Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
304 (328) |
PWM (Da): |
33022.6 (35286.3) |
Transmb domain: |
i7-29o |
PI (pH): |
6.77 (4.36) |
Peptide Signal: |
cut: 24 range:24-351 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MSMPMASSGFYENTCPKVEAIVQKIIAEKISLAPSLAAPLLRMHF HDCFVRGCDGSVLIDSTKNNQAEKDGFPNLSLRGFQIIDAAKTVVEAACPGVVSCADILALVARDAMYQIKGPYWPVPLGRRDGRVSIASESLTDLPSPFDNITRLKEHFTSKGLSVKDLVVLSGG HTIGTSHCLGVAVRLYNFTGKGDTDPSLDSDYVPYLKSKCKPTDTTTLIEMDPGSFRTFDENYYTNVLKRRGLFVSDAALLNDYETSAYVKLQAQSHGSTFLKDFQESMVKMGQIGVLTG SAGEIRQYCNAIN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
partial sequence from genomic (part of PS is missing : MAYLKNLCSLFYHLLLLAFILTNNVNADGLK found with frame shift) |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCAATGCCGATGGCCTCAAGTGGGTTCTATGAAAACACATGCCCTAAAGTTGAGGCTATTGTACAAAAGATAATAGCAGAAAAAATTTCGTTAGCTCCATCTCTTGCAGCTCCATTG CTCCGAATGCACTTTCATGATTGTTTTGTTAGGGGGTTAGTACATGTAGTATAAGCTTGTTTGTTACGTACACTTTTAACTTTTTAAGTTTCCTAACCCATACTTCACGTAATAGCATAA CGCATTACGTCTTCACATAAACTATGAAAAGGATCGGATATAGTCTATATCCGATCCTTTTCATAGTAACGAGTCTCGTCTTAGTTATATCTTATTTAAATCTACCATTTCGTCGGAAAT TTGTTTGAAAATGTTTCCCACAAATCATTTTTGTAAGAAATTTGTCGAAAATGGCAGTTTCGTACGCTTTTTTTTTTTTTTTGACATAATTTGGCATAGGAGTAGACTCACTTTTGTAGT AGTGAGATGTAGAGAATTTTTTTGGGCATAGTACAATGTAAAGAGGGATTGTAATATTTTATAAATGGTATATCAGATTGCAACTTTATCACAAATTAAGTTGATAATCAGTTATTTATC TGCAGGGCTGTGACGGTTCGGTCCTAATCGACTCTACAAAAAATAACCAAGCCGAGAAAGACGGATTTCCCAATCTTTCCCTTAGAGGATTTCAAATTATCGATGCAGCAAAAACTGTTG TAGAAGCCGCATGCCCCGGTGTTGTCTCTTGCGCGGATATTTTAGCTTTAGTGGCTCGAGATGCCATGTATCAGAGGTAATTACCATTACAAGAGAATGCGTAAATTAGACCTAAGTTTG CCCCACACCGTGGAGCCTTATGTACCGGGTTTGCCGTCTTTTTCTCTAAAATCTATCTTTTGGTATTTTTTAAAAAAGTATATATATTTTTTCTTTTTCTAGATTAAAGGCCCTTATTGG CCTGTGCCACTGGGGAGAAGAGACGGAAGAGTATCAATAGCATCCGAGAGTTTGACTGATCTACCTTCTCCTTTTGATAACATTACTCGGCTCAAAGAACATTTCACCTCCAAGGGCTTG AGTGTTAAAGATCTTGTTGTTCTTTCAGAGGTATTTTGTCACCCAAAAAAATCAATAGAAAAATAATGTGGTCAATCACACAATTGTTTGTTCCTTGATGACAATATATGCGAATCAATC AATAACTACAGAATACTATATGGTAAAATACCGGTCAAATTTAACAAGATAAACATTAAATGTTCATTTTATAAAAATAAATTTATACTTTTTTTTTCTTCCGAGTGTACTTATGAGTAC TAATCACTCGACCACGTGGACATCATTAGGACGTGACATGTGGCTTCTTTAGGCGAAAAAGCTGGTGCAAAACTAATATATATAGTCCGCGTGGAAGGCGGATTAGTGCTCTTGTACGCA