Entry information : HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Entry ID 13771
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-12-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Name (synonym) HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDiOx02
start..stop
S start..stop
HaDiOx06 1060 0 1..642 1..642
HaDiOx04 1053 0 1..642 1..642
HaDiOx05 1014 0 1..642 1..628
CclDiOx02 1008 0 9..642 5..638
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 163454027..163454146 120 N° 2 163454671..163454937 267 N° 3 163462850..163462999 150 N° 4 163463455..163463588 134
N° 5 163463859..163464072 214 N° 6 163464148..163464293 146 N° 7 163464661..163464888 228 N° 8 163464956..163465158 203
N° 9 163465791..163466034 244 N° 10 163466401..163466623 223  
join(163454027..163454146,163454671..163454937,163462850..163462999,163463455..1 63463588,163463859..163464072,163464148..163464293,163464661..163464888,16346495 6..163465158,163465791..163466034,163466401..163466623)


exon

Literature and cross-references HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (163454027..163466623)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr12g0385531
Protein sequence: HaDiOx02 (HanXRQChr12g0385531)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   642
PWM (Da):   %s   73278.18  
PI (pH):   %s   8.83
Sequence 880
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MIPFLSSTKSLLLSPVKHFIHHDFHVVVQKMPLIDRLLFMIIHGVDKLGIRWYRLPVFLGLVYLAIRRYLHDEYNLLNVGKTPVGVRFNPVDFPFRTADGKFNDLFNEGAGSEGTFFGRNMPPVDQKEKLLQPDPMVVATKLLTRREFKGTGKQFNMIAASWIQFMIHDWIDHLEETNQIELKAPAEVASQCPLKSFKFYKTKEVDTGFYGINKGHINIRTPWWDGSAIYGSNSTKLKKLRTFKDGKLKIGEDGLLQHDNDGVPLSGDVRNGWIGLSTLQALFMLEHNKICDALKEDHTLSDEDLYRHARLVTSAVIAKIHTIDWTVELLKTDLLHVAMRANWYGLLGKKFKDKFGHVGGAILGGIIGLKKPNNHGVPYSLTEEFVSVYRMHSLLPDQLLIRDVNSTPGPNKSLNVTQKVDMINLIGKKGENELSKIGSRTLMVSMGHQACGALELWNYPAWLRFVVPQNVDGTDRPDQVDLPSLIYRDRERNVARYNEFRRSLFLIPISKWQDLTDDKKAIDTLREVYGDDVEQLDLLVGMAAEKKIKGFAISETAFVIFIIMASRRLEADRFFTSDFTEEVYTKRGLEWVNTTESLKDVLDRHYEKMTDKLMNPASAFTVWDAPREPNNPIPIYFRVP

Retrieve as FASTA  
Remarks Very long intron 2, prediction confirmed with 1 EST from Helianthus petiolaris.
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATTCCATTCTTATCTTCTACAAAATCTCTTCTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATCACGACTTCCATGTTGTCGTTCAAAAGATGCCACTCATTGATAGGCTTCTTTTCATG
