View Redoxidase 13741

Entry information : HaCSD04 (HanXRQChr02g0055581)

Entry ID	13741
Creation	2016-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes	2016-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))

Peroxidase information: HaCSD04 (HanXRQChr02g0055581)

Name (synonym)

HaCSD04 (HanXRQChr02g0055581)

Class

Cu/Zn SOD [Orthogroup: CSD001]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus

Organism

Helianthus annuus (Sunflower) [TaxId: 4232 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	HaCSD04 start..stop	S start..stop
AtCSD02	319	2.34e-112	8..225	1..216
NoffCSD02-1B	307	1.53e-107	9..225	1..207
TsCSD02	307	3.05e-107	9..225	1..226
NoffCSD02-1A	301	4.04e-105	40..225	34..215

Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13741' 'join(165504867..165505158,165506905..165506966,165507057..165507096,165507190..165507285,165508560..165508591,165508695..165508770,165508894..165508947,165510013..165510035)'

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	165504867..165505158	290	N° 2	165506905..165506966	60	N° 3	165507057..165507096	38	N° 4	165507190..165507285	94
N° 5	165508560..165508591	30	N° 6	165508695..165508770	74	N° 7	165508894..165508947	52	N° 8	165510013..165510035	21
join(165504867..165505158,165506905..165506966,165507057..165507096,165507190..1 65507285,165508560..165508591,165508695..165508770,165508894..165508947,16551001 3..165510035)

Literature and cross-references HaCSD04 (HanXRQChr02g0055581)

DNA ref.	HanXRQ genome: HanXRQChr02 (165504867..165510035)

Protein sequence: HaCSD04 (HanXRQChr02g0055581)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	225
PWM (Da):	22692.66
PI (pH):	6.43

Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MQQAALALMAAHSILFSSPTTTTNPLIFPLSNPNTLHSSFTGVSLKSTLNRQSLTLSAAAATAPKPLTVVAATKKAVAVLKGTSSVEGVVTLTQEDDGPTTVNVKITGLTPGPHGFHHEF
GDTTNGCISTGPHFNPNGHTHGAPEDEIRHAGDLGNIIANADGVAEATIVDNIPLTGPNAVVGRALVVHELADDLGKGGHELSLSTGNAGGRLACGVVGLTP

