View Redoxidase 13661

Entry information : HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)

Entry ID	13661
Creation	2016-05-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes	2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))

Peroxidase information: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)

Name (synonym)

HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)

Class

Thioredoxin Type TDX [Orthogroup: TDX001]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus

Organism

Helianthus annuus (Sunflower) [TaxId: 4232 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	HaTDX01 start..stop	S start..stop
AtTDX01	452	5.62e-160	1..364	2..371
ThasTDX01	405	1.17e-141	1..360	1..347
PpaTDX01	234	6.74e-74	1..229	1..268
KflTDX01	181	1.77e-53	64..245	143..337
KflTDX01	51	0.000000224	1..46	4..49

Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13661' 'join(90156988..90157097,90157174..90157207,90159840..90159941,90160040..90160127,90160580..90160660,90160967..90161031,90161925..90162065,90162926..90163042,90163251..90163278,90163373..90163701)'

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	90156988..90157097	108	N° 2	90157174..90157207	32	N° 3	90159840..90159941	100	N° 4	90160040..90160127	86
N° 5	90160580..90160660	79	N° 6	90160967..90161031	63	N° 7	90161925..90162065	139	N° 8	90162926..90163042	115
N° 9	90163251..90163278	26	N° 10	90163373..90163701	327
join(90156988..90157097,90157174..90157207,90159840..90159941,90160040..90160127 ,90160580..90160660,90160967..90161031,90161925..90162065,90162926..90163042,901 63251..90163278,90163373..90163701)

Literature and cross-references HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)

DNA ref.	HanXRQ genome: HanXRQChr13 (90156988..90163701)

Protein sequence: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	364 (309)
PWM (Da):	39962.39 (34947.0)
PI (pH):	6.2 (8.69)	Peptide Signal:	cut: 27 range:27-335

Sequence
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Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MDDSKIHELKLFVESCQSDPSILHNPSLGFFKTFLQSLGAKIPPASTGAENGHTSNEDIVESDLELDDSDVVKPDDDPPQKMGDLSIEVSDESRDLAQSLKSKAIEAISEGNLDEAIDHLTEAITLNPSSAILYATRASVYVKQKKPNAAIRDADA
ALKINADSAKGYKTRGMARAMLGHWEDAAHDLGLASNLDHDEEIGSTLKKIEPNVHKIREHRRKYERLRKEKKVRATEHAKQKTKAETEDVKASTQTGEVVSICKASELETRLTASSKSN
QLAILYFTATWCGPCRFMAPLYTSLASKYPKVVFLKIDIDEASDVAAKWSISSVPTFFFTKNGKEIDKVVGADKSSLENKLAKYAS

