Entry information : HaFSD02(HanXRQChr08g0223321)
Entry ID 13745
Creation 2016-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-05-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaFSD02(HanXRQChr08g0223321)
Name HaFSD02(HanXRQChr08g0223321)
Class FeSOD    [Orthogroup: FSD001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaFSD02
start..stop
S start..stop
HaFSD03 340 3.71e-120 2..199 50..255
HaFSD01 296 3.7e-102 2..200 50..271
LeFSD03 286 5.71e-99 2..194 49..249
LeFSD02 283 4.27e-97 2..189 49..259
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13745' 'complement(join(59081500..59081616,59082273..59082299,59083219..59083292,59083386..59083746,59089024..59089056))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 59089024..59089056 31 N° 2 59083386..59083746 359 N° 3 59083219..59083292 72 N° 4 59082273..59082299 25
N° 5 59081500..59081616 115  
complement(join(59081500..59081616,59082273..59082299,59083219..59083292,5908338 6..59083746,59089024..59089056))


exon

Literature and cross-references HaFSD02(HanXRQChr08g0223321)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr08 (59089056..59081500)
EST ref. GenBank:   CD847604.1
Protein sequence: HaFSD02(HanXRQChr08g0223321)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   204
PWM (Da):   %s   22882.71  
PI (pH):   %s   5.55
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MIDLKPPPYALDALEPHMSKETLEYHWGKHHRGYVNNLNKQIEGTELHEKSLESIILASYNKGDILPAFNNAAQVWNHEFFWESMKPGGGGKPSGELLELIIRDFGSFEALIQEFKLGAA
THFGSGWTWLV
YDIEHKKLAVLKTSNAINPLVLDYYPLLTLDVWENLRPDYIATFLDKLVSWDAASSRLDAAKVSIEGKKDGG