Retrieve as FASTA

Remarks

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGCAGCAAGCTGCACTTGCATTAATGGCTGCTCACTCAATCCTCTTCTCTTCACCAACAACCACCACTAATCCCCTCATCTTTCCTCTTTCAAACCCTAACACTCTCCACTCTTCTTTC
ACCGGCGTCTCCCTCAAATCCACCCTCAACCGCCAATCCCTAACCCTCTCCGCCGCCGCCGCCACCGCTCCTAAGCCGCTTACGGTTGTCGCCGCCACCAAGAAAGCTGTTGCTGTTCTC
AAGGGTACTTCTAGCGTTGAAGGCGTTGTTACTCTTACTCAAGAAGACGATGTGGTATTATTTTTATATATTTATGTATTTATATATTTTTATGTTTAGTAATCTATTTGACTTAAACGC
TAGGGGTGAGAAAATAACTGAATTAACTGAAGTGGAACCTGCTTATTACCTATAGGTTTTTAGCATAGTTGTTAAAAACCATGGTTTCTTGCGCCTAGGCCCATTTTTCAGGCGAGGCGA
GTCAATTGCGCTTTAATTCTCCGAGTGATGATTCGGGCGTAGATTCCTTAGGCTAGAGGGTGTGGTTTAAAGCCCTAGGGGCTTTATTACGCCACGTAAGCAAGGGGCTTTATCGCTAAC
TTACACGGTGTGGAATAACGCCCCTTATAAAAGCCCTTTTTTAACTATATTAAAAAAAGATAAATAAAAAATCTGATTGGTTTACATTAGGTGGGGCTCCTTGATTTCATCTCTCGCGCG
CACTACTCCTTTGGCGGAAGCCATTGATGGCGCCCCCTTTAACGGAGGCGGGGTGGTTTAACTAGATGGGGGGCGCTAAAGTTCATGAGGTGGCAGGGAGGCGCCAAGCCACACCCCCTG
GCCTTAGAGTTTCCGACCAAAATATCTAAATTCCGGCAAGATTTTAGCCAAATTTCTACTTTTATATAAGGAAAACTACTTTTCTACACTAATATTTTAGATCTCTTGGTTCTAAATAGA
TGATATTAAATGTTAATATATATTTTTAGTACATAATATATTTTTAATTTTTTTTCATTGTGCGCTTTTATTTCCTCAAGCCCTCACTTTTTTTGCGCTCTGTGCTTAGGCCTCATGCGA
TGCCTATTCGCCTTGAGTGCGCCTAGCGCTTTTAATAACTTTTAATAAAATATTGTGGTTTCTGTTTGGTTCTTGTTTTAAAAAGCGAAAAGCGACAAAGTCTAAAACCAAGAGAAGCGC
GCCGCTTTTGTACCCGAGGGGCAAATAACTATGTAATTTTATTTATATATTGTCTGTAGGTTTCTAATATTATTTACCCAATAATTAGAGACAAGTAAGCGTTGTATATTTTTTCAATAT
GCAAATTACATACATTTACAATCTGAAAAGCATGCTGCACAACAACTTGTTGCACAAAAATATGGGAAATACATGAGGCGCACGGCTCAGAGTCAAATTTTTTGCCAAGAAATCGCGCCT
CAGGTAGTGCGCTTTTTTAAAAAAGCGCGCCTTATGCAGTTATGCTACCAAAACTTGTTGTGCCTAGGCACACTTTTCTAAACCAAGGTGTGGTTGGGGCTCAAAGCCGACCTGAACCGA
ATCAACCAAGACGGACCAAATTTTTAAAATTATATGAAAATTTAGGTTTCAGTTCGGTTGGGGATTAAAAAGCAAACCGAATCAACCAAGACGGACCAAATTTTTAAAATTATATGAAAA
TTTAGGTTTCAGTTCGGTTGGGGATTAAAAAGCAAACCGAATCAACCAAGACGGATCAATTTCCAAAAACTTTTAAACTGAATATTCCAGTTTCGGTTCGCTTGGTGCTCAAAACCAAAC
TGAACCGCCCCGTGCACACACTACTTAAACCTATCTAGCACTTAACTGTTAAAATATTTAAGCATCCGTTTCGATTTGAACCTGAAACTTAGCTGGATTGGAATGTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTAATTTGTGATTAAACATTATATCATATTTGGATTAGGGTTTGAATTTTGACTAGACAAGTGTATGATATATGCCATTGATTTGTTTGTGAATTGTTGTTATTGATGTAG

