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Entry information : HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Entry ID 13661
Creation 2016-05-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Name (synonym) HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Class Thioredoxin Type TDX    [Orthogroup: TDX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaTDX01
start..stop		 S start..stop
AtTDX01 452 5.62e-160 1..364 2..371
ThasTDX01 405 1.17e-141 1..360 1..347
PpaTDX01 234 6.74e-74 1..229 1..268
KflTDX01 181 1.77e-53 64..245 143..337
KflTDX01 51 0.000000224 1..46 4..49
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 90156988..90157097 108 N° 2 90157174..90157207 32 N° 3 90159840..90159941 100 N° 4 90160040..90160127 86
N° 5 90160580..90160660 79 N° 6 90160967..90161031 63 N° 7 90161925..90162065 139 N° 8 90162926..90163042 115
N° 9 90163251..90163278 26 N° 10 90163373..90163701 327  
join(90156988..90157097,90157174..90157207,90159840..90159941,90160040..90160127 ,90160580..90160660,90160967..90161031,90161925..90162065,90162926..90163042,901 63251..90163278,90163373..90163701)


exon

Literature and cross-references HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (90156988..90163701)
Protein sequence: HaTDX01 (HanXRQChr13g0400971)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   364 (309)
PWM (Da):   %s   39962.39 (34947.0)  
PI (pH):   %s   6.2 (8.69) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-335
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDDSKIHELKLFVESCQSDPSILHNPSLGFFKTFLQSLGAKIPPASTGAENGHTSNEDIVESDLELDDSDVVKPDDDPPQKMGDLSIEVSDESRDLAQSLKSKAIEAISEGNLDEAIDHLTEAITLNPSSAILYATRASVYVKQKKPNAAIRDADA
ALKINADSAKGYKTRGMARAMLGHWEDAAHDLGLASNLDHDEEIGSTLKKIEPNVHKIREHRRKYERLRKEKKVRATEHAKQKTKAETEDVKASTQTGEVVSICKASELETRLTASSKSN
QLAILYFTATWCGPCRFMAPLYTSLASKYPKVVFLKIDIDEASDVAAKWSISSVPTFFFTKNGKEIDKVVGADKSSLENKLAKYAS

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGAGGTATACTA
TAATTCCACTTATTATTATTCTACGATTTTTAATTAATAATTTTATTTCTTCAATTGTTTGTTTCCAGTCTTGGCGCCAAAATCCCACCTGCCTCAACACCGCGGTGAGCCCTATTTAAT
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TGGTTTTTTAAAGTAGATGATTAAGTTTGAGATTTTGGATGAAGAGAAGTGATTATGATTGATTATTTTTTATATTTTAGGGTGAAACACAAGTGGTTGATTTAGGTAGGTGATTTGAGA
TGGTTAAGCCGCCCGTACCACCACGGCTACACCGTTGACACTGTCACAACTAGAGGTGCTCACTGCTCAGATTGGGATTAAACCCTAAATTGGTTTGGGTTGGTCAACAAAAAGTCAAAA