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Shorter 5' but confirmed with EST.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATCGATTTGAAGCCACCTCCTTATGCATTGGTACGATAAATATATATAACTCAAAACTATACTATAACTTAAATAATCTATATATATATATATATATATATATATATAGGGGAAAGA
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GGACCATTGATTTCCTTTTTAGTTGTTAAAGGTATGATTGTAATTATATAAAAAATTAGATTTAAATCATTATTTTAATAATTGAATTAAGTTACATCTTTCCTAATTTAAATTCATTAT
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TGAAACATCCTTATCGACCAAGCAAACAAACATACGTGAATCATCCTTATCGACCTCATACGTGAATCATCCTTATCGACCTTCCATCTCCACTTTCCTCGTTTACGACGTCTCCTATAA
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GTGTTATATAGTGTTATATATAGTGTTATAATACACTTCTCACACTTCTGAATTAATGTACACTATCCCTACCCTATACACATATATATATATATAGATATATATATATATTGCATTTTA
GTCTTCATATATATAGGCATGTCCAAACTTGCTAATCATGATTCAAAAATAAGCACCACCGGTTAAGACTGCTAGAATTTAGCCGACACATAAAACCTTTGAGCTTTTAGCTGCCAACTA
GGATTTAGCCTCCGCTTTAACCCCGACTAGAATTTAGCCTCCATTTTATCCGTGAGCTAGAATTTAGCCGCCTGCTTTTTATTTACCGGTTAGGATTTAGCCCCCGCTTTTTATCCGCCA
ACTAGGATTTTAGCTCACGCATTTTATCCTCCATCTAAATTTAACTCACGCTTTACACGTGTATTATTTTGATTGCTTTTTTTACTACTTTTCAAGGTTCTTGTGCTGGCTAATTTCTAA
TCGTCTCAGCCGGCAATGCTTATTTGTCGAATATTGATTGGTTGGTTTAGACATGTCTATTTTTATGAAGGCTAAACGCAGTGTTTATTTTGTTAATTTTGTCAGTCAAAAATGTCCATA
TTGTTAAGTTTTCCATAATTTAATTACTAGGAGATGCTCTTGAACCACACATGAGCAAAGAGACATTGGAATATCATTGGGGAAAACACCACAGAGGTTATGTCAACAATCTAAACAAGC
AGATTGAGGGAACTGAACTACATGAAAAGTCATTAGAAAGCATAATATTAGCTTCATATAATAAAGGCGATATTCTTCCCGCCTTCAACAATGCTGCACAGGTTTGGAACCATGAATTCT
TCTGGGAATCTATGAAACCTGGTGGTGGTGGAAAGCCTTCCGGAGAACTTTTAGAATTAATAATCCGAGATTTCGGTTCGTTTGAAGCGCTAATTCAAGAGTTTAAGTTAGGTGCCGCTA
CTCACTTTGGTTCTGGATGGACTTGGCTTGTAT
GTAAGTGTTGTGTTTGTTCCACCAAGATCCATGACCAAACAATTTGAAACAACATTGATCCATTAATTTTTAAAAGTCTTTGTTTAT
GTGTAGATATGACATAGAGCACAAGAAGCTTGCTGTGTTGAAGACCTCAAATGCAATTAATCCTCTGGTGTTGGATTACTATGTGAGTAAACAATAATATTATTTTCTTTTTGTTATATT
GGTATTAAATTAATCATTAATTCTTGTATTAACCTTTGTATTATATCTCTTGCATATGTTTGTCATATTGGGGAGGGTTTATTTTAGAACCGCTTTTATTGCGAGAACCACGAGAACCAA
TGTGAACACAACAAAATAAAAAGGGAAAATTACCAAAATGTTGGTTGACTAAGAGGGTTTTCAATTTTGTCACTCTCCTGCGTCATTGGAAGGACCACTGAGCATGGGATGAGTCGGCAT
ATCATGTTGAAGAGTCCATGTATCACGCTTCTTCAGAAGAGTCCACCGACGCTTCGGAAGAGTCACCGACGCTTCGGAAGAGTCCACCGACGCTTCGGAAGAGTCACCGACTCTTCCCAT
AAATATGTGGGACACGTGTCAGCTTCTAGGGACATGGACGCATCAACATAACATGCGGACTCTTCCGAAGCTTAGTGGTCCTTCCAAGGACGCAGGAGAGTGACAAAATTGAAAACCCTT
TTGGTCAACCAACAGTTTCGTAATTTTCCCAAATAAAAACCCACTCACAACCACCCAAAACCTAAACACCCCCCCCCCCTGGCGGCTAAAAAAAAAAAAAACTATACCTCACCCAAAAAC
TTATACGAGTTGTGAGAATTTAAAGAACTCGGTCTTACGAAAGGTTTTTTCAAAAGTAGTGATAAGGTGGCAATGTTTTTCACTTTTAAGTGTTAAAAAATGGGTGTTTTTCTTATATGC
GCTAGCTAGGCATGCTTTTTAAAGTTTTTAGGTTTTGTTATTCTGGATGACTTAATTGGGCTACTTGCTTGGCGTAACATAAGCTATTGAGTAGTGTATATATATATGATATATTTATAA
TTATAATCTAACAATTGGTTTCTTTTTCTTGGACTTGCCAGCCCCGCTCCTCACCTTAGATGTTTGGGAGGTAGTTATATCTCTTCGCTTACATTTTCCACAATAAATAAACAATGTCCA
TGATATATTCACTAACTTCAATTTGAAACTGAATTGTGATTGCAGCATGCATACTACCTGGATTTTAAGGCAAGAACTTGCTACTTTCTTCCAGATCGATGCACATATTTATCGGGGTGT
TTGGATATTTGCGCTATAAAACTGATTAATCGGTTACATATCTGCAAGACAAAAATTATTATTTAAGAAATATTAACATCATTAATTTATCCACATTTTCATTGAAATAATACTTCCAAC
ATAATTAATATGTAAGAATTATCTAAGCTAAAAATCATTTTCAATTCAATCTCTAAAAAAATACTTAGGTTTATTAGAAGAAGTCTTGAGTTTGAATACTTCAACAACAGATAAAAAAAA
TCCATTTTAGTCATTTTATCTATTACTTCACTTAAGAAAAACTAGAACTATCACAGCTTCAAAAGGTTTGAAGCACATCAAATCGGTATCATATCATATTATTTACTATTTAGCATCAAT
AATGAGTTTCAAAATGCATGTCCAAACACCCTCATTCACCATATGTATAAACAAAGTGACCCTTTAGCCTATCTAATGCTTGATTAGTGTCACAATAATGGTATTAAAATTAAAAGTCTA
TTGCAGAAAACCTCAGGCCCGATTATATAGCTACTTTCCTCGATAAGCTTGTATCATGGGATGCGGCAAGTTCCAGACTCGATGCAGCCAAGGTTAGCATTGAGGGAAAGAAAGATGGAG
GCAAT

