Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
246 |
PWM (Da): |
26589.42 |
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PI (pH): |
4.95 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGKIYPSLSEEHKSAVDQAKGELRAFITEKQCAPLVLRLAFHSAGTFDVNTKTGGPFGTMKLKSEQNHGPNVGLDTAVELLEPIKQKFPLVSYGDFYMAGIVAVESTGGPQITFNPGRTD LDAPPPEGRLPLPNQGPDQLRNVFVNTMGLTDQDIVALSGAHTGSTHKERSGQDGSWTSNPMVFDNSYFKELLAGEKAGLIQLTSDKALVEDPAFRPLVEKFADQNAFFQAFAESYLKLS ELG* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic. No EST |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGATCTACCCGAGCTTAAGTGAGGAGCACAAGTCGGCTGTCGATCAAGCCAAGGGTGAGCTTCGAGCCTTCATCACCGAGAAGCAATGCGCTCCTCTAGTGCTTCGACTTGCG TAAGACGAATTGAATTCTCCTTTTTTGGTAATTTTTTATTCGTGTTTTAATGTTGTTATTGCTCTCCAGATATTTCACTCGGCTGGGACTTTCGATGTGAATACGAAGACCGGAGGTCCG TTCGGTACCATGAAGCTTAAATCGGAGCAAAACCATGGTCCTAATGTTGGGCTTGACACTGCTGTTGAATTGTTAGAGCCTATTAAACAGAAGTTCCCACTTGTTTCCTATGGTGACTTT TATATGGTAACTATGATCATGATACAATATAATTATATAAATTTTTTTTTAAGTTATGTTGTGGATCAATATTAATCTACATTTATCTTGATATATAGATATGGCTGGTATTGTCGCGGT TGAAAGTACCGGAGGACCACAAATTACTTTCAACCCCGGGAGGACGGTATGTGCTTTTCAATGTCGGTTAAACCAGAAGACTGGTTGAACCGGTATGGTTGTATTGACTGACCTGGTTTA GTGGTTGAATCAATATTCAATGACCCCTCTCACTAGTTGGACTTGTGTTGATTAGATTTTTTTTACAATACTTTTTGTCATGCATAAATATTACTATTTGAAACAATCTAAAAAAATATT GTTGTATATATAAGTAACAAAATTAGATACTTTCATTTGAAAATTCTCTTATTATTCTATACTTTTTTCACTCTAAAAAACATATTTTTTATTCATTTAAATATAACCAACGTAACAATA TAGTATTCAAATTAATGTAATATATAGTTTTTTTTAAATTAGTTATGACATCATTATGTTTTGGGTCTGGTTTAACTGTTTCAACCAGTGAACCAGTATTATGGTTGGTTATATGTCTGG TTCAGTTGGTACAATGATCGGTTTGGTTTACATAATATTATCAATGCTCTTAATTTCTATATAATATATTTAAATGTTTTATTTGCCATTATATAATATATTTTATTGTAAATTATAATT GATTTTTCATTCTTCAAGGAGACCTGGATGCTCCCCCTCCAGAAGGTCGTCTTCCTCTTCCTAATCAAGGTTGGTGAAGAAAATTGACAATTTATGGAAATTAATTATGTTGAATTCTTT TAAAGTGGCATCATTAATACTTTATATTTATATAAAATATATGTCAGGTGTCCTGACCAGTTGAGGAATGTGTTTGTGAACACCATGGGTCTCACTGACCAAGATATTGTTGCTCTCTCT GGTGCACATACATTGGTTTGTTTTCATACACTTATACCACATGTCATTATATAATATATATTATTTAAAAGAATAAAATCCTAGATAAAAAAATATTTCGGGTCAAACCAATGAGCACAA AGGTTACATATTTTGATCTGTTACCCAACCTGCTTGTTGTAACATGTTTACTTGTTCTAGGGGGATCTACCCACAAGGAACGATCCGGACAAGATGGATCATGGACATCCAACCCGATGG