Entry information : HaPrx98 (HanXRQChr12g0378371)
Entry ID 13652
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaPrx98 (HanXRQChr12g0378371)
Name (synonym) HaPrx98 (HanXRQChr12g0378371)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx98
start..stop
S start..stop
NtPrx31-1A 463 1e-165 2..323 6..327
LvPrx18 462 1e-165 5..300 10..304
NtPrx31-1B 461 9e-165 2..323 6..327
LsaPrx18 459 1e-164 5..300 10..304
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 112836176..112836379 204 N° 2 112836619..112836810 192 N° 3 112836891..112837056 166 N° 4 112837182..112837591 410
join(112836176..112836379,112836619..112836810,112836891..112837056,112837182..1 12837591)


exon

Literature and cross-references HaPrx98 (HanXRQChr12g0378371)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (112836176..112837591)
Protein sequence: HaPrx98 (HanXRQChr12g0378371)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (302)
PWM (Da):   %s   35377.59 (32904.4)  
PI (pH):   %s   6.12 (5.76) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-323
Sequence 364
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MHFPTISLVFCLFVFQPFVYGQLDYKFYDTTCPNLTKIVRFGVWSAMANDTRMAASLLRLHFHDCISNGCDASVLLDETSSFRSEKDALPNLNSARGFELIESIKANVEKVCPKTVSCVDILTLAVRDAVLLTGGRYWNVALGRRDGLTANITAANTMTPSPFESLDDIIAKFTAKGLDIKDVVALSGAHTIGFVQCFAFKFRLFNFSGTGSFDPSLDASFASSLQTQCPNQDASDTTLVPLDAVTTTKFDNMFFRNLVNNSGVLGSDQALMSDNRTSAMVINYSKYPFWFAKDFSDSMVKLSNVGVITGQNGQVRDKCNLVN

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCATTTTCCTACTATTAGTCTCGTCTTTTGCCTTTTCGTTTTTCAACCGTTTGTATATGGTCAACTTGATTACAAATTTTATGATACCACTTGTCCTAATTTGACGAAAATCGTGAGGT
TCGGTGTTTGGTCTGCGATGGCTAACGATACCAGAATGGCGGCATCACTTCTTCGCTTGCATTTTCATGACTGTATTTCTAAT
GTAATAATTTCGTCATTTTCATTTCTTGTATTTTGAA
ATTTTTAATCGAATATTTTTATGTGAATCATGGGGACCCCACCAATACCCTGCTAACCAATAAGATTAAGAAAAAACGCAGCTTGCGTTGGGTAGGTAGCCTTCAACGGGGTTAAATGCA
TAAATCACTGCCAGCCGCTTAAATGTTAAATCTTTTAAATGTCGGACTAAATTAAATTAACTTTTTTTTCGTGTGTGTCTAGGGGTGTGATGCTTCGGTGTTACTTGATGAGACTAGTAG
TTTCAGGAGCGAGAAGGACGCTCTTCCTAATCTAAATTCAGCTAGAGGGTTTGAGCTTATTGAAAGCATAAAAGCAAATGTGGAGAAAGTTTGTCCTAAAACAGTTTCGTGTGTTGACAT
ATTGACACTCGCTGTGAGAGACGCAGTTTTACTG
GTAAGACCTTTGTTATATAAACAACATTACAAAAAAAAAATTGGTATTTTTCTAACATATAAATATGCTTTGTTTTCTAGACGGGA
GGGCGTTATTGGAATGTAGCCCTGGGACGTCGAGATGGTCTCACAGCAAATATAACTGCGGCAAACACGATGACTCCATCACCTTTTGAGTCTTTAGATGACATTATTGCAAAATTCACA
GCAAAAGGTCTTGATATAAAAGACGTAGTTGCATTATCAG
GTAAAAAAACATAACATTACCACAAGTTAGCTAATTAATTATACAAATTTTTGTTTGTTGTCATTTTCACACACATGTAA
GGTGTAGTAGGATTGTGATGTTATGTTGCTTTAATTTGTGTGAAGGTGCGCATACCATAGGATTTGTACAATGCTTCGCGTTCAAGTTCAGACTATTCAACTTTAGTGGAACAGGGAGTT
TTGATCCATCACTAGACGCATCATTTGCAAGTAGTTTGCAAACTCAGTGTCCGAATCAAGATGCTTCGGACACCACACTAGTCCCTCTTGACGCGGTGACAACTACAAAGTTTGACAACA
TGTTTTTCAGGAATCTTGTGAACAACTCGGGGGTTTTAGGTTCAGATCAAGCTCTTATGAGTGATAATAGGACCTCGGCCATGGTTATAAACTATAGCAAGTATCCGTTCTGGTTTGCTA
AAGATTTTAGTGATTCGATGGTTAAGCTAAGCAACGTGGGTGTAATTACGGGGCAAAATGGTCAAGTTAGAGACAAATGCAACCTTGTGAACTAG