TGACATGCGACAAAGCATAGATTAGTTTTTGTAAAACAAAAGGTCAAGATTTATTCTGTCAACTTTGATTGACTCATTTTGGTGATTATTTCATGATAAAGGTATTATATACTATTTGAA AGGGTAAAATACAATATCATTTAACGTACAAATTCAGGGGCGGAACCAGCGGGGGGTCAAGAGGGTCCGTTGACCCTCCGGTCACCGGAACTTTTTGAATTTTTATTTATAAATTTTGAG TTTTTAAAGAACAAACTTAGGGATGGACCCCTAATTTGAACCAGTATAGAATATAAGCTTATGATGACCCCCTAACTAAATCGTTCTGGTTCCGTCATTGCGTACAATACGTATGAGATG AAATTATAACATGCGTGATTAGGTTTTTACCCATGCGTGATTTTTGATTTTGTACATGCGTGATGTATGGTTTTTCAACATGCGTGTTTAGGGTTTTGAGTTTTATAACATACGTAATTT CATCTCGTACGCATCGTATATTAAGAAATATTGTATGTTAACCCACACCTATAAATTATATCTCCTAATTAATATATGATAAAATAAAAAGTGAATGAACAATATCATTCACTTTTCATT TTATATATATTAATTCTTTATTTATTATGTGATTTTTTTTATATTGAGCAATACCTTATATTCATTTATTAGACTAACAGGTATGGGGTGAGGGTTTGGGCATGGTTTGGGTACAAATTC CCAAGTCACCACCCCGGGTGGGTTTGGGTTTCGGTGTGGCCCCTTGAGCGGGAGTTTCAGCCCGGGCGTTGGGCATGCCTAGCGGTCCTCCGTGGCCGGCTCTCATTGGCTGGGTTGGCT AGGCCTTAGCGGCTAGGTTTAAATTTTAAAAAATAACCGTTTTGCAAGTCACTATAAAACCCCCCAATCCCACCGCCTGTCCACATCGCTACCCCAACCCTTCACTCCACCTACCCGAAC CCGCTACCCACACTTGATACCGGCACAACGCGATGAAGGGCCGCCAACCCGGTGAGACCCGTTGCTGGCCAGAAGCTTTCGCTAGCTACCGGCACAACGTGGGGAACGACCGTCACAATT TAAACTCGTGCCAACACAAGTGGCGCGAGCTACGACCGAAGCTCTACCGTTTTAAAGCCTACTACGATAGCAGCCCGGGTGGTGATATAAGTCACGAAAACCGGGTGGCGGTGGCCAACA TCGAGTTCCAGGGCAAGGAGCGGAAGCCGTTTGACAAGCTCGCCCTATTCGAAATCTACCTAACGCTTTAGGCTTTTTTTTATTAACCGACCCAACACGTCACTCACCAACGGGGAGGCT CGAAGTCCACTTTTACAGTGATTAAGTGTTGAAACAAGAGTTAGGGTCTACGTTCAGTCTTTGCAATAAGTGAAACAGTTAAATGAAGAGTTGCAGGATGATGTCGGTCGAAAACAACAA TGCCTTTCGCGCAACGCGCGTCATTGAAAAACACTAGTTATGGTTAAAAATATTATGATAAATTTAAACTAATTAAAAAGCACAACAATAAGAACCCGAATAACTTGGTTTAACATCTTG CCTATTCTTTCATACAGGGGGACACACTATAGGGACTTCACACTGCCTTGGAGTAGCGGTTCGGTTGTACAATTTCACTGGCAAAGGTGACACCGATCCTTCACTAGACTCGGATTACGT ACCTTACTTGAAGAGTAAATGTAAACCCACTGATACAACGACACTGATTGAGATGGATCCAGGGAGTTTTAGAACATTCGACGAGAATTACTACACTAATGTTTTGAAAAGGAGAGGCTT GTTTGTATCAGATGCTGCTCTTCTCAATGACTACGAAACAAGTGCTTATGTGAAGCTGCAAGCACAGTCTCATGGGTCTACATTCTTGAAGGATTTCCAGGAATCAATGGTTAAAATGGG CCAAATCGGAGTTCTGACTGGCAGTGCTGGTGAAATCAGGCAATATTGTAATGCAATTAACTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCAATGCCGATGGCCTCAAGTGGGTTCTATGAAAACACATGCCCTAAAGTTGAGGCTATTGTACAAAAGATAATAGCAGAAAAAATTTCGTTAGCTCCATCTCTTGCAGCTCCATTG