TATTTGACAATAGTTACTTCAAGTAAGCTTTGTTACAAATTTTTGGTCCCTTTTTTAAAACTTTACATTCTTCATTATCATTAAGTATCATTTTGTTGAACCCGCAACAGAGAGAACTCT TAGCTGGTGAGAAGGCCGGGCTGATTCAGTTAACTTCCGATAAAGCACTAGTTGAAGACCCCGCTTTTCGACCTCTTGTCGAGAAATTCGCTGCAGTAAGTACATTTTCTTGTTTATTGC AATGTAATAATGTCACTTTTATAATTTTAATACCATAACCATAAGTGCTAACAATAATGGGCTTTGTTTTATTTACAATAACAGGAGATCAAAATGCTTTCTTTCAAGCCTTTGCTGAGT CCTACTTGAAGCTTAGCGAGTTGGGGTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGATCTACCCGAGCTTAAGTGAGGAGCACAAGTCGGCTGTCGATCAAGCCAAGGGTGAGCTTCGAGCCTTCATCACCGAGAAGCAATGCGCTCCTCTAGTGCTTCGACTTGCA TTTCACTCGGCTGGGACTTTCGATGTGAATACGAAGACCGGAGGTCCGTTCGGTACCATGAAGCTTAAATCGGAGCAAAACCATGGTCCTAATGTTGGGCTTGACACTGCTGTTGAATTG TTAGAGCCTATTAAACAGAAGTTCCCACTTGTTTCCTATGGTGACTTTTATATGATGGCTGGTATTGTCGCGGTTGAAAGTACCGGAGGACCACAAATTACTTTCAACCCCGGGAGGACG GACCTGGATGCTCCCCCTCCAGAAGGTCGTCTTCCTCTTCCTAATCAAGGTCCTGACCAGTTGAGGAATGTGTTTGTGAACACCATGGGTCTCACTGACCAAGATATTGTTGCTCTCTCT GGTGCACATACATTGGGATCTACCCACAAGGAACGATCCGGACAAGATGGATCATGGACATCCAACCCGATGGTATTTGACAATAGTTACTTCAAAGAACTCTTAGCTGGTGAGAAGGCC GGGCTGATTCAGTTAACTTCCGATAAAGCACTAGTTGAAGACCCCGCTTTTCGACCTCTTGTCGAGAAATTCGCTGCAGATCAAAATGCTTTCTTTCAAGCCTTTGCTGAGTCCTACTTG AAGCTTAGCGAGTTGGGGTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGA TCTACCCGAG CTTAAGTGAG GAGCACAAGT CGGCTGTCGA TCAAGCCAAG GGTGAGCTTC GAGCCTTCAT CACCGAGAAG CAATGCGCTC CTCTAGTGCT TCGACTTGCA
TTTCACTCGG CTGGGACTTT CGATGTGAAT ACGAAGACCG GAGGTCCGTT CGGTACCATG AAGCTTAAAT CGGAGCAAAA CCATGGTCCT AATGTTGGGC TTGACACTGC TGTTGAATTG
TTAGAGCCTA TTAAACAGAA GTTCCCACTT GTTTCCTATG GTGACTTTTA TATGATGGCT GGTATTGTCG CGGTTGAAAG TACCGGAGGA CCACAAATTA CTTTCAACCC CGGGAGGACG
GACCTGGATG CTCCCCCTCC AGAAGGTCGT CTTCCTCTTC CTAATCAAGG TCCTGACCAG TTGAGGAATG TGTTTGTGAA CACCATGGGT CTCACTGACC AAGATATTGT TGCTCTCTCT
GGTGCACATA CATTGGGATC TACCCACAAG GAACGATCCG GACAAGATGG ATCATGGACA TCCAACCCGA TGGTATTTGA CAATAGTTAC TTCAAAGAAC TCTTAGCTGG TGAGAAGGCC
GGGCTGATTC AGTTAACTTC CGATAAAGCA CTAGTTGAAG ACCCCGCTTT TCGACCTCTT GTCGAGAAAT TCGCTGCAGA TCAAAATGCT TTCTTTCAAG CCTTTGCTGA GTCCTACTTG
AAGCTTAGCG AGTTGGGGTA A
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Retrieve as FASTA
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