Entry information : HaKat08 ( HanXRQChr14g0427441)
Entry ID 13673
Creation 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaKat08 ( HanXRQChr14g0427441)
Name (synonym) HaKat08 ( HanXRQChr14g0427441)
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaKat08
start..stop
S start..stop
HaKat05 971 0 1..502 1..492
HaKat04 965 0 1..502 1..492
HaKat01 863 0 1..502 1..492
HaKat07 862 0 1..502 1..492
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13673' 'join(4345187..4345201,4346690..4346719,4346840..4346936,4347020..4347297,4348090..4348866,4349572..4349661,4349940..4350007,4350160..4350253,4350701..4350757)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 4345187..4345201 13 N° 2 4346690..4346719 28 N° 3 4346840..4346936 95 N° 4 4347020..4347297 276
N° 5 4348090..4348866 775 N° 6 4349572..4349661 88 N° 7 4349940..4350007 66 N° 8 4350160..4350253 92
N° 9 4350701..4350757 55  
join(4345187..4345201,4346690..4346719,4346840..4346936,4347020..4347297,4348090 ..4348866,4349572..4349661,4349940..4350007,4350160..4350253,4350701..4350757)


exon

Literature and cross-references HaKat08 ( HanXRQChr14g0427441)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr14 (4345187..4350757)
Protein sequence: HaKat08 ( HanXRQChr14g0427441)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   502
PWM (Da):   %s   57521.67  
PI (pH):   %s   7.1
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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S
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Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
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ATGGATCCGTACAAGAGGTACAACTCATCACTTCATCACTTGCCCTTTTTACCATTTTTGTACAACTATTTAATGCATGTATGTATCTTAGTAATTTTGTTTGAACCGTGACTTTTTTTT
AGTGATTCAATATCACACCGTCTAATATAAGATGCAATTATTAAAAAAGAAAACGAGAATATAGAAATTACCTGTTTAAAACAAATATTTTGTATATAAAATTGGGATTTTAATTGGAAA
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AGGTAACTGTTTTATAGATATTTTGCTACTTGTCAGTTACATGTTG
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AGGTGAATCTTATTTCAATTAGTGAATTTGTTTATCCGTTTTT
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GTTTTATAAAACGATTAAATAGTTAACATAAGGATATCTTTTTATCATAACTAATACACTGGTTCTTTTATAAATACGTTAAGAAATGGACAAAGAAGCGTTAAAACCATAGTTGTTAAT
