Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
|
Length (aa):  |
124 |
| PWM (Da): |
14572.38 |
|
| PI (pH):
| 9.67 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MTAWGFRSKQPCGNLAKCFKEVKDDVFQGDDGYPLKACYPLMLHVFFKFLETVIPKYNDFKQPGDRYRSWDLARQERFIVRMCKILSDPRVTHELRSIWISYWTAYQSLGQKIASRLNVHPNY |
Retrieve as FASTA
|
|
| Remarks |
Pseudogene from genomic (first 420 aa are missing) |
DNA ►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTGTATACACTTGAGGTGAGTTCATAACCCCTCTTTTCTAATTGTTTTTAAATATCATTGCGACTGAT
CATGTAAAAGGAGTTAATTGTCTCGGAAGGGTTTATTAAATCGTATATTGTATATTGACGGTTATAATTTAAGTAGCTGAATGTCCCATTTAGGTGACCTCCAGTGTTGTTTTGAATAGG
ATTGAAAGGGATATGTTTTAATGAGTTAATTAACCAAAGATTGTGTGAAAAATTTGGGTAACATACTGGTTAAAGGGTTAGTATGTTTAGACATTACAATAGCTTGAAATTGTGAATACG
TGTATTGTTAACCATATAAAATATTTATGTGTTGTAGAGATGATTGTGAGCTGAGTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCC
ACTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGGTATATATATGCTCTCATAGTGAAATTATATATGTATTAAGATGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAAATTAAGATGAT
AAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAATAAAATGTGGATTTTTTTTCCAAGAAAGCCCTTTCACCAATGGCTATTGTTGTGCTTCTAAAGGTTACTTTTTCGCTTTCAATTTAAATTT
GTGTTAAATATCATGTATTAGTAGTTTTCTTATGGTGTTGATTGGTTTTTTATTGGTTCGGTTCAACTTTAAAGTGGTTTCAAATGAGAGGAATACAAACCAGTTAAAAACCTACGGTTT
GTACCAGCTCTGAACCGGTTCTATATATACCAACTATAAACCGGTTTCTGTTCGGGTTGGTTAGCCGGTTTTAGTTTTCAAACCGGATTGAATGTGCATCTTTACACTCCTCTGCTACCA
CACTACACCAACACCCAAACATACTAGCTTCCAGAAACCGCTCATTCATCGTAAATTTTTTACAAGGTTCTTGCTGCTTCCTTCTTATCAACGATTTCAAAAGCTATTGCACCCCTTCTT
TTTTTTTTCTTGGTGCTTTTAGTGATTGTTATTGTCATTCCTCAATTTATAAAAATACTAATTAAGGGGTTATGTAACAAAATCGGGTTGTTGATAAGGATCAAGATAGTGGTTCTGCCA
ATTCTAGGTCTAAGGTCAACGATGGTCGGTGAGTAAATAACTAACCATGTATGTTTCTATAGATCGAAAATAAACTCATGTTATTCAAAATTGTTTGGTTTAGTTTTACAGTGATTATGA
CAATTATGTTTTTTGTTTGTTTTGTATTATAATAGGATGAAGATGTGATTGCTTGCATATAAACAAGGGTTTCAGATGAACTAATACATGGTGTTCTCTTTTATAAATAATTCTTAACAA
TTTGTGATTTTTTTATTCGATTTTTTCAGTTCAATGTTATAATTTAACATTTTTATAAGTAATGGAATTTTTTCTTTCACTTCAAACGTGTCATTTAAATAAAGTGTCGGTTTGGTCGGG
TTAAGAAGGTTACATGTAGAGTTAGTTACTTCGTTTATTTTTTTAATTAAGAAATAAGTTACCTCATGTATTCTTTATTTCTTTATATTTACAAACCGAAAGATAGTATTGTTGATGCTC
CTTAATACCCCCTATTCATGAAATTATAATCAGTGGCGGAGCTTGACCAAAAGTTTCGATGGGGCGTAAAGTGATGGGATCCAACTTTTTTCCTATCGTTATGTTTCGGGTCGGGTCAGC
