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Entry information : HaPrx42 ( HanXRQChr02g0053951)
Entry ID 13596
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaPrx42 ( HanXRQChr02g0053951)
Name (synonym) HaPrx42 ( HanXRQChr02g0053951)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx033]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx42
start..stop		 S start..stop
HaPrx24 540 0 1..334 1..333
HaPrx43 493 1.87e-177 1..325 3..329
HaPrx102 486 1.38e-174 1..325 3..324
LsaPrx42 456 2.06e-163 1..287 1..287
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 159745048..159745272 223 N° 2 159745840..159746019 178 N° 3 159746123..159746285 161 N° 4 159747769..159748205 435
join(159745048..159745272,159745840..159746019,159746123..159746285,159747769..1 59748205)


exon

Literature and cross-references HaPrx42 ( HanXRQChr02g0053951)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr02 (159745048..159748205)
Protein sequence: HaPrx42 ( HanXRQChr02g0053951)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (308)
PWM (Da):   %s   35943.04 (33192.6) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   7.93 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MANSKAVAFIAAIMFIILNLTGHCYGDLQFGFYNGKCQSSDVEDI
VRRTVVAKFFSDKTIAPALIRMQFHDCFVNGCDASILLDGNNSEKTASPNLSVRGYDVIDDAKAAVERVCPGVVSCADIIVMATRDVISLSGGGRYNVQTGRRDGTVSLAQNTASLPSPSTSVSSAIQAFASKGLNATDMIYLLGGHTIG
VTHCSFINDRLYNFKNTGKPDPNMDWELLTSLRRTCPQNAAVDRAINLDQNPFSSSVVDKSFYNQIMLRRGVFQIDQELAIDSLSKPTVAAIASSSDFTTKFGQAMVKLGAIQVLTGTQG
EIRRSCRAVNGPTWPSLFN

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAAACAGTAAAGCAGTTGCATTCATAGCAGCAATTATGTTCATCATCTTGAACCTAACCGGTCACTGCTATGGTGATCTCCAGTTTGGGTTCTACAATGGAAAGTGTCAAAGTTCA
GACGTTGAAGATATTGTAAGAAGAACGGTTGTCGCTAAATTCTTTTCCGACAAAACGATCGCCCCAGCTCTCATTAGAATGCAGTTTCATGATTGCTTTGTGAATATGTAAGTTAATATT
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ACGTTATTTCATTGTGGTAAACAATATTATATGTATTGAATTTTATAACTTATTAGATTCAGAACTTTATAATTATATTTAGTATGCATGTTTTAACTTTAAATATCATATTATTGTAGA
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CTAGTAAAGGACTAAATGCGACCGACATGATCTATCTTCTTGTGGTAATTCATTAAACTATGACAATTTTAACACGCTTAAGATTTAAGTTAGATTTTATTTTAGACAGGCTAAACTAGA
