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Entry information : HaKat[P]03 (HanXRQChr04g0096431)
Entry ID 13669
Creation 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaKat[P]03 (HanXRQChr04g0096431)
Name (synonym) HaKat[P]03 (HanXRQChr04g0096431)
Class Catalase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaKat[P]03
start..stop		 S start..stop
HaKat04 146 3.14e-43 52..124 420..492
HaKat05 143 4.28e-42 52..124 420..492
HaKat08 128 2.7e-36 52..124 430..502
EcamKat13 107 7.57e-32 39..120 17..99
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 8407648..8407701 52 N° 2 8408063..8408161 97 N° 3 8410143..8410210 66 N° 4 8410292..8410385 92
N° 5 8410683..8410739 55  
join(8407648..8407701,8408063..8408161,8410143..8410210,8410292..8410385,8410683 ..8410739)


exon

Literature and cross-references HaKat[P]03 (HanXRQChr04g0096431)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (8407648..8410739)
Protein sequence: HaKat[P]03 (HanXRQChr04g0096431)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   124
PWM (Da):   %s   14572.38  
PI (pH):   %s   9.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MTAWGFRSKQPCGNLAKCFKEVKDDVFQGDDGYPLKACYPLMLHVFFKFLETVIPKYNDFKQPGDRYRSWDLARQERFIVRMCKILSDPRVTHELRSIWISYWTAYQSLGQKIASRLNVH
PNY

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (first 420 aa are missing)
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTGTGTATACACTTGAGGTGAGTTCATAACCCCTCTTTTCTAATTGTTTTTAAATATCATTGCGACTG
ATCATGTAAAAGGAGTTAATTGTCTCGGAAGGGTTTATTAAATCGTATATTGTATATTGACGGTTATAATTTAAGTAGCTGAATGTCCCATTTAGGTGACCTCCAGTGTTGTTTTGAATA
GGATTGAAAGGGATATGTTTTAATGAGTTAATTAACCAAAGATTGTGTGAAAAATTTGGGTAACATACTGGTTAAAGGGTTAGTATGTTTAGACATTACAATAGCTTGAAATTGTGAATA
CGTGTATTGTTAACCATATAAAATATTTATGTGTTGTAGAGATGATTGTGAGCTGAGTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTAC
CCACTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGAGGTATATATATGCTCTCATAGTGAAATTATATATGTATTAAGATGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAAATTAAGA
TGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAATAAAATGTGGATTTTTTTTCCAAGAAAGCCCTTTCACCAATGGCTATTGTTGTGCTTCTAAAGGTTACTTTTTCGCTTTCAATTTAA
ATTTGTGTTAAATATCATGTATTAGTAGTTTTCTTATGGTGTTGATTGGTTTTTTATTGGTTCGGTTCAACTTTAAAGTGGTTTCAAATGAGAGGAATACAAACCAGTTAAAAACCTACG
GTTTGTACCAGCTCTGAACCGGTTCTATATATACCAACTATAAACCGGTTTCTGTTCGGGTTGGTTAGCCGGTTTTAGTTTTCAAACCGGATTGAATGTGCATCTTTACACTCCTCTGCT
ACCACACTACACCAACACCCAAACATACTAGCTTCCAGAAACCGCTCATTCATCGTAAATTTTTTACAAGGTTCTTGCTGCTTCCTTCTTATCAACGATTTCAAAAGCTATTGCACCCCT
TCTTTTTTTTTTCTTGGTGCTTTTAGTGATTGTTATTGTCATTCCTCAATTTATAAAAATACTAATTAAGGGGTTATGTAACAAAATCGGGTTGTTGATAAGGATCAAGATAGTGGTTCT
GCCAATTCTAGGTCTAAGGTCAACGATGGTCGGTGAGTAAATAACTAACCATGTATGTTTCTATAGATCGAAAATAAACTCATGTTATTCAAAATTGTTTGGTTTAGTTTTACAGTGATT
ATGACAATTATGTTTTTTGTTTGTTTTGTATTATAATAGGATGAAGATGTGATTGCTTGCATATAAACAAGGGTTTCAGATGAACTAATACATGGTGTTCTCTTTTATAAATAATTCTTA
ACAATTTGTGATTTTTTTATTCGATTTTTTCAGTTCAATGTTATAATTTAACATTTTTATAAGTAATGGAATTTTTTCTTTCACTTCAAACGTGTCATTTAAATAAAGTGTCGGTTTGGT
CGGGTTAAGAAGGTTACATGTAGAGTTAGTTACTTCGTTTATTTTTTTAATTAAGAAATAAGTTACCTCATGTATTCTTTATTTCTTTATATTTACAAACCGAAAGATAGTATTGTTGAT
GCTCCTTAATACCCCCTATTCATGAAATTATAATCAGTGGCGGAGCTTGACCAAAAGTTTCGATGGGGCGTAAAGTGATGGGATCCAACTTTTTTCCTATCGTTATGTTTCGGGTCGGGT
CAGCTATTGATTCGGGTCAGGTCAAATAATAATAGTTGCAAATAAAGTCAAAAAATTTCATTCATTCAAAGGACCCGTTCTTACACATAAAAACTTGCGATTAAGTTTATTGTGTGGTGT
GTAATCTAGGGTTAAACAAATAAGACTTAAAATATATTTACAAAACTACCCATCACTTATATACAAAGTGATAACAAATTTTACTTTAATTTGTATATTGTATAAATATTTAGGATATAC
AAAGTGGTAACAAACTTTACTTTAATTTATATATTGTATAAATATTTAGGAAAAATAATTGGGGGGAGACGATCCTATATAATTTTTAAAATTTTCGGACGAAAAATTGGAACCTGTACA
CTTCTAACCGAAACATTGGGGTGGGCGGGTGCACCCCCGAACACCAACTAACCTTCGCCACTGATTATAATATATATTTAATTCATACACTTTAGTATTTCTCATAAGAGTACTGTAGCT
ATTGTAGTTGCTTTTAAATTATGTCATATAGCTTTTAATTTTACAGCTCAACTTTCATCTTAATAAATATATATTTGGTACACAGGTAGAGAGAGAACGGACGGGTTGGGTGATGGGCCA
CTTGAGTTTGGGCAAAAGGGCCACCTCAATAGTAACAAGCACCAAGTAAATGAATGTGTTTATTTATTTATTTTTTTTATTTTAATTTTGTGAATGCAGACTGTGATCCCAAAATATAAC
GATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGAGGTACGTGTTTTATATGGTTTGTTTTTTTAAAATATTCCAAGATGCCATAAATTTGCTAAACTATGTCTGAT
CTTTCTATAGGCAAGAGAGATTCATTGTCCGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGAGGTTTGTACACGCTT
CCCATCTTAAGTCTTACTTTCATTCCCACAAAAGAAAACGTTCATCCATCCCATTATATTTACAAAAAAAATACCTTTAGTATAGTTTAGAACTTCAATGCATCGTGTTCTTAATAAGTT
TACGTCAAATGGAAGAAGTTACAGCTGGTAAAATGGGTGGGTTGAGTAACGGATAAACGGGCCAATCTAAACATGTGATTTTTTAGTACGAGCCAAAACAGGCTTAAAAACTTTCTTTAG
AAATATATGCTGAGTTGGTACATTTTGGGTGGTGTTGTTGCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTGCACCCCAATTAT

