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Entry information : CclRboh01 ( Ciclev10018741m)
Entry ID 13504
Creation 2015-12-10 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CclRboh01 ( Ciclev10018741m)
Name (synonym) CclRboh01 ( Ciclev10018741m)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclRboh01
start..stop		 S start..stop
CsRboh01 1958 0 1..947 1..947
CcaRboh05 1704 0 1..946 1..945
CcaRboh01 1704 0 1..946 1..945
PtRboh03 1678 0 1..946 1..948
Literature and cross-references CclRboh01 ( Ciclev10018741m)
Protein sequence: CclRboh01 ( Ciclev10018741m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   946 (324)
PWM (Da):   %s   107418.45 (34221.8) Transmb domain:   %s   o385-404i524-546o566-588i745-762o
PI (pH):   %s   9.72 (4.14) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGSASHQRR WASDTVPGRT VVSSASSPGT ESNPAEEYVE VTIDLQDDDT IVLRSVEPAP PHVLSIEDGA GAGSETPSSA SLSPSIKRSS SNRLRHFSQE LKAEAVAKAK QFSQELKAEL  RRFSWSHGQA SRVLSASTSS SAQNGNGFDS ALAARALRKQ RAQLDRTRSG AQKALRGLRF ISNSSKTNGV DAWNEVQSNF NKLAKGGFLY RADFAQCIGM RDSKEFALEL FDALSRRRRL  KVDKISREEL YEYWSQITDQ SFDSRLQIFF DMVDKNEDGR IAEEEVKEII MLSASANKLS RLKEQAEEYA ALIMEELDPE GLGYIELWQL ETLLLQKDTY LNYSQALSYT SQALSQNLQG  LRKKNRIKRM STEFLYYLQE NWRRLWVLSL WILIMIGLFT WKFFQYKHKD AFHVMGYCLL TAKGAAETLK FNMALILLPV CRNTITWLRS TRLGFFVPFD DNINFHKTIA AAIVVGVILH  VGNHLACDFP RLISSSESDY HRYLSSSFGK HKPTYWDLVK GAEGITGILM VIFMAIAFIL ATRWFRRNLI KLPKPFDRLT GFNAFWYSHH LFVIVYILLI VHGILLFLVH KWYLKTTWMY  LAVPVLAYAG ERTLRFFRSG FSTVRLLKVA IYPGNVLTLQ MSRPPQFRYK SGQYMFVQCP AVSPFEWHPF SITSAPGDDY LSVHIRQLGD WTQELKRVFS EACEPPVAGK SGLLRADETT  KKSLPKLLID GPYGAPAQDY RNYDVLLLVG LGIGATPFIS ILKDLLNNIV KQEEQADSVS DFSRTSDNSV GSNDSNTNRV SPKRKKALKT TNAYFYWVTR EQGSFDWFKG VMNEVAELDQ 
RGVIEMHNYL TSVYEEGDAR SALITMVQAL NHAKNGVDIV SGTRVRTHFA RPNWKKVLSK LSSKHCNARI GVFYCGAPVL AKELSKLCYE FNQKGSTKFE FHKEHF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGGCT CAGCCAGTCA CCAGCGCCGG TGGGCCTCCG ACACTGTTCC CGGACGGACG GTGGTGAGTT CGGCGTCTTC ACCGGGAACT GAGTCTAACC CGGCAGAGGA ATATGTTGAG  GTTACAATTG ATCTTCAAGA CGATGATACA ATTGTCCTTA GAAGCGTCGA GCCGGCGCCA CCTCATGTGC TTAGCATCGA GGACGGAGCC GGAGCTGGAA GTGAGACTCC GTCGTCGGCC  TCTCTATCGC CATCCATAAA ACGAAGCTCG TCGAATAGGT TGAGACATTT TTCGCAAGAG TTAAAGGCGG AAGCAGTGGC AAAAGCGAAG CAATTCTCGC AGGAGCTGAA AGCCGAGCTG  AGGAGGTTCT CTTGGAGCCA TGGACAGGCT TCTCGCGTGC TCTCGGCTTC AACTTCCTCG TCAGCACAGA ATGGCAATGG ATTCGACTCG GCTTTAGCGG CTCGAGCTTT GAGAAAGCAG  