GTGCGTATCTCCATGCATGCCGCTTAAATTTTCACTTTTTTTCTTAACTACAATATAATATAGTGGCAGATTTAGAAAATAATTATAAGGGTAACATTCAAAAAAATTTTAGTGTAAAGG
GGCAGCGAAATCAAAAAAACGTCAAAAATATTTTTTTACATTACCACCGGAGCGTCAAAGGACAGCGGGAGCTGTATATCTGCCCTTGACGATTTATAGAGTAAAACCAACCCTTAAAGA
TTTGGAAACCTCCAACTTGGATGTGTATCCAAAGTTTACCTCACTTATTTCTCGGCTAGCAGGGTTATGAGACGGGTTAGTTACCGGAGATCCTGATTCCCTTATAAAGAGTTAAGCTCC
TCGAACTCGTGGGTTAAGCCGGCCGCTCAGCCTTTCTTTAAGGACCTTAGACGGGTCCAACTTAAATTTTCAGTTACTTTGATAATTAAAATGGTGGTATTAATTAATAAATTAATTAAT
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GTATAATTCTATACCTATGTCCACTACAAGACTCGAATACTAAATCAAT
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TGAGAAAAATATTTAATTGCGAAGAAAAAGAAAACATGTTACAAGTAAAACATTAAATATTTTCTCTGTCTCATTTATTATTATCTTTAACTAATTAATTAGTTGTAAAAACTATTATCA
TTCATAAAAAAAAAGTTTTGTCTACACACATCAAAATTTATCTTATACATTTTGAAATTTATCCTACACATATTAAAATTTATCTTACACATGTCAAAAATTATCCTACATTTTATCATA
CACAACTCACAATTTATCTTAAACTCTACCTTTTTGAAATATATATATATATATATATATATATATTGAAAATAAGTTACAATTTAATGTACGTAGTTGGCTATTAAAGAGGTATCCTAC
AAATTAATTATCTATATAAATTTACCAATAAACCCTAACAATAACAATAAATACAAATATTAAATGAAACATTCCTATTAGTTAAAATTTCTTTTTTTTCTTACAAAGAATTTCTTCTTA
TTTGAATCATTCACTATATATATATGGGGTAGAAAGAAACACCCTTGAGTTAAGAAAATTTAAGAAAACCTTATGTAACAAAAACAAATTCTAAAAAAATAGAGAATGTAAGTTACATGG
TTTTCGAACATTCTGAGCCCAAAAAAAACATTGACTAGATATTTTTTAGAAAAAGTTGATTATTTGTATGTTACACTGTTTTTTTAGTATATGTCAGATGTTACACAAAAATTTCAGCTT
AAAAAAAACAACTATATGTTTTTTTGGCTCAAAACATTTGAAAACATGTAACTTACATTCCCTAATTTTATTTGAAAAAAAAAGTTTGTTGCATAAAGTTTTTACAAATTTTTCCTAAGT
TTTATCAATTTAGGTGGGTTTTCTCTCTATAATTCCCCTGTATATGGGAGGGTCAGTTGATAAAAAAAAAAATTATTATGACTAAAAAGAATAAATAGGACAACTGTAAAATATTAAATA
GTTATATCTCTCTTTTTTATTACTCCCTCCGTCCCATTTTAGATGTCATGGGACCCACATTCACACAATTTAAGAAATATTTGAGTATTTTATTTTTTGAGTTGTAAAATGACAATAATG
TCCTTAGAAATGACAATTAAATTGGGACAACAAAAAATGGAAGTTTGTAATGGTAAGGGCAAAACTGGAAATTATATTTACATTTTTGGAAATGACAATTAAATTGGGACAACCAAAAGT
GGAAATTTGGACATTTAAAATGGGACGGAGGGAGTATTATCTTTGTCTAATTAATTAGTTATAAAAAGTATTATCATTGACACTAAATGTTTTTACTACACACATCAATATTTATCTTAT
ACATTTTGAAATTTGTCCAACACATATTGTATTTTATCTTACACACATCCAAATTTATCCTACATTTTATCCTAAACAGCTCGTAATTTATCTTACACTCTAACTTTTTTAAATATATAT
ATATATATATAGGTAGAGGATCCTGTAAAAAAGGCCTAAAGTGTGAGAAGGGTAAGAAAGAATCTCAGCCATTAGATCTTTTGATCTAATGGTTGAGATCAATAGGGACCAAATTGTAAA
