Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
|
Length (aa): |
246 |
PWM (Da): |
26589.42 |
|
PI (pH):
| 4.95 |
|
Sequence 287
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGKIYPSLSEEHKSAVDQAKGELRAFITEKQCAPLVLRLAFHSAGTFDVNTKTGGPFGTMKLKSEQNHGPNVGLDTAVELLEPIKQKFPLVSYGDFYMMAGIVAVESTGGPQITFNPGRTDLDAPPPEGRLPLPNQGPDQLRNVFVNTMGLTDQDIVALSGAHTLGSTHKERSGQDGSWTSNPMVFDNSYFKELLAGEKAGLIQLTSDKALVEDPAFRPLVEKFAADQNAFFQAFAESYLKLSELG |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic. No EST |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGATCTACCCGAGCTTAAGTGAGGAGCACAAGTCGGCTGTCGATCAAGCCAAGGGTGAGCTTCGAGCCTTCATCACCGAGAAGCAATGCGCTCCTCTAGTGCTTCGACTTGCG TAAGACGAATTGAATTCTCCTTTTTTGGTAATTTTTTATTCGTGTTTTAATGTTGTTATTGCTCTCCAGATTTCACTCGGCTGGGACTTTCGATGTGAATACGAAGACCGGAGGTCCGTT CGGTACCATGAAGCTTAAATCGGAGCAAAACCATGGTCCTAATGTTGGGCTTGACACTGCTGTTGAATTGTTAGAGCCTATTAAACAGAAGTTCCCACTTGTTTCCTATGGTGACTTTTA TATGGTAACTATGATCATGATACAATATAATTATATAAATTTTTTTTTAAGTTATGTTGTGGATCAATATTAATCTACATTTATCTTGATATATAGATGGCTGGTATTGTCGCGGTTGAA AGTACCGGAGGACCACAAATTACTTTCAACCCCGGGAGGACGGTATGTGCTTTTCAATGTCGGTTAAACCAGAAGACTGGTTGAACCGGTATGGTTGTATTGACTGACCTGGTTTAGTGG TTGAATCAATATTCAATGACCCCTCTCACTAGTTGGACTTGTGTTGATTAGATTTTTTTTACAATACTTTTTGTCATGCATAAATATTACTATTTGAAACAATCTAAAAAAATATTGTTG TATATATAAGTAACAAAATTAGATACTTTCATTTGAAAATTCTCTTATTATTCTATACTTTTTTCACTCTAAAAAACATATTTTTTATTCATTTAAATATAACCAACGTAACAATATAGT ATTCAAATTAATGTAATATATAGTTTTTTTTAAATTAGTTATGACATCATTATGTTTTGGGTCTGGTTTAACTGTTTCAACCAGTGAACCAGTATTATGGTTGGTTATATGTCTGGTTCA GTTGGTACAATGATCGGTTTGGTTTACATAATATTATCAATGCTCTTAATTTCTATATAATATATTTAAATGTTTTATTTGCCATTATATAATATATTTTATTGTAAATTATAATTGATT TTTCATTCTTCAAGGACCTGGATGCTCCCCCTCCAGAAGGTCGTCTTCCTCTTCCTAATCAAGGTTGGTGAAGAAAATTGACAATTTATGGAAATTAATTATGTTGAATTCTTTTAAAGT GGCATCATTAATACTTTATATTTATATAAAATATATGTCAGGTCCTGACCAGTTGAGGAATGTGTTTGTGAACACCATGGGTCTCACTGACCAAGATATTGTTGCTCTCTCTGGTGCACA TACATTGGTTTGTTTTCATACACTTATACCACATGTCATTATATAATATATATTATTTAAAAGAATAAAATCCTAGATAAAAAAATATTTCGGGTCAAACCAATGAGCACAAAGGTTACA TATTTTGATCTGTTACCCAACCTGCTTGTTGTAACATGTTTACTTGTTCTAGGGATCTACCCACAAGGAACGATCCGGACAAGATGGATCATGGACATCCAACCCGATGGTATTTGACAA