CGTGCTCAGC TGGACCGGAC CCGGTCCGGC GCCCAGAAGG CTCTTCGTGG ATTGAGGTTC ATAAGTAACA GTAGTAAAAC AAACGGCGTC GACGCATGGA ATGAAGTTCA AAGTAATTTT  AATAAGCTTG CCAAGGGCGG CTTTCTCTAT CGTGCCGATT TCGCCCAATG CATAGGTTCT TCTCATATCC GCCCGCTTTT TTGTTTTTTT TTTTCATTTT TCATTTTTCG GTTAACCCTG  CGTTAATTAA TGCTTTGATA ATTAAATATT TTTTTTTCGT ATTATAATCA CAGGAATGAG AGATTCTAAA GAGTTTGCAT TGGAGCTTTT TGATGCTTTA AGTAGGAGAA GAAGGTTAAA  AGTTGACAAG ATTAGCAGAG AAGAGCTTTA CGAGTACTGG TCACAAATCA CCGATCAAAG CTTTGATTCT CGGCTTCAGA TCTTCTTCGA TATGTAAGCA TTAGTTAGTT AAACCAGTAT  CAACTTTCAT TTCTAGTTTT TACAGGTTTT ATTAATTAAT TCACTGCTTA TTTATATATG TATATTACGT ACTTACGTTC GTTCATCTTG TATGTATAAT GCCTCATTAG GGTCGACAAG  AACGAAGATG GAAGAATCGC GGAGGAGGAA GTAAAAGAGG TGTTTAATCA ATTCTGTTTC AATAGTAATA CGTACTGATT TCATTTTCTT ATTTAAATTA TATTTTAAAC CTTTTGATGA  TTAGATAAAG CAAAAGTCAC TCAATTGAAT ATCATTATAT ATGTATAATC TTGTAAATTC AAGCTACTTG GTGTTATTGC TTACAGGGTG TCATTTTGGT TTTAATAATC AACGTTAGGC  GGGATTCGGT AACCTTAAAT TAAATGAAAT TTCATAAATT AGTACCTTCA ATATAATTAG GAAAAGGGCA AAAAAGAAAA ATATTGAGCT TGCTTAGTCT TCGACGCTAC CCATGTTCTA  ATCAATTTGG CATCTTATCT ATAATTAGAT CATGTATATT CAAGATCTGC AGGGTTCAAA GTTTCGACAC ATGGCATCTC CACTTTATTA TCATAAGTAA TTATTACGTT TTTTAAGTGG  GGTTGGTGGG GGCTCTTTTG TCTTTCAGTT TGAATGTGCG AGTTATTTTT AAAATACTAT AATTTGTTAA CTGTTAGATT TTTATTTTCC ATTTTTTTTT TTTTTGTGTG TAAATTGAAC  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TAGAATTTCA GGTTTCTTTT TTCTTTTTTA AGATGTAACC GAATATCTAA TTAATTATTT GCTTAATTAC CACTGATGGA CATTTGCAGA CAATAGCTGC AGCAATTGTA GTCGGTGTAA  TTCTGCATGT CGGGAACCAT CTCGCATGTG ATTTCCCAAG GCTAATAAGC TCTTCAGAAA GTGACTACCA TCGGTATCTG AGTTCGTCTT TTGGAAAACA TAAACCCACA TACTGGGACC  TTGTCAAAGG GGCAGAAGGT ATTACAGGAA TTCTTATGGT CATATTCATG GCAATTGCAT TCATTTTAGC AACTCGTTGG TTCAGAAGGA ACCTCATTAA GCTGCCAAAG CCCTTCGATA  GGCTCACTGG TTTCAATGCT TTCTGGTATT CACACCATTT GTTCGTCATT GTCTATATTC TGCTCATCGT CCACGGCATA TTACTTTTCC TCGTTCACAA ATGGTACCTA AAGACGGTAT  AACACTTAAC TCTCTTCTAA TTTTTTCAAA AAACAAAAAA TCCTTAAAGT TTCTTGTGAT TGATTGTGGT TTCTGAATTC TTTGCTTGTA GACATGGATG TATCTTGCTG TTCCTGTTCT  TGCGTATGCT GGAGAAAGGA CCCTGCGATT TTTTCGTTCT GGCTTTTCTA CTGTCAGGCT TCTAAAGGCG AGTATATGGA TAAATCACTC ACTCATATAT ATATATATAT ATATATATAA  AACATATAAA CTAAATTATG TTTTCTAACA ATTAGATGAA TATTGTTTAG GTCGCAATAT ATCCTGGAAA TGTTCTCACA TTGCAAATGT CAAGGCCTCC ACAATTTCGG TACAAGAGCG  GACAGTACAT GTTTGTTCAG TGTCCTGCTG TGTCTCCATT CGAGTGGTAA GTCATTGTGC TGATAGTAGG TCACAATTGC TTGAAACTCT AGAAATAGTC TTGTTTCTGA GTGCTTACAG  CTTAATTTTG