Entry information : EgrPrx[P]197
Entry ID 13308
Creation 0000-00-00 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-05-11 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EgrPrx[P]197
Name EgrPrx[P]197
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus grandis    [TaxId: 71139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EgrPrx[P]197
start..stop
S start..stop
EgrPrx191 271 1e-91 1..241 70..317
EcamPrx191 271 2e-91 1..241 70..317
EguPrx191 270 3e-91 1..241 70..317
EglPrx191 268 3e-90 1..241 70..317
Literature and cross-references EgrPrx[P]197
Protein sequence: EgrPrx[P]197
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   232
PWM (Da):   %s   24648.03  
PI (pH):   %s   6.59
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
VQGYNASLLS DDTATFTGEK ATQPNHNSLE I*SP*HH*VR IEAACNATVS CADIFALAAH DGVVLVGGEP S*MAPLGQ*D ARPPA*SHPL SPAPSPFSSL ANLISSDAQG LNARDMTALS  GAHAIRLAQC xxxKTKNDTR WTTTQKTHYL ASETETNLAP LN*TPNRFDN DY*QNLMARH GLLHSDLELF NGGS*DVLVG TCRNNFRAFA SDFAAVMMKM DNISLLTRTN GEMRRNCRVV 
N* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (chromo 11). Exon 1 is missing and several stop in frame. Tandem duplication of 11352
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGCCGAACCA AAACTCTCTT AGGGGATTCG AAGTCATCGA CACCATTAAG TCCCGTGTTG AAGCTGCTTG CAATGCTACC GTTTCTTGCG CGGACATCCT TGCGCTCGCT GCTCGAGACG  GGGTTGTCCA AGTGAGTTTC TCATATATCA TGATCATTAA TAACTTTTTC TCCTATTTTC TCTTTAATGC ATGATTTTGG TTTATATTAA CTTCAAATCT CTGACCATAC CAATTACATA  ATAGTCATCC CCTGTTTCAT GATTGGATTA GTCCATATTT ATGGGATAAA TTCGCAATTT TTTATACATA ACATTTTTAT AGAAGACTGA ACATTCGCAA ACATAAATTG TATAAGCTTA  TGCGATTGAT ATTGGCATTA TAGTTGGGAG GACCATCGTG GGCGGTGCCT CTAGGGCGGC GAGATGCAAG GACCGCTAGC CTGAGCGGTG CCAACAGCCA AATCCCATCG CCTTTCTCCA  GCCTCGCCAC CCTCATCTCC TCCTTCGCTG CCCAAGGCCT CAATGCCCGT GACATGACCG CCCTGTCTGG GGGCCATGCT ATTGGCCTGG CCCGGTGTAC CACCTTCCGG AACCGCATCT  ACAATGAGAC CAACATCGAC GCCAGCTTCG CTACCACCCG AAGGACTAAC TGCCCTGCCT CTGGAGGGGA CGCCAACCTT GCTCCCCTCG ACCGGACCCC GAACCGGTTT GACAACAACT  ACTACCAGAA CCTCGTGGCA CGGCGTGGGC TCCTCCATTC GGATCAAGAG CTGTTCAACG GAGGATCACA GGACGCACTC GTTAGGACTT ACAGCAATAA CTATAGGGCT TTCGCGAGTG  ATTTTGCGGC TGCGATGGTG AAGATGGGTA ACATCAGCCC GCTCACCGGA AGAAATGGAG AGATCAGAAG GAACTGTAGG GTGGTGAACT AAGGTTGAAT GCCCTCCAAA CAAAAAAGAA  AGTTATGGAA GCTGGATTTA GCAAATTGTT ATAAATGTTT AATGCATGTC TATCTTTGCA TATTTCTTTT CCTGTTTTCA ATAAGATTCA TGTTTATGAA GGCCTTGGTC AAGAAATTGA  CAAAGCTGTA CTGCTTTGTT TCTGAATATA TGTATTTAGA CATGAAATCC TAATGTTCTT TTCCAACTCA ATGTCACTTG GTCTATCTAT ACTTGGAAAT CGAAATATGC TCTTTGGCAT  TTATGTACAG GAGACAGCTT GCGTGACTTA TTCTCAGTAC ATAGTATTTC TCTAAAAGCC TCTACTATGT AGTCACGCTC ACTTGTCTGA CATTTTACCT AGTACGAAGT GCATCACCAA  AATGTTATAT ATGATAGCTC TTGTCCTATT TAAGCTACCA AATATGGCCT TTCAAACATA AATCTCTGAA TCCAACACTT CGATGTGTCT AAGACCCCTA AAAGCTGCGA GTACATAAAA  CCTCGAATTT AGGCAAATGA TTACAAAATT ACAAAGAAGC TTCAATTTGC GCCTCGTGGG GTATGCATTT TTGGGCATAT TGAGAATGAA CATCTAGAAA GTTAAAGAAT AATAAAGCGA  AGACAAGAAT