AGCATAGCGATGCGATACTATATATGCCGCTATCTGATTTTTTGCGCCTTAAACACGAGGAAATAGCGGGAAAATAGTTTTTTTATTCTTTTTAGTAAATACATGTAGCGACTGAAAAAA
TAAGCGTATTTTAGGGTTTTTTGTTGCAGGATTGAAAATAGAAGCGTATATACTTCCATATTTACCAGATTTTTTTATAAAATATACATGTAAAATATTTCTAAAGTTTTCTTCTAGTGT
ATCGCTAAATATGAAATAGCACCCACTATTTCATCGCCATCGCTACATAGCGTGTAGGTAGCTTGTCGCTCGCTATTGACAACTCTGAACCTGTTATGACCCATCTATCTTGCCACCTTA
GTGAATTTGATATATGTTTCTAAATTTGCAGGGTAACTTTGATATTGTGGGAAACAACTTTCCCGTGTTCTTTACTCGCGACGCAATGGCTTTCCCAGACGTGATCCACGCGTTTAAACC
GAACCCAAAGTCACACATTCAAGAAGACTGGAGAATCCTCGACTTCCTCTCACACCATCCCGAGAGTTTAAACACTATGACGTTCTGGCTTGACGATGTTGGCATACCATCAGATTACCG
ACACATGGAAGGCTCGAGTGTTAACGCTCTCACTTTAGTCAACAAAGACGGGAAAACACATTACGTGAAGTTTACATGGAAGCCAACATGCGGCGTGAAGTGTCTTTTAGAAGATGAAGC
GGTTAAAGTTGGCGGAAATAATCACAGTCACGCCACACAAGATTTATACGACTCGATTGCAGCCGGTAAGTTTCCCGAGTGGAAGCTGTTTGTTCAAGTTATTGATCCTGATCATGAAGA
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GCAGCTGGCGTTTAATCCGGGCCTTGTTGTTCCTGGAATATATTATTCTGATGATAAGATGCTTCAAGGTTGGATCTTTGCGTATTCGGATACGCAAAGGCATCGTTTAGGACCGAATTA
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ATTTAGTCCCTAACTTGGACATGCTAAAACCTTTAGATTTGTTGGCTGGGGACTAAATGCGTTACAAAGTGCAAACCACAGGGACCGTCCGTGTAATTTTGGAAAGTTAGGGACCAAATC
CAAAATTTTGGTAAACCACAGGGACCATCCGTGTACTTTACTCTTAATTAGAGGTGGTAACATGGACAGGCGTGTGGGTTAGGTAACAGCCAACGGGTCAAAATAGGTTCAGGTTAAAAC
AATGTTTTTTCTACTACAGGGCGAAATGGGCCCCATTGGGTTCGGTTGACCCCCGAGTCAAGTGTTAGGAAGTTGACCGACTTCCAATCTGTTTGACCCGTTCTACCCATTCCCTTTTGG
CTATTTGCTTCGTTCAGATAAAATACCATCCGAATTGACCCATTCATAAGTAACTGGATTATTATATTGTTCCAGGTTGATTACTTCCCTTCGAGGTATGATCGTGTTCAACATGCTCAG
CAGTATCCGATTTCCCCTGTTAAGCTAACTGGAACCCGTCAAAGG
GGGTTAGTTATTTTGTGTTTTCTTTATTGTATCAGGCCGGTTTATATTTTTGATATTTAAGATGATCTCAAAATC
AAGTCATTGACTTTTAAACAGTCAAACTTGGGGTTTCATCGCCAATAGTCCTTCGTCCTTAGTTTTTCCAAAACATGAAAAAAAAAATTTTAAAATTAAAATATAAAAATGTTGAATATA
TGTTTGGTGCACGGTCTGTTATCCCAGATATCAAACACTTGACGACCTGTAGTTGTTACGTAAAAATTCTGTTATTTTCGTGCAGGCTGTTATCCCAAAATACAATGATTTTAAGCAGCC
AGGGGAGAGATACCGATCATGGGCACCGGACAG
AGGTACTATTTACTTTCTATTATATTATATTAAATTTAAACGAATATGTCGTAATTACAAGAATAAATAATGCATGTGCAATATTTT
TTCTATATAAACATATAGCATTAGATTTGGTCATTTGATGGTCAAATTGAGTATATTATTTGTACAGGCAAGAAAGGTTCATTTGCCGAATGGTGAAGATGTTGTCTGACCCACGGGTCA