CTCCGAATGCACTTTCATGATTGTTTTGTTAGGGGCTGTGACGGTTCGGTCCTAATCGACTCTACAAAAAATAACCAAGCCGAGAAAGACGGATTTCCCAATCTTTCCCTTAGAGGATTT CAAATTATCGATGCAGCAAAAACTGTTGTAGAAGCCGCATGCCCCGGTGTTGTCTCTTGCGCGGATATTTTAGCTTTAGTGGCTCGAGATGCCATGTATCAGATTAAAGGCCCTTATTGG CCTGTGCCACTGGGGAGAAGAGACGGAAGAGTATCAATAGCATCCGAGAGTTTGACTGATCTACCTTCTCCTTTTGATAACATTACTCGGCTCAAAGAACATTTCACCTCCAAGGGCTTG AGTGTTAAAGATCTTGTTGTTCTTTCAGGGGGACACACTATAGGGACTTCACACTGCCTTGGAGTAGCGGTTCGGTTGTACAATTTCACTGGCAAAGGTGACACCGATCCTTCACTAGAC TCGGATTACGTACCTTACTTGAAGAGTAAATGTAAACCCACTGATACAACGACACTGATTGAGATGGATCCAGGGAGTTTTAGAACATTCGACGAGAATTACTACACTAATGTTTTGAAA AGGAGAGGCTTGTTTGTATCAGATGCTGCTCTTCTCAATGACTACGAAACAAGTGCTTATGTGAAGCTGCAAGCACAGTCTCATGGGTCTACATTCTTGAAGGATTTCCAGGAATCAATG GTTAAAATGGGCCAAATCGGAGTTCTGACTGGCAGTGCTGGTGAAATCAGGCAATATTGTAATGCAATTAACTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGCATACCTT AAAAACCTTT GCTCCCTTTT TTACCATCTT CTACTTCTTG CTTTTATTTT GACCAATAAT GTCAATGCCG ATGGCCTCAA GTGGGTTCTA TGAAAACACA TGCCCTAAAG
TTGAGGCTAT TGTACAAAAG ATAATAGCAG AAAAAATTTC GTTAGCTCCA TCTCTTGCAG CTCCATTGCT CCGAATGCAC TTTCATGATT GTTTTGTTAG GGGCTGTGAC GGTTCGGTCC
TAATCGACTC TACAAAAAAT AACCAAGCCG AGAAAGACGG ATTTCCCAAT CTTTCCCTTA GAGGATTTCA AATTATCGAT GCAGCAAAAA CTGTTGTAGA AGCCGCATGC CCCGGTGTTG
TCTCTTGCGC GGATATTTTA GCTTTAGTGG CTCGAGATGC CATGTATCAG ATTAAAGGCC CTTATTGGCC TGTGCCACTG GGGAGAAGAG ACGGAAGAGT ATCAATAGCA TCCGAGAGTT
TGACTGATCT ACCTTCTCCT TTTGATAACA TTACTCGGCT CAAAGAACAT TTCACCTCCA AGGGCTTGAG TGTTAAAGAT CTTGTTGTTC TTTCAGGGGG ACACACTATA GGGACTTCAC
ACTGCCTTGG AGTAGCGGTT CGGTTGTACA ATTTCACTGG CAAAGGTGAC ACCGATCCTT CACTAGACTC GGATTACGTA CCTTACTTGA AGAGTAAATG TAAACCCACT GATACAACGA
CACTGATTGA GATGGATCCA GGGAGTTTTA GAACATTCGA CGAGAATTAC TACACTAATG TTTTGAAAAG GAGAGGCTTG TTTGTATCAG ATGCTGCTCT TCTCAATGAC TACGAAACAA
GTGCTTATGT GAAGCTGCAA GCACAGTCTC ATGGGTCTAC ATTCTTGAAG GATTTCCAGG AATCAATGGT TAAAATGGGC CAAATCGGAG TTCTGACTGG CAGTGCTGGT GAAATCAGGC
AATATTGTAA TGCAATTAAC TAAATATGTT GATTGGTTTC TTTTTATCTT AAGAGTGCAG CAAATGAAGC TGATGCGTGG TTTGATTAAA TAAAGAGACC CGCGAAAAGG GATCTTGCTC
ACATATATGT GATGCTTGTA TATGGTATTG TTAAGTTGCG TAAATTTGTG AATATTTTAT ACACGGGCAG TATTAAATAA AAAGTTAGTG TCATATCAC
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Retrieve as FASTA
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