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATCGATTTGAAGCCACCTCCTTATGCATTGGATGCTCTTGAACCACACATGAGCAAAGAGACATTGGAATATCATTGGGGAAAACACCACAGAGGTTATGTCAACAATCTAAACAAG
CAGATTGAGGGAACTGAACTACATGAAAAGTCATTAGAAAGCATAATATTAGCTTCATATAATAAAGGCGATATTCTTCCCGCCTTCAACAATGCTGCACAGGTTTGGAACCATGAATTC
TTCTGGGAATCTATGAAACCTGGTGGTGGTGGAAAGCCTTCCGGAGAACTTTTAGAATTAATAATCCGAGATTTCGGTTCGTTTGAAGCGCTAATTCAAGAGTTTAAGTTAGGTGCCGCT
ACTCACTTTGGTTCTGGATGGACTTGGCTTGTAT
ATGACATAGAGCACAAGAAGCTTGCTGTGTTGAAGACCTCAAATGCAATTAATCCTCTGGTGTTGGATTACTATCCGCTCCTCACC
TTAGATGTTTGGGAG
AACCTCAGGCCCGATTATATAGCTACTTTCCTCGATAAGCTTGTATCATGGGATGCGGCAAGTTCCAGACTCGATGCAGCCAAGGTTAGCATTGAGGGAAAGAAA
GATGGAGGCAAT

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCCAACTTAA CACAACTTAT AATCATCCTA TTTCTACTGC AGAGAGTCTG CCTCCAATCT AAACCGTCAG GCTAGAAAAT CTGCTTCTGG AGCCATGATC GATTTGAAGC CACCTCCTTA  TGCATTGGAT GCTCTTGAAC CACACATGAG CAAAGAGACA TTGGAATATC ATTGGGGAAA ACACCACAGA GGTTATGTCA ACAATCTAAA CAAGCAGATT GAGGGAACTG AACTACATGA  AAAGTCATTA GAAAGCATAA TATTAGCTTC ATATAATAAA GGCGATATTC TTCCCGCCTT CAACAATGCT GCACAGGTTT GGAACCATGA ATTCTTCTGG GAATCTATGA AACCTGGTGG  TGGTGGAAAG CCTTCCGGAG AACTTTTAGA ATTAATAATC CGAGATTTCG GTTCGTTTGA AGCGCTAATT CAAGAGTTTA AGTTAGGTGC CGCTACTCAC TTTGGTTCTG GATGGACTTG  GCTTGTATAT GACATAGAGC ACAAGAAGCT TGCTGTGTTG AAGACCTCAA ATGCAATTAA TCCTCTGGTG TTGGATTACT ATCCGCTCCT CACCTTAGAT GTTTGGGAGC ATGCATACTA  CCTGGATTTT AAGAACCTCA GGCCCGATTA TATAGCTACT TTCCTCGATA AGCTTGTATC ATGGGATGCG GCAAGTTCCA GACTCGATGC AGCCAAGGTT AGCATTGAGG GAAAGAAAGA  TGGAGGCAAT TGATGTAATG CGTAAACACG CCACAATAAA ACCTATCACT ACACCCTTTG GTCGCCACAA TAAAACCTAC ACTACACCCT TTGGTCTTCT TCGCATTCCC TCATTATGGT  TAAGTATTTA TGATGTGTCT TCTTGGTTTG GTTTGCTTGT TTGATCTTCT AGCATTCGTA TTGAGTTGGG TTGGTCCGAA AATAACACAT GGACATTCAA AGTATTATTT CTTGTACTTT  TATATTTGGT GTGAGATCTC CCTGGTTTGA ATCGAACAAT AAACATAAAT CTTAGAAGGT AAATCTCATG AATAACAAAC AAAATACAGA AATATATCAT TGTAGATTTA GCATCAACCC 
CCATGGATTA TCCATGGGGT ATTACATCAA AGATCCATTA AGAAGATACT ATCAGATACA CACCTCCAAA TGATGGTCGC T 

Retrieve as FASTA