Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
260 |
PWM (Da): |
28374.68 |
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PI (pH):
| 7.34 |
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Sequence 427
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MASLSASAALLSSNPRYISPKSSNLSQTLSFLGSSSVNFRSKSLRSALAVRPSASRCNGSLIKAALPLVGNKAPDFEAEAVFDQEFIKVKLSDYIGKKYVILFFYPLDFTFVCPTEITAFSDRYAEFEKINTEILGVSVDSFSHLAWVQTDRKSGGLGDLNYPLVSDVTKSIAKAFNVLIEDQGIALRGLFIIDKEGVIQHSTINNLAIGRSVDETMRTLQALQYVQENPDEVCPAGWKPGEKSMKPDPKLSKEYFAAV |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCGTCTTTATCTGCTTCTGCTGCTCTTCTTTCTTCAAACCCTAGATACATTTCCCCCAAATCATCCAATCTATCTCAAACCCTAAGTTTCCTCGGCTCTTCTTCCGTCAATTTCCGA TCCAAATCTCTCCGCTCCGCCCTCGCCGTTCGTCCCTCGGCCTCCCGTTGCAACGGATCCCTTATCAAAGCTGTAAGTAGTTCAATTCACCGTTCACGGAATTATGTTTATTTGTTATTA GTAGTAGTAGTAGTTGAATTTATGGTTGACTGAATTCTGTTTGTTAGAATTTGTTGAATTTATCGTTGACTGAAATCTGTTTGTCTGAGTGACGTGATTGATATGTTTGTGTTGTTAATT ACTTGCTAAAGAAGTTAGAAATGTAAGCGTTAAGTTGAGATATTAGATACTACTGGTTAGGACAAATATCGATACGCTGCAGTTGGATTAAGAGTAAATTAAGTTTGGAAGCATTTCAAT CATAGTTATTAAAGGCGTTAGCGCACTCAAGGCGCATAGGTCTCGCTTCGGGCCTAGGCGCAAGGCGCAAAAGAAACGCAGGCCTGAGAAAAAAAAAGCGCACAGCGAAAAAAACTCAAA ATATTTATATATAATAGAAAATTAATACCATCCTTCATATAAAAAAAAAACTAAAGCTATTATATAACATTTAATATCGTCTACTTAGTACCAGAAGTTTTAAAATGCTAGTATATCTGT GTAGAAAAATAGTTTTCGTTAGATAAAAGTATAAATTTAGCTGGAATCTTGCCAGAATTTAGAGAATTTGGCCGGAAACTCTTCAGAATCTAGGAATCTCGCTGGAATATGCGCAGAACC ATCACCCAAAGAATTAAAGCGCAATTGCCTTGACTTAAGGCGCAATTGCCTCGCCTTGCTAGGAAATTGGGCCTAGGCGCAAGAGGCGATGGCTTTTAACAACTATGATTTCAATTGGCT TTTCATTTCAAGTTATGTAATTATCCACAAAGAGATGGAGGACTGTGAAACAACGAGCGATTTTGGATGAAGAAAATGTTGAATATGGTGTTTTTTTTCGGATTTATACATTCAGTGTCA AAATTGGCTCATTTTGTTATGAAGTATGATTTCTTTTGGCATTTTTTAAGAAGAATGATGATTATTGATTAGTTTGTAACGAAGAGCCAAGTATGATGATATAATTTGAGATCTTGTTGA TGTAATTGTGGAATTAGAATTGATTGATTGACTTGGTTCCACCTGTTAGTTTTATAGTTGTGCAAATAATGACGCCTTAGTGTACTCGGTGTTGTAAGGCAGTAAGGTTACTTGTGGGTA TGGGGATACACGTGTGTGATTCGTAAAACAAGGATATGTGTGCATTCATATATGTGTTTATCTGTGTAAATATGTACAGTCTTAAGATTGAAACAATATAAGAAAAAAAGTTATTTCATG ATTTATACATTTAATTTGTAAATAAAGAGCACACATAGGCCTAACTTTGTTTTGTCACTTTACCTTATGTGTTCATTTTTGGAACGGAAACCCATTTCACGGATAAAACAAGTGAATTAT TACTATTATAGTTAAAGCTCTGATATTCCACATTTTTAGTCCATGAGTGAATTATTACTATTATAGTTAAAGCTCTGATGTTCCACATTTTTAGTCCATGATTCTTTAGCATTTTGTATC CTTATTGACATTAATATTTATTTGCCATCTTTTATCTAAACTCCGTTTCTTTATGTAGGCACTACCATTAGTTGGAAATAAGGCACCAGATTTTGAAGCAGAAGCTGTTTTTGATCAAGA