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Remarks

DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGAGGTATACTA
TAATTCCACTTATTATTATTCTACGATTTTTAATTAATAATTTTATTTCTTCAATTGTTTGTTTCCAGTCTTGGCGCCAAAATCCCACCTGCCTCAACACCGCGGTGAGCCCTATTTAAT
TGATTTAAGTGTGTTTTTGGTTTCAAGTGAGTGCTGTTAAATTGAAAAGATTATATGTTTTGAGCTTTTGGGGGTGTTTGGGAAAGTGGGATTGTATGTTTGAAGAGGTGATGTGCTCAT
TGGTTTTTTAAAGTAGATGATTAAGTTTGAGATTTTGGATGAAGAGAAGTGATTATGATTGATTATTTTTTATATTTTAGGGTGAAACACAAGTGGTTGATTTAGGTAGGTGATTTGAGA
TGGTTAAGCCGCCCGTACCACCACGGCTACACCGTTGACACTGTCACAACTAGAGGTGCTCACTGCTCAGATTGGGATTAAACCCTAAATTGGTTTGGGTTGGTCAACAAAAAGTCAAAA
CCGGTTTTGGGTTCAAAGCGATTCGGATTGTGTCGGTTTGTTGACCGGTTTTTGTATGGGTTTGGTTTGGATTCAAACCAGCTTTGATTGTTTTTTTACCAGTTGGAGGAACCGGTTTCA
CAGTAGAGGATTACAAACCGGTCCCAAACCTACAGGTTCAATCGGGTTGGAACCGGTTCGTGTGTATAGGTTTGGAAACGGTTTCTATTCGGGCTACAAACCGGTTTCACCACTAGTCAC
AACCTCCGCCACCTTTGTCGCCATCCCACCACCGCTGCTGACTCCACCTGTCACAATTAACTGCCAAAACATATTGGGGGATTATATATATATATATATATATATAGGGGAGGGTTTAAA
TGAGAACGCTAAATATTGCGAGAACCGTGAGAACGAATGAAAAAAGCAATCAAAACCATTTTTTTTAATACAAACCTCATTGTAATTAAGATACATCATCAAAACAAGAATTTATAACAT
CAAATAATTCATTTCTCCTTTCAAAATCACTCTTTTTAGATTTTTTACACATGTGTAAATATAACAGATTTACACATGTGTAAATGGCAAACTTACACATGTGTAAATTTTCTTTATTTA
CGAATTCACGTAAATTTAAACGTGTAAATTGAAGTTCTAACATTGTATTCGAATAATAATAATAAGTGTAGAAAAAAAATTTGAATTTGAATTGTTTTTGACCAAGTTCTCATGGTTTTT
TTATTTGTTCTCACGGTTCTCACAATATTTAGCGTTCTCATTTAAACCCTCCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTCTA
AAACAACTCACTTCAACCCGAGCCTCTTTTGGTCTGAACTGTTTTGGCCCGAACCAAATTGATACTTCTTTAAAGCTGCCTGTTTTGACCCTAACCCATTTTATTCAGAACCCGTTTTGA
CCCGAATCCAGTTCGCATCTGTTTTGACCCGTTACCCATCACAACCCGCCCCACCCTTTTTTCAAGAGGACATTCCCCAAGGGTTTTAAGGGACATGACTAGTGTTTAATTGGTAACTTT
AACGCAGTGTCAAGTTTTATTCTTTTTCGGTTTTTATTAACGGTATTTTGGTCTGTTAGTTTTGTTAGATTCTAGTGGCAAATGGCAATAGGTTTTCTTTAATTATAAATATGGTTTCTT
GTCCTAAAGTGTTGCTATAGGTGATATAATTGTCCCACTTGTTGATAGAATTGTTGTGCTTTTATTGACTTTTATCTTAAAGACTATTTTATATTTTAAATATTATAAAAAACTGTTATC
CAAGTTGTGATACAAGTTTTTAATAACACGATTCAGGTGGTTGTAAATATTTTAGTATACTTCGACTGACTTTTAATGGGATATCATAATTATATAAACGCATTGGACTTGTTACCAATA
AATAAAATCTAAATTGACTCATTTTTGCACAAGTGGGCTGAAATCGACTCTAGAACAGTAGAACTGTAGAAGTCCAGATTTGCGTCATTTTTGTTCAGATTTTTTTACTTAATGAATCCT
TGGTTTTAAAAAGCAAGAGGCGCACCAAAGCGACGGGTCCAAAACCGAGGCGCGAAGCGCAAAAGCGGTGGGCTTTACGAACCTGAGGCGCAAAGTGATTATATAATTTTTTATATATAT
CCCACAGGTTTTTAGCATCACTTATCCAAAATATAGCTATAAATAAGGTTTATATATGATTTTACCTACAAGTACAAGCCAAAAACCCTATTGTACAACAGTTTGATGCTTAAAAACAGA
ATAAAAACACCTTATGTACATGAGGCGCGCGCCTCAGGCCAGTAAAACCCCCAAAATTTGCGCTTTTTGTAAAAAGCGCGCCTCGGGCTACTTAAGGCGCCAAGGCTTGCGCCTCGCGCC
TAGGCGCACTTCAGGCGCGCGTTTTAAAACCCAGAATGAATCAGACAATTTTAGACTCATTCATATAATCATATGTTAATGGAAGAACATATATATGTTTAATTCTGATCAAATCAGGCT
GATTTGATTAAAATGTCTATCAAGTATTTTTTTCAAACAAATGACCCTGTTAATCATATGTTAATGGAAGAACATATACATGTTTAATTCTTTGAACTTGCAGCCTTGATGTATTGATGC
ATTTTTATTTCCATACTTTTCTGTCACGTATTTTGATATCTATTTTTTTTTGTTATAATGTGTCTTTTTTGACGTTTCCAAAAAAATCTTATGAAGGGTGCTGAAAATGGACACACGTCC
AACGAGGATATTGTTGAGTCTGACCTGGAGTTAGATGATTCTGATGTCGTAAAACCTGACGATGACCCTCCACAAAAGAGGTGGTAAAAATGGATGAATTTTGACCTGGTCAACCACTGT
TATACAAGTATTCCTTTTTCTTATTCTTGTTATCAAGTTATATCACCTTTTGTTTTAGATGGGAGATCTCTCAATTGAAGTTAGTGATGAAAGCCGTGATCTTGCACAAAGTTTGAAGTC
AAAGGCTATTGAGGCAATCTCTGAAGAGGCATGTTTTATATGTTGCTGAGGTGGCAAAGTGGGAAGGGTGGGTAGGGTAGCCGGTCAAAAGGGGGAAGGTTGAACTGTTGAAAGGGTCAG
TTTTTGTACGGGTCGAAACAGTCTGGATCTGGTTGTGTTGCCTGTTGACCCACAAACACTATTACGTAATAAGGAATTCACGCGTTAGTTATGAGTTATGTCAATATTATTATGATAATA
ATCTGAACCGTTGAATAAAACAGTTTTTGTGTGCATAAGAATAGCCTTTGGTGAGTCGGTGACTTTCAACCTGTTCAGCCCGTTCCCCTTTTAGCTAAACATTTTGACCCGTTTGTGATC
AAATTCATCCCGTTGTTAAGTTATTGGGTCAAATTAGCCACCTTTAATATGTTAATCTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTATTAATGTCTACTAGTCTTTGAAAAATTATGTATGTTGTAG