ATATTTTCATTAATTTGGACTGATTTGAAATATCTAAGGCAATATAGTCTTTTAAACCCACTAGAAATTAGGTAATGCACATGTAACTCCCCCCCCCCCCCGTCTTTTTTAAACGTCAAT
AACTTTTTATACGTAACTTTTTTTAAAAAAAAATTACACCATAACATCGAGCGTTTTTTTATCTTTAATATGAGTACCATATTGCTATACTTATATAGAGAAAAAAAATATGTTTCGATC
AGATGTTTAATCAATGAATGGTGTTATATACTTGCTGAATGGTTTATATACTTACTGAATGGTGTTATATACTTGCTGAATGGTGTTATATACTTACTGAATGGTGTTACATACTTGTTG
AATGCTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGTTATATACTTACTGAATGGTGTTATATACTTGTTGAATGGTGT
TATATACTCCCTATAATTAAGGTGGCGGATATGGGAAGTTTTTAATTAATTGAATTAATTGAAATGTTTAAATACAAAAGACTTTTAATGTACGACATTACTAAGAGTTTTTTTTAATAT
ATACGTATATCTATATTGTTAATTCTTAAACTAATACATATGTTATAGTATGAAACATAAATGTACGATACTTATTTTTTAACTTTAAACACGTATTTTACACATATGTACACTAGAAAA
AACATATTTAAAACCATCGTCTTCCTTTATTTACATATATATCTATAACAATACTTATGTTTAAATTTTAAACATGTATATTCATATATTTATCATTTAAGATTGGCAATATATCTTTTG
CATTATCAACTATACATATATGTGTATAGAGTGGGGATCCTACGGAAAGTGTGTTTTTCCTAAAAAGTGTAAAAAGTCATAAAATACAATAATTTCAGGCATAAAACACACCTAAAACTC
ACAAATAATAGAATGAATATTACTAAAACACCATATTCAAACTCTAATAGTCCATAAAAACTTCAAACACACCATCGTAGAACTATGAATATAAAACACACAATGCTAAACAACATAAAA
CACAATAATATTTGTCATTCCACAATCAGAGCCTTAACATCTAAAACACAACACAAAACCCACATACATGATGTTTTAGTAGTCTTCATCATATTATTTGTGGGTTTTTGGTGTGTTTTA
TGGTTGACATTATGGTGTTTTATGACTTTTTACACTTTTTAGGAAATTTGGACTTTCTGGCCAACTCCTATCCTATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGGGGC
TGCTAGAATGAAAACCACCTCGAGTTGTAAGAACCGCGAGAACTACACCCCACGGGTGGGCGTTCACCATGATTTTTTTTTACAACTAGATGTGTATATTATAAACACAGCCGTAAAAAA
AAATTTTAACGCCGCGGCCGAGGGGGTAGTTTTTTACACCACAAGTTTGGTGTTTTTAATTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTCACCAAACTTGTGGTGTAAAAAACTACCCCCTCGGTC
GCGTCGTTTAAATTTTTTTTTTACGGCTGTGTTTATAATATACACATCTAGTAGTAAAAAAAAATCATGGTGAACGCCCACCCGTGGGGTGTAGTTCTCGCGGTTCTTACAACTCGAGGT
GGTTTTCATTCTAGCGGCTCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGACAAAGATCCGTTAGGAACCACCCTTTATTGCGAGAACCGCGAGAACCAGTGTGAG
CGCAAACAGTAATACCTAAAAAAATCTAAAAAACACCCAAAATTTTTTTTTTATTTTTTACTATTTTTTATATAAAAATCGCTACTTTTAGTATAAAAAAAAATTTTAAATATTTAAAAA
AAAAAAAATTTGGCTACTAAAAGTAGCGATTTGAACATAAAAAATAGTAAAAAAAATAAAAAAAAATTTAGATTTTTTTTTTGATTTTTTTAGATTTTTTAGGTTTTTTGGGGGTTTAGT
TTTTAGCATTTTAGCTTGGGGGGGTTTAGGTTTTTGGGGGTGGGGGAGGGGGGTTTAGGTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGAGGGTTAGGTTTTTTGAGGGTTTTAGTTTTTAGCATTTAGC
TTGAGGGGGTTAGGTTTTTTTTTGGGGGGGGAGGGGGGTTAGGTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGTTTAGGTTTTTGGGGGGTGGGGGTTAGGTTTTTTTAGGGT