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TGGTTTTAAAAAGCAAGAGGCGCACCAAAGCGACGGGTCCAAAACCGAGGCGCGAAGCGCAAAAGCGGTGGGCTTTACGAACCTGAGGCGCAAAGTGATTATATAATTTTTTATATATAT
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ATAAAAACACCTTATGTACATGAGGCGCGCGCCTCAGGCCAGTAAAACCCCCAAAATTTGCGCTTTTTGTAAAAAGCGCGCCTCGGGCTACTTAAGGCGCCAAGGCTTGCGCCTCGCGCC
TAGGCGCACTTCAGGCGCGCGTTTTAAAACCCAGAATGAATCAGACAATTTTAGACTCATTCATATAATCATATGTTAATGGAAGAACATATATATGTTTAATTCTGATCAAATCAGGCT
GATTTGATTAAAATGTCTATCAAGTATTTTTTTCAAACAAATGACCCTGTTAATCATATGTTAATGGAAGAACATATACATGTTTAATTCTTTGAACTTGCAGCCTTGATGTATTGATGC
ATTTTTATTTCCATACTTTTCTGTCACGTATTTTGATATCTATTTTTTTTTGTTATAATGTGTCTTTTTTGACGTTTCCAAAAAAATCTTATGAAGGGTGCTGAAAATGGACACACGTCC
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AAAGGCTATTGAGGCAATCTCTGAAGAGGCATGTTTTATATGTTGCTGAGGTGGCAAAGTGGGAAGGGTGGGTAGGGTAGCCGGTCAAAAGGGGGAAGGTTGAACTGTTGAAAGGGTCAG
TTTTTGTACGGGTCGAAACAGTCTGGATCTGGTTGTGTTGCCTGTTGACCCACAAACACTATTACGTAATAAGGAATTCACGCGTTAGTTATGAGTTATGTCAATATTATTATGATAATA
ATCTGAACCGTTGAATAAAACAGTTTTTGTGTGCATAAGAATAGCCTTTGGTGAGTCGGTGACTTTCAACCTGTTCAGCCCGTTCCCCTTTTAGCTAAACATTTTGACCCGTTTGTGATC
AAATTCATCCCGTTGTTAAGTTATTGGGTCAAATTAGCCACCTTTAATATGTTAATCTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTATTAATGTCTACTAGTCTTTGAAAAATTATGTATGTTGTAG

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TGTGGTATTTATATGTGTTTTTTCAAAGTGATTATTGCTACTTGAAAAGTCAGAATTGGATAATCTGGAAGTATGTTAATTAAAGCTAGGGATATATAGATGATTTTTTTAACCCTAATC
GGTAAATCAAGATCAAATTCTTTTTTGTTAAACACATAATAATGATTATTTCAATAATCATTTGATACACATCCGAATGTGAACGTCCCCTAACTGTCTTCCTTTGAACCTTTGGTTATT
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AATGGTTAGGGGCTGAAAGCGCACACTGCACACAATAGAAACGAAATTTACTTTTTTTTTTCTTATTTTAGCAACCGATTTCATATACCTGATTTTATTTGTAAATTGTTATGTCAGCTT
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CCCTGCGGTTTGGTCACTTTTGCCACTTTAGTCCAAAACTCAAACCTTTTGCATCTGGGTCCCTGTGGTTTCAGTTTTATTGCCATTTTGGTCCAAAAATGAAATCAGGTCATATTTGTC
TTATAAAATCCTGCAATTTTGTCCTTTTCCTCAGGGGCAAATCAGGTCATATTTGTGTTATAAAATCTTGTATTTATTTATAAAAAAGAAATGACCATTTTGCCCATGTGGAAAAGGACA
AAATAGCAGAATTTTATAAGACAAATATGACCTGATTTCATTTTTGGACCAAAATGGCAATAAAACTGAAACCACAGGACCCAGATGCAAAAGGTTTGAGTTTTGGACTAAAGTGGCAAA
AGTGACCAAACCACAGGGACCAAATGGCAGTTTACTCTAAATATTATATATGACATTATATGCCACGTGGCATATAGACATACACTAAAACATTATTTGAAAATATCACCTGGTTGCTAA
AACCGGTAATAAACTGCAAGTTGTTTTTCATTTTGCGCCTAGTTTAAAGTTGGTTGCTAAGATTTTGGAAGAAGTGTAAAGTTTGTTTCTATGTCATGCAATATGTCATAATGGATACAA
