View Redoxidase 13593

Entry information : HaPrx39 (HanXRQChr01g0003431/HanXRQChr01g0003451)

Entry ID	13593
Creation	2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes	2016-05-02 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))

Peroxidase information: HaPrx39 (HanXRQChr01g0003431/HanXRQChr01g0003451)

Name (synonym)

HaPrx39 (HanXRQChr01g0003431/HanXRQChr01g0003451)

Class

Class III peroxidase [Orthogroup: Prx017]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus

Organism

Helianthus annuus (Sunflower) [TaxId: 4232 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	HaPrx39 start..stop	S start..stop
HaPrx[P]64	622	0	1..325	1..327
HaPrx65	580	0	1..325	1..329
HaPrx44	580	0	1..325	1..329
HaPrx33	576	0	1..325	21..349

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	15746257..15746481	223	N° 2	15745968..15746153	184	N° 3	15745645..15745819	173	N° 4	15745362..15745515	152
N° 5	15741703..15741940	236
complement(join(15741703..15741940,15745362..15745515,15745645..15745819,1574596 8..15746153,15746257..15746481))

Literature and cross-references HaPrx39 (HanXRQChr01g0003431/HanXRQChr01g0003451)

DNA ref.	HanXRQ genome: HanXRQChr01 (15746481..15741703)

Protein sequence: HaPrx39 (HanXRQChr01g0003431/HanXRQChr01g0003451)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	325 (298)
PWM (Da):	35260.95 (32269.4)	Transmb domain:	i7-25o
PI (pH):	8.2 (8.21)	Peptide Signal:	cut: 28 range:28-325

Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MATYKNSFGYFVLPVMVLAFLTLQAEGQGLKVGFYEKSCPHAEKI
VTTVINEVMAVAPSLSGPLLRMHFHDCYIRGCDGSVLLDSPTNQSEKFAPPNLSLRGFNIVDRVKLALENACPGVVSCADIVALVARDVTVATKGPFWEVETGRRDGNVSLISDPINPATGLPPFFASINLLKQSFALRGLNTKDLVVLSGGHTIGMSHCSSFDSRLYNFTGIGDTDPSMDPNYIARLKLKCKQGDQTTLADGFKTFDDSYYRLVTKRRGLLQSDAALLNDPETRAYLVQSTSHGSTFFTDFGVSMVKMGRIGVLTGSQG
EVRKVCSKRN

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Remarks

Complete sequence from genomic. No EST.