TTTTTTAGGTTTTTTTAGCTATTTTAGGTTGTGTTCACATTGGTTCTCGCGGTTCTCGCAATAAGGTGGTTCTCGCATGAACCTTACCCTATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACTGACAGAAAAAACTCTGATTTTTCAAAAAAGAATTACATTTTTGCTTAGGGAAAATGTGTGTTTA
GAGTGTTTCTCAAATTTCTCAATTAGGCTAGTTACTCTCACACGTTTTTAACCCTATATATATAGGGTAGGGTTCGGCTACAAAGTTCATTTTTCCTACAAAGTGTACAAAGTCATAAAA
CACCACAATTTCAACCATAAAACACACTTAAAACCCACAAAAAACAGAGTGAAGATTACTAAAACACAATAGCCAAACCGTAACAATCTATAAAAACTTCAAATACACCATCATAGAAAT
ATGAATATAAAACACAACATGATAATCAACATAAAACACACTAATGTTAGTCATTCGATAATCAAAGCCTTAGCATCTAAAACACAACATAAACCCACAAATATGACATTTTAGTAATCT
TCACTTTGTTATTTTTAGGTTTTGAGTGTGTTTTATGGTTGACATTATGGTGTTTTATGACTTTTTACACTTTGTAGGAAAAGTAGACTTTGTAGCAAACTCACACCCTATATATATATA
TATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGACAGACAGAGAGAATCATTTCAGAACCATAAATATTTACAGAACTCGCAGAACTCCTAATAAACAATCTTTTT
ATTTATATATTTTTATGTTTAGGATAATTTTATCATTTATTATGTGTATTTTTACGATTACATACATGTTAAGAGTAATTTTATCATTTTTATATTTAATTTTCTAATTACACATATGTA
ATTAGTTTTTTTTACATATATGTAATTAGTTATGACACATATATATAATTTTGGCAATTAAACATATGTAAACTACTTTTAACATGTATGTAATCAAAGAAATACATATAATAGATGATA
AAATAATCCTAAATGCAAAAACTTATATATAAAATGATTGTTTATTAGATAATAGATGATAAAATAATCCTAAATACAAAACCTTATATATAAAATGATTGTTTATTAGGAGTTCTGAAA
GTTCTGTAGTTATTTAGAGTTCTGAAATGAACTCAAAGGGTTGAGTTCATTTCAGAACTCTAAATAACTACAGAACTTTCAGAACTCTTAATAAACAATCATTTTATATATAAGTTTTTG
TATTTAGGATATTTTTATCATCTATTATATGTATTTCTTTGATTACATACATGTTAAAAGTAGTTTACATATGTTTAATTGCCAAAATTATATATATATGTGTCATAACTAATTACCTAT
ATGTAAAAAAACTAGTTTACATATGTGTAATTATAAAATTACATATAAAAATGATAAAATTATTCGTAACATGTGTGTAATCGTAAAAATACACATAATAAATGATAAAATTATCCTAAA
CATAAAAATATATAAATAAAAAGATTGTTTATTAGGAGTTCTGCGAGTTCTGTAAATAATTAAATATTCATGGTTCTGAAATGATTCTGACTATATATATATATATATATATATATATAA
TTTTTTTATCCCTTTTGCTTTCAATGTATTTTCTTAGGCCCCTCTCTAAATATATTCCTCTAATGTTGGAAGCATTTAGGTTTTTGTTAATAAGGAATTTCTTTAATTCTTTTATTTGTG
TGATTTGAACTCGATTTACAAACTTAGGTGTCTCTAAAAGTTTTGTCTTTATCAATGAGCCACCAACTCCATTGATAACTAAGGTTTAGTTATCTTCATAATTGTTTCATAAATACAGAG
ATCTCGTTGTAATAAGCTTTATAATCATACATCTTCCATCACGCCAATCGATAACATTAACACTCGAACATATACTCTCTATACAATTGCAAGCTAAGCTAGTTTTATATATGTATATTG
TTTTGTAATAACATGGGGGTATGATTATATATTTACATATACAAATGACAACAGGGTGGTTGGATCGGAACTTTTTGAACCAAGTGATCTGAATAATAGATAATCCTTCAAAGTATAATT
AAATAATTATAGTTTTTTTTCTTAAAGTTATATAATAATCTTTTTTTTTTAAATATAAAGTACATTCACGATTTTCCTTAATCATTGAGGAAAAAGCACATTACTTTTTGGGTATGTGCA