ATTCATCAAAGTAATTAAATTATCAGTACCTTGCCTTCGTATTTTTTGATAGAATTAATATTAGTCACAAAAAAATCAGGAACTTTTGTAATTTTCGGAACTATGCAAATGCAGGTTAAG CTCTCTGATTATATCGGGAAGAAATATGTCATTCTCTTCTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTTTGTCCAACCGGTGAGCATGTTTTAAGTCAAATTATATAATATTCTTGGTTGAAC AAATTTCTTATTTAATATTCTTGGTTGTACAGAAATCACTGCTTTCAGTGACCGTTATGCTGAATTTGAGAAGATAAATACCGAAATATTGGGGGTTTCCGTAGACAGTGTGGTATGATT GTTTAAGTTTAACGGGGCATTTGGTTTGTACATATAAGATTATCACAATGTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTTTTCTTTTATAGTTCTCCCATCTTGCATGGGTTCAAACAGACAG AAAATCCGGAGGTCTTGGTGATCTGAACTACCCATTAGTTTCGGATGTAACCAAGTCAATTGCGAAAGCTTTTAATGTGTTGATCGAAGACCAGGTACGCCTTTTGTTATATGCGTAAAC ACACTCGTATTATTATTAATGTTATTGTTACTGTTACTGTTCACACCTATATACGTGGATATGTACTTTTTGTAACCTAAATTGTAAACAATTAATGAAAATAATAATCTTTCTTGATCT TTACATTTCAGGGAATCGCGTTGAGAGGACTTTTCATAATTGACAAAGAAGGCGTTATTCAACACTCCACGATCAATAATCTTGCAATTGGTAGAAGTGTAGATGAAACAATGAGAACAC TTCAGGTAGATAATTATTTACTTGTTACGCCCCGCTGGCGGTATGCGCATATAATGTATATATGTGTGGGCGCTCGGGGGGCAAAAGTGAAACTTCACTAGTTTTAACGTTATTTTTACT AATTTCGTGAAAATAACGTTAAAAGAGGGGGATGGTTAATCATGCATCATGTGGTGGCGTTGATAGCCGAAAGACAAGGGAGTACATGCACTAATCGGCCGTTGTCTTAATTGCTGAGTG TTATGTGCCTTATGTCCAAGGCTTGATGCAAAACTACTATCGAGTCGGGGGTCTCACTGGAAGCAGCCTCTCTATTCTTAACGGGTAGAGGTAAGGCTGTCTGCATCTTACCCTCCACAG ACCCTACCTTAGCTTTGCTGAGTATGATGATGATGAGATTTTACTTGTCTTCCACTCAAACTCAATGTTACCATCCATGTTTTCATAACTGGACAGGTCATCGAACTGACAAATGGACCG GTTTAAAAAACCGTATAACTTCATAAATAGTTTAAAATTTTGAGTAAAATGCCAAATCGTCCTTGAGGTTTTTGGGCGCTTTTTCTTGTTCCCATCCCAAATAAGAATTTTTTGTAACTG GACCCCTGACGTTTCATTTTTGTTGTCATTTCCATCCAATTTGCAATTCTCAAATCTCAGGGATGATTTTGTATTTTATTTTTTGTCACTATCGTCCCTGAGGTTTGGGAATTGCCAAAA TCATCCATGACTTAACAATATATTTTAACTGAGTTAGTGATTTGGATGGAAATGGCAACAAAAATGAAACGCCAGGGTCCAGTTACAAAAAAAATCTTATTTTGGATGGAACAAGCAAAA GTGCCCAAACCTCAGAGACGATTTTGGCATTTTACTCAAAATTTATATATATTAAATTTAAGGGAATATTTCACAGAATAATAACCAAGTTTTAAAAGTATGAAATCAGCTTATCTTTTG GTGTGGATTTAGAATGTTAACATAATATAATAGTGATTGAATCAGTAAATGAGATTTAAGAAGGATTTTTTTTTTTTAAAATCCAACCTAACCACCTGGTGTGGTTTTGACGGTCCGACC GGTTGGACTCGACCAGACCGGTCATGTAATGTAGCTGGTTCTCGGTCCGACTGGCTGGTCAGTGAGGCTATGAAAACATTGGTTATCATTCTAAATGATAATGTCCGTTTAGGCTTGTCA ACATCTCTGTATTTGAACATTTGACCAAAAACATGTTACGGGTGGTTGTACTGTAGGCATTGCAATATGTACAAGAGAACCCCGATGAGGTATGCCCAGCTGGATGGAAGCCAGGGGAGA