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGCCACTTACAAAAACTCATTTGGATATTTTGTGCTTCCAGTTATGGTTCTAGCATTCTTAACTCTCCAAGCAGAAGGCCAAGGCTTAAAAGTTGGGTTCTATGAGAAATCATGCCCA
CATGCTGAAAAGATCGTAACTACGGTCATCAATGAAGTTATGGCAGTCGCCCCGTCACTTTCTGGCCCATTGTTGAGAATGCATTTCCACGACTGCTACATTCGGGTTTGTAACATGTTA
TATTATCATATAATTCAAGTTCACTTCTTAGATTATTTCATCATCTAACGTGAATGTGTTTTATGATTTATGAACGTTTCATTTGTAGGGGGTTGTGATGGTTCAGTTTTATTGGACTCT
CCAACAAATCAATCCGAGAAATTTGCACCCCCGAATCTCAGCCTGAGAGGGTTTAATATCGTTGATAGAGTGAAGTTGGCGTTAGAAAATGCCTGTCCAGGTGTAGTTTCTTGTGCTGAC
ATCGTAGCCCTTGTTGCCAGAGACGTTACTGTGGCGGTAGATTTATCCCCCATTCAAATCTAATGCTAAAATTAGCTTCATGTGTATAGCATGATAATGCCGACATTTTGGATACAATGT
TCATTTTTCTTGTGATAATAATGATTCATCATCTTCTTATACGACGAACCTCTTTTGTTAACAGACACCAAGGGACCATTTTGGGAGGTCGAAACTGGCCGAAGAGACGGAAATGTGTCT
TTAATCAGTGATCCCATAAATCCAGCAACAGGATTACCGCCATTTTTTGCAAGTATTAATCTTTTGAAACAATCATTTGCACTGAGGGGACTAAACACAAAAGATCTTGTGGTTCTCTCT
GGTACGTTAATGAGTGTTTTTATTTTCCAGGAACCTTTCTTACAAATTCATATCTTCAGCAAAGTTAGTATCAAAGTGATTAGTTTCCAGATTGTTCGTAACTAAAATGCGTAATCTTGA
TCATTTTTAGGAGAGGGCATACCATAGGGATGTCTCATTGCTCGTCATTCGATAGCCGTCTCTACAACTTCACTGGGATAGGCGATACTGACCCCTCAATGGACCCAAACTACATTGCAA
GATTAAAGTTGAAATGCAAACAAGGAGACCAAACCACTTTAGCTGAGTTAGACCCTGGGAGCTCACTACTACAGAAATAGGCATTTGCGACGGCCAAATCCGTAGCAAATCCATAGCAAA
CACCCTTTTTGCTACGAATTTGCTACGGATTTGGTTCGTAGCTACAAGTCCCGTCGCGAATTTATTTGCTACGAACTTTAGCTACGGAAATTATGTTTGCGATGAATTTAGCTACAAAAA
ATGTCGTCGGTATTTTAGCCACGAATTTGCTACGAACAAGGTTGCTACGAAATTTCGCTATGGTTTTTTAGCTACGGATGTTTTTAGCTACGGAAACTTTAGCTACGGTTGTTTTTAGCT
ACGGATACTTGTAGCTACGCAACATTTTAGCTATGGTTATTTTTTAGCTACAGAACTTTGCTACCATTTTTTGCTACAGATTATTAGCTACAGAGTCTTTTTGCTATGGATTTTAGCTAC
GGTTTTTTAGTTACGAAACTTTGCTACCATTTTTATATTAAAATATATCCAAATTCACATAAAGATTTACAATCACAAATAAAACCTGAGTTTCTACAATTTGATAAAAATTATAAGATA
TATACAACGCAATAAAATATCATAAAATTCTACAATTATTGGAATACAACTTCTATATCTAAATGAAGAAAACAACACTACTTCATGCCATCAAGAACACAACTTCTTATGAATGCAACA
TAGAATATAATGTTTATAAACAGCACCGCTTTTTCTTGATCTTCATCATTTCAAGAACCTTCATTGCCATCTTTTCTAATCAAATGCTTCAAAGCACATGCATTTTAGAGATTCGAACCT
GAGCAAAGACATAATTTAAATTTATTAGTGTAATATAGGGGAATAACATTTGGTGTTCAAAAAAATGCTTCGAAGCAAATTATATGTCCAAGCATATACACCTTTGGCTCACAATAACTA
ATTTGTTTAGTTGTGAGCCTGCGAAGCATTAAGAACCATCCAAAATCTCAAAACCATCTTGTACAAATGGTTGAGAACAAAAACACGAGAGTATAAAAAATATATATTTAAATGGGATTC
GTACTTAAATAATGCAATGTGCACCTGGGACTTAAAAAACACATATTAGTGGTAATGATGATTAATTATGAAGAGAGATTATAAAAATGAAATGATCGCATACCCCGTGACGCCGTAGTA
TGAATGAGAATTTAGTTTGGGGATGAATTAAGAAAATAAGTGTATTTTGGAAGAAAGAAACTTGAAAGATCGAGCTCGGGCTCGTTAAGGCTCGACTCGTTCGAGCTTTTAACCGAGTCG