GCCCAACAACTGTGAATGTGAAAATAACCGGACTAACTCCCGGACCCCACGGGTTTCATCTATAGTAAGCATTCATCTTGTTCTTAGCGTAACACGTTAAATGATTTTAATGCATGATTA
AGTGCTAATAGTTTGGCGTTTCTTTAATCTGTAGCATGAGTTTGGTGATACCACAAACGGGTGCATATCAACAGAGGTTTGATTTTTTTTAATGCATTACAATGTACATGTTCTAGGGTA
CGGTTCGTTTAGTTCTAATGATTTAACGTTGACCATTGATTAATATTAGGACCTCATTTCAATCCGAATGGGCATACTCATGGTGCTCCTGAAGACGAAATTCGCCATGCGGGTGACCTG
GGAAACATAATTGCCAATGCCGATGTGGTATTTCACTATAATCATATTTTATATTTTAAGGGTAAAGTTCTTGTACAAATAATCTTAACATACTAAACATACAAATTGAAGGAAAACTCA
AAAAGACAAGGTGGCATTTTTGTAATTATCAATAACCATCAAAGTTACTCTACAAATATACCTAAAAAAACCTAACCACTCCCCCCACCCCCAAAAAAAACCTAAACCCCCCACCCCCCA
AAAACCTAACCCCCCCACCCAAGCTAAAATGCTAAAAACTAACCCCCCCAAAAAACCTAAAAAAATCTAAAAAAATAAAAAAAACACACAAATTATTTTATTTTATTTTTTTAACATTTT
TTATTAAAAAATCGCTACTTTTAGTAGCAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTGCTAACGAAATGTAGTGATTTTTTAATAAAAAATGTTAAAAAAAATTGTGTTTTTTTAG
GTATTTTTGGTTGTAACTTTGATAGTTGGTGGTAATTACAAAAATGCCACCTTGTCTTTTTGGGTTTTCCTTCAATTTGTATGTTTAGTATGTTAAGATTATTTGTATTTGATCTTTTGC
CTATATTTTAATTGTTTTAAAGTAAAACTGAGGTTTGGCCAGTTTTGTGACTTTCGTCCAAAGGTTTGTTTTTCCGCATCTGGGACGAAAATGGCATTTTACTCTACTTTTTAGGAAAAA
TTACAAGTTTTGTCCTTTATCTTTATACCACTTTTCAGGCCGTGTCCTTTTTAACGAATGTTGACAGGCGGTGTCCTTTACTAGGTATTTTGTTGCAAGTTTAGTCCTTTACACCCAACA
ATTAACAGGGTTTTTTAACTGGGTTGGGTGTAAAGGACTAAACTTGCAACAAAATACCTAGTAAAGGACACCGCCTGTCAACATTCGTTAAAAAGGACACCGCCTGAAAAGTGGTATAAA
GATAAAGGACAAAACTTGTAACAAAATACCTAGGTAAAGGACTAAACTTGCAACAAAATACCTAGTAAAGGACACCGCCTGTCAACAATTAATAGGGTTTTTTAACTGGGTTGGGTGTAA
ATGACTAAACTTGCAACAAAATACCTAGTAAAGGACACTGCCTGTCAACATTCGTTAAAAAGGACACCGCCTGAAAAGTGGTATAAAGATAAAAGACAAAACTTGTAATTTTTCCTATTT
TTTATTTATTCTTAATTTGGTCGTCCGTCGTTTACACCAGCCCCAAGTTAAATGACCGTCTTTGATCTTTCTTTATAATTTTTGTGTTAAATATAATGCAGGCGTGGCTGAGGCTACAAT
CGTCGATAATCAGAGGTTTGAGTGTAAAGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTGTTTAATGATCCTGTTTGGTGTAATTTGTTGATCGTCTAGTTATAATATTTGATTTATGAGGACTTGCAGAT
ACCATTGACCGGGCCTAATGCTGTGGTTGGAAGAGCCTTGGTGGTTCATGAGCTTGCTGACGACCTCGGAAAGGGGGTAATTTGCAATTAATTTTTATAATTATTATTATTTTTTTTAAA
TTTAATTTTTTGAGTATATGTTACCTAGAATCTGAACGTTGTGTAATTCTTTTTTGACGTTTTTTTGGTTTGATTTTAGGTGGTCACGAACTTAGCCTCTCCACTGGAAATGCAGGCGGA
CGATTGGCTTGTGTGGTATGATAATTAATTAATTATACACATGTTAATTTTAATTATTTTGGTGGCAGTTTTGACCCATTTATCCAAAGATGGGTTGATCCTAGGGGTGTTCAAAATTCG
TTTCGAATTCGAAAAATCGAAATTCGTTTCGATTATCAACAATTCGAATCCGAATTCAAATTTGATTCAAATCGAGTCTAGTAAATCGAATACAAATTTATAATTTTATATCCGATTTGA
AATTCGAATTAAAATGATACATATTTATTTATCATTTTTATATATAATTGTATATAACTTTTGTTGGCCTACAATATAAATTAATTTCTAAATTTATTCTAAGTATTAAAATAGCCCATT
ACCAAACCCATAACTTAAACGAAATTATTACATATCTTAACTGAATTTTTATCAAAACGAATTTATTCGAATTTAACCGAATTCGATTCGAATTCGAATTGGGATTTTAATTCGAATACG
AATCGAATTGGTTGGTTCTTAATTGAATTCGAATTCAAGCAAAAAATAGATTATAGGAAAAATTCGATTTGAAATTTCGATATTCGATTCGATGAACACCCCTAGTTGATCTGGATTATA
TTTTATCTCAAACGGGTCAAAAGGTGTCTAAAAGTGTAATAAAATCCTTACAATCTTTTAATCCAGTTTATTAAAAATCATATTACTCTTTTCGTACTTTAGTTTTTCAATCATATTTAG
TAGTTAGTACGTTAATCATTAAATTAAAAAAAAATAAAGAACACCTCAAAAGATCGTTCGTGTAGTTTTTTGGTTTTATTAAATTAAGTATAACCTTTTTATTAAAAATCATATTGCCAT
TTTCATGCTTTAGGTTTCAAATTCATCTTTACTATAAAAATCATTAAACAAAGTAAGAAAAATGAATAAAGAGCATCTCAAACGATTGTCTATGTGGTTTCATCAGATTAGAAAGCGTGT
CGTTTTCTAAATCATTATTCACATAAAAGGCGAAAAAGAAAGAAAAAAGAGTTGTATTTTGATTCACTTTGTTACAACTTTTTTAAACCGCAAATCTCTTTCGCCCTTTGAAATATGCAG