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AGGTTCGTTCACCTCCCCCTCTTTGGTCCATTTCAAATAAAGGTTGACTTTTGAAGTTAAAAAGCAATTTTGTTTGACA
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GTTGGGTTGACACGAAACACTATGTCCAAGTTTCTTTTAATATTCTTTTGAGTAATTAGCATCAAATGTGATTACAAAAATATTATTTCAACCGTAGTCTAATTCTTTTAATAGAAATAT
TTAGGATATTTTATACATTAAAACTACATTTTGGGCGCCTTTTGACCCATATTTAACATAACTCGGATTGACTTGTTTATAAGTAAATGGGTTGAAAATGCGTACTTGATTTGGGCTGGT
ATTCTTGCAGGCTGACAAATCACTGGGGCAGAAAATAGCTTCACGCCTCAACGTGCGCCCTAACTTT

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATCCGTACAAGGGTTCAAATCTCATCCTCCCTCCCCCGAATCAACGCCCTTCGAGTGCTTACAATGCTCCGTTTTGGACGACTAATGCTGGTGCACCGGTTTACAACAATACTGCA
GCCTTGACTGTTGGAGACAGAG
GTCCAATTCTTCTTGAGGACTATCATTTAATAGAGAAACTTGCTAATTTCACTCGTGAACGGATCCCAGAACGCATTGTACACGCTAGGGGCGCAAGT
GCTAAGGGATTTTTTGAGGTTACACATGACATCACTCACCTTACATGTGCTGATTTCCTTCGTGCTCCTGGAGTCCAAACGCCTACTATTGTTCGTTTCTCGACTGTTATCCATGAGCGT
GGTAGTCCCGAAACTATCAGGGACCCTAGAGGTTTTGCAACCAAGTTTTACACCAGAGAG
GGTAACTTTGATATTGTGGGAAACAACTTTCCCGTGTTCTTTACTCGCGACGCAATGGCT
TTCCCAGACGTGATCCACGCGTTTAAACCGAACCCAAAGTCACACATTCAAGAAGACTGGAGAATCCTCGACTTCCTCTCACACCATCCCGAGAGTTTAAACACTATGACGTTCTGGCTT
GACGATGTTGGCATACCATCAGATTACCGACACATGGAAGGCTCGAGTGTTAACGCTCTCACTTTAGTCAACAAAGACGGGAAAACACATTACGTGAAGTTTACATGGAAGCCAACATGC
GGCGTGAAGTGTCTTTTAGAAGATGAAGCGGTTAAAGTTGGCGGAAATAATCACAGTCACGCCACACAAGATTTATACGACTCGATTGCAGCCGGTAAGTTTCCCGAGTGGAAGCTGTTT
GTTCAAGTTATTGATCCTGATCATGAAGATAGGCTTGACTTTGACCCGCTTGATGGGACGATGACATGGCCCGAGGATGTGATACCGCTGCAGCCAGTTGGACGTATGGTGTTGAATAAG
AATATTGATAACTTCTTTGCAGAAAATGAGCAGCTGGCGTTTAATCCGGGCCTTGTTGTTCCTGGAATATATTATTCTGATGATAAGATGCTTCAAGGTTGGATCTTTGCGTATTCGGAT
ACGCAAAGGCATCGTTTAGGACCGAATTATCTGCAGTTACCTGTTAATGCTCCAAAATGTGCTCATCATAATAATCACTATGATGGAAATATGAATTTCATGCATAGAGATGAGGAG
GTT
GATTACTTCCCTTCGAGGTATGATCGTGTTCAACATGCTCAGCAGTATCCGATTTCCCCTGTTAAGCTAACTGGAACCCGTCAAAGG
GCTGTTATCCCAAAATACAATGATTTTAAGCAG
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GCTGACAAATCACTGGGGCAGAAAATAGCTTCACGCCTCAACGTGCGCCCTAACTTT

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cDNA