AAATACAACAAATTCCTTTGACCATATCTTAAACTAAAACTATAGTAAGACATGTTAATGATGGCTTTAAAACACTCATATACAACTATTGGTTATTCTGGACCATACAATTCTCTTCCT
TTGTCGAAATGAAAAACAATATAAGATACTTGTGTCATTGAGTAAGTCGGCATTTGTCTATTTTTGAGATTAATAAAATATAAACACCGGAATCGTTTTTAATCAACTTAGAAAATCATT
ATATTTAGCTCAACTTAGATTTCATAGAATATATTTAATTATTTATTACGAGCAGTGAACAACGTATAAAAACAACGAATTAATTAATCCGGCTTCTGCAATTTGAATATAATTTAATAG
AGACAGGATTGATGCTAAGATAAATAAATATTAAAACATTGTCACTTTTTACACCTTGTATAATTAATGGAGCTGTTGAACTAACCAGCAATTATATAATGCTTCTTAAAAAATATCTTT
TGTTCAGATTTTTAAGTAGATACTGAACATGAATCAAAATATAAATTATTGTGACTCATATATATCTTATTCTATTTGGTTAATTATCCAGTGGTATAGAGTAGAAAGTGTTTTTAACCT
ACGAAGTGTAAGGGCTCATCAAATCTGGCGCATGTCTTGAGACGAGAGGTATATGCATGAATATATATTTGCACAATAATTACACACAAGTTATCCAACGTATTGTCGTTCAAAAAAAAG
TTATCCAACGTATATAAATAACTAAGCACAATATTACGCAACTTATATAAATTATAACTACGCACAATATTACGCAACATAAATTTCTTTCAAATCTTATAATTTTATATTTAATTTTAA
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ACATAATGATACTTAACTAATTACAAATACAAATTTTATATAAAATAGACTTTCTAATAATAATAATAATTCTAAAACTTTAACCTTCCATAGGCATACATATTCAAAGTTGGTCAAATA
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GTTTACTTTACTTGCATGCGTTCAAGA
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CATACAAGCGGACTTTAACCGTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAATTATCATGCTAGCTAAAGTCCAAACAAGCATAACAAAGCTAAAAGCAGACTTTACAAAGTCCGCTTATATCATGAGCG
GATTTTGTCAGATTTAGTTAAAATCCGTTAGAAACAAGGATACTCCCTTGAACCACCTACAACGCTCTTTGAAACCCTAAACCACCTAAACGACCAAAAATTAAAATTCATGCATTCGAT
CGTATTTATCTATCCTTAATCTACTAAAATACATGAAGTGTTAACATATGAATATGGATTTTTTTCAGATTGAGCTGAAGGCACCTGCAGAAGTAGCTAGTCAGTGCCCTCTTAAATCCT
TTAAATTTTACAAGACTAAAGAAGTCGATACAGGATTTTATGGTATCAATAAAGGTCATATTAACATCAGAACTCCTTGGTG
GTATGAAAACTTAATTATATCTCCTTTTCAACAAGTTT
CATATATTACTACAAAAGCCAATAACATGTTAGGACATCATGATTTTATTTTAATATTTTTCAATAAATTATTGATTGCTAAGTACAATAAAAAATAGTGCACAGAAACAATAAAGATAC
AAAGTTATAAACATTTGAGTTCAAAGAAATAATATGGAAAAGCCGAAAATAGGAACTTGATTATACGGTTAATTAAGAAGCCAATATGACATTAAGAGGATGGATATTTCAGGGATGGGA
GCGCGATATATGGAAGCAACTCGACTAAGTTGAAGAAACTGAGAACATTCAAAGATGGGAAACTAAAGATCGGAGAAGACGGCCTCCTCCAACATGACAATGATGGAGTTCCATTATCAG
GCGATGTTCGTAATGGTTGGATTGGTCTATCAACCTTACAAGCTCTCTTTATGCTAGAGCACAATAAAATTTGTGATGCGTTGAAG
GTTATACCTATTCAAACAATTTATTTCAAACTCA
TTAGTCATTCTCCTTTGAAAATTAACTAATCATTTTATCAGAAAGAGGATCATACTTTGAGCGATGAAGATCTATATCGTCATGCAAGACTAGTAACTTCGGCTGTCATTGCCAAGATTC
