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Entry information : HaRboh02 (HanXRQChr04g0125801)
Entry ID 13778
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh02 (HanXRQChr04g0125801)
Name (synonym) HaRboh02 (HanXRQChr04g0125801)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh02
start..stop		 S start..stop
HaRboh07 1620 0 2..922 1..914
VvRboh07 1391 0 2..922 1..917
DtriRboh04 1365 0 10..922 5..950
DgloRboh05 1357 0 13..922 11..927
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 172845519..172846104 584 N° 2 172846190..172846349 158 N° 3 172847483..172847531 47 N° 4 172847656..172847769 112
N° 5 172847840..172848262 421 N° 6 172848369..172848752 382 N° 7 172848856..172848951 94 N° 8 172849043..172849158 114
N° 9 172849246..172849416 169 N° 10 172849493..172849844 350 N° 11 172849925..172850053 127 N° 12 172850140..172850218 77
N° 13 172850299..172850408 108  
join(172845519..172846104,172846190..172846349,172847483..172847531,172847656..1 72847769,172847840..172848262,172848369..172848752,172848856..172848951,17284904 3..172849158,172849246..172849416,172849493..172849844,172849925..172850053,1728 50140..172850218,172850299..172850408)


exon

Literature and cross-references HaRboh02 (HanXRQChr04g0125801)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (172845519..172850408)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr04g0125801
Protein sequence: HaRboh02 (HanXRQChr04g0125801)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   922
PWM (Da):   %s   103954.15 Transmb domain:   %s   o359-378i494-516o543-565i722-739o
PI (pH):   %s   9.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MMQSESPVSSRGGSDGRSTFSRMLDHPADHSNDSYGVGGAMLPIFLNDLRRNNNDQDLVEVTLELEDDSVILCSVTPTANHSNHHHHQHVPSQSSPAGAASRLRRKFSWLTSSSSRASSS
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VQALTHAKHGVDILSGTRVRTHFARPNWREVFGKVASKHPNTTIGVFYCGMPVLAKELRKLSYEMSQKTSTRFEFHKEYF

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Remarks
DNA ►
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ATGATGCAATCTGAGTCTCCCGTCAGTAGCCGCGGTGGCTCTGACGGAAGATCCACTTTCAGCCGGATGCTAGACCATCCGGCTGATCATTCCAATGACAGTTACGGAGTTGGAGGAGCA
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TGTTGGCATCGGTTTGCACGCTGGAAATCATATGATTTGCGATTTTCCTCGGTTGGTAAACTCTTCACCAGAAAAGTTTGCTCTTATAGCATCAGATTTCCATAACAAGAAGCCGACATA
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GTAGGAGTGTTCTATTGTGGGATGCCAGTGTTGGCTAAGGAGCTAAGGAAACTATCATATGAGATGAGCCAGAAGACATCGACACGATTTGAGTTCCACAAGGAGTACTTCTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
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ATGCTCCCTATATTCCTCAACGATCTACGTCGAAACAACAATGATCAAGATTTAGTAGAAGTCACGTTAGAACTCGAAGATGATTCGGTCATTTTATGCAGTGTGACCCCGACCGCTAAC
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GATGCAAGTGTGGACCGGGTGATCACGTCTAGAGATGCTAGAAAATTGAAAGCTAAACTGATTCGCACGAAATCTAGCGCGCAAAGAGCGCTAGGTGGTCTTCGGTTTATAAGTAAAACT
ACAAACACCGATGTTAACGAGTTGTGGAAAAACGTTGAGGCACGGTTTGCGTGTCTGGCTAAAGATGATGGATTATTAGCTCGAGAAGATTTCGCTGAATGCATAGGAATGGCGGATTCG
AAGGAGTTTGCGTTGGGCGTATTCGATGCGTTGGCGCGAAGAAGACAGCAGAAATTGGGGAAGATCACGAAAGCGGAGCTTCACGATTTTTGGTTACAGATTTCCGACCAGAGTTTTGAC
GCTCGTCTGCAGATATTCTTCGACATGGCCGACAGCAACGAAGATGGAAGAATCACAAGGGATGAGATACAAGAGCTGCTAGTGCTTAGTGCTGCAGCAAACAGATTGTCAAAGTTGAAA
GAACAAGCAGAGGAATACGCTTCTTTGATTATGGAAGAATTAGACCCCGAAAATCTTGGCTATATTGAGTTATGGCAGTTGGAAACGCTTCTACTACAAAGGGAAGCTTACATGAACTAC
AGTAGACCTCTGAGCATAGCAAGCGGCGGGTGGAGTCAAAATTTGAATTCACTGAAACCTAAAAGCGTTGTTCATAGGCTAACTCATTTTGTAAAGTCGGGTTTGGTGGAAAACTGGCAA
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GGGGCTGCTGAAACCCTCAAACTCAATATGGCTCTTATTCTTTTACCCGTTTGTAGAAACATGTTAACGTTCCTAAGGTCTACCCGAGCGCGATTGTTCATCCCTTTTGATGACAATATC
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GCATCAGATTTCCATAACAAGAAGCCGACATACAAGGAACTAATTGTCGGTGTGGAAGGCATGACTGGAATTTCAATGCTGATATTAATGGCCTTTGCGTTCACCTTAGCTTCGCGATAT
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TCTTCATGTACGATTGGTCGAGCCAAATTTAGGAAGCTAGGGGAAGTGGATTCAAAAGGTTTACCAAAGCTACTGTTGGACGGACCTTACGGTGCACCAGCGCAAGATTACAGGAACTAT
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TACTTCTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
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TGTATAGTTT ATAATGGCAA GGTGGAAGTT GGAAAAGATA GGGGGTTAAA GAAACAAGAC TCAACTACTC TCAACACATA AGCGTTGAAT TCGTGTGCTC CCATCGTTTG CTTGTTTCAC  AAATCCCTTT TCACTATGTG GTTTTCTTTC CATACATGTT GATGCAAATT CACGTTTATA TGTTTAACAC AATTTTAAGC AATCTACAAC AATGATGCAA TCTGAGTCTC CCGTCAGTAG  CCGCGGTGGC TCTGACGGAA GATCCACTTT CAGCCGGATG CTAGACCATC CGGCTGATCA TTCCAATGAC AGTTACGGAG TTGGAGGAGC AATGCTCCCT ATATTCCTCA ACGATCTACG  TCGAAACAAC AATGATCAAG ATTTAGTAGA AGTCACGTTA GAACTCGAAG ATGATTCGGT CATTTTATGC AGTGTGACCC CGACCGCTAA CCATTCAAAC CATCATCATC ATCAACATGT  TCCTTCACAG TCGTCTCCAG CTGGGGCGGC CTCCAGGCTT CGTAGGAAGT TTTCGTGGCT GACGTCTTCT TCATCGCGAG CTTCTTCTTC GGATGCAAGT GTGGACCGGG TGATCACGTC  TAGAGATGCT AGAAAATTGA AAGCTAAACT GATTCGCACG AAATCTAGCG CGCAAAGAGC GCTAGGTGGT CTTCGGTTTA TAAGTAAAAC TACAAACACC GATGTTAACG AGTTGTGGAA  AAACGTTGAG GCACGGTTTG CGTGTCTGGC TAAAGATGAT GGATTATTAG CTCGAGAAGA TTTCGCTGAA TGCATAGGAA TGGCGGATTC GAAGGAGTTT GCGTTGGGCG TATTCGATGC  GTTGGCGCGA AGAAGACAGC AGAAATTGGG GAAGATCACG AAAGCGGAGC TTCACGATTT TTGGTTACAG ATTTCCGACC AGAGTTTTGA CGCTCGTCTG CAGATATTCT TCGACATGGC  CGACAGCAAC GAAGATGGAA GAATCACAAG GGATGAGATA CAAGAGCTGC TAGTGCTTAG TGCTGCAGCA AACAGATTGT CAAAGTTGAA AGAACAAGCA GAGGAATACG CTTCTTTGAT  TATGGAAGAA TTAGACCCCG AAAATCTTGG CTATATTGAG TTATGGCAGT TGGAAACGCT TCTACTACAA AGGGAAGCTT ACATGAACTA CAGTAGACCT CTGAGCATAG CAAGCGGCGG  GTGGAGTCAA AATTTGAATT CACTGAAACC TAAAAGCGTT GTTCATAGGC TAACTCATTT TGTAAAGTCG GGTTTGGTGG AAAACTGGCA AAGAAGTTGG ATTTTACTGC TATGGTTTTT  AACCATGGCT TGTTTATTTA CATGGAAATT TAAGCAGTAT AGGAACAAGG CTGCTTTTCA TGTCATGGGC TATTGTTTGA CCACTGCTAA AGGGGCTGCT GAAACCCTCA AACTCAATAT  GGCTCTTATT CTTTTACCCG TTTGTAGAAA CATGTTAACG TTCCTAAGGT CTACCCGAGC GCGATTGTTC ATCCCTTTTG ATGACAATAT CAACTTTCAC AAGGTAATTG CTTTTGCAAT  AGCTGTTGGC ATCGGTTTGC ACGCTGGAAA TCATATGATT TGCGATTTTC CTCGGTTGGT AAACTCTTCA CCAGAAAAGT TTGCTCTTAT AGCATCAGAT TTCCATAACA AGAAGCCGAC  ATACAAGGAA CTAATTGTCG GTGTGGAAGG CATGACTGGA ATTTCAATGC TGATATTAAT GGCCTTTGCG TTCACCTTAG CTTCGCGATA TTTCAGAAAA AATGTTTTGA AGCTGCCATC  ACCTTTCAAC CGGTTAACTG GATTCAATGC ATTCTGGTTT TCACATCATC TTTTTGGTTT GGTGTACATA CTGCTTTTGG TTCATGGATC ATTCTTGTTT TTGGTTCATA ACTGGACTCA  AAAAACCACG TGGATGTACA TCTCGGTTCC AATTTTAATA TACGCAGCTG AGAGAAGTCT ACGAACAGGA CGTTCAGAAC ACTACTCCCC TAAAATCATG AAGGTTTCCA TCCTACCAGG  AGATGTATTC AGCATAATTA TGTCAAAACC GAGTGGATTT AGATACCGGA GTGGACAGTA CATATTTCTG CAATGCCCTT CAATCTCTCC ATTTGAATGG CATCCGTTTT CATTGACTTC  ATCACCAGGA GACGATTACT TGAGCGTTCA CATCCGGACA GTTGGAGACT GGACCCAAGA GTTGAAGCAA GTATTAACCA ATGATACTGG TTCTTCATGT ACGATTGGTC GAGCCAAATT  TAGGAAGCTA GGGGAAGTGG ATTCAAAAGG TTTACCAAAG CTACTGTTGG ACGGACCTTA CGGTGCACCA GCGCAAGATT ACAGGAACTA TGACGTGTTA CTTCTTGTTG GGCTAGGAAT  TGGAGCTACT CCTTTTATAA GTATTCTTAG AGATTTACTA AACAATAATC GGGCAGTAGA AGACCAAACA GATTCAAACA CAGAAACGAG TATGTCAGGG GATAGTCTTA CGAGTATAGC  ATCTTCAAGT ATCGCATCGT CAAATGAAAA GAAGAAACCA AGAAGGACTA AAAGTGCAAA TTTCTATTGG GTCACTAGGG AGCCCGGCTC GTTTGAATGG TTTAAAGGAG TCATGAATGA  AGTTGCGGAA ATTGATCACA AAGGTCAAAT CGAGATGCAC AATTATCTTA CAAGTGTTTA TGAGGAAGGT GATGCAAGAT CAACTTTGAT CACTATGGTT CAAGCACTTA CTCATGCCAA  ACATGGAGTT GACATCCTAT CTGGCACTAG AGTAAGGACA CATTTTGCTA GGCCGAATTG GAGAGAGGTG TTTGGGAAGG TAGCATCGAA ACATCCGAAT ACAACCATAG GAGTGTTCTA  TTGTGGGATG CCAGTGTTGG CTAAGGAGCT AAGGAAACTA TCATATGAGA TGAGCCAGAA GACATCGACA CGATTTGAGT TCCACAAGGA GTACTTCTGA ACTAAAACAG TCCGTATAAT  GTTATACATA CTTATATATT TTTTTTTATA CATTTGAATT TAAAAGAATG TAAATTTGTA CACCACGCAG CAGCTAGTGT AGGTAAACCT GTATAATTAG AGCAATACAA TTATAAGAAA 
GTGAGAAACC GATAATATAC TCCTTCCATT TAGTTATACA AAGATTTTAA CAAGCTAAGA GCTCTA 

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