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCCA
CTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGCAAGAGAGATTCATTGTC
CGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTG
CACCCCAATTAT

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGCTGTAGGG GCTGCCGGTG TCAGTTGAAA GCGCCAGTGA ATGACGGCTT GGGGGTTTCG GTCGAAACAA CCATGTGGAA ATCTAGCCAA GTGTTTTAAA GAGGTCAAAG ATGATGTGTT  TCAAGGTGAC GACGGCTACC CACTTAAAGC ATGCTACCCA CTGATGTTAC ATGTGTTCTT CAAATTCTTA GAGACTGTGA TCCCAAAATA TAACGATTTC AAGCAGCCCG GAGACAGATA  CCGATCATGG GATCTAGCCA GGCAAGAGAG ATTCATTGTC CGAATGTGTA AGATATTGTC TGACCCACGG GTAACCCATG AACTCCGCAG TATTTGGATC TCCTACTGGA CCCAGGCTTA  CCAGTCTCTG GGGCAGAAGA TAGCATCACG CCTCAATGTG CACCCCAATT ATTGAACACG GTTATCTTGA GTTTGGGCCC GCTTAAGCTA GATTGATGAT CATGCTATAG TAGGTCCATC  TCTAAGATTG TTATGTTACA CAAGCGGTGT TGTATGTATC AGTCCTACCT TTCGTCTGTA ATATTTTATC ATACTTAAGG AACCTGAAAC TTAGAATAAG TGCACACCTA GATGTGTGAG 
T 

Retrieve as FASTA