA GCAACTCAAA ACTTTTCTTC AATGACTTTG TCAACTCCAT GATCAAGATG GGGAATATAA GTCCACTTAC TGGGACTAAT 
GGAGAGATTA GGAAGAATTG CAGGGCTGTT AATTCTTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACCCTTGACC CTTAAGAGTA TTAGCATTAG GATTCCACTG AGTGCTATAA CATACTTAAA ATTGCTGTGG GGGAAAATTG ATATATATAA TATAGCATTA ATGATGAAGA GTCCAAACAA  CTTTAAGGGT TATTATTATT CTCTGTTTAT GATCAGCTTG ATGCTTTGTT TAGGTGCGAG GTCCCAACTA ACTACTGATT TCTATTCACA AACATGTCCA TCTCTCCTTT CAACGGTACG  GAAACAAGTT CAGAGTGCGA TCAAGACCGA AATGCGAATG GCGGCCTCTC TGCTCCGGCT TCATTTCCAC GATTGCTTTG TGAATGGTTG TGATGCATCA GTTTTGTTGG ATGGAGACAA  TAGTACTGAG AAGTTTGCTC TTGCAAATGT CAATTCGGCA AGAGGATTTG AAGTCATCGA CGCAATAAAA AGCGCCGTAG AGAGCTCATG CAGTGGAGTT GTATCATGTG CTGATATATT  AGCCATCGCT GCTCGCGATT CTGTTGTCTT AAGTGGAGGT CCAACATGGA GAGTTTTATT AGGAAGGAGA GACGGACTAG TTTCCAACGG GACACTAGCA AACGCTGCAC TTCCTTCTCC  ATTCGAGGCA TTGGATGCCA TCATTCAAAA GTTTGTCGAT GTTGGTCTCA ACATAACAGA TGTAGTCTCT TTATCAGGTG GCCATACAAT TGGATTGGCA AAGTGTGCCA CCTTCGACAA  TAGATTATTC AATTTCTCAG GAACTGGTGC TCCCGACAGT ACGATGGAGG CTAACATGTT GGCGGATTTG CAAAGCTTTT GTCCGGTTAA CGGTGACAGT AACAGGTTCA CTGCTCTTGA  TAGGAACTCA ACTGATCTAT TTGACAACCA TTATTTCAAG AACTTGTTAA ATGGGAAGGG CTTATTAGGT TCGGATCAGA TTTTATATTC TAGTGATTTG GCCGTTTCCA CAACTAAAAG  CCTTGTTGAA AGTTACAGCA GCAACTCAAA ACTTTTCTTC AATGACTTTG TCAACTCCAT GATCAAGATG GGGAATATAA GTCCACTTAC TGGGACTAAT GGAGAGATTA GGAAGAATTG  CAGGGCTGTT AATTCTTAGT TTGCAGTTTA ACTGAAAGAG GATTTGCTCA AATAATTATA GTCAAGTTTG GTGGTCAAGT GATAGGAGAT TGAAGGAATT ACTTATGTGA GACATGATTG  CTGTAAATAT CAGCTTATGT AATAATGTTC ATGATTTCTG TGTGTTTGTT TTACGAGCTA TATGTCCCTA TTTATGCCCC CAACAATATA TTTATGACAC GTGTTTCAGT TTAATGCTAC 
ACTAATTTGT GTTTAATCAA ATTCGCAGCT AATTCGATTG TCTTTTCCTT ATTT 

Retrieve as FASTA