Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
334 (300) |
PWM (Da): |
36969.62 (33017.7) |
Transmb domain: |
i19-36o |
PI (pH): |
9.71 (9.62) |
Peptide Signal: |
cut: 35 range:35-334 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MPTILTTMMKTETKMKMQMLCFLFFSFLVASSYAQVKLKQNFYQN TCPNVESIVRSAVTKKFQQTFVTAPATLRLFFHDCFVRGCDASVMLANGNAEKDHHDDLSLAGDGFDTVIKAKAAVDSNPSCRNKVSCADILALATRDVVALTGGPSYNVELGRRDGRISTKKSVQHKLPHADFNLDQLNTMFASHGLSQTDMIALSG AHTLGFSHCGQFKKRIYSKAGIDRTLNRQYALQLRQMCPVNVDPRIAINMDPTTPQTFDNAYYKNLEQGKGLFSSDQVLFTDKRSRPTVNLFASNNNAFNQAFVNAITKLGRVGVLTGNQ GEIRRDCTRVN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGCCCACCATCTTAACTACAATGATGAAAACGGAAACCAAAATGAAGATGCAAATGCTATGTTTCTTGTTCTTCTCTTTCCTTGTTGCTTCATCATATGCTCAAGTTAAACTTAAACAA AACTTCTATCAAAACACTTGCCCAAATGTCGAATCAATCGTTAGATCTGCCGTCACTAAAAAGTTCCAGCAAACGTTTGTCACCGCTCCGGCCACTCTCCGCCTCTTCTTTCACGACTGT TTCGTTCGGGTTCGTTTAACTATCCATATACAAACTTATTAAATTTTGTAATATGATCAATTGTATTCAATGTTATGGTTATGTATGTTGTATAGGGGGATGTGATGCTTCGGTTATGTT AGCAAATGGAAATGCGGAGAAGGACCATCATGATGACTTGTCGTTGGCCGGAGATGGATTCGACACGGTTATCAAAGCGAAGGCCGCGGTTGACAGCAATCCAAGTTGCAGGAATAAAGT TTCTTGTGCGGATATATTAGCTCTTGCCACAAGAGATGTTGTAGCTTTGGTGAGTATTGCCTCAAGACTTGTGGTTACCATTTGAACCAATTTAATGATTTTAAAGTTTTAGGCAGATTG GACTTCAATCATCCAAACTAAACTCATTTCCTGATAATAATTTATAGTAACAATGCGAAAAATGACACTCATAACTTTCACTTTTGTTGTTCAGGGTTGTTTTCACCTTATTACGTGTTC AAGGTTGTTTCACTTTAACAGAAAAGTAACTACGACTGCCGCTAATGAATGTTGTAAATTGTGTTGAAATATAATATAATAATAAATGGAAGTTAGGGGCAGAAGAACTTACTTTACGTT AGAGTGAATTTGTTTTTGGCAACGGAAAGGAAAAAGTCATAAGTTTACTTTGTCACATACCAGCATGAATGAGTCATTGTTTTAAAATTACTACCAATTTGCCTATCACCTTTTATAGCT AAACTAATATGATTCAATCTATTTATATTCTTCAAAATGGCAACTCAACATTTTAAAATGTTTTTTTTTTTTGTGGCTTAATTTTTTTATTTATAATATACAGACACAGGTGGGCCATCG TACAACGTTGAATTAGGAAGGAGAGATGGAAGAATCTCTACCAAAAAAAGTGTTCAACACAAGCTTCCACATGCAGATTTTAACCTAGACCAACTCAACACCATGTTTGCCTCTCATGGT CTATCTCAAACCGATATGATTGCACTTTCAGGTAAACTAATTGATCCACATGGTTGATTAATTAACGGTACCAAACTAAAACATATATTTTAACACACACTTTATCATGTAAACTATTGT TTTCTAGGTGTGCGCATACGCTAGGATTCTCTCACTGTGGTCAATTTAAAAAACGTATCTATTCAAAGGCTGGAATAGACCGGACGCTAAATCGACAGTATGCTCTTCAGCTACGACAAA TGTGTCCAGTTAATGTAGACCCTAGGATTGCGATTAACATGGACCCTACCACCCCGCAAACTTTTGACAACGCGTATTATAAGAACCTTGAACAAGGGAAGGGGTTGTTTAGCTCGGACC AAGTCTTGTTCACGGACAAGCGATCAAGGCCAACGGTTAATCTATTTGCTTCAAACAACAATGCCTTTAATCAAGCGTTTGTGAACGCTATCACCAAGCTTGGCCGTGTTGGGGTTTTGA