AATCAATGAAACCAGACCCTAAACTCAGCAAGGAGTACTTTGCAGCAGTA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCGTCTTTATCTGCTTCTGCTGCTCTTCTTTCTTCAAACCCTAGATACATTTCCCCCAAATCATCCAATCTATCTCAAACCCTAAGTTTCCTCGGCTCTTCTTCCGTCAATTTCCGA TCCAAATCTCTCCGCTCCGCCCTCGCCGTTCGTCCCTCGGCCTCCCGTTGCAACGGATCCCTTATCAAAGCTGCACTACCATTAGTTGGAAATAAGGCACCAGATTTTGAAGCAGAAGCT GTTTTTGATCAAGAATTCATCAAAGTTAAGCTCTCTGATTATATCGGGAAGAAATATGTCATTCTCTTCTTCTACCCTTTGGACTTCACTTTCGTTTGTCCAACCGAAATCACTGCTTTC AGTGACCGTTATGCTGAATTTGAGAAGATAAATACCGAAATATTGGGGGTTTCCGTAGACAGTGTGTTCTCCCATCTTGCATGGGTTCAAACAGACAGAAAATCCGGAGGTCTTGGTGAT CTGAACTACCCATTAGTTTCGGATGTAACCAAGTCAATTGCGAAAGCTTTTAATGTGTTGATCGAAGACCAGGGAATCGCGTTGAGAGGACTTTTCATAATTGACAAAGAAGGCGTTATT CAACACTCCACGATCAATAATCTTGCAATTGGTAGAAGTGTAGATGAAACAATGAGAACACTTCAGGCATTGCAATATGTACAAGAGAACCCCGATGAGGTATGCCCAGCTGGATGGAAG CCAGGGGAGAAATCAATGAAACCAGACCCTAAACTCAGCAAGGAGTACTTTGCAGCAGTA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
AATCTTTGAT GCTATTTTGA CCTAAAGTCA ACAAAACAAG TCTACCAACT ACCAAAACAG TCCAAAACCC ATCATCACTA TGCCAATCAT TGTGATTTAT CACATTCTCT TCACCACACA
AACCCTAGGC TCCATCATCA CTGACGTTAA CAGAAGATCG ATCGATCGAT CAAACAATGG CGTCTTTATC TGCTTCTGCT GCTCTTCTTT CTTCAAACCC TAGATACATT TCCCCCAAAT
CATCCAATCT ATCTCAAACC CTAAGTTTCC TCGGCTCTTC TTCCGTCAAT TTCCGATCCA AATCTCTCCG CTCCGCCCTC GCCGTTCGTC CCTCGGCCTC CCGTTGCAAC GGATCCCTTA
TCAAAGCTGC ACTACCATTA GTTGGAAATA AGGCACCAGA TTTTGAAGCA GAAGCTGTTT TTGATCAAGA ATTCATCAAA GTTAAGCTCT CTGATTATAT CGGGAAGAAA TATGTCATTC
TCTTCTTCTA CCCTTTGGAC TTCACTTTCG TTTGTCCAAC CGAAATCACT GCTTTCAGTG ACCGTTATGC TGAATTTGAG AAGATAAATA CCGAAATATT GGGGGTTTCC GTAGACAGTG
TGTTCTCCCA TCTTGCATGG GTTCAAACAG ACAGAAAATC CGGAGGTCTT GGTGATCTGA ACTACCCATT AGTTTCGGAT GTAACCAAGT CAATTGCGAA AGCTTTTAAT GTGTTGATCG
AAGACCAGGG AATCGCGTTG AGAGGACTTT TCATAATTGA CAAAGAAGGC GTTATTCAAC ACTCCACGAT CAATAATCTT GCAATTGGTA GAAGTGTAGA TGAAACAATG AGAACACTTC
AGGCATTGCA ATATGTACAA GAGAACCCCG ATGAGGTATG CCCAGCTGGA TGGAAGCCAG GGGAGAAATC AATGAAACCA GACCCTAAAC TCAGCAAGGA GTACTTTGCA GCAGTATAAT
TTTGGGAGCA CTTGTGGAAA GAAACAAGAT CTCCTGCCTT GTGAAATTGG AGTTATGAGT GTATCTTGTT TTAAAACATT GTTCTATCTA ATGAGGTTTT GGCATAATAA ATTTGTGGTT
ATATAATAAA TGAATGATTT AACAAGTATA TTTAAAAAAA AAGGTTATTG GATTTTATCA CCCCAATTAT CGGCTTTTGG CCGTTGCCAC CCTCAACTAA CACTTTGACA CCCGACACCT
TCAACTTGAC TTTTAGTTTG TGCTGTCACC ACTCTCTTAA CTCATTACTA ACAGAGTTAG TTTCTGATCC TAGGTGTCAC AACTTACTTT ACGTGTACAG GATG
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