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCATTTTCCTACTATTAGTCTCGTCTTTTGCCTTTTCGTTTTTCAACCGTTTGTATATGGTCAACTTGATTACAAATTTTATGATACCACTTGTCCTAATTTGACGAAAATCGTGAGGT
TCGGTGTTTGGTCTGCGATGGCTAACGATACCAGAATGGCGGCATCACTTCTTCGCTTGCATTTTCATGACTGTATTTCTAAT
GGGTGTGATGCTTCGGTGTTACTTGATGAGACTAGTA
GTTTCAGGAGCGAGAAGGACGCTCTTCCTAATCTAAATTCAGCTAGAGGGTTTGAGCTTATTGAAAGCATAAAAGCAAATGTGGAGAAAGTTTGTCCTAAAACAGTTTCGTGTGTTGACA
TATTGACACTCGCTGTGAGAGACGCAGTTTTACTG
ACGGGAGGGCGTTATTGGAATGTAGCCCTGGGACGTCGAGATGGTCTCACAGCAAATATAACTGCGGCAAACACGATGACTCCAT
CACCTTTTGAGTCTTTAGATGACATTATTGCAAAATTCACAGCAAAAGGTCTTGATATAAAAGACGTAGTTGCATTATCAG
GTGCGCATACCATAGGATTTGTACAATGCTTCGCGTTCA
AGTTCAGACTATTCAACTTTAGTGGAACAGGGAGTTTTGATCCATCACTAGACGCATCATTTGCAAGTAGTTTGCAAACTCAGTGTCCGAATCAAGATGCTTCGGACACCACACTAGTCC
CTCTTGACGCGGTGACAACTACAAAGTTTGACAACATGTTTTTCAGGAATCTTGTGAACAACTCGGGGGTTTTAGGTTCAGATCAAGCTCTTATGAGTGATAATAGGACCTCGGCCATGG
TTATAAACTATAGCAAGTATCCGTTCTGGTTTGCTAAAGATTTTAGTGATTCGATGGTTAAGCTAAGCAACGTGGGTGTAATTACGGGGCAAAATGGTCAAGTTAGAGACAAATGCAACC
TTGTGAACTAG

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCTATTATCT TAACGACAAA GTTCACTGAA TTAGGAGGCT TCCTTACATA CACCAATATT ACATATAAAA TACACAATTG TTTAGAGTGT AATCCTAGTG TCTTGAACTA TCAACTGCTT  TTTGCATACT GAATGAGCAC CAACTCCACT TAGGAGCTTC AGCTCAGCAT CCAAACTCAA AAGTGCCTTC ATTTTATCTT GATGTTGACT TGTTCCAAAC TCTTTCTAGT GGCAGACCCA  CTGTATATAT AACAAAAATA TCTATTTAAG CCCATCTTGT GTTGCCATAA GTTCTAAGAG TAAGAGCTCT TGAAGCAGCA CATAACTACA AACATGCATT TTCCTACTAT TAGTCTCGTC  TTTTGCCTTT TCGTTTTTCA ACCGTTTGTA TATGGTCAAC TTGATTACAA ATTTTATGAT ACCACTTGTC CTAATTTGAC GAAAATCGTG AGGTTCGGTG TTTGGTCTGC GATGGCTAAC  GATACCAGAA TGGCGGCATC ACTTCTTCGC TTGCATTTTC ATGACTGTAT TTCTAATGGG TGTGATGCTT CGGTGTTACT TGATGAGACT AGTAGTTTCA GGAGCGAGAA GGACGCTCTT  CCTAATCTAA ATTCAGCTAG AGGGTTTGAG CTTATTGAAA GCATAAAAGC AAATGTGGAG AAAGTTTGTC CTAAAACAGT TTCGTGTGTT GACATATTGA CACTCGCTGT GAGAGACGCA  GTTTTACTGA CGGGAGGGCG TTATTGGAAT GTAGCCCTGG GACGTCGAGA TGGTCTCACA GCAAATATAA CTGCGGCAAA CACGATGACT CCATCACCTT TTGAGTCTTT AGATGACATT  ATTGCAAAAT TCACAGCAAA AGGTCTTGAT ATAAAAGACG TAGTTGCATT ATCAGGTGCG CATACCATAG GATTTGTACA ATGCTTCGCG TTCAAGTTCA GACTATTCAA CTTTAGTGGA  ACAGGGAGTT TTGATCCATC ACTAGACGCA TCATTTGCAA GTAGTTTGCA AACTCAGTGT CCGAATCAAG ATGCTTCGGA CACCACACTA GTCCCTCTTG ACGCGGTGAC AACTACAAAG  TTTGACAACA TGTTTTTCAG GAATCTTGTG AACAACTCGG GGGTTTTAGG TTCAGATCAA GCTCTTATGA GTGATAATAG GACCTCGGCC ATGGTTATAA ACTATAGCAA GTATCCGTTC  TGGTTTGCTA AAGATTTTAG TGATTCGATG GTTAAGCTAA GCAACGTGGG TGTAATTACG GGGCAAAATG GTCAAGTTAG AGACAAATGC AACCTTGTGA ACTAGAAAAT CTGTAGCTTT  TCATGGTTGT TGTAGATTGT GTTTCAGACT TGTTTATGTT TTTGGATGAA TAATTATGCT TATTGCAAAT ATTGAATTCT GCTATATGCG ACAATTTCAA CTCATTTACT TTATAAATTG 
ATCGTTTTTA GCTGTAAATA TAAATAAATA CATGTTAACT GTTAAGAAAA CTTAAAA 

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