TGAAAATTTC CTATATATTC GGACGTGTAT ATTAATGAAT AATACATCGG CCTATTTATA GACCTTATTA GATAACTATT TTAAGATAAT ATCTCAATTA ATATATGCAC  AATATGCATG CAATCTTGAG AAATATGGAT AATGAATAGA ATTATCAAAA TAACTTTGAA GGGGGAAATT ATTTCAATAC AAATCTTAAT TATTTTAGAA AATTTGTGAC TCGACAAGTT  GTTATGCTCA CAATAACCAA AAGATTATTA TATTAGCAAA GCCCACATAA GTATGCAAGA GAATGACTTG GATTTTTATA TTGTGTTTGG TTATTACGAT TATATAATGA TTAAATTGTT  GCAGTCAGAT TCGAAAGTAG ACTTGCATTG GATCTAAGAA AATTTCTTCC ACATGTACTC AATTCATCAC TAATCAAATG AAAAAAAGAA AGATGAACTC TTAATTATGC GAAATGGTGC  AAATTGTGAC CTTCTCTTTC GAGACAATCT TATTACATAT CTCGGACTTC TCGTGCAAGG ATATAACGCA TCGCTTCTCT CGGATGACAC GGCCACTTTC ACCGGAGAAA AGGCCACTCA  ACCAAACCAT AACTCTTTGG AGATTTGAAG TCCTTGACAC CATTAAGTCC GCATCGAAGC TGCTTGCAAT GCTACCGTTT CTTGCGCGGA CATCTTCGCA CTTGCGGCCC ATGACGGTGT  TGTCTTGGTG GGCATCTCTT ATATCATGAT CATGACTAGC TTTTGCTCCT ACCCTCTGTT TTATGCATGA TTTTGGTTAT ATCAACTTCA AATATTTGAC CATACCAATT ACTTAATAGT  CATCCATTGA TTCATGATTG GATTCATTCC ATAGTTGTGG GGAGAAGTAC ACTTTTAGTG CCATAAGTTA TATACGGTAT TTATTTTGAT GTCAAAAATT TCTGTCAGAT CACTTAAATG  CAAAATCGGA GGAAAAACAA TTACTTTGGT GCCACTGGCG AAAGATTGCA ACCAAAATGA TTATGTGGCT TTTATATTTA AAAAAAAAAT CGACAATGCC TTTAAACGAT GTCGTTTTCC  GTCTTCCTTA AGAAAACAAC ATCGTTTTGC CTTAAGAAAA CAACATTGTT TTGCCATCCT AAGTGGATGG CCTCAAGAAA ACGACGTCGC ACAACTCATT TGGATTTTTT TTTTTTATTT  GAGGATTGAA ATTAGGGTTT TTTTGTCTGA TTCTCGCCCA ATGCCGGCCG TCGTCGCTCG GCTGCCGTCG CTCGGCCTTT GTCGCTCGGC CGCCGTCGCT CGGCCGTCGT TGCTCGGCCT  CTGTTGCTCG GCCTACATCG CTTGGCCACC GTCGCTCAAC CTCCCTCGTA GTAGCACCAT GTCCCAATCT CGATAACATT TCACTAGCTT CAACGTTCTC AAATTCTTCG AGCCGGGACT  GCGTCTAGTA GCTCCGAGTG GGTGTGGAGG GTGAGCCTCT GGCGGCTCTG GCCTTCGATT GCAAGCTAGT GGCAGCACAC GAGGGAGTAC CGGCCCGGGT TACCGAAGCC TAGGTATTGG  AAGACATAAA CCAGACACTC GTCGGGGAGA TCAGAGATAG AGAGGGAGAG ATCGGGGGCG GCGCACTCCT TGGCAACCTC CCTGAGCACC GACTAGATCA CGGCTTTCGA CTTGGCCAAT  GAGTAGCTGT TGTCGGGGTC GGGGTCGGGG TCGAAGCCAC GGTCGCCGAG CGCAGAGGGC CGTTGAGGAC GGCGACTGGC CCATTGCTGT TGGCTTATCT TCTCTCTCTC AATTTGGGGA  TTTAGGGTTT TGAATTGGGG GAGAGACACC AAACGGCGTC GTTTTGTTAT TTAAATGCTG ACTGTATTCT CCGGTGAGCC ACATCAGCTT AAAAAATTAA TAAAAAAGTG TAATGTCGGA  TTTCCGGCCA ACTAGATTAG AGTTGGTACT AAAATGATCG TTGTTTAAAT TTTTTGGTAC TTAAGTGATC TGACAAAAAA TTTTGGCATT AAAGTGAGCG CCGTATATAA CTTATGGCAC  TGATAGTGTA TTTATCCCAT AGTTGTGAGA TAGATTCACG TTTTTTAGAA GACTGACCAT GCTACTTGCA TAAATTATAT AAGCTTATGT GATTGGAATT GTCATTATAT GGAATTGTCA  TTATAGTTGG GAGAACCATC GTGAATGGCG CCACTAGGAC AATGAGACGC AAGACCGCCA GCCTGATCCC ATCCCCTTTC TCCAGCCTCG CCAACCTCAT CTCCTCCGAC GCCCAAGGCC  TCAATGCCCG TGATATGACC GCCCTATCGG GGGCCCACGC TATTAGGCTA GCCCAGTGCA AAGACCAAAA ACGACACTCG TTGGACTACC ACCCAGAAGA CTCACTACCT TGCCTCTGAA  ACGGAAACCA ACCTTGCACC CCTCAACTAG ACCCCAAACC GGTTTGACAA CGACTACTAG CAGAACCTCA TGGCGCGGCA TGGGCTCCTC CATTCGGACC TAGAGTTGTT CAACGGAGGA  TCGTAGGACG TGCTCGTTGG GACTTGTAGA AATAATTTTA GGGCTTTTCG CGAGCGATTT TGCGGCCGTG ATGATGAAGA TGGATAACAT CAGCTTGCTC ACCAGAACAA ATGGAGAGAT 
GAGAAGGAAC TGTAGGGTGG TAAATTAA 

Retrieve as FASTA