GTAATCTGGATGAAGCTATAGATCACCTAACTGAAGCTATAACACTAAATCCAAGTTCAGCCATATTATATGCAACGAGAGAGGTATTTCTCATTTGCAAAAGTAATAATTAAATATTTA
TGTGGTATTTATATGTGTTTTTTCAAAGTGATTATTGCTACTTGAAAAGTCAGAATTGGATAATCTGGAAGTATGTTAATTAAAGCTAGGGATATATAGATGATTTTTTTAACCCTAATC
GGTAAATCAAGATCAAATTCTTTTTTGTTAAACACATAATAATGATTATTTCAATAATCATTTGATACACATCCGAATGTGAACGTCCCCTAACTGTCTTCCTTTGAACCTTTGGTTATT
TATATTTTTGTCTCTATACCTAATTGCAGCTAGTGTATATGTGAAACAAAAAAAACCAAATGCTGCAATCCGAGATGCTGATGCAGCTTTAAAGAGGTCTGTCTTTACACCTTAGCTAGT
AATGGTTAGGGGCTGAAAGCGCACACTGCACACAATAGAAACGAAATTTACTTTTTTTTTTCTTATTTTAGCAACCGATTTCATATACCTGATTTTATTTGTAAATTGTTATGTCAGCTT
CACATGTGAAAGTATCTGAAAATTTATAAATAAATATTTATTACATGTTTGCAAAAAGATGATCTTTTTCTTTCAGAAAGTTATTTGAAAATAAATATTAGAGTAAACTGCCATTTTGGT
CCCTGCGGTTTGGTCACTTTTGCCACTTTAGTCCAAAACTCAAACCTTTTGCATCTGGGTCCCTGTGGTTTCAGTTTTATTGCCATTTTGGTCCAAAAATGAAATCAGGTCATATTTGTC
TTATAAAATCCTGCAATTTTGTCCTTTTCCTCAGGGGCAAATCAGGTCATATTTGTGTTATAAAATCTTGTATTTATTTATAAAAAAGAAATGACCATTTTGCCCATGTGGAAAAGGACA
AAATAGCAGAATTTTATAAGACAAATATGACCTGATTTCATTTTTGGACCAAAATGGCAATAAAACTGAAACCACAGGACCCAGATGCAAAAGGTTTGAGTTTTGGACTAAAGTGGCAAA
AGTGACCAAACCACAGGGACCAAATGGCAGTTTACTCTAAATATTATATATGACATTATATGCCACGTGGCATATAGACATACACTAAAACATTATTTGAAAATATCACCTGGTTGCTAA
AACCGGTAATAAACTGCAAGTTGTTTTTCATTTTGCGCCTAGTTTAAAGTTGGTTGCTAAGATTTTGGAAGAAGTGTAAAGTTTGTTTCTATGTCATGCAATATGTCATAATGGATACAA
CTTAATCCATCATCATATGAATTTTTCAGATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTC
TAGCATCGAATTTGGATCATGATGAGGAAATTGGGTCAACCCTTAAAAAGAGGTGCTTCTCTTTCTCACACCTGTTTTAGCTTTTTTTAAGGTTTAATTTCGTATAAAACCAGCTTAACG
TTTCAGTGGTTTAGCCCATTAACCTTATTCTGTTTTTGCAATGGATGCATCCCTTAGTTCTTTTTTTTGACTTGTTGAAATTCTGCTTTGACATGTTGAACTACTTAAGCGGTTGTGTGG
ACAATGGACACAAGTATGAATTATAAATAGAGTAAAGTACACAAATGGTCCCTGTGGTTTGCACTTTGCAACGCATTTAGTCCCCTGCTTTTTCTAAAAGTACATGGATCATGGATGGTC
CCTATGGTTTGCATTTTGTAACACATTTAGTTCCTAACTTGGACCTCCTAAAACCTTTAGATTTGATAGCTAGGGACTAAATGCGTTACAAAGTGCAAACCACAGGGACCATCCGTATAC
TTTTGAAAATCTAGGGACCAAATCCAAAATTTTGGTAAACCACAGGGACCATCCGTGTACTTTACTCTTATAAATATAACAATGATAATAGAACCTGAAAAAGTTAAGGGATATATCATA
CAACCTTGGTTTTAAATAAGCGCGAGGCATTTAGGTCCCGAAAGCAGAGGCATTAGGTGTGAGAAGCGAGGCGTAAGCTTTAAGTACGCGAGGTGTTTCTCTATGTACAACCAAATAAGC
TTGATGTACAACCACACGTCGCATCTCTCTTGTCTCTTTTACATATCAACCATCTTCACCAAGCAAACTGTTCATAACTACCATTCCAGTACACGTCGAGTACCAGACGCATTTCATATT
TGGCTATTTTCTTAAAATCTTACCTGGTTAGCCCGTTGGAGATGAAATTTGACCCTAATTGTCCCTTTACAGATTGAACCTAATGTTCACAAGATCAGAGAGCATCGGAGGAAGTATGAA
CGATTAAGGAAAGAGAAGAAAGTTAGAGCAACTGAGCATGCAAAGCAAAAAACGAAAGCGGAAACCGAGAGGCATGTTATATTCTTTTCTATATATTTAGAATATCATTATAACTTTTAA
TCTAGGGTACAACAAATCTTTAATTTATAAAAAAATTAATCCCTATGAACTGCAAAGTTTATCGGCAATATTTTTATATGCCCTTTTGGGATTTTAACAACTCTGATCAAGTTTAAGATG
ATTTATTCGAGGCTTACGTACAATTTTTATTTAATGCAGGATGTGAAGGCTTCGACTCAAACATATGTGGTATGTGATTTCACTTTTATGCGCATGCTATTAAATTTGAACTTGTTTAAT
ATTTTTGTGTACTTTTATAATTTTTTTATATGTTGATCTTTAGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTAGCC
ATTTTGTACTTCACGGCTACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCGAGT
GATGTGGCCGCAAAGTGGAGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCCAAG
TATGCTTCATAA