AATTAGAAATATACCTAAAGGGGAAATTGGTAAAAGTCGCTCAAAACATATACTAAATTAGGTGTGTAACCAATCTTAGTCGAATCTACTATTGTGAAGGCTCAAGTTGAACTTGATTGA
GCCTTCAGTTTTAAACTTGTGCTTGACTTCACTACTAGAGAAGTGGAAATTTTCCTAAGAAAATTTACTATGGAAAAATATGAGGCGGAAATTCCTAAAAAAATGCGATAAACTTTGTAC
GCAAATAACCCTAATTTAGAGACAAAATTCCCACAAGATAGCGAAAAAAAAGAATCTTTGTAAATGTGTTGTGGCGTTCTCGTCCGACCAGCTTTCTACCAGTACTTAATTTAGCTCACT
TATCTATATTAGGTAAACTATGGTGATAAAGTGGTGTATTCTCCAATCAAATGGTTGTTGGTTCAAATCCTGGGCAGTGTGATGATTTTAACTATAGAAAAATAAAAAAAAATATTAGTC
AAGGGCAATTTATATATCTACAAAATTTTCAAACGTAAAATAGCATAAGGATGATAAGGCTAGTGAGTCTCGGTATGGAGTTTTATAATACACTAACATGACTCACCCACGTAACTAGAC
TCGCGAGAGTTCATTTCAAATATTTTCTAGTAAGTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTCTAGTAGGTACTAAGTAGCTTGCAAGATGACTTACCTTAATTACACCCCTATTG
TAAAATTAATACAAGATACGCATTAAATGTATTTTTAATGACAAAGTAACATACTTCTATGCCTGTACTTTATATGATTTGAACTTGTTGGAATTAAATCTCGATTGAAGGAATTATATA
TGTGAATCATGAAAGTTAAAGGTTAAAAGGTTAACTTGGTGTTTAAGATAAACACACAAGATATATAGATAATGGTTAGGGATTTTTTTTAATTATTTGTTTCCTTATAAGAGTAAGATT
TTTTACAAGACTTCTTAACAAGGTTTATTTTAGTATAAAGGGCTAGAATCATTGTATTTTTTTTGTTCTTTGTTCATAATAATTTAGAATTCGTAACTAGTGATTAGTTACATAAGATCA
TTGTACTTGTAACGTTTGCTCGATCCAGTTTTCCAACAAACTCTCAATCTCATAAACAGAGAGAAGACATCTTACCACCACACCATTAAATCAATACATTAGATTACAATTTTAATAACT
TAACTGTGGTCATATCTAGCACACTCAATTTCGAAAGACTGGTATTTGGGCCAACTAGTTATGCAATACCACATTGGTCTCTACCCAAAAGTTATCAGTTTTTACCACTTAACCAATTCA
CTTTGCCACCTTTACAACTCAGTACCGTTGCAAATTTATTAATGATTATTTCAAACACACATTTACTTAACATTTTTTTTGGTGTAGGTGGTCACACTATTGGAGTTACTCATTGTTCTT
TTATTAATGATCGCCTTTACAACTTCAAGAACACTGGGAAACCAGACCCCAACATGGATTGGGAGCTGTTAACATCACTGAGACGTACATGTCCTCAGAATGCAGCAGTAGATCGTGCTA
TAAACTTGGATCAAAACCCTTTTAGCTCTTCAGTGGTAGACAAATCTTTCTACAATCAGATTATGCTTCGTAGGGGAGTTTTTCAGATTGATCAAGAGTTGGCAATTGATAGTTTGAGTA
AGCCCACGGTTGCGGCCATTGCTAGTTCCTCTGATTTCACAACCAAGTTTGGTCAAGCCATGGTTAAGTTGGGTGCCATCCAAGTTCTTACAGGAACACAAGGAGAGATAAGGAGGTCAT
GCCGAGCAGTCAACGGACCAACATGGCCTTCTTTATTTAATTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAAACAGTAAAGCAGTTGCATTCATAGCAGCAATTATGTTCATCATCTTGAACCTAACCGGTCACTGCTATGGTGATCTCCAGTTTGGGTTCTACAATGGAAAGTGTCAAAGTTCA
GACGTTGAAGATATTGTAAGAAGAACGGTTGTCGCTAAATTCTTTTCCGACAAAACGATCGCCCCAGCTCTCATTAGAATGCAGTTTCATGATTGCTTTGTGAATGGGTGTGATGCGTCA