GTGTGGTCGGGTTGACTCCAATA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA

cDNA►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ACAAAACAAC AAGAAACACA CCGAATGAAT CATCTTTTAT CTTCCATTTG TTGTCACAAA CATTATCATT TTATCATCAT TCACACCTAC CACTGAATGC AGCAAGCTGC ACTTGCATTA ATGGCTGCTC ACTCAATCCT CTTCTCTTCA CCAACAACCA CCACTAATCC CCTCATCTTT CCTCTTTCAA ACCCTAACAC TCTCCACTCT TCTTTCACCG GCGTCTCCCT CAAATCCACC CTCAACCGCC AATCCCTAAC CCTCTCCGCC GCCGCCGCCA CCGCTCCTAA GCCGCTTACG GTTGTCGCCG CCACCAAGAA AGCTGTTGCT GTTCTCAAGG GTACTTCTAG CGTTGAAGGC GTTGTTACTC TTACTCAAGA AGACGATGGC CCAACAACTG TGAATGTGAA AATAACCGGA CTAACTCCCG GACCCCACGG GTTTCATCTA CATGAGTTTG GTGATACCAC AAACGGGTGC ATATCAACAG GACCTCATTT CAATCCGAAT GGGCATACTC ATGGTGCTCC TGAAGACGAA ATTCGCCATG CGGGTGACCT GGGAAACATA ATTGCCAATG CCGATGGCGT GGCTGAGGCT ACAATCGTCG ATAATCAGAT ACCATTGACC GGGCCTAATG CTGTGGTTGG AAGAGCCTTG GTGGTTCATG AGCTTGCTGA CGACCTCGGA AAGGGTGGTC ACGAACTTAG CCTCTCCACT GGAAATGCAG GCGGACGATT GGCTTGTGGT GTGGTCGGGT TGACTCCAAT ATAATCTTGT GGCGAACCTT GTTCAGTCGG TCTCAGTTTT CGCATAGAGG TTAATGGTTT GCAATTAAAA ACTGTAAGGT GAAATATTTG CACATTGTAT TTAGCCAAAT AATCATTGAG GCTTATGTGA AAACACTTGG TGAAAATGAT GCAGAACCAC TTCTTGCTGT TTTAATAACT TATGGTTTGA
TTATCATATT ATTGGACCAC TTTTACTTGG CACCTTTATG AAGGCATTCA TATTTATAAT ATGTAGGGCT GCAAACGAAC CGAATGAACA CGAACAAGAC CTTGTTCGTG

Retrieve as FASTA