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GTGTTTGCAA GGGACCATAG ATATTCACAA GATCACAAGA CAGCTTTGAT TCTCGTTATT CTTGTCCCTC AGCATGGATC CGTACAAGGG TTCAAATCTC ATCCTCCCTC CCCCGAATCA  ACGCCCTTCG AGTGCTTACA ATGCTCCGTT TTGGACGACT AATGCTGGTG CACCGGTTTA CAACAATACT GCAGCCTTGA CTGTTGGAGA CAGAGGTCCA ATTCTTCTTG AGGACTATCA  TTTAATAGAG AAACTTGCTA ATTTCACTCG TGAACGGATC CCAGAACGCA TTGTACACGC TAGGGGCGCA AGTGCTAAGG GATTTTTTGA GGTTACACAT GACATCACTC ACCTTACATG  TGCTGATTTC CTTCGTGCTC CTGGAGTCCA AACGCCTACT ATTGTTCGTT TCTCGACTGT TATCCATGAG CGTGGTAGTC CCGAAACTAT CAGGGACCCT AGAGGTTTTG CAACCAAGTT  TTACACCAGA GAGGGTAACT TTGATATTGT GGGAAACAAC TTTCCCGTGT TCTTTACTCG CGACGCAATG GCTTTCCCAG ACGTGATCCA CGCGTTTAAA CCGAACCCAA AGTCACACAT  TCAAGAAGAC TGGAGAATCC TCGACTTCCT CTCACACCAT CCCGAGAGTT TAAACACTAT GACGTTCTGG CTTGACGATG TTGGCATACC ATCAGATTAC CGACACATGG AAGGCTCGAG  TGTTAACGCT CTCACTTTAG TCAACAAAGA CGGGAAAACA CATTACGTGA AGTTTACATG GAAGCCAACA TGCGGCGTGA AGTGTCTTTT AGAAGATGAA GCGGTTAAAG TTGGCGGAAA  TAATCACAGT CACGCCACAC AAGATTTATA CGACTCGATT GCAGCCGGTA AGTTTCCCGA GTGGAAGCTG TTTGTTCAAG TTATTGATCC TGATCATGAA GATAGGCTTG ACTTTGACCC  GCTTGATGGG ACGATGACAT GGCCCGAGGA TGTGATACCG CTGCAGCCAG TTGGACGTAT GGTGTTGAAT AAGAATATTG ATAACTTCTT TGCAGAAAAT GAGCAGCTGG CGTTTAATCC  GGGCCTTGTT GTTCCTGGAA TATATTATTC TGATGATAAG ATGCTTCAAG GTTGGATCTT TGCGTATTCG GATACGCAAA GGCATCGTTT AGGACCGAAT TATCTGCAGT TACCTGTTAA  TGCTCCAAAA TGTGCTCATC ATAATAATCA CTATGATGGA AATATGAATT TCATGCATAG AGATGAGGAG GTTGATTACT TCCCTTCGAG GTATGATCGT GTTCAACATG CTCAGCAGTA  TCCGATTTCC CCTGTTAAGC TAACTGGAAC CCGTCAAAGG GCTGTTATCC CAAAATACAA TGATTTTAAG CAGCCAGGGG AGAGATACCG ATCATGGGCA CCGGACAGGC AAGAAAGGTT  CATTTGCCGA ATGGTGAAGA TGTTGTCTGA CCCACGGGTC ACCCATGAGC TCCGCAGCAT TTGGATCTCA TACTGGTCTC AGGCTGACAA ATCACTGGGG CAGAAAATAG CTTCACGCCT  CAACGTGCGC CCTAACTTTT AAACTGATCT ACACGTCATT ACAGGAAAGG GTCTCTCTCG TTGTCTGTTA ACAGAAAGCA TGGTTTTATC ATCACAGCGT CGTACTGTTT TAATTATGTA  ATGTTTTATG AACCTAGGAC TTAGAATAAA AGCTTTGGTG TTCTAGGTTA AGTTTGAAGC TAAAAACATG TGGCATGCAT GTAGTCTAAG TTGCTTTTTT ACATGTAATA TAAGTAATGT  TGTTGCTTAT GTTGATTTTG GTTCTTGTTT TGTTCTTCAT CGTCATCAAA TAAGTTTTAT GTACAACCAA GTAAGCTTTG TGTACGACTA AAAGCCATAC AACTCTCCTC TTTTACATAT  TAGCCTTTGT AATCTAGTAA ACTATTCACA ATAAGTTCAT CTTGCTTTGT TCTTCATTGT CGCAACGTCG TTTTCTTTTT TACCTCTCTA ATTGATGCAA CCACAATCAA AGCTGCCCCG 
TCAAGCGTGA CTCTACCACG TGTTGTATAC ACCGCCAGCG ACTTTTGG 

Retrieve as FASTA