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Entry information : HaGOX03 (HanXRQChr09g0257521)
Entry ID 13762
Creation 2016-05-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGOX03 (HanXRQChr09g0257521)
Name (synonym) HaGOX03 (HanXRQChr09g0257521)
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGOX03
start..stop		 S start..stop
HaGOX08 699 0 1..350 20..369
HaGOX09 697 0 1..350 20..369
BstrGOX03 668 0 1..350 20..369
ThasGOX11 660 0 1..350 20..367
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 138723305..138723384 78 N° 2 138723461..138723585 123 N° 3 138723713..138723759 45 N° 4 138724336..138724413 76
N° 5 138724885..138725076 190 N° 6 138725169..138725231 61 N° 7 138725721..138725790 68 N° 8 138725883..138726088 204
N° 9 138726304..138726495 190  
join(138723305..138723384,138723461..138723585,138723713..138723759,138724336..1 38724413,138724885..138725076,138725169..138725231,138725721..138725790,13872588 3..138726088,138726304..138726495)


exon

Literature and cross-references HaGOX03 (HanXRQChr09g0257521)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr09 (138723305..138726495)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr09g0257521
Protein sequence: HaGOX03 (HanXRQChr09g0257521)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   350 (264)
PWM (Da):   %s   38176.99 (29096.4)  
PI (pH):   %s   8.89 (8.46) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-285
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MVYDYYASGAEDQWTLEENRNAFSRILFRPRILIDVSKIDMTTTILGFKLSMPIMIAPTAMQKMAHPGEYATARAASAAGTITLSSWATSSVEEVASTGPGIRFFQLYVYKDRNVVAQLVRRAERAGFKAIALTVDTPRLGRREAD
IKNRFTLPPFLTLKNFEGLDLGKMDEANDSGLASYVAGQIDRTLSWKDVKWLQTITTMPILVKGVITAEDTRLAIQAGAAGIIVSNHGARQLDYVPATISALEEVVKAAQGRVPVFLDGG
VRRGTDVFKALALGASGIIGRPVVFSLAAEGEAGVRNVLKMLRDEFELTMALSGCTSLREITRDHIVTEWDAPKARPAPRL*

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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTCTATGACTACTATGCTTCTGGTGCCGAGGATCAGTGGACTCTCGAAGAGAACCGAAACGCTTTTTCAAGAATATTTTGTACGCTCTACTTATGCTCACAGGCACGCGTGCACACA
CATATGCTGAAAGTGGTTGTTTTTTAATGGTGAAACAGGTTTAGGCCGCGCATTCTTATTGATGTGAGCAAGATTGACATGACTACCACAATTTTGGGATTCAAATTATCGATGCCGATT
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CCGACCAACAATTAAAATCTAAAGGCCTAAACATCGGTTATAGATTCATTTTTATTCATAACTAAACCTAACTGAACCGTGCTCACCCCTATTTCATCTTTTATTTTTTCTTAATATACA
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GCTTGGACGCCGAGAAGCTGACATCAAAAACAGGTTTACTCTACCACCATTTTTGACACTGAAGAACTTTGAGGGTTTGGACCTTGGCAAGATGGATGAAAAGTAAGTCAATACAACAAA
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CCATAGTTTCGTCTATGGAACCCATTGCATATAGGTCCCTTAGGTCATCTCTATAGGTGTTGTCCTCATGCATTAACTTTTAGAGACGACATATCGTCACAATAGACTTAGAGCACATTC
TAAAATCGGCCCCTTCCCATAGAAAATTTTACTTAGGATCCTAACATGTGGGATTAAAATGACACACATAAATTGTATGCAATTTTTAAAAGGCAAAAAATTACACAATTCCAATGAGGG
AGGAGTTGTGATCGTAGAGTAAGAATCGAATGTAGTCGAGTTTTAAAAGTCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCGAGCCACCCATGGTTCTCGATTGCGC
CTTATGTTAGTAACTTATGTGCATGCAGGATGTGAAGTGGCTACAAACAATTACCACAATGCCGATCCTCGTTAAGGGTGTTATCACTGCTGAGGACACAGTAAGAAGGATCAAAAGCCG
TTGTAATTATGTTTTTCATTAGTTTTTGTATTTTGTTAAACTAATGTTAGAATGCTGCTGATCATTGTACAGCAAGGTTAGCTATTCAAGCTGGAGCAGCGGGTATTATTGTTTCCAACC
ATGGAGCTCGCCAGCTGGATTACGTTCCGGCTACAATCAGCGCTTTGGAAGAGGTTGTGAAAGCGGCACAGGGTCGTGTCCCAGTGTTCCTGGACGGTGGTGTCCGCCGTGGAACCGATG
TTTTCAAGGCACTGGCTCTTGGAGCTTCTGGCATCTTTTTGTAAGTAACTAAACATATCAAGTCTTGTTTTGAGCTCATACAAATCTTTCTTAAGAAAATGCAAATAATTCACCATTATA
TTTTGCAAAAATGAGCAATACTAGATGATTTATCTTATGCTTTAAAGTGATTTATTTTTAATAGTAGAAATCAAATAAATAGTTATAATAAATAGTTATAATCTCATATTTCTTATGATA
TGGTGTAAATTTCAGATCGGGCGACCTGTGGTGTTTTCTTTGGCTGCTGAGGGAGAAGCTGGAGTGAGAAATGTACTCAAAATGTTACGTGATGAATTCGAGCTAACTATGGCACTAAGC
GGTTGCACCTCACTCAGAGAGATCACTCGTGACCACATTGTGACCGAGTGGGACGCCCCAAAGGCTCGTCCTGCACCACGGTTGTAA