ATCACGAGTAGCTCTCGAGCCTCTGGGCTTGTTTACACCCTTAACTACAATAATAAATACTCTGTGAGTTAATTGACTATGTGCCTACACAACACTGATGCATTCTTCTTTATGGCCACC
TCTGAATAACTATAGAGAGTGACTTTTTTACCCCTATGACAAACGAAACACAGAAACAAACACTACAGAAAAAAAAAGTTCAAATCTTTTAACTGTGTATTTGCAATTTATAACCAGAAA
CCTAGAAGGAATACATTAAATCGTTTAAATTTTCAACGCTAAAATTACACACAACCAAATTGATACATAAATGTTAATCCATCATCTTCCTGTCAAATGCAAATTAACAAATAAAACAAA
TTCAATTTAAAACCTAACAACATATTTTGAAATGAGCTCAAAAAAACCAATTTCTCCAATTCTATTGCCGTCATCAAAATTCCGTCAAAGAACAGTCTCTCATTCTCCCTTTATGTATGA
AAACCTTTCTTACTCTCCAAGTGTATCCCTAAAAATTACCAACCTAACACAAATGACCGACACAAATTTCGGATTCGAGTAAAAGGATTGATGATACCTGATGAAACAGCAGTGGCGGTG
AAGACGTTGTCCGATTGAGGTTGGCTGGAATGAGATGTTGGTCGCCGGACGGAACTAGAAGGTTGGCCGGCGGCTGGAACAAGAACGTCGGCGAGTTTAAGGGTGCGACCGTGGGCTGGA
ATGTGTGTTTTTTAGGATTGAGGGGGTATACAAGTAGTACAGGAAGTCAAAATTAAATTATACCAATTTAACAAATCTATCGAATTATACTTAGATCTGTGATTTAAAAAAATAGGAAAT
AAAATTGTTAAATAAACGTCTTTAAGAATCTATGCAAAATTATATGAGTAATTTATTAATATTACATACATATCTAAGTATTTATACATATTACGTATGTATATAATATTAATAAATTAA
TGAATTGTGGGAGTCGGTAGGAGTCGGTTCAAGTTTTTACCCAAATACCCAACTACCCGATTTCAACAAGGACAGGAACCGAGTTTTAGACGTGGGTTTTTTTCGGGTAGTGTACGTAGG
TGAGGTCGGGTATCGGTTTGGGTCGGTTCTTGCTCGGGTCGGGTCGGGTTTTGATTTTTCTCACCCCTAGAAGAAATAGATCGAAAGAAATTGGAAGTGTACCTGAGTCACAAGAAATTA
GACCTTGGAAATTAAAATTGAAGGTCGTGATTCCGGTGGAGTGGGCGGCGATGGTCGTGAACGGTGGTAGAGTAACTGGTTGCATATGAGAAAACCCTATTTTGGGGTTTAAGCTTTATT
TACATCCAACTTTCTACAATTTTGCTACCAAGTTTATTTAACTTTTTTATTTAATTTTCAAACATTTCTTTTTGCTACTGATTTTGCGACGTTATTTTTTTATATTTTTTTCCTCAGATT
TGCTACGGATGTTGCTACAACTTTTTTCTACGCTTGGTTTTAATTTTTTTTTTTTTTGATAAATTTTGCTACGAATTTTGCTAGGCTTTTTATTTAATTATTTTTTAGATACTTATATTC
TCAACTTTGCTACAGATTTTGCTACTGGTTTTATTTAATTGATTTTTAGTTAATTTATAAGTATGTATTTTCTTGGTTTTGCTACGGATTTTGCTATGTTAGTTTTTAAGAATTTTTCTA
TATTTTGCTACCAATTTCTCTGCAGACTCAATTTACTTACCGATTTTGCTACCATTCTTATTAAACCTCAGTTAGTTAGTTTTTAATATTTATTTTTATGATTTAGCTATGGACTTTGCT
ACCAATTTTACTAAGTTTTTTTATTAAATTTATTTTCACAATTTTGCTATCGATTTTGCTAGAAATTTTATTTTACTTTTTTTAGTTTATTTCTTAATACTTATTTTCATGGTTTTGCTA
CCGGTTTTGCTACAATATATGATTTATATTAATTTCATCAATTAATTTGCTACGGATTTGCTATGAGTTTTGCTACAAAATTCATTTGCGACGGAAGTTCGTAGCTAATCCGTAGCTAAT
TCGTAGCAAAATGTGCTCGTAGCTAATCCGTAGCAAACTCGTAGCAAAATTTGCCACCATTTTTTTCTGTAGCAAAATTTCATAGCAAATGCCTCTTTTTGTAGTAGTGTGGCTTCAAGA
CATTTGATGACTCTTACTACAGACTAGTGACTAAGAGGAGAGGACTTCTACAATCAGATGCAGCCTTGCTTAACGACCCTGAGACTAGAGCGTACTTGGTTCAATCTACTAGCCATGGTT
CCACTTTCTTCACGGATTTTGGTGTGTCTATGGTTAAAATGGGTCGTATTGGGGTTCTTACTGGCTCTCAGGGTGAAGTCAGGAAAGTGTGTTCCAAAAGGAACTAA

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CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA