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Entry information : HaDiOx06 (HanXRQChr14g0450071)
Entry ID 13775
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDiOx06 (HanXRQChr14g0450071)
Name (synonym) HaDiOx06 (HanXRQChr14g0450071)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDiOx06
start..stop		 S start..stop
HaDiOx04 1285 0 1..643 1..643
HaDiOx05 1256 0 1..643 1..629
HaDiOx07 1128 0 1..643 1..626
HaDiOx02 1025 0 1..642 1..642
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 140594993..140595112 118 N° 2 140595201..140595467 265 N° 3 140597122..140597271 148 N° 4 140597369..140597502 132
N° 5 140597653..140597866 212 N° 6 140597952..140598097 144 N° 7 140598204..140598431 226 N° 8 140598547..140598749 201
N° 9 140598832..140599075 242 N° 10 140599179..140599404 224  
join(140594993..140595112,140595201..140595467,140597122..140597271,140597369..1 40597502,140597653..140597866,140597952..140598097,140598204..140598431,14059854 7..140598749,140598832..140599075,140599179..140599404)


exon

Literature and cross-references HaDiOx06 (HanXRQChr14g0450071)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr14 (140594993..140599404)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr14g0450071
Protein sequence: HaDiOx06 (HanXRQChr14g0450071)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   643
PWM (Da):   %s   73342.6  
PI (pH):   %s   6.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKTFMSFAKQQLLSPVKHFIHADFHELFERMTLIDKFLFLIIHGVDKSGIGWHRFPVFLGLTYLAIRRSLHDKYNLLNVGKTRVGVRFDTDDVDFRTANGKFNDPFNESAGSEGTFIGRN
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VLDRHYPEMSDRWMNSTSAFSVWDATPEPHNPVPIYFRLPK

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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG
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TTCTAGCCATGGCCTCAAGAGGTATATATACAAATCACTACGATAAAGAGAATGAAAACTGTAAATTAACAAACTAATGGATCAATTATATATACCAACTAAATATATTGGGTCATGTGT
GCAGGCGACTCCAAGCGGATAGATTCTTCACTAGCGATTTCAACGAAAATGTGTACACGAAAAAAGGGTTCGAATGGGTAAACACAACAGAGAGTCTGAAAGATGTGTTGGACCGACACT
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CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAACATTCATGTCTTTTGCAAAACAACAACTTCTTTCACCCGTCAAACACTTCATCCATGCCGACTTTCATGAACTCTTTGAAAGGATGACACTCATCGACAAGTTTCTCTTCTTG
ATCATTCATGGTGTCGATAAATCCGGGATAGGATGGCACCGTTTTCCTGTGTTCTTAGGTCTTACTTACTTGGCCATTCGCCGGAGTCTTCATGATAAGTATAATCTGCTCAATGTTGGG
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TCATGGATTCAGTTCATGATTCATGATTGGATTGATCACCTTGAAGAAACAAATCAGATTGAGCTTAGGGCGCCAGCAGAAGTAGCAAGTGAATGCCCTCTCAAATCCTTCAAGTTCTTC
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GTGCACACCATTGATTGGACCATTGAGCTTCTCAAAACTGACATGCTTGTTGCTGGAATGAGAGCTAACTGGTATGGGCTATTGGGGAAAAGATTCAAGGACACATTTGGGCATGTTGGA
GGATCTATTTTGGGAGGACTAGTAGGGCTAAAGAAACCCGAAAACCACGGGGTACCCTACTCGCTAACAGAAGAGTTTACAAGTGTTTATCGAATGCATTCTCTCTTACCTGATCAACTT
GTCATAAGGGATGTTAATTCCACACCAGGACCTAACAAGTCTCCAAAGATTACCAAGGAGATTGACATGATCAATTTGATTGGAAAGAATGGAGAAAAGGAATTATCAAAAATTGGATTT
ACCACACAAATGGTATCCATGGGACATCAAGCGTGTGGGGCGCTTGAGCTATTCAACTATCCAGTCTGGCTTAGGGACATTGTGCCTCAAAACGTGGACGGGACAGATCGCCCTGACCAC
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AAAGAAGCTATTGCCACATTGCGTGAAGTGTACGGTGATGATGTCGAAGAGCTTGATTTGTTAGTAGGATTGATGGCTGAGAAAAAGATCAATGGGTTCGCCATTAGCGAAACCTCTTTT
ATAATCTTTCTAGCCATGGCCTCAAGGCGACTCCAAGCGGATAGATTCTTCACTAGCGATTTCAACGAAAATGTGTACACGAAAAAAGGGTTCGAATGGGTAAACACAACAGAGAGTCTG
AAAGATGTGTTGGACCGACACTATCCAGAGATGAGCGATAGATGGATGAACTCAACGAGTGCTTTTTCGGTGTGGGATGCTACCCCAGAACCTCATAATCCCGTACCAATTTATTTTCGT
CTCCCCAAGTGA

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cDNA►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GTTATATATA GGCCATCTTG GCATTGTAAA CCTCACAAAA ACATCTCACT TTGCCCATCA AACACTTCAT CAATACCCAA AATGAAAACA TTCATGTCTT TTGCAAAACA ACAACTTCTT  TCACCCGTCA AACACTTCAT CCATGCCGAC TTTCATGAAC TCTTTGAAAG GATGACACTC ATCGACAAGT TTCTCTTCTT GATCATTCAT GGTGTCGATA AATCCGGGAT AGGATGGCAC  CGTTTTCCTG TGTTCTTAGG TCTTACTTAC TTGGCCATTC GCCGGAGTCT TCATGATAAG TATAATCTGC TCAATGTTGG GAAAACTCGG GTAGGGGTTC GGTTTGATAC CGATGACGTT  GATTTCAGGA CCGCCAATGG AAAGTTTAAC GATCCTTTCA ATGAAAGTGC CGGCAGTGAA GGAACTTTCA TTGGCCGTAA CATGCCCCCC GTTGATCAGA AAGAGAAGCT GTTGAAGCCG  GATCCGATGT TGGTAGCAAC AAAGCTTCTA GCACGTAAAC AACTTATAGA CACCGGAAAG CAGTTCAACA TGATTGCTGC TTCATGGATT CAGTTCATGA TTCATGATTG GATTGATCAC  CTTGAAGAAA CAAATCAGAT TGAGCTTAGG GCGCCAGCAG AAGTAGCAAG TGAATGCCCT CTCAAATCCT TCAAGTTCTT CGAGACTAAA GAAATCGATA CTGGTCTTTC TGACATTAAG  AAAGGTCATC GTAACATCAG AACTCCTTGG TGGGATGGGA GTGTGGTATA TGGAAGCAAC TCAAAGGCTG GACGTCACGT AAGAACGTTC ATTGACGGAA AGCTCAAGAT TGCAGATGAT  GGTCTCCTTC AACATGACAA CGATGGATTG CCTATAGCGG GAGACGTTCG TAATAGTTGG ATTGGGGTGT CAACTTTGCA AGCCCTCTTT ATCCACGAGC ACAATGCGGT TTGTGACGCC  TTAAAGAAAG AATATCCTTA TTTGGACGAT GAAGATCTGT ATCGCCACGC AAGACTAGTA ACTTCTGCGG TGATCGCAAA GGTGCACACC ATTGATTGGA CCATTGAGCT TCTCAAAACT  GACATGCTTG TTGCTGGAAT GAGAGCTAAC TGGTATGGGC TATTGGGGAA AAGATTCAAG GACACATTTG GGCATGTTGG AGGATCTATT TTGGGAGGAC TAGTAGGGCT AAAGAAACCC  GAAAACCACG GGGTACCCTA CTCGCTAACA GAAGAGTTTA CAAGTGTTTA TCGAATGCAT TCTCTCTTAC CTGATCAACT TGTCATAAGG GATGTTAATT CCACACCAGG ACCTAACAAG  TCTCCAAAGA TTACCAAGGA GATTGACATG ATCAATTTGA TTGGAAAGAA TGGAGAAAAG GAATTATCAA AAATTGGATT TACCACACAA ATGGTATCCA TGGGACATCA AGCGTGTGGG  GCGCTTGAGC TATTCAACTA TCCAGTCTGG CTTAGGGACA TTGTGCCTCA AAACGTGGAC GGGACAGATC GCCCTGACCA CATTGACTTA GCATCACTCG ACATTTATAG GGATAGGGAG  AGGAAAGTAG CAAGATACAA TGAGTTCCGT AGATCACTTT TCTTGATCCC AATTTCCAAA TGGGAAGATC TAACGGAGGA CAAAGAAGCT ATTGCCACAT TGCGTGAAGT GTACGGTGAT  GATGTCGAAG AGCTTGATTT GTTAGTAGGA TTGATGGCTG AGAAAAAGAT CAATGGGTTC GCCATTAGCG AAACCTCTTT TATAATCTTT CTAGCCATGG CCTCAAGGCG ACTCCAAGCG  GATAGATTCT TCACTAGCGA TTTCAACGAA AATGTGTACA CGAAAAAAGG GTTCGAATGG GTAAACACAA CAGAGAGTCT GAAAGATGTG TTGGACCGAC ACTATCCAGA GATGAGCGAT  AGATGGATGA ACTCAACGAG TGCTTTTTCG GTGTGGGATG CTACCCCAGA ACCTCATAAT CCCGTACCAA TTTATTTTCG TCTCCCCAAG TGATAATGCT TTGATGGAAA AAAATATGTT  ACATGTTTGG TATATATGTA TAGGTATTGC ATCTGTTGGG GGTGCCTTAT TTAATCTATT TGCTTAGTAT GCGTTATTTA ATTTTCTTAT AGAATAAATG AATAATATAT TATATGTATC 
TTGATTAAAT AAAAGG 

Retrieve as FASTA