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CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTCTATGACTACTATGCTTCTGGTGCCGAGGATCAGTGGACTCTCGAAGAGAACCGAAACGCTTTTTCAAGAATATTGTTTAGGCCGCGCATTCTTATTGATGTGAGCAAGATTGAC
ATGACTACCACAATTTTGGGATTCAAATTATCGATGCCGATTATGATTGCGCCAACAGCCATGCAGAAGATGGCTCACCCTGATGGTGAGTATGCAACAGCAAGAGCTGCATCTGCAGCT
GGAACTATTATGACCTTGTCTTCATGGGCTACATCAAGTGTTGAGGAGGTTGCTTCAACAGGACCTGGAATCCGTTTCTTCCAGCTTTATGTGTACAAGGACAGGAACGTGGTTGCTCAG
CTTGTGCGAAGAGCCGAAAGAGCTGGTTTTAAGGCTATCGCTCTTACAGTTGATACACCTAGGCTTGGACGCCGAGAAGCTGACATCAAAAACAGGTTTACTCTACCACCATTTTTGACA
CTGAAGAACTTTGAGGGTTTGGACCTTGGCAAGATGGATGAAGCTAATGATTCTGGTTTAGCTTCTTATGTTGCTGGTCAGATCGACCGCACCTTGAGCTGGAAGGATGTGAAGTGGCTA
CAAACAATTACCACAATGCCGATCCTCGTTAAGGGTGTTATCACTGCTGAGGACACAAGGTTAGCTATTCAAGCTGGAGCAGCGGGTATTATTGTTTCCAACCATGGAGCTCGCCAGCTG
GATTACGTTCCGGCTACAATCAGCGCTTTGGAAGAGGTTGTGAAAGCGGCACAGGGTCGTGTCCCAGTGTTCCTGGACGGTGGTGTCCGCCGTGGAACCGATGTTTTCAAGGCACTGGCT
CTTGGAGCTTCTGGCATCTTTATCGGGCGACCTGTGGTGTTTTCTTTGGCTGCTGAGGGAGAAGCTGGAGTGAGAAATGTACTCAAAATGTTACGTGATGAATTCGAGCTAACTATGGCA
CTAAGCGGTTGCACCTCACTCAGAGAGATCACTCGTGACCACATTGTGACCGAGTGGGACGCCCCAAAGGCTCGTCCTGCACCACGGTTGTAA

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cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GAATAATCTT TTAAAGTTTG TTTGGTTATC TTCACTTGTT ATCTATCTTG GGCTTTGCCC CTCTCACCAA AAATACCAAG TGTCCAAAAG GGTAGTGAAG AAAAATGGAG GTCACAAATG  TCACTGAGTA TCAGGCTATT GCCAAGGAGA AGTTGCCAAA GATGGTCTAT GACTACTATG CTTCTGGTGC CGAGGATCAG TGGACTCTCG AAGAGAACCG AAACGCTTTT TCAAGAATAT  TGTTTAGGCC GCGCATTCTT ATTGATGTGA GCAAGATTGA CATGACTACC ACAATTTTGG GATTCAAATT ATCGATGCCG ATTATGATTG CGCCAACAGC CATGCAGAAG ATGGCTCACC  CTGATGGTGA GTATGCAACA GCAAGAGCTG CATCTGCAGC TGGAACTATT ATGACCTTGT CTTCATGGGC TACATCAAGT GTTGAGGAGG TTGCTTCAAC AGGACCTGGA ATCCGTTTCT  TCCAGCTTTA TGTGTACAAG GACAGGAACG TGGTTGCTCA GCTTGTGCGA AGAGCCGAAA GAGCTGGTTT TAAGGCTATC GCTCTTACAG TTGATACACC TAGGCTTGGA CGCCGAGAAG  CTGACATCAA AAACAGGTTT ACTCTACCAC CATTTTTGAC ACTGAAGAAC TTTGAGGGTT TGGACCTTGG CAAGATGGAT GAAGCTAATG ATTCTGGTTT AGCTTCTTAT GTTGCTGGTC  AGATCGACCG CACCTTGAGC TGGAAGGATG TGAAGTGGCT ACAAACAATT ACCACAATGC CGATCCTCGT TAAGGGTGTT ATCACTGCTG AGGACACAAG GTTAGCTATT CAAGCTGGAG  CAGCGGGTAT TATTGTTTCC AACCATGGAG CTCGCCAGCT GGATTACGTT CCGGCTACAA TCAGCGCTTT GGAAGAGGTT GTGAAAGCGG CACAGGGTCG TGTCCCAGTG TTCCTGGACG  GTGGTGTCCG CCGTGGAACC GATGTTTTCA AGGCACTGGC TCTTGGAGCT TCTGGCATCT TTATCGGGCG ACCTGTGGTG TTTTCTTTGG CTGCTGAGGG AGAAGCTGGA GTGAGAAATG  TACTCAAAAT GTTACGTGAT GAATTCGAGC TAACTATGGC ACTAAGCGGT TGCACCTCAC TCAGAGAGAT CACTCGTGAC CACATTGTGA CCGAGTGGGA CGCCCCAAAG GCTCGTCCTG  CACCACGGTT GTAAACAAAA ACATGATACG GTCATAAGCA TCTCGACTTT TAATGGCACA TTATAAGGTA TATACCTTGT GTTACGGTTG CAAAACTCAT ATTGTTTCCT TGTATAATGT  TCGTTTCTGA ATGATCGGCT GTATGGATGT ATAATTCTTA AAGGTTCATG GCTTTACTTA TATATATGTG GTTAATTAAT AATTGTATAC ATATGATCCA CATTTAACTT GGATAATAAC 
TTAATATATT AAACATGAAT TCGTAA 

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