ACACCATCGATTGGACCGTTGAGCTTCTCAAAACAGACTTGCTTCATGTAGCAATGAGAGCTAACTG
GTAAATTAGTTGAAACTACATTTTTTTATATTTTCAGGTTTTTTTTAAATATA
AGCGTTTCAAGGAGATTTTTGTACTTGTCTTGGTTTCTAGCGAGTCTGCTAGTCAATGGAGCAGACACAATTGGAGTTCGCTAGTCATAGGAGTAGACTCATTTCGTTTAGTTTTGTCAT
GTCAGCGTATTCAAGTAATACGCTTGTCACGTTAACCAGAACACTTCCAAAATTGTGAAACTAGAACACTTCCAAAACCTTCTAGAAGCACTTATCATTTTGCTAAAACACCCAGAAATA
AAAACAAAATGAAACTAATTATATAGGGTAATATCTAATTGTGTGTTTAATTTCTTGAAAATGGTATGATTCAGGTATGGGCTATTGGGTAAAAAATTCAAGGACAAATTTGGGCATGTT
GGAGGAGCCATTTTAGGAGGTATTATAGGGTTAAAGAAACCCAATAATCATGGGGTACCCTACTCACTAACCGAAGAGTTTGTGAGTGTTTACAGAATGCACTCTCTCTTACCTGATCAA
CTTCTTATTAGGGATGTCAATTCAACACCAGGCCCTAACAAGTCTCTAAATGTGACCCAAAA
GTAAGACCTTTCACCCTCTTATTTTATAAAACAATATTCAAGCATTGTGTTCATGATA
GATTTACAGGGTTGATATGATAAATTTGATTGGGAAGAAAGGTGAGAACGAATTATCGAAAATTGGATCAAGAACACTAATGGTATCAATGGGACATCAAGCATGTGGGGCACTTGAACT
ATGGAACTATCCGGCGTGGCTTAGGTTTGTGGTGCCACAAAATGTTGATGGCACTGATCGTCCTGATCAGGTGGACTTACCCTCACTTGAGA
GTAAGTATAGCTATTTCTCTCACTAAAC
TTGATCATATAAATGAGTCTTATGGCTCTATATATGTCTTATTCCATTTGATCAACTCTAATATAATTTGTTTATCATTTGAATGAAAGCTATAAAAGATGACAATATATATTACACAAT
TCTAACTAGTAAATTGGGCAATTGCGACCGAAACTTGCAACAAAAAGGGCGACAAATTAGTGATTGATTTGCGACAGAAATTATAACAGTCGCAAAACTTAGCAATTGCAAATTTTGCGA
CCAAGACTGCAGTTGCTAAATTCAATCGAAGATTACCCTGGGCTGCAAAATTTAACGGTCGCAATTCATGGAAAATTTGGAGATCAAATCGTCATAAATTTCGCGGCCAAGAATGTGGTC
GATTTACCCATATGGATGTTTTTGCGACCACGATACCGATTACAAATTGGTAGTAAATTTGGCCATCTAAAATGGGTGGCGAATTTTGTGATCACTAATTTTGGTAGAAAAGTTTGTCGC
AACGATTTCGGTCGCAAATCCTTAGCCAATAGCTATTTGCGACCAAAATTGCGGTGACAAATACCCAGTTTCTTTGTAGTGAAAACACTAAACCAAGATTTTATTTGTATGCATGATGGT
GCAGTTTACAGGGATAGGGAAAGGAATGTAGCAAGGTATAATGAGTTTCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATCTCAAAGTGGCAAGATCTAACAGACGATAAAAAAGCAATTGACACA
TTGCGTGAAGTGTATGGTGACGATGTGGAACAACTCGATCTTTTGGTGGGAATGGCAGCTGAGAAAAAGATCAAAGGTTTCGCCATTAGCGAGACGGCTTTTGTAATCTTTATCATCATG
GCATCAAG
GTACAACTCCAACAATAGCAAAACTGAAATATATAATTACAAACATAAACAAACTAAACCTATGCCACCCCAAAACTCAAACGAACGATAGACGAGAAATTTTAACGGTCGT
TTAAAGGTAGGTGGCCATGACGCAAGCTCTAACCTTCAATCAGTTATTCGACGAATCCTCAAACAGCCATTTTAAAGTATGGAGCTATGACACAAGCCTTAACCTTAGCATGACCCCTAA
TTAATATAACAAGCCCTAATCTTCAAATGGTCATTCAGTGCAACCTCCAACAACATTTGTTTGAAAACGGTTTAAGATTAGATTGTTTGGGACTGTGTATAGCATGCCTCCTAATTAATA
TATTGATTTCTTAGGAGACTCGAAGCAGATAGATTTTTCACAAGTGACTTCACCGAAGAAGTGTACACAAAAAGGGGGTTGGAATGGGTGAACACAACCGAGAGTTTAAAGGATGTCTTG
