Entry information : HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Entry ID 13779
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Name (synonym) HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh03
start..stop
S start..stop
HaRboh06 1059 0 40..813 26..827
EgrRboh06 1035 0 1..813 12..857
EglRboh06 1034 0 1..813 12..857
EguRboh06 1031 0 1..813 12..857
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13779' 'join(25387589..25387937,25388009..25388171,25388246..25388294,25388580..25388693,25388755..25389558,25389690..25389779,25389865..25389980,25390071..25390173,25391030..25391103,25391193..25391340,25391593..25391706,25392574..25392702,25392796..25392874,25393514..25393623)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 25387589..25387937 347 N° 2 25388009..25388171 161 N° 3 25388246..25388294 47 N° 4 25388580..25388693 112
N° 5 25388755..25389558 802 N° 6 25389690..25389779 88 N° 7 25389865..25389980 114 N° 8 25390071..25390173 101
N° 9 25391030..25391103 72 N° 10 25391193..25391340 146 N° 11 25391593..25391706 112 N° 12 25392574..25392702 127
N° 13 25392796..25392874 77 N° 14 25393514..25393623 108  
join(25387589..25387937,25388009..25388171,25388246..25388294,25388580..25388693 ,25388755..25389558,25389690..25389779,25389865..25389980,25390071..25390173,253 91030..25391103,25391193..25391340,25391593..25391706,25392574..25392702,2539279 6..25392874,25393514..25393623)


exon

Literature and cross-references HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr05 (25387589..25393623)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr05g0133941
Protein sequence: HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   813
PWM (Da):   %s   93172.66 Transmb domain:   %s   o366-388i415-437o468-490i641-660o
PI (pH):   %s   9.1
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
DNA
Send to BLAST
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ATGGAACACGATGGAAGTGCGGCTTTCTCTATAGACCGGTCAAGTGTGGCTTTCTCTATAGACCAGTCAAGCCGAACATTTCTGAAAGAGGAAGTGAGCTTGTCAGTCACAGGCAGACTA
AGCAGGAAATCTAGCAGGTTAGGTTCTAGCCGACAGAGACTCCCGCCTAATGACGAGTCAAGGATGGTAAGGCAAAGATCAAGTGCGGCTAGAGGGCTTGATGGCTTGCGGTTTGTTGAT
AGAGTTGTGACCGGGAAAGAGGGGGACGCGTGGATGGCTATTGAGAAACGTTTTCAACAATTTTCAGTAGATGGAAAGCTGCCTAGAGAAAAATTTGGAATATGTATTG
TGGTTAGTTTT
CGGATCTTGAATGATTTGTTTACAAACTAATTGTTTTGATTATTTTGGTTTGTTTTCTTTAGGAATGGGCAACAGTGGCGAGTTCACAGGGGAACTGTTCGATGCACTTGCGAGGCGGAA
GAGGATTGATGGATCTAAAGGGATCACATTAGAGCAAGTAAAAGTATTCTGGGAAGATTTGTCGAATGAGGACCTTGATACCCGAATTCATATTTTCTTCGATAT
ATGTAAAATCGATAT
TCCTTTTTTTCACATAATGTCAAACTAGAAACTCGTAACATATAACTAAAATTGAACTCAGGTGTGACAAGAATGGAGACGGGTTGCTAACTGAGGAAGAAGTAAAAGAGAGGTACACCG
CACCCTACAGATAGCAAAATGGTTAAAACGGGTTTAGTAACAGCTCAAAACGATCATTTGTCAAATGATACGTAGTCATTCTAACCTGATCCGGCCTTTTTAATGCACTTTTTTCAGTTA
TAGTCCTCTTCGACATGTTTGGCTACGCTGTTTTGCTTAATCTCACTTGAGAGATTAACAAAAAAAAGCCCAAAAACCATTTGTCTCGTTTTTTATGTTCTTTCCTGTCTCAATCTTAAA
TCTACATTGATTGTTTTCGGTTTTTCTCATGTGTAAGGTCCTGATAATGAGTGCATCAGCCAACAAGCTTTCAAATTTCAAGAAACAAGCCGGTACATATGCAGCTCTAATCATGGAAAG
ACTCGACCCTGATGACTACGGTTACATAGAG
AGGTAAAAAAAAGTTATACTTAACATGTCAACACATTTCTTTAACTTGATCATCGAATGACAGATGTGGCAACTCGAGACGTTGTTGAA
AAGTATGGCGACACCAAAGGAAGCTACCATGAACCCTGAAGACACAAACGATCTAGCCAAAACAATGATCCCAGAACTTTACAGGAACCCGTGGAGAAAATTCATGACAAGAGTGTTTGA
ATCGGGACTCGAGCACTGGAAAGTGTTTTGGGTATTATTTCTATATTTGGAAATGAACGTTGCGCTGTTTATGTGGAAATTCCACCAATATTCGTTGATGCCGTCGTTCCAAGTTTTGGG
GTATTGTAGTTGCACAGCGAAAGGTTCCGGAGAGACTCTAAAGTTTAATATGGCTCTCATTCTCCTTCCTGTATGCCGAAGAACACTTACAGCCATTAGAGAAACTTTCCTTGGGAAAGT
ATTACCTGTGGATGAGAACATTAATTTCCACAAGATAATCGCGCTCGCAATCGCGATAGGAACAGTAGTTCACACCGTTGCGCACATGGCCTGCAATTTTATAAGGTTGTCAAGATGTCC
TTTGAACAAATTCAAGGCCATCTTTGGAAATTTATTTGTAACGCAACCGAGTTACATGGATTTAGTAACAAGCATCCCGGGATATACTGGAATCATCATGATTATTTTGATGGCTATTTC
CTTCACCTTTGCAACAAGTTCTTTTAGGAGAAACGTTGTTAAGTTGCCTCACCCGTTCAACGATTTAGCCGGTTTTACTTCCTTTTGGTACACTCATCATCTGTTGATCATCGTTTACTT
TTTATTCATCGTTCATGGCACCTTCTTAATCCTCACTGTAGGATGGTACAGAAAAACA
CAGTACGTCACTTGACAACTTGTCTTACACTCCCACACAATTCCAGATACGCGATTTTCACA
CAAAATCGCGTATATGGTGCAGTGCGTGAAACATAAGTTTGATCAAATTTTGTCAAACAACATTCTTGCAGACATGGATGTACCTGTTGCTTCCAATGTTGTGTTATGCAAGTGAGAGAC
TCCTTACAACTGACCATACAATGCTTGTTGACACCATTAAG
AGGTGACCCAACGATGCCATTGTTATTATCTGTTTATCGTTATAAAAATAAAATTCTTGATTATCAGTTTGTGGTATGA
AAATTCAGGCTATCATATATAGCGGGAATGTGCTAGCACTCTACATGACCAAACCTATAGGATTCAAGTACAAGAGTGGCATGTACCTCTTTGTACAGTGTCCACAAATATCACGCTTCG
AATG
TGGTAAGCTTGTTATTAATTATATATTTAACGACACATTATTAAATATAAACTAATTGGATTACTAATTATAGATGTTGATTTACATGATAGGCATCCTTTTACCATCACTTCTGC
GCCTGGAGATGATTATCTAAGTGTACATATTCGTACTCTGGGAGACTGGACGAAAGCACTACGGGAAGAATTTGCAAAG
AGGTCACACACTGTTTTCTAGTGAAGGGGCAATATTATGGC
ACTGGTTAAAAAAGGCCAGGCTGGGTTGTATTGACCCGTAACACTTTTTTTTTCCATTTTTAGAACATTCTATAAGTGATGAATGGGTTAATTATGATTCCAAAACAATTAGTATATAAT
TATGATGCCTATCATAGTAAACCATATATATATATAGAGAGAGGGTAAGTTTCATAAGAAAACTACCCTTCGTGGGAAATACTACATATGTGCGGTACTAATACATATGTAGTAACCACC
ACAAGTGGCCTAGTGGTGGAGTGACTTGGGTTCTCCAATGGAGACCCAAGTTCAATTCCCATTAGTGCCACTTTGGTGGCCACCGACACCCGCTTTAAAGCCGGACCGAGGACACTCGAG
GTCTCGGGTTTGAAACATGTTTCTTACCCCTCTTTGATGGCTATGGGTATTTGCCGCCAGGGATCCTTGTCGGGTGGTGAACTGGGAAGGGAGATCCCTTCCGCGGTCAGGGGTACCGTG
CATCTACCCTTTTTTTAATACATATGTAGTATGATATACCACGTATATGTGGTATGTAGTTTTTTGGTTTTCTCACGCAGTACGAGTTTCTAATAATCTCTTTCCTATATATATATATTG
AAAGGCATCAAAGACGAAAATATTACAAATAATAGAGTTTGCCCACAACTCAACCCATTTGACATGTACCCAGTTTACATTAATTTTCCAATTTGACCCGTGTATGGTAATGCACATCCC
AGACCGACACTTGCGTAAGTAAAAGGGTTGAGACTATCACCTCAGCTCTACGTCAACCGTTCTATCTTAATCTAAATTCTAAAACGCAGAAATGCAGGCCTGTGAGCCGAATGGAAATCT
AGCCCGAATGGAAACTAATTCGAACTTGACCATTCAGGAATCACAAGCAAT
ATGTGAGTGCCACATAATCTAAGTCTACATCACCGTCTTTTTTAACATCACTTCTAATCAATTTCATGA
TAATATTCATTTGTTTTGGCAGCTATCCTAGAATCTACATCAAAGGACCATATGGCGCACCTGCACAAAACTACCGGAAATACAATGTCCTATTACTTATCGGTTTGGGTATTGGAGCCA
CCCCGTTTATCAGCATATTAAATGACCTCTTACATCACCTAAAAAAGTCG
CGGTAAGTAAACACAATGCCTACTCAAATAGTTATGTCCTACGTGTGTATAAGTAAAAAGAACATTCTAG
ATAACAAAAACATGCATAATTAAGGTAACAAACTTTTAAAAAAATGATAAACTATCTCCAACTTTAGAAAGTTTGAGCCGCTTTGTGAGCGAAAATGAACTCGTCACCCAAAATAAGAGT
TACATCAAAGTTATGCAATTTTCCTTGTATTTAAAAACCTCAAGGAGCATTCATTCTATTGCAGAAATCCGGCGAGATCCTGGATAAAAGAGCTTACTTTTATTGGGTAACAAGGGAGCA
GGGTTCATTCGAATGGTTCAAAGGTGTAATGGATGATATCGCAGAACATGATCACGAG
AGGTGAGTCATTAATAGGCCTGTAAACGAACCGAACGTTCATGAACTGTTCATGAACTTGTT
CGGCAGGAAGTTCGTTTATGTTCGTTTATTTAATAAACGAACGAACACGAACAAAAATATTTGTTCGTTTAATTAAATGAACGAACATGAACGCACCTTGTGTTCGTTCATTTATGTTCG
TGAACATTCTTTTATGTTCGTTTATTTATGTTCGTGAACGTTCATTTATGTTCGTTTAAATTTTAATAAATACATAAATAGTTATATTTAAATATCAGGTTTTCGAACTACTTATATAAA
TATAACTAATTAGTATATCTATGAACCCTTATTTAGATGTGTTTTCGGATGAAATGTAATATATTAGACTTGTTTCTTCAATCATGTTAACTTATTTTTATTCAAATATATTCAATTAAT
TTTTTTTTATGTTCGTTTATGTTCGTGAACTGTTCGTTTAGGCTTTAAACGAACGAACATAAACGAACACGAACATGCTCGATTTCTTAATGAACGAACACGAACAAAAAAATGTGTTCG
ATTATATGTTCGTGTTCGTGTTCGGTTAAAGTTAAATGAACGAACACGAACATGATGTTCGTGTTCGTTCGGTTCGTTTACAGGCCTAGTCATTAACCTTAAACTTTAGCTTTATGGTAC
TATCTACTTACTTAGAACCAACTTTCTTAGATAGGTTAAGCCTGTTTGTTCTAATTATTAGACTATATTATTATGCGCCCACGAGCTCAGTTAGGTTTCTAAGGTTACTCGTATTCTCTG
TATGGTAACCCTAGAAAACCTAACATAGCCTGTGGGCCGGTAATAATATAGTCTAATACTAATGAGGTTTTCACATGTGAATTTCAGAACATTATTGAAATGCATAACTACCTCACAAGT
GTGTATGAGCATGGTGATATGAGATCTACACTTATATCCATGGTGCAGACTCTGCAACATGCCAAAGATGGAGTCGATGTCGTCTCTCAAAGTCGG
GGGTATAAACTTTCTTAAAATATA
TGATCAACCAACACCTAATTCAACGTTTTATTTCAAAAATTTATTTTCTAATCACAAACACATCACGACAGATTAAAACGCATTTTGCAAGACCAAATTGGAGAAAAGTATTCTACAACT
TGGCAACTACACATGAAGGTCGTAGGATAG
AGGTAAGACATCACTCATTACTACATTGGGTTTTCTTGTGATTAAAGGTGGCAATCCGGGCTCGTTTACTGGTAAATAGATTAATTTGGG
TTGTGTTTATTCTCAACTGGATCTAGTAAAAAAAAGCTAAAGGAGAACAAGCCAAAGATGCTAAAATCACACAAAGTCTATTATTATTATTATCACTTACAACCTCTTAAATCGTTGTAT
TCAAACTTTAGACTATTACTCCATCTGTCTCAAAATTATCGTCCGCGTGACTATTTTTGTTTGTCCCCAAAGAAATGTTCACTTTTGAAAAATGGATAGTCAAAAATACTATTTTCGCCA
CGGGTAAAATCAGCATTCTACACGCTAAAAATTGTACGCCTTTATCATTGATACAAGTTTTTCAAATCAATTACGTCTTAAATGCATGGGCATTCTACAAACTAAGTGTTATACATGAAG
CCAAAGGTTTTTTTGTTGGTGCACAATTAAGCTGGACAAAGGGAGTATTGTAATAAAATTGTTTCTGTAGTCATAATTAACGGGTTCACTATTCATATATAAATGGACATAAAGCGACGT
AACCACACACATTTGCCCGCTACCAAAAATGATCCGGTTTAAGTTAAACCTTGGTTTCCAATGAACTGCAGGTGTTTTCTACTGTGGAGCCCAAGCACTCGTAAGACAATTAAAAAAGCT
CTGCAAAGAATTTAGCCGTCAAAACATTACTCGCTTTGATTTCCACAAGGAGAATTTCTAA

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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAACACGATGGAAGTGCGGCTTTCTCTATAGACCGGTCAAGTGTGGCTTTCTCTATAGACCAGTCAAGCCGAACATTTCTGAAAGAGGAAGTGAGCTTGTCAGTCACAGGCAGACTA
AGCAGGAAATCTAGCAGGTTAGGTTCTAGCCGACAGAGACTCCCGCCTAATGACGAGTCAAGGATGGTAAGGCAAAGATCAAGTGCGGCTAGAGGGCTTGATGGCTTGCGGTTTGTTGAT
AGAGTTGTGACCGGGAAAGAGGGGGACGCGTGGATGGCTATTGAGAAACGTTTTCAACAATTTTCAGTAGATGGAAAGCTGCCTAGAGAAAAATTTGGAATATGTATTG
GAATGGGCAAC
