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Entry information : HaDiOx03 (HanXRQChr12g0385541)
Entry ID 13772
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDiOx03 (HanXRQChr12g0385541)
Name (synonym) HaDiOx03 (HanXRQChr12g0385541)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDiOx03
start..stop		 S start..stop
HaDiOx06 1003 0 1..640 1..642
HaDiOx04 1003 0 1..640 1..642
HaDiOx05 950 0 1..640 1..628
CclDiOx02 937 0 9..641 5..639
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13772' 'join(163499749..163499868,163500141..163500407,163501083..163501232,163501363..163501496,163502349..163502556,163502641..163502786,163504615..163504842,163504987..163505189,163505659..163506128)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 163499749..163499868 118 N° 2 163500141..163500407 265 N° 3 163501083..163501232 148 N° 4 163501363..163501496 132
N° 5 163502349..163502556 206 N° 6 163502641..163502786 144 N° 7 163504615..163504842 226 N° 8 163504987..163505189 201
N° 9 163505659..163506128 468  
join(163499749..163499868,163500141..163500407,163501083..163501232,163501363..1 63501496,163502349..163502556,163502641..163502786,163504615..163504842,16350498 7..163505189,163505659..163506128)


exon

Literature and cross-references HaDiOx03 (HanXRQChr12g0385541)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (163499749..163506128)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr12g0385541
Protein sequence: HaDiOx03 (HanXRQChr12g0385541)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   641 (619)
PWM (Da):   %s   73628.98 (71060.6)  
PI (pH):   %s   9.13 (8.99) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-641
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
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Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATTCCAT TTCTGTCTTG TGCGAAATCT CTTCTTTTTT GGGTCATCAA ACACTTCGTA CATGCTGATT TCCGTGAACA TTTTCAAAGG ATGAAACCCC TGGACAGGCT TCTCTTCTTG  ATTATTCATG GTCTTGATAG GTCCGGGATG GAGTGGCACC GTTTCCCCGT GTTCTTAGGG TTGGCATACC TTCTTGCACG ACGACATCTA CATTACCACT ATACTTTGCT TAACGTTGGA  AAAAATCAGG CGGGTGAAAG GTTTAATCCT GCTGAGTTTC CCTATAGGAC AGCCAACGGA AAGTTTAATG ATCCTTCCAA CGAAGATGCT GGCAGTATAG AAAGTTTTTT CGGACGAAAC  ATAGCGCCAC TTGATTGCAG AAAAGGGCTA TTGAAGCCAA ACCCTATGAA GGTGGCAACA AAGCTTCTGG CACGCAAACA ATTCATAGAC ACCGGAAAAC AGTTAAACCT AATTGCTGTT  TCATGGATAC AATTCATGAC TCATGACTGG ATGGATCATC TTGAGTCAAC ACAACAGATT GAGCTGAAGG CGTCCGAAAA AGTGGCGAAT CAGTGCCCTC TAAGATCTTT CAAGTTTTAC  AAGACTGAAA GAGTCAATAC TTGCTTAGAT AATATCAAGG AAGGCCATCT TAATATTAGA ACATCGTGGT GGGACGGAAG CGCGATATAC GGAAGTAACT CTTCGCAATT GCATGAAGTG  CGGACGTACA AAGAAGGTAA ACTTAAGATC GCAGGCCTCA TTCAGCATGA CCAAGAAGGG TTAGAAAAAG CAGGTAACAT TCGTAACGCT TGGATTGGTG TATCAAGCTT GATAGCCCTA  TTCATCCTTG AACACAATGC CATTTGTGAC GCCTTAAAGA AAGAATATCC TAATCTGGAT GACGAAAATC TATACCGTCA TGCAAGACTA GTCACTTCCG CAGTCATGGC TAAGATTCAC  ACTATCGACT GGACTGTCCA ACTTCTTAAA ACTGACACCC TTCTTGCTGG AATGAGAGGT AATTGGTATG GGATATTAGG CAAAAGATTC AAAGACACAT ATGGGCATGT TGGAGGCCCC  TTTTTGGGAG GTCTTGTGGG GTTAAAAAAA CCGAATAATC ATGGAGTACC CTACTCATTA ACCGAAGAAT TTGTGAGTGT TTATAGACTG CACTCTCTAT TACCCGATCA TCTTCTCATC  AGAGATATTG ATTCATCACC AGGTCCTAAT AAGTCTCCAA AATTGAGCCA CAAGATTGAT ATGGTAAATT TGATTGGGAA TAAAGGGGAG AAGGAATTTT CCAAAATTGG ATTTACGACA  CGAATGGTAT CAATGGGACA TCAAGCATGC GGGGCACTTG AGCTATGGAA TTATCCGGTG TGGCTCAGGG ACGTTGTGCC TCAAAACGTC GATGCCACAG ATCGAGCCGA TCATGTCGAT  TTAGCTTCAC TCGAGATCTA CAGGGATAGA GAAAGGAGTG TGCCAAGATA CAATGCGTTC CGTAGATCAC TTTTCTTGAT CCCAATATCC AAGTGGGACA ATCTAACGAA CAATAAAGAA  GTCATCGACA CATTGCGCGA AGTGTATGGC GATGATGTTG AGCAACTCGA TTTGTTGGTA GGAATGTTGG CCGAGAAAAA GATCAAAGGG TTTGCAATTT GCGAGACTGC ATTTGTAATT  TTCCTCATCA TGGCGTCAAG GAGACTTGAA GCAGATAGAT TTTTTACTAG TGATTTTAAT GAAAAAGTGT ATACGAGAAA AGGGTTTGAA TGGGTAAACA CATGCGAGAG TTTAAAAGAC  GTGTTGGACC GACACTACCC GGGGATGACC AATCGGTGGA TGAACTCCAC AAGTGTTTTT ACAGTGTGGG ATGCTCCACC AGATCCTCAT AATCGTATAC CAATTTATCT TCGGCTCCCT  CATTGAATTA TTTTGTTTTA TGTATATTTT TTAGAATGGC AACTTATGCA CCATCTATCT ACTCCTAATT TTACTTCACA ATATACATTA TGGGACTCGA ATTGCTTTAG GTACTTTCTT 
TTTTTAGTAC GTTGTTGATC TAGACTAGCT AGGAAGGTGT TCTATTAAAA AGGGGTGGCA ACATGATCAA CCGAGAACAC ATCCCCAATT TGTATGTAAC GGTTACTTTT ACT 

Retrieve as FASTA