TAGTTACTTCAAGTAAGCTTTGTTACAAATTTTTGGTCCCTTTTTTAAAACTTTACATTCTTCATTATCATTAAGTATCATTTTGTTGAACCCGCAACAGAGAACTCTTAGCTGGTGAGA AGGCCGGGCTGATTCAGTTAACTTCCGATAAAGCACTAGTTGAAGACCCCGCTTTTCGACCTCTTGTCGAGAAATTCGCTGCAGTAAGTACATTTTCTTGTTTATTGCAATGTAATAATG TCACTTTTATAATTTTAATACCATAACCATAAGTGCTAACAATAATGGGCTTTGTTTTATTTACAATAACAGGATCAAAATGCTTTCTTTCAAGCCTTTGCTGAGTCCTACTTGAAGCTT AGCGAGTTGGGGTA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGATCTACCCGAGCTTAAGTGAGGAGCACAAGTCGGCTGTCGATCAAGCCAAGGGTGAGCTTCGAGCCTTCATCACCGAGAAGCAATGCGCTCCTCTAGTGCTTCGACTTGCA TTTCACTCGGCTGGGACTTTCGATGTGAATACGAAGACCGGAGGTCCGTTCGGTACCATGAAGCTTAAATCGGAGCAAAACCATGGTCCTAATGTTGGGCTTGACACTGCTGTTGAATTG TTAGAGCCTATTAAACAGAAGTTCCCACTTGTTTCCTATGGTGACTTTTATATGATGGCTGGTATTGTCGCGGTTGAAAGTACCGGAGGACCACAAATTACTTTCAACCCCGGGAGGACG GACCTGGATGCTCCCCCTCCAGAAGGTCGTCTTCCTCTTCCTAATCAAGGTCCTGACCAGTTGAGGAATGTGTTTGTGAACACCATGGGTCTCACTGACCAAGATATTGTTGCTCTCTCT GGTGCACATACATTGGGATCTACCCACAAGGAACGATCCGGACAAGATGGATCATGGACATCCAACCCGATGGTATTTGACAATAGTTACTTCAAAGAACTCTTAGCTGGTGAGAAGGCC GGGCTGATTCAGTTAACTTCCGATAAAGCACTAGTTGAAGACCCCGCTTTTCGACCTCTTGTCGAGAAATTCGCTGCAGATCAAAATGCTTTCTTTCAAGCCTTTGCTGAGTCCTACTTG AAGCTTAGCGAGTTGGGGTA |
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGGAAGA TCTACCCGAG CTTAAGTGAG GAGCACAAGT CGGCTGTCGA TCAAGCCAAG GGTGAGCTTC GAGCCTTCAT CACCGAGAAG CAATGCGCTC CTCTAGTGCT TCGACTTGCA
TTTCACTCGG CTGGGACTTT CGATGTGAAT ACGAAGACCG GAGGTCCGTT CGGTACCATG AAGCTTAAAT CGGAGCAAAA CCATGGTCCT AATGTTGGGC TTGACACTGC TGTTGAATTG
TTAGAGCCTA TTAAACAGAA GTTCCCACTT GTTTCCTATG GTGACTTTTA TATGATGGCT GGTATTGTCG CGGTTGAAAG TACCGGAGGA CCACAAATTA CTTTCAACCC CGGGAGGACG
GACCTGGATG CTCCCCCTCC AGAAGGTCGT CTTCCTCTTC CTAATCAAGG TCCTGACCAG TTGAGGAATG TGTTTGTGAA CACCATGGGT CTCACTGACC AAGATATTGT TGCTCTCTCT
GGTGCACATA CATTGGGATC TACCCACAAG GAACGATCCG GACAAGATGG ATCATGGACA TCCAACCCGA TGGTATTTGA CAATAGTTAC TTCAAAGAAC TCTTAGCTGG TGAGAAGGCC
GGGCTGATTC AGTTAACTTC CGATAAAGCA CTAGTTGAAG ACCCCGCTTT TCGACCTCTT GTCGAGAAAT TCGCTGCAGA TCAAAATGCT TTCTTTCAAG CCTTTGCTGA GTCCTACTTG
AAGCTTAGCG AGTTGGGGTA A
|
Retrieve as FASTA
|
|