Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
124 |
PWM (Da): |
14572.38 |
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PI (pH):
| 9.67 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MTAWGFRSKQPCGNLAKCFKEVKDDVFQGDDGYPLKACYPLMLHVFFKFLETVIPKYNDFKQPGDRYRSWDLARQERFIVRMCKILSDPRVTHELRSIWISYWTAYQSLGQKIASRLNVHPNY |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Pseudogene from genomic (first 420 aa are missing) |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTGTATACACTTGAGGTGAGTTCATAACCCCTCTTTTCTAATTGTTTTTAAATATCATTGCGACTGAT CATGTAAAAGGAGTTAATTGTCTCGGAAGGGTTTATTAAATCGTATATTGTATATTGACGGTTATAATTTAAGTAGCTGAATGTCCCATTTAGGTGACCTCCAGTGTTGTTTTGAATAGG ATTGAAAGGGATATGTTTTAATGAGTTAATTAACCAAAGATTGTGTGAAAAATTTGGGTAACATACTGGTTAAAGGGTTAGTATGTTTAGACATTACAATAGCTTGAAATTGTGAATACG TGTATTGTTAACCATATAAAATATTTATGTGTTGTAGAGATGATTGTGAGCTGAGTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCC ACTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGGTATATATATGCTCTCATAGTGAAATTATATATGTATTAAGATGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAAATTAAGATGAT AAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAATAAAATGTGGATTTTTTTTCCAAGAAAGCCCTTTCACCAATGGCTATTGTTGTGCTTCTAAAGGTTACTTTTTCGCTTTCAATTTAAATTT GTGTTAAATATCATGTATTAGTAGTTTTCTTATGGTGTTGATTGGTTTTTTATTGGTTCGGTTCAACTTTAAAGTGGTTTCAAATGAGAGGAATACAAACCAGTTAAAAACCTACGGTTT GTACCAGCTCTGAACCGGTTCTATATATACCAACTATAAACCGGTTTCTGTTCGGGTTGGTTAGCCGGTTTTAGTTTTCAAACCGGATTGAATGTGCATCTTTACACTCCTCTGCTACCA CACTACACCAACACCCAAACATACTAGCTTCCAGAAACCGCTCATTCATCGTAAATTTTTTACAAGGTTCTTGCTGCTTCCTTCTTATCAACGATTTCAAAAGCTATTGCACCCCTTCTT TTTTTTTTCTTGGTGCTTTTAGTGATTGTTATTGTCATTCCTCAATTTATAAAAATACTAATTAAGGGGTTATGTAACAAAATCGGGTTGTTGATAAGGATCAAGATAGTGGTTCTGCCA ATTCTAGGTCTAAGGTCAACGATGGTCGGTGAGTAAATAACTAACCATGTATGTTTCTATAGATCGAAAATAAACTCATGTTATTCAAAATTGTTTGGTTTAGTTTTACAGTGATTATGA CAATTATGTTTTTTGTTTGTTTTGTATTATAATAGGATGAAGATGTGATTGCTTGCATATAAACAAGGGTTTCAGATGAACTAATACATGGTGTTCTCTTTTATAAATAATTCTTAACAA TTTGTGATTTTTTTATTCGATTTTTTCAGTTCAATGTTATAATTTAACATTTTTATAAGTAATGGAATTTTTTCTTTCACTTCAAACGTGTCATTTAAATAAAGTGTCGGTTTGGTCGGG TTAAGAAGGTTACATGTAGAGTTAGTTACTTCGTTTATTTTTTTAATTAAGAAATAAGTTACCTCATGTATTCTTTATTTCTTTATATTTACAAACCGAAAGATAGTATTGTTGATGCTC CTTAATACCCCCTATTCATGAAATTATAATCAGTGGCGGAGCTTGACCAAAAGTTTCGATGGGGCGTAAAGTGATGGGATCCAACTTTTTTCCTATCGTTATGTTTCGGGTCGGGTCAGC