GATCGACATTACGAGAAGATGACTGATAAATTGATGAACCCAGCCAGCGCTTTTACGGTGTGGGATGCTCCACGAGAGCCTAATAACCCGATACCAATATATTTCCGTGTGCCTTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATTCCATTCTTATCTTCTACAAAATCTCTTCTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATCACGACTTCCATGTTGTCGTTCAAAAGATGCCACTCATTGATAGGCTTCTTTTCATG
ATTATACACGGTGTTGATAAGTTAGGGATCCGGTGGTACCGTCTGCCAGTGTTCTTGGGGCTGGTATACCTAGCCATACGGAGGTATCTTCATGACGAGTACAATTTGCTCAATGTTGGG
AAAACTCCGGTCGGTGTTCGGTTTAATCCGGTCGACTTTCCGTTCCGGACAGCTGACGGGAAGTTCAATGATCTTTTCAATGAAGGAGCCGGCAGCGAAGGGACTTTCTTTGGCCGAAAT
ATGCCACCGGTTGATCAAAAAGAAAAG
TTACTACAACCAGATCCTATGGTGGTGGCAACAAAGCTCTTGACACGCAGAGAATTTAAAGGTACTGGAAAGCAGTTCAACATGATTGCTGCT
TCATGGATTCAATTCATGATTCATGATTGGATCGATCATCTAGAAGAAACCAACCAG
ATTGAGCTGAAGGCACCTGCAGAAGTAGCTAGTCAGTGCCCTCTTAAATCCTTTAAATTTTAC
AAGACTAAAGAAGTCGATACAGGATTTTATGGTATCAATAAAGGTCATATTAACATCAGAACTCCTTGGTG
GGATGGGAGCGCGATATATGGAAGCAACTCGACTAAGTTGAAGAAACTG
AGAACATTCAAAGATGGGAAACTAAAGATCGGAGAAGACGGCCTCCTCCAACATGACAATGATGGAGTTCCATTATCAGGCGATGTTCGTAATGGTTGGATTGGTCTATCAACCTTACAA
GCTCTCTTTATGCTAGAGCACAATAAAATTTGTGATGCGTTGAAG
AAAGAGGATCATACTTTGAGCGATGAAGATCTATATCGTCATGCAAGACTAGTAACTTCGGCTGTCATTGCCAAG
ATTCACACCATCGATTGGACCGTTGAGCTTCTCAAAACAGACTTGCTTCATGTAGCAATGAGAGCTAACTG
GTATGGGCTATTGGGTAAAAAATTCAAGGACAAATTTGGGCATGTTGGA
GGAGCCATTTTAGGAGGTATTATAGGGTTAAAGAAACCCAATAATCATGGGGTACCCTACTCACTAACCGAAGAGTTTGTGAGTGTTTACAGAATGCACTCTCTCTTACCTGATCAACTT
CTTATTAGGGATGTCAATTCAACACCAGGCCCTAACAAGTCTCTAAATGTGACCCAAAA
GGTTGATATGATAAATTTGATTGGGAAGAAAGGTGAGAACGAATTATCGAAAATTGGATCA
AGAACACTAATGGTATCAATGGGACATCAAGCATGTGGGGCACTTGAACTATGGAACTATCCGGCGTGGCTTAGGTTTGTGGTGCCACAAAATGTTGATGGCACTGATCGTCCTGATCAG
GTGGACTTACCCTCACTTGAGA
TTTACAGGGATAGGGAAAGGAATGTAGCAAGGTATAATGAGTTTCGTAGATCACTTTTCTTGATCCCAATCTCAAAGTGGCAAGATCTAACAGACGAT
AAAAAAGCAATTGACACATTGCGTGAAGTGTATGGTGACGATGTGGAACAACTCGATCTTTTGGTGGGAATGGCAGCTGAGAAAAAGATCAAAGGTTTCGCCATTAGCGAGACGGCTTTT
GTAATCTTTATCATCATGGCATCAAG
GAGACTCGAAGCAGATAGATTTTTCACAAGTGACTTCACCGAAGAAGTGTACACAAAAAGGGGGTTGGAATGGGTGAACACAACCGAGAGTTTA
AAGGATGTCTTGGATCGACATTACGAGAAGATGACTGATAAATTGATGAACCCAGCCAGCGCTTTTACGGTGTGGGATGCTCCACGAGAGCCTAATAACCCGATACCAATATATTTCCGT
GTGCCTTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA
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