AGTGGCGAGTTCACAGGGGAACTGTTCGATGCACTTGCGAGGCGGAAGAGGATTGATGGATCTAAAGGGATCACATTAGAGCAAGTAAAAGTATTCTGGGAAGATTTGTCGAATGAGGAC
CTTGATACCCGAATTCATATTTTCTTCGATAT
GTGTGACAAGAATGGAGACGGGTTGCTAACTGAGGAAGAAGTAAAAGAGGTCCTGATAATGAGTGCATCAGCCAACAAGCTTTCAAAT
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ATGTGGCAACTCGAGACGTTGTTGAAAAGTATGGCGACACCAAAG
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AAAGGTTCCGGAGAGACTCTAAAGTTTAATATGGCTCTCATTCTCCTTCCTGTATGCCGAAGAACACTTACAGCCATTAGAGAAACTTTCCTTGGGAAAGTATTACCTGTGGATGAGAAC
ATTAATTTCCACAAGATAATCGCGCTCGCAATCGCGATAGGAACAGTAGTTCACACCGTTGCGCACATGGCCTGCAATTTTATAAGGTTGTCAAGATGTCCTTTGAACAAATTCAAGGCC
ATCTTTGGAAATTTATTTGTAACGCAACCGAGTTACATGGATTTAGTAACAAGCATCCCGGGATATACTGGAATCATCATGATTATTTTGATGGCTATTTCCTTCACCTTTGCAACAAGT
TCTTTTAGGAGAAACGTTGTTAAGTTGCCTCACCCGTTCAACGATTTAGCCGGTTTTACTTCCTTTTGGTACACTCATCATCTGTTGATCATCGTTTACTTTTTATTCATCGTTCATGGC
ACCTTCTTAATCCTCACTGTAGGATGGTACAGAAAAACA
ACATGGATGTACCTGTTGCTTCCAATGTTGTGTTATGCAAGTGAGAGACTCCTTACAACTGACCATACAATGCTTGTTGAC
ACCATTAAG
GCTATCATATATAGCGGGAATGTGCTAGCACTCTACATGACCAAACCTATAGGATTCAAGTACAAGAGTGGCATGTACCTCTTTGTACAGTGTCCACAAATATCACGCTTC
GAATG
GCATCCTTTTACCATCACTTCTGCGCCTGGAGATGATTATCTAAGTGTACATATTCGTACTCTGGGAGACTGGACGAAAGCACTACGGGAAGAATTTGCAAAGGCCTGTGAGCCG
AATGGAAATCTAGCCCGAATGGAAACTAATTCGAACTTGACCATTCAGGAATCACAAGCAAT
CTATCCTAGAATCTACATCAAAGGACCATATGGCGCACCTGCACAAAACTACCGGAAA
TACAATGTCCTATTACTTATCGGTTTGGGTATTGGAGCCACCCCGTTTATCAGCATATTAAATGACCTCTTACATCACCTAAAAAAGTCG
AAATCCGGCGAGATCCTGGATAAAAGAGCT
TACTTTTATTGGGTAACAAGGGAGCAGGGTTCATTCGAATGGTTCAAAGGTGTAATGGATGATATCGCAGAACATGATCACGAG
AACATTATTGAAATGCATAACTACCTCACAAGTGTG
TATGAGCATGGTGATATGAGATCTACACTTATATCCATGGTGCAGACTCTGCAACATGCCAAAGATGGAGTCGATGTCGTCTCTCAAAGTCGG
ATTAAAACGCATTTTGCAAGACCAAAT
TGGAGAAAAGTATTCTACAACTTGGCAACTACACATGAAGGTCGTAGGATAG
GTGTTTTCTACTGTGGAGCCCAAGCACTCGTAAGACAATTAAAAAAGCTCTGCAAAGAATTTAGCCGT
CAAAACATTACTCGCTTTGATTTCCACAAGGAGAATTTCTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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TGCAGCCTTG TAGTTCCAAA TTGGTAGAAT AATCAAGAAC AATGTTAAAT CTTCTATAAT AGAACACTTT TTCGGTGATT CTAATTAGCA CAAAGAAATT GTCATGCAT 

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