TATTGATTCGGGTCAGGTCAAATAATAATAGTTGCAAATAAAGTCAAAAAATTTCATTCATTCAAAGGACCCGTTCTTACACATAAAAACTTGCGATTAAGTTTATTGTGTGGTGTGTAA
TCTAGGGTTAAACAAATAAGACTTAAAATATATTTACAAAACTACCCATCACTTATATACAAAGTGATAACAAATTTTACTTTAATTTGTATATTGTATAAATATTTAGGATATACAAAG
TGGTAACAAACTTTACTTTAATTTATATATTGTATAAATATTTAGGAAAAATAATTGGGGGGAGACGATCCTATATAATTTTTAAAATTTTCGGACGAAAAATTGGAACCTGTACACTTC
TAACCGAAACATTGGGGTGGGCGGGTGCACCCCCGAACACCAACTAACCTTCGCCACTGATTATAATATATATTTAATTCATACACTTTAGTATTTCTCATAAGAGTACTGTAGCTATTG
TAGTTGCTTTTAAATTATGTCATATAGCTTTTAATTTTACAGCTCAACTTTCATCTTAATAAATATATATTTGGTACACAGGTAGAGAGAGAACGGACGGGTTGGGTGATGGGCCACTTG
AGTTTGGGCAAAAGGGCCACCTCAATAGTAACAAGCACCAAGTAAATGAATGTGTTTATTTATTTATTTTTTTTATTTTAATTTTGTGAATGCAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATT
TCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGTACGTGTTTTATATGGTTTGTTTTTTTAAAATATTCCAAGATGCCATAAATTTGCTAAACTATGTCTGATCTTTCT
ATAGGCAAGAGAGATTCATTGTCCGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGTTTGTACACGCTTCCCATCTT
AAGTCTTACTTTCATTCCCACAAAAGAAAACGTTCATCCATCCCATTATATTTACAAAAAAAATACCTTTAGTATAGTTTAGAACTTCAATGCATCGTGTTCTTAATAAGTTTACGTCAA
ATGGAAGAAGTTACAGCTGGTAAAATGGGTGGGTTGAGTAACGGATAAACGGGCCAATCTAAACATGTGATTTTTTAGTACGAGCCAAAACAGGCTTAAAAACTTTCTTTAGAAATATAT
GCTGAGTTGGTACATTTTGGGTGGTGTTGTTGCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTGCACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCCA
CTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGCAAGAGAGATTCATTGTC
CGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTG
CACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGCTGTAGGG GCTGCCGGTG TCAGTTGAAA GCGCCAGTGA ATGACGGCTT GGGGGTTTCG GTCGAAACAA CCATGTGGAA ATCTAGCCAA GTGTTTTAAA GAGGTCAAAG ATGATGTGTT
TCAAGGTGAC GACGGCTACC CACTTAAAGC ATGCTACCCA CTGATGTTAC ATGTGTTCTT CAAATTCTTA GAGACTGTGA TCCCAAAATA TAACGATTTC AAGCAGCCCG GAGACAGATA
CCGATCATGG GATCTAGCCA GGCAAGAGAG ATTCATTGTC CGAATGTGTA AGATATTGTC TGACCCACGG GTAACCCATG AACTCCGCAG TATTTGGATC TCCTACTGGA CCCAGGCTTA
CCAGTCTCTG GGGCAGAAGA TAGCATCACG CCTCAATGTG CACCCCAATT ATTGAACACG GTTATCTTGA GTTTGGGCCC GCTTAAGCTA GATTGATGAT CATGCTATAG TAGGTCCATC
TCTAAGATTG TTATGTTACA CAAGCGGTGT TGTATGTATC AGTCCTACCT TTCGTCTGTA ATATTTTATC ATACTTAAGG AACCTGAAAC TTAGAATAAG TGCACACCTA GATGTGTGAG
T
|
Retrieve as FASTA
|
|