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CDS►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGTCTTGGCGCC
AAAATCCCACCTGCCTCAACACCGGGTGCTGAAAATGGACACACGTCCAACGAGGATATTGTTGAGTCTGACCTGGAGTTAGATGATTCTGATGTCGTAAAACCTGACGATGACCCTCCA
CAAAAGATGGGAGATCTCTCAATTGAAGTTAGTGATGAAAGCCGTGATCTTGCACAAAGTTTGAAGTCAAAGGCTATTGAGGCAATCTCTGAAGGTAATCTGGATGAAGCTATAGATCAC
CTAACTGAAGCTATAACACTAAATCCAAGTTCAGCCATATTATATGCAACGAGAGCTAGTGTATATGTGAAACAAAAAAAACCAAATGCTGCAATCCGAGATGCTGATGCAGCTTTAAAG
ATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTCTAGCATCGAATTTGGATCATGATGAGGAA
ATTGGGTCAACCCTTAAAAAGATTGAACCTAATGTTCACAAGATCAGAGAGCATCGGAGGAAGTATGAACGATTAAGGAAAGAGAAGAAAGTTAGAGCAACTGAGCATGCAAAGCAAAAA
ACGAAAGCGGAAACCGAGGATGTGAAGGCTTCGACTCAAACATATGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTA
GCCATTTTGTACTTCACGGCTACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCG
AGTGATGTGGCCGCAAAGTGGAGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCC
AAGTATGCTTCATAA