CTTAATCCATCATCATATGAATTTTTCAGATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTC
TAGCATCGAATTTGGATCATGATGAGGAAATTGGGTCAACCCTTAAAAAGAGGTGCTTCTCTTTCTCACACCTGTTTTAGCTTTTTTTAAGGTTTAATTTCGTATAAAACCAGCTTAACG
TTTCAGTGGTTTAGCCCATTAACCTTATTCTGTTTTTGCAATGGATGCATCCCTTAGTTCTTTTTTTTGACTTGTTGAAATTCTGCTTTGACATGTTGAACTACTTAAGCGGTTGTGTGG
ACAATGGACACAAGTATGAATTATAAATAGAGTAAAGTACACAAATGGTCCCTGTGGTTTGCACTTTGCAACGCATTTAGTCCCCTGCTTTTTCTAAAAGTACATGGATCATGGATGGTC
CCTATGGTTTGCATTTTGTAACACATTTAGTTCCTAACTTGGACCTCCTAAAACCTTTAGATTTGATAGCTAGGGACTAAATGCGTTACAAAGTGCAAACCACAGGGACCATCCGTATAC
TTTTGAAAATCTAGGGACCAAATCCAAAATTTTGGTAAACCACAGGGACCATCCGTGTACTTTACTCTTATAAATATAACAATGATAATAGAACCTGAAAAAGTTAAGGGATATATCATA
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TTGATGTACAACCACACGTCGCATCTCTCTTGTCTCTTTTACATATCAACCATCTTCACCAAGCAAACTGTTCATAACTACCATTCCAGTACACGTCGAGTACCAGACGCATTTCATATT
TGGCTATTTTCTTAAAATCTTACCTGGTTAGCCCGTTGGAGATGAAATTTGACCCTAATTGTCCCTTTACAGATTGAACCTAATGTTCACAAGATCAGAGAGCATCGGAGGAAGTATGAA
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TCTAGGGTACAACAAATCTTTAATTTATAAAAAAATTAATCCCTATGAACTGCAAAGTTTATCGGCAATATTTTTATATGCCCTTTTGGGATTTTAACAACTCTGATCAAGTTTAAGATG
ATTTATTCGAGGCTTACGTACAATTTTTATTTAATGCAGGATGTGAAGGCTTCGACTCAAACATATGTGGTATGTGATTTCACTTTTATGCGCATGCTATTAAATTTGAACTTGTTTAAT
ATTTTTGTGTACTTTTATAATTTTTTTATATGTTGATCTTTAGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTAGCC
ATTTTGTACTTCACGGCTACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCGAGT
GATGTGGCCGCAAAGTGGAGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCCAAG
TATGCTTCATAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGATTCCAAGATTCATGAACTGAAGCTCTTCGTAGAAAGCTGTCAATCAGACCCTTCAATTCTCCACAACCCATCACTAGGCTTCTTCAAAACCTTTCTCCAGAGTCTTGGCGCC
AAAATCCCACCTGCCTCAACACCGGGTGCTGAAAATGGACACACGTCCAACGAGGATATTGTTGAGTCTGACCTGGAGTTAGATGATTCTGATGTCGTAAAACCTGACGATGACCCTCCA
CAAAAGATGGGAGATCTCTCAATTGAAGTTAGTGATGAAAGCCGTGATCTTGCACAAAGTTTGAAGTCAAAGGCTATTGAGGCAATCTCTGAAGGTAATCTGGATGAAGCTATAGATCAC
CTAACTGAAGCTATAACACTAAATCCAAGTTCAGCCATATTATATGCAACGAGAGCTAGTGTATATGTGAAACAAAAAAAACCAAATGCTGCAATCCGAGATGCTGATGCAGCTTTAAAG
ATCAATGCTGACTCAGCAAAAGGCTATAAAACGCGTGGGATGGCAAGGGCTATGCTTGGTCATTGGGAAGATGCAGCACATGATTTGGGTCTAGCATCGAATTTGGATCATGATGAGGAA
ATTGGGTCAACCCTTAAAAAGATTGAACCTAATGTTCACAAGATCAGAGAGCATCGGAGGAAGTATGAACGATTAAGGAAAGAGAAGAAAGTTAGAGCAACTGAGCATGCAAAGCAAAAA