ATTCTACTAGACGGAAACAACTCTGAGAAAACCGCATCTCCAAATTTAAGCGTTAGGGGCTACGATGTGATTGATGATGCAAAAGCCGCGGTGGAGAGAGTGTGTCCAGGGGTGGTTTCT
TGTGCTGACATTATCGTTATGGCTACAAGAGACGTTATTTCATTGAGTGGTGGAGGTAGATACAATGTCCAAACTGGAAGACGAGATGGGACAGTGTCTCTTGCGCAAAACACCGCAAGC
CTCCCATCTCCTTCTACATCGGTATCAAGTGCAATTCAAGCTTTTGCTAGTAAAGGACTAAATGCGACCGACATGATCTATCTTCTTGGTGGTCACACTATTGGAGTTACTCATTGTTCT
TTTATTAATGATCGCCTTTACAACTTCAAGAACACTGGGAAACCAGACCCCAACATGGATTGGGAGCTGTTAACATCACTGAGACGTACATGTCCTCAGAATGCAGCAGTAGATCGTGCT
ATAAACTTGGATCAAAACCCTTTTAGCTCTTCAGTGGTAGACAAATCTTTCTACAATCAGATTATGCTTCGTAGGGGAGTTTTTCAGATTGATCAAGAGTTGGCAATTGATAGTTTGAGT
AAGCCCACGGTTGCGGCCATTGCTAGTTCCTCTGATTTCACAACCAAGTTTGGTCAAGCCATGGTTAAGTTGGGTGCCATCCAAGTTCTTACAGGAACACAAGGAGAGATAAGGAGGTCA
TGCCGAGCAGTCAACGGACCAACATGGCCTTCTTTATTTAATTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCAAGGAAA AAATAAATGG CAAACAGTAA AGCAGTTGCA TTCATAGCAG CAATTATGTT CATCATCTTG AACCTAACCG GTCACTGCTA TGGTGATCTC CAGTTTGGGT TCTACAATGG  AAAGTGTCAA AGTTCAGACG TTGAAGATAT TGTAAGAAGA ACGGTTGTCG CTAAATTCTT TTCCGACAAA ACGATCGCCC CAGCTCTCAT TAGAATGCAG TTTCATGATT GCTTTGTGAA  TGGGTGTGAT GCGTCAATTC TACTAGACGG AAACAACTCT GAGAAAACCG CATCTCCAAA TTTAAGCGTT AGGGGCTACG ATGTGATTGA TGATGCAAAA GCCGCGGTGG AGAGAGTGTG  TCCAGGGGTG GTTTCTTGTG CTGACATTAT CGTTATGGCT ACAAGAGACG TTATTTCATT GAGTGGTGGA GGTAGATACA ATGTCCAAAC TGGAAGACGA GATGGGACAG TGTCTCTTGC  GCAAAACACC GCAAGCCTCC CATCTCCTTC TACATCGGTA TCAAGTGCAA TTCAAGCTTT TGCTAGTAAA GGACTAAATG CGACCGACAT GATCTATCTT CTTGGTGGTC ACACTATTGG  AGTTACTCAT TGTTCTTTTA TTAATGATCG CCTTTACAAC TTCAAGAACA CTGGGAAACC AGACCCCAAC ATGGATTGGG AGCTGTTAAC ATCACTGAGA CGTACATGTC CTCAGAATGC  AGCAGTAGAT CGTGCTATAA ACTTGGATCA AAACCCTTTT AGCTCTTCAG TGGTAGACAA ATCTTTCTAC AATCAGATTA TGCTTCGTAG GGGAGTTTTT CAGATTGATC AAGAGTTGGC  AATTGATAGT TTGAGTAAGC CCACGGTTGC GGCCATTGCT AGTTCCTCTG ATTTCACAAC CAAGTTTGGT CAAGCCATGG TTAAGTTGGG TGCCATCCAA GTTCTTACAG GAACACAAGG  AGAGATAAGG AGGTCATGCC GAGCAGTCAA CGGACCAACA TGGCCTTCTT TATTTAATTG ATATAAAATA TCATGTGTTT ATTTGTAAAA TTATGCCTGT TATCAGTTAT CTGATTTCAT 
GAGTTTAAGA ATTAAAATAC ATATTTGATT GATTATTATT AGGTATTTTG ACACCCTTGT GCTCTCATCA AACTAAGAAC TAA 

Retrieve as FASTA