CAGGAAACCAGGGCGAAATCAGGCGTGACTGTACTAGAGTTAATTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGCCCACCATCTTAACTACAATGATGAAAACGGAAACCAAAATGAAGATGCAAATGCTATGTTTCTTGTTCTTCTCTTTCCTTGTTGCTTCATCATATGCTCAAGTTAAACTTAAACAA AACTTCTATCAAAACACTTGCCCAAATGTCGAATCAATCGTTAGATCTGCCGTCACTAAAAAGTTCCAGCAAACGTTTGTCACCGCTCCGGCCACTCTCCGCCTCTTCTTTCACGACTGT TTCGTTCGGGGATGTGATGCTTCGGTTATGTTAGCAAATGGAAATGCGGAGAAGGACCATCATGATGACTTGTCGTTGGCCGGAGATGGATTCGACACGGTTATCAAAGCGAAGGCCGCG GTTGACAGCAATCCAAGTTGCAGGAATAAAGTTTCTTGTGCGGATATATTAGCTCTTGCCACAAGAGATGTTGTAGCTTTGACAGGTGGGCCATCGTACAACGTTGAATTAGGAAGGAGA GATGGAAGAATCTCTACCAAAAAAAGTGTTCAACACAAGCTTCCACATGCAGATTTTAACCTAGACCAACTCAACACCATGTTTGCCTCTCATGGTCTATCTCAAACCGATATGATTGCA CTTTCAGGTGCGCATACGCTAGGATTCTCTCACTGTGGTCAATTTAAAAAACGTATCTATTCAAAGGCTGGAATAGACCGGACGCTAAATCGACAGTATGCTCTTCAGCTACGACAAATG TGTCCAGTTAATGTAGACCCTAGGATTGCGATTAACATGGACCCTACCACCCCGCAAACTTTTGACAACGCGTATTATAAGAACCTTGAACAAGGGAAGGGGTTGTTTAGCTCGGACCAA GTCTTGTTCACGGACAAGCGATCAAGGCCAACGGTTAATCTATTTGCTTCAAACAACAATGCCTTTAATCAAGCGTTTGTGAACGCTATCACCAAGCTTGGCCGTGTTGGGGTTTTGACA GGAAACCAGGGCGAAATCAGGCGTGACTGTACTAGAGTTAATTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TGTACTCAGT AGTCAGTACT TATATATGCC CACCATCTTA ACTACAATGA TGAAAACGGA AACCAAAATG AAGATGCAAA TGCTATGTTT CTTGTTCTTC TCTTTCCTTG TTGCTTCATC
ATATGCTCAA GTTAAACTTA AACAAAACTT CTATCAAAAC ACTTGCCCAA ATGTCGAATC AATCGTTAGA TCTGCCGTCA CTAAAAAGTT CCAGCAAACG TTTGTCACCG CTCCGGCCAC
TCTCCGCCTC TTCTTTCACG ACTGTTTCGT TCGGGGATGT GATGCTTCGG TTATGTTAGC AAATGGAAAT GCGGAGAAGG ACCATCATGA TGACTTGTCG TTGGCCGGAG ATGGATTCGA
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TCTATCTCAA ACCGATATGA TTGCACTTTC AGGTGCGCAT ACGCTAGGAT TCTCTCACTG TGGTCAATTT AAAAAACGTA TCTATTCAAA GGCTGGAATA GACCGGACGC TAAATCGACA
GTATGCTCTT CAGCTACGAC AAATGTGTCC AGTTAATGTA GACCCTAGGA TTGCGATTAA CATGGACCCT ACCACCCCGC AAACTTTTGA CAACGCGTAT TATAAGAACC TTGAACAAGG
GAAGGGGTTG TTTAGCTCGG ACCAAGTCTT GTTCACGGAC AAGCGATCAA GGCCAACGGT TAATCTATTT GCTTCAAACA ACAATGCCTT TAATCAAGCG TTTGTGAACG CTATCACCAA
GCTTGGCCGT GTTGGGGTTT TGACAGGAAA CCAGGGCGAA ATCAGGCGTG ACTGTACTAG AGTTAATTAA AAAAATGATG ATTATTTTTC TTGAATAAGT AGCTACAATT GTTCAAATGT
ACCTATGCAA GTAGTTTTCG AAGAACAGTT CGATTATGTT GAATATAATT TGAATATATA ATAAATACTT TATGTGAATT GTGATATATC TTTAAGTTGC ACACTACTAG AAAACAGCCA
GATTTACGAC AAGCATATTT GTAGCAAATC TGTGGAAAAT TGGCCTTAGC TACAAATTTG CGACAAAACA G
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Retrieve as FASTA
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