TATGTCAGGC ATCCATTTTC TATCACATCT GCTCCTGGTG ATGACTACCT TAGTGTTCAC ATCCGGCAGT TAGGTGACTG GACTCAAGAG CTTAAAAGGG TATTTTCTGA  GGCCTGTGAG CCTCCTGTAG CTGGGAAAAG TGGGCTGCTC AGGGCTGATG AAACAACAAA GAAAAGGTAT GTATTGTGAT TTTGGTCGTG CAATTAACTA AGGGTATCAA GTTGTTAATA  CTATTTATTA AGCTCAATTC TTATCGGGTA ACAGTCTGCC AAAGCTCTTA ATAGATGGGC CTTATGGTGC CCCGGCACAA GACTACCGAA ATTATGATGT CCTGCTTCTA GTTGGTCTTG  GGATTGGAGC AACACCCTTC ATCAGCATTC TGAAGGATCT GCTTAACAAC ATTGTGAAAC AGGAGGAACA AGCTGTAAGT GTCTGTTTCC AGTGCTTCAC AGCTACAAAA ACCTTATTTG  ACTTTTGGCA TTGTCCTGAT TGATAATAGT TTTACAGTAC TTCTGAAACA AAGCACATCT TAGTTTCTGA TTCTTTTTTT TCTTTTCTTT TTCAGGATTC TGTGTCAGAT TTCAGTAGGA  CATCAGACAA TAGTGTTGGA AGCAATGATT CTAACACCAA CAGGGTTTCT CCAAAGCGGA AAAAGGCTCT GAAGACCACC AATGCTTACT TCTACTGGGT AACTAGGGAG CAAGGCTCAT  TTGATTGGTT CAAAGGTGTC ATGAATGAAG TTGCAGAGCT TGATCAGAGG GTAATACATA ATATTGATTG TAATCACTTT GCAGTTTCTT TTTAATGTTT ATTTAATTTC CTGGGATTTT  AACTTCATAT TTTGGACTTC AGGGTGTCAT TGAGATGCAC AACTACTTGA CTAGTGTGTA TGAGGAAGGT GATGCCAGAT CAGCTCTAAT CACAATGGTT CAAGCTCTTA ATCATGCCAA  GAACGGAGTG GACATTGTTT CTGGCACTAG GGTAAGAAAG ACCTTTAGTG ATTGTCATTT TCAGTCTCTC CCTTCACAAC ATCTCTTCTT GCACTTGTGG CTTGAAACTA TTATTGAATA  TCTTGTCACA AATGTCACTC CAATAGTCAT GATAAGGCCA GCAGCAACTC AAATCTGATG GTTTCATTGG GTCATATCAC TATAATTTCT AAAGTTCCAA AATTCTATCA TCAGGTGAGA  ACCCATTTTG CAAGGCCTAA TTGGAAGAAG GTTCTGTCTA AATTAAGTTC AAAGCACTGC AATGCCAGGA TTGGTAAGTG CATGTCCATT TTCCTTTTTT AAAAATGACC TTTTTAATTC  TTTCTCAATC TCATAATATG CTTTATGTTT CTTTTGGAAC AGGAGTTTTT TACTGTGGAG CACCAGTTTT GGCTAAAGAA CTCAGCAAAC TTTGCTATGA GTTCAATCAG AAAGGCTCTA 
CCAAGTTTGA ATTCCATAAA GAACACTTCT AA 

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CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGGCT CAGCCAGTCA CCAGCGCCGG TGGGCCTCCG ACACTGTTCC CGGACGGACG GTGGTGAGTT CGGCGTCTTC ACCGGGAACT GAGTCTAACC CGGCAGAGGA ATATGTTGAG  GTTACAATTG ATCTTCAAGA CGATGATACA ATTGTCCTTA GAAGCGTCGA GCCGGCGCCA CCTCATGTGC TTAGCATCGA GGACGGAGCC GGAGCTGGAA GTGAGACTCC GTCGTCGGCC  TCTCTATCGC CATCCATAAA ACGAAGCTCG TCGAATAGGT TGAGACATTT TTCGCAAGAG TTAAAGGCGG AAGCAGTGGC AAAAGCGAAG CAATTCTCGC AGGAGCTGAA AGCCGAGCTG  AGGAGGTTCT CTTGGAGCCA TGGACAGGCT TCTCGCGTGC TCTCGGCTTC AACTTCCTCG TCAGCACAGA ATGGCAATGG ATTCGACTCG GCTTTAGCGG CTCGAGCTTT GAGAAAGCAG  CGTGCTCAGC TGGACCGGAC CCGGTCCGGC GCCCAGAAGG CTCTTCGTGG ATTGAGGTTC ATAAGTAACA GTAGTAAAAC AAACGGCGTC GACGCATGGA ATGAAGTTCA AAGTAATTTT  AATAAGCTTG CCAAGGGCGG CTTTCTCTAT CGTGCCGATT TCGCCCAATG