ACGAAAGCGGAAACCGAGGATGTGAAGGCTTCGACTCAAACATATGGTGAAGTGGTTAGCATTTGTAAAGCTAGCGAGTTGGAAACAAGGTTGACCGCTTCATCAAAGTCAAACCAACTA
GCCATTTTGTACTTCACGGCTACATGGTGTGGGCCCTGCCGGTTCATGGCTCCTCTCTATACAAGCTTGGCGTCCAAGTACCCAAAAGTAGTGTTCTTGAAAATCGACATTGATGAAGCG
AGTGATGTGGCCGCAAAGTGGAGTATTAGCAGCGTGCCAACGTTCTTTTTCACTAAAAATGGAAAGGAAATTGATAAAGTTGTCGGGGCAGATAAATCTTCACTTGAAAACAAACTCGCC
AAGTATGCTTCATAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TTTTTTTACG CCCTTTGTTT TAGTAAAAGG GTTTTTTTTT TTGGAAAATT TAAAAACATT GCACATTCGG CAATGTTCCT GAAAGACCTT TAAGAATACT ACTAACCTCA CTGATGAAAC  CGCAAAGTTG AGCATAACAT CAAACAAGAA CGATGGATGA TTCCAAGATT CATGAACTGA AGCTCTTCGT AGAAAGCTGT CAATCAGACC CTTCAATTCT CCACAACCCA TCACTAGGCT  TCTTCAAAAC CTTTCTCCAG AGTCTTGGCG CCAAAATCCC ACCTGCCTCA ACACCGGGTG CTGAAAATGG ACACACGTCC AACGAGGATA TTGTTGAGTC TGACCTGGAG TTAGATGATT  CTGATGTCGT AAAACCTGAC GATGACCCTC CACAAAAGAT GGGAGATCTC TCAATTGAAG TTAGTGATGA AAGCCGTGAT CTTGCACAAA GTTTGAAGTC AAAGGCTATT GAGGCAATCT  CTGAAGGTAA TCTGGATGAA GCTATAGATC ACCTAACTGA AGCTATAACA CTAAATCCAA GTTCAGCCAT ATTATATGCA ACGAGAGCTA GTGTATATGT GAAACAAAAA AAACCAAATG  CTGCAATCCG AGATGCTGAT GCAGCTTTAA AGATCAATGC TGACTCAGCA AAAGGCTATA AAACGCGTGG GATGGCAAGG GCTATGCTTG GTCATTGGGA AGATGCAGCA CATGATTTGG  GTCTAGCATC GAATTTGGAT CATGATGAGG AAATTGGGTC AACCCTTAAA AAGATTGAAC CTAATGTTCA CAAGATCAGA GAGCATCGGA GGAAGTATGA ACGATTAAGG AAAGAGAAGA  AAGTTAGAGC AACTGAGCAT GCAAAGCAAA AAACGAAAGC GGAAACCGAG GATGTGAAGG CTTCGACTCA AACATATGGT GAAGTGGTTA GCATTTGTAA AGCTAGCGAG TTGGAAACAA  GGTTGACCGC TTCATCAAAG TCAAACCAAC TAGCCATTTT GTACTTCACG GCTACATGGT GTGGGCCCTG CCGGTTCATG GCTCCTCTCT ATACAAGCTT GGCGTCCAAG TACCCAAAAG  TAGTGTTCTT GAAAATCGAC ATTGATGAAG CGAGTGATGT GGCCGCAAAG TGGAGTATTA GCAGCGTGCC AACGTTCTTT TTCACTAAAA ATGGAAAGGA AATTGATAAA GTTGTCGGGG  CAGATAAATC TTCACTTGAA AACAAACTCG CCAAGTATGC TTCATAAGCT AAGGTTCCTA AATTTTGGAC CAACCGTTGT GTTCTTTTTA ACCTTTGTTT TAAAAGTATG TTGTCATTGT  GTAACACCAG AGGTTCTGGG TTAACTCTAT TGTCGACGCT TGCCAGGTCC TTTTTAATGG AAAAACAGGT TATGTCGTGT GTGACATGTC CTTGTTTAGA AAGGGTAAAA TCATGAAACC  CAAAATGGTG ATTTTAGGGG AGCATGGTTT GACTCAAACA ACCTACTTTT GTTTTCGGGT CAACCAGACG GTATGTATTA ACCAAAGATT AGGTGTTGGT ATGTACTATG TAGTCTAATG  GTAGCGTCTA TTAGGGCTGT TTAACGAGTG TGTCAAGTTC GCTTCAACTT GGGTTCAAAC TATAATGAAC TAGCTTGGCT CGGCTTTGTT TATTCTTAAT GAGTTAATTT TGAGATTGAT 
TGTGTTCGGC TCGTGAAAAG CTTGAGCCAA CTCCTTTAAA TTAAAAATTA ATAGTTAATA ATTATAATGA TATTTAAAGT GATAGTTAAC CATAAAAATA ATG 

Retrieve as FASTA