TATTGATTCGGGTCAGGTCAAATAATAATAGTTGCAAATAAAGTCAAAAAATTTCATTCATTCAAAGGACCCGTTCTTACACATAAAAACTTGCGATTAAGTTTATTGTGTGGTGTGTAA TCTAGGGTTAAACAAATAAGACTTAAAATATATTTACAAAACTACCCATCACTTATATACAAAGTGATAACAAATTTTACTTTAATTTGTATATTGTATAAATATTTAGGATATACAAAG TGGTAACAAACTTTACTTTAATTTATATATTGTATAAATATTTAGGAAAAATAATTGGGGGGAGACGATCCTATATAATTTTTAAAATTTTCGGACGAAAAATTGGAACCTGTACACTTC TAACCGAAACATTGGGGTGGGCGGGTGCACCCCCGAACACCAACTAACCTTCGCCACTGATTATAATATATATTTAATTCATACACTTTAGTATTTCTCATAAGAGTACTGTAGCTATTG TAGTTGCTTTTAAATTATGTCATATAGCTTTTAATTTTACAGCTCAACTTTCATCTTAATAAATATATATTTGGTACACAGGTAGAGAGAGAACGGACGGGTTGGGTGATGGGCCACTTG AGTTTGGGCAAAAGGGCCACCTCAATAGTAACAAGCACCAAGTAAATGAATGTGTTTATTTATTTATTTTTTTTATTTTAATTTTGTGAATGCAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATT TCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGTACGTGTTTTATATGGTTTGTTTTTTTAAAATATTCCAAGATGCCATAAATTTGCTAAACTATGTCTGATCTTTCT ATAGGCAAGAGAGATTCATTGTCCGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGTTTGTACACGCTTCCCATCTT AAGTCTTACTTTCATTCCCACAAAAGAAAACGTTCATCCATCCCATTATATTTACAAAAAAAATACCTTTAGTATAGTTTAGAACTTCAATGCATCGTGTTCTTAATAAGTTTACGTCAA ATGGAAGAAGTTACAGCTGGTAAAATGGGTGGGTTGAGTAACGGATAAACGGGCCAATCTAAACATGTGATTTTTTAGTACGAGCCAAAACAGGCTTAAAAACTTTCTTTAGAAATATAT GCTGAGTTGGTACATTTTGGGTGGTGTTGTTGCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTGCACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCCA CTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGCAAGAGAGATTCATTGTC CGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTG CACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGCTGTAGGG GCTGCCGGTG TCAGTTGAAA GCGCCAGTGA ATGACGGCTT GGGGGTTTCG GTCGAAACAA CCATGTGGAA ATCTAGCCAA GTGTTTTAAA GAGGTCAAAG ATGATGTGTT
TCAAGGTGAC GACGGCTACC CACTTAAAGC ATGCTACCCA CTGATGTTAC ATGTGTTCTT CAAATTCTTA GAGACTGTGA TCCCAAAATA TAACGATTTC AAGCAGCCCG GAGACAGATA
CCGATCATGG GATCTAGCCA GGCAAGAGAG ATTCATTGTC CGAATGTGTA AGATATTGTC TGACCCACGG GTAACCCATG AACTCCGCAG TATTTGGATC TCCTACTGGA CCCAGGCTTA
CCAGTCTCTG GGGCAGAAGA TAGCATCACG CCTCAATGTG CACCCCAATT ATTGAACACG GTTATCTTGA GTTTGGGCCC GCTTAAGCTA GATTGATGAT CATGCTATAG TAGGTCCATC
TCTAAGATTG TTATGTTACA CAAGCGGTGT TGTATGTATC AGTCCTACCT TTCGTCTGTA ATATTTTATC ATACTTAAGG AACCTGAAAC TTAGAATAAG TGCACACCTA GATGTGTGAG
T
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Retrieve as FASTA
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