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cDNA►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

TTTTTTTACG CCCTTTGTTT TAGTAAAAGG GTTTTTTTTT TTGGAAAATT TAAAAACATT GCACATTCGG CAATGTTCCT GAAAGACCTT TAAGAATACT ACTAACCTCA CTGATGAAAC CGCAAAGTTG AGCATAACAT CAAACAAGAA CGATGGATGA TTCCAAGATT CATGAACTGA AGCTCTTCGT AGAAAGCTGT CAATCAGACC CTTCAATTCT CCACAACCCA TCACTAGGCT TCTTCAAAAC CTTTCTCCAG AGTCTTGGCG CCAAAATCCC ACCTGCCTCA ACACCGGGTG CTGAAAATGG ACACACGTCC AACGAGGATA TTGTTGAGTC TGACCTGGAG TTAGATGATT CTGATGTCGT AAAACCTGAC GATGACCCTC CACAAAAGAT GGGAGATCTC TCAATTGAAG TTAGTGATGA AAGCCGTGAT CTTGCACAAA GTTTGAAGTC AAAGGCTATT GAGGCAATCT CTGAAGGTAA TCTGGATGAA GCTATAGATC ACCTAACTGA AGCTATAACA CTAAATCCAA GTTCAGCCAT ATTATATGCA ACGAGAGCTA GTGTATATGT GAAACAAAAA AAACCAAATG CTGCAATCCG AGATGCTGAT GCAGCTTTAA AGATCAATGC TGACTCAGCA AAAGGCTATA AAACGCGTGG GATGGCAAGG GCTATGCTTG GTCATTGGGA AGATGCAGCA CATGATTTGG GTCTAGCATC GAATTTGGAT CATGATGAGG AAATTGGGTC AACCCTTAAA AAGATTGAAC CTAATGTTCA CAAGATCAGA GAGCATCGGA GGAAGTATGA ACGATTAAGG AAAGAGAAGA AAGTTAGAGC AACTGAGCAT GCAAAGCAAA AAACGAAAGC GGAAACCGAG GATGTGAAGG CTTCGACTCA AACATATGGT GAAGTGGTTA GCATTTGTAA AGCTAGCGAG TTGGAAACAA GGTTGACCGC TTCATCAAAG TCAAACCAAC TAGCCATTTT GTACTTCACG GCTACATGGT GTGGGCCCTG CCGGTTCATG GCTCCTCTCT ATACAAGCTT GGCGTCCAAG TACCCAAAAG TAGTGTTCTT GAAAATCGAC ATTGATGAAG CGAGTGATGT GGCCGCAAAG TGGAGTATTA GCAGCGTGCC AACGTTCTTT TTCACTAAAA ATGGAAAGGA AATTGATAAA GTTGTCGGGG CAGATAAATC TTCACTTGAA AACAAACTCG CCAAGTATGC TTCATAAGCT AAGGTTCCTA AATTTTGGAC CAACCGTTGT GTTCTTTTTA ACCTTTGTTT TAAAAGTATG TTGTCATTGT GTAACACCAG AGGTTCTGGG TTAACTCTAT TGTCGACGCT TGCCAGGTCC TTTTTAATGG AAAAACAGGT TATGTCGTGT GTGACATGTC CTTGTTTAGA AAGGGTAAAA TCATGAAACC CAAAATGGTG ATTTTAGGGG AGCATGGTTT GACTCAAACA ACCTACTTTT GTTTTCGGGT CAACCAGACG GTATGTATTA ACCAAAGATT AGGTGTTGGT ATGTACTATG TAGTCTAATG GTAGCGTCTA TTAGGGCTGT TTAACGAGTG TGTCAAGTTC GCTTCAACTT GGGTTCAAAC TATAATGAAC TAGCTTGGCT CGGCTTTGTT TATTCTTAAT GAGTTAATTT TGAGATTGAT
TGTGTTCGGC TCGTGAAAAG CTTGAGCCAA CTCCTTTAAA TTAAAAATTA ATAGTTAATA ATTATAATGA TATTTAAAGT GATAGTTAAC CATAAAAATA ATG

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