CATAGGAATG AGAGATTCTA AAGAGTTTGC ATTGGAGCTT TTTGATGCTT TAAGTAGGAG AAGAAGGTTA  AAAGTTGACA AGATTAGCAG AGAAGAGCTT TACGAGTACT GGTCACAAAT CACCGATCAA AGCTTTGATT CTCGGCTTCA GATCTTCTTC GATATGGTCG ACAAGAACGA AGATGGAAGA  ATCGCGGAGG AGGAAGTAAA AGAGATTATT ATGTTAAGTG CTTCTGCCAA TAAGTTATCG AGATTGAAGG AGCAAGCAGA AGAATATGCA GCTTTGATAA TGGAAGAGCT AGATCCCGAA  GGACTTGGAT ACATAGAGCT ATGGCAATTG GAGACGCTTT TGCTACAAAA GGACACGTAT CTGAACTACA GCCAAGCGCT GAGCTACACA AGCCAAGCTT TGAGCCAAAA CTTACAAGGC  TTGAGAAAAA AGAACAGAAT CAAAAGAATG AGCACGGAGT TTCTGTATTA TCTGCAAGAG AATTGGCGAA GGCTTTGGGT ATTGTCACTG TGGATTTTGA TTATGATCGG GTTATTTACA  TGGAAGTTTT TCCAATACAA ACACAAAGAT GCTTTTCATG TAATGGGTTA TTGTCTTCTC ACGGCTAAGG GTGCAGCAGA GACCTTAAAA TTCAACATGG CTCTAATTCT TTTGCCTGTT  TGTAGAAATA CAATTACGTG GCTTAGGTCC ACCAGGTTGG GTTTCTTTGT GCCTTTTGAC GACAACATCA ACTTTCATAA GACAATAGCT GCAGCAATTG TAGTCGGTGT AATTCTGCAT  GTCGGGAACC ATCTCGCATG TGATTTCCCA AGGCTAATAA GCTCTTCAGA AAGTGACTAC CATCGGTATC TGAGTTCGTC TTTTGGAAAA CATAAACCCA CATACTGGGA CCTTGTCAAA  GGGGCAGAAG GTATTACAGG AATTCTTATG GTCATATTCA TGGCAATTGC ATTCATTTTA GCAACTCGTT GGTTCAGAAG GAACCTCATT AAGCTGCCAA AGCCCTTCGA TAGGCTCACT  GGTTTCAATG CTTTCTGGTA TTCACACCAT TTGTTCGTCA TTGTCTATAT TCTGCTCATC GTCCACGGCA TATTACTTTT CCTCGTTCAC AAATGGTACC TAAAGACGAC ATGGATGTAT  CTTGCTGTTC CTGTTCTTGC GTATGCTGGA GAAAGGACCC TGCGATTTTT TCGTTCTGGC TTTTCTACTG TCAGGCTTCT AAAGGTCGCA ATATATCCTG GAAATGTTCT CACATTGCAA  ATGTCAAGGC CTCCACAATT TCGGTACAAG AGCGGACAGT ACATGTTTGT TCAGTGTCCT GCTGTGTCTC CATTCGAGTG GCATCCATTT TCTATCACAT CTGCTCCTGG TGATGACTAC  CTTAGTGTTC ACATCCGGCA GTTAGGTGAC TGGACTCAAG AGCTTAAAAG GGTATTTTCT GAGGCCTGTG AGCCTCCTGT AGCTGGGAAA AGTGGGCTGC TCAGGGCTGA TGAAACAACA  AAGAAAAGTC TGCCAAAGCT CTTAATAGAT GGGCCTTATG GTGCCCCGGC ACAAGACTAC CGAAATTATG ATGTCCTGCT TCTAGTTGGT CTTGGGATTG GAGCAACACC CTTCATCAGC  ATTCTGAAGG ATCTGCTTAA CAACATTGTG AAACAGGAGG AACAAGCTGA TTCTGTGTCA GATTTCAGTA GGACATCAGA CAATAGTGTT GGAAGCAATG ATTCTAACAC CAACAGGGTT  TCTCCAAAGC GGAAAAAGGC TCTGAAGACC ACCAATGCTT ACTTCTACTG GGTAACTAGG GAGCAAGGCT CATTTGATTG GTTCAAAGGT GTCATGAATG AAGTTGCAGA GCTTGATCAG  AGGGGTGTCA TTGAGATGCA CAACTACTTG ACTAGTGTGT ATGAGGAAGG TGATGCCAGA TCAGCTCTAA TCACAATGGT TCAAGCTCTT AATCATGCCA AGAACGGAGT GGACATTGTT  TCTGGCACTA GGGTGAGAAC CCATTTTGCA AGGCCTAATT GGAAGAAGGT TCTGTCTAAA TTAAGTTCAA AGCACTGCAA TGCCAGGATT GGAGTTTTTT ACTGTGGAGC ACCAGTTTTG 
GCTAAAGAAC TCAGCAAACT TTGCTATGAG TTCAATCAGA AAGGCTCTAC CAAGTTTGAA TTCCATAAAG AACACTTCTA A 

Retrieve as FASTA