Entry information : HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Entry ID 13783
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Name (synonym) HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh07
start..stop
S start..stop
HaRboh02 1597 0 1..914 2..922
VvRboh07 1375 0 1..914 1..917
DtriRboh04 1337 0 24..914 42..950
DgloRboh05 1336 0 24..914 40..927
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13783' 'complement(join(46526377..46526486,46526563..46526641,46526723..46526851,46526940..46527291,46527376..46527546,46527640..46527755,46527830..46527925,46528012..46528395,46528508..46528930,46529667..46529780,46529964..46530012,46530870..46531029,46531371..46531932))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 46531371..46531932 560 N° 2 46530870..46531029 158 N° 3 46529964..46530012 47 N° 4 46529667..46529780 112
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N° 9 46527376..46527546 169 N° 10 46526940..46527291 350 N° 11 46526723..46526851 127 N° 12 46526563..46526641 77
N° 13 46526377..46526486 108  
complement(join(46526377..46526486,46526563..46526641,46526723..46526851,4652694 0..46527291,46527376..46527546,46527640..46527755,46527830..46527925,46528012..4 6528395,46528508..46528930,46529667..46529780,46529964..46530012,46530870..46531 029,46531371..46531932))


exon

Literature and cross-references HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr06 (46531932..46526377)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr06g0178241
Protein sequence: HaRboh07 (HanXRQChr06g0178241)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   914
PWM (Da):   %s   103467.89 Transmb domain:   %s   o351-370i486-508o534-556i714-731o
PI (pH):   %s   8.84
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
DNA
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GAGATTACACTCCTAAATTGAAAATTTTCATGTAATGCACTCAACATTTTCCACAAGCAGTGGTGGATCCAGCCCTGTTTTGTGGGTTCACATGAACCCACTCGGTTTGGAAAAAATTAG
TAAGAACTTTGTATGATTTGGAAAAAGTAGTGAGAATCTACCAAAACGAACCCACTAAAAGAAGTTCCTGGATCCACCACTGTCCCCATGTTTATCAAAAAACAGTACTGAATGTTTTTG
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TAAGCAATATAAACACAAGGCGGCGTTTCAGGTGATGGGTTATTGTTTAACCACTGCTAAAGGGGCTGCCGAGACTCTCAAACTCAATATGGCTCTTATTCTTCTACCCGTTTGTAGAAA
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GTAAATAACATATTACATACTTGTTTAAA
TCTTGATGTGTGTCATTAATGATCTACCAATTAACTTGATTGTGACTATTTTGAAATAGGGGGTCAAATTGAGATGCACAATTATCTAACAAGTGTTTATGAGGAGGGTGATGCAAGATC
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GTATGAACTATGATACATTATACATGCTACATTATTAGATATGCTATAAT
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TCCCCTAAAAACCCGACTCAGTTAGTTAAATTATAAGTTAATGCTTAGATAAGTGTTGATTTTGGTAGGAGAGTATTCTATTGTGGGATGCCGGTTTTGGCAAAGGAGTTGAAGAAATTA
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CDS
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GAATGGCGGATTCGAAGGAATTTGCGGTGGGAGTTTTC
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TTATGGCAGTTGGAAACACTTTTACTACAAAGAGAAGTTTACATGAACTACAGTAGACCTCTAAGCATACCAAGT
GGAGGGTGGAGCCAGAATTTGAGTTCACTGAAGCCAAAAAGCATCGTCCATCGGCTAAGTCATTTCGTGAGGTGGGCATTGATCGAAAACTGGCAAAGAAGTTGGGTTTTGCTGCTATGG
TTTCTAGCCATGGCATGGTTATTTTCTTGGAAATTTAAGCAATATAAACACAAGGCGGCGTTTCAGGTGATGGGTTATTGTTTAACCACTGCTAAAGGGGCTGCCGAGACTCTCAAACTC
AATATGGCTCTTATTCTTCTACCCGTTTGTAGAAACATGCTAACGGTTTTAAGGTCTACACGAGCCTGTTTCTTCATTCCTTTCGATGACAATATCAACTTTCACAAG
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CTAGCATCTTCAAATATGGCATCAACAACTGAAAAGAAGAAATCAAGAAGGGCTAAGAGTGCAAATTTTTATTGGGTCACTAGGGAGCCCGGCTCGTTTGAATGGTTCAAAGGAGTCATG
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GGTCAAATTGAGATGCACAATTATCTAACAAGTGTTTATGAGGAGGGTGATGCAAGATCAACTCTAATAACTATGGTTCAAGCACTTACACAT
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GTAAGGACACATTTTGCTAGACCAAATTGGGGAGAGGTGTTCACCAAGGTAGCATCAAAACATCGGAATACAACCGTAGGAGTA
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cDNA
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TACACCAGCT AGTATAGATC AACCTGTATA ACTTGAGAAC CACAATCAAG AAAATGACAA ATAGACATTA CATTTGGTTA ATATTTTTTG TGAATTAG 

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