Entry information : HaRboh09 (HanXRQChr08g0228981)
Entry ID 13786
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh09 (HanXRQChr08g0228981)
Name (synonym) HaRboh09 (HanXRQChr08g0228981)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh09
start..stop
S start..stop
HaRboh01 1090 0 14..862 7..917
HaRboh10 1072 0 1..862 6..928
HaRboh04 1014 0 4..862 57..930
NtRboh04_BelW3 991 0 71..862 123..938
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13786' 'join(96777260..96777665,96778252..96778414,96778509..96778557,96779758..96779871,96779953..96780333,96781135..96781584,96781702..96781797,96782264..96782385,96782477..96782579,96782669..96782730,96783375..96783910,96784437..96784543)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 96777260..96777665 404 N° 2 96778252..96778414 161 N° 3 96778509..96778557 47 N° 4 96779758..96779871 112
N° 5 96779953..96780333 379 N° 6 96781135..96781584 448 N° 7 96781702..96781797 94 N° 8 96782264..96782385 120
N° 9 96782477..96782579 101 N° 10 96782669..96782730 60 N° 11 96783375..96783910 534 N° 12 96784437..96784543 105
join(96777260..96777665,96778252..96778414,96778509..96778557,96779758..96779871 ,96779953..96780333,96781135..96781584,96781702..96781797,96782264..96782385,967 82477..96782579,96782669..96782730,96783375..96783910,96784437..96784543)


exon

Literature and cross-references HaRboh09 (HanXRQChr08g0228981)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr08 (96777260..96784543)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr08g0228981
Protein sequence: HaRboh09 (HanXRQChr08g0228981)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   862
PWM (Da):   %s   97565.41 Transmb domain:   %s   i288-307o367-389i427-446o491-513i
PI (pH):   %s   9.03
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDADDGRSVLPENNNHDHHHSDKAAVGSGPVNKTGGWKTVQLSVLGGAKAGSSSEGVTKTVNVAEVGKRLSRIQDVAKKLMYLNASSKQPILNGFNFSGKNNDPEAAWIALEKRFDELTM
KTGGLLPSSSFGKCI
GMNTDSDKFAEDLFKSLCQRRGITSDPINKTLFKEFWEEISNQSFDSRLKIYLAMIDKDNDGKITEEEIMIIKASASANKLPTIEKDAEKYAAFIKEKLDPEKLG
YIM
IDKLEKLLKDAATRNDIGETHDSSESSRQQFKLTQFLHDNWKRCWVVVLWIGIMVGLFTWKYIQYKHRAVYDVLGPCVCIAKGAAETLKLNMAIMLLPVCRNTITWLRNKTKLGAVV
PFDDNINFHQ
VIAVAIAIGVGLHAISHLACDFPRLIHATEEEYKPMQQYFGDQAENYWHFVKEVEGYTGIIMLVLMIIAFTLAWLRKGLKLPSLTRFKAFKNSKSYNSIVKKLTGPIAAI
NKLTGFNIFWYSHHLFVIVYALLIVHGIKLYLTKEWYKKT
TWMYLAVPILLYACERLKRTFRSRFDPAKILKVAAYPGRDGVLALRMRKPENFNYKSGEYMFVKCDAVSPFEWHPFSITS
APSDDYLSVHIRALGDWTKKINKIYS
ACLPDEGSEIRKADFPEQIPNNLRVLKIDGPYGAPAQDYKDYEVVLLVGLGIGATPMVSVVKDIVNNIKAKEEKQNALEDGTISQKNKLSPTRE
HEFKTKRAYFYWSTKGQNTLGWFKDVMDEVAEIGKNDVIQIHNYCTSVYEEADARSSLITMLQSLYYDEKGVDIVSGTRVKTHFARPNWQKVYKRIADTHKGSK
GVFYCGSPVVIKELKE
LALEFTDSSTTFEFHKENF

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCCGATGATGGAAGAAGTGTGTTACCTGAAAATAACAACCATGATCATCACCACTCCGACAAAGCGGCTGTTGGAAGTGGTCCAGTGAACAAAACCGGTGGCTGGAAAACTGTC
CAGCTTAGTGTTCTTGGAGGCGCTAAGGCCGGAAGTAGCAGCGAAGGTGTGACCAAGACGGTCAATGTAGCTGAAGTAGGGAAGAGATTATCGAGAATCCAAGATGTGGCGAAAAAGTTG
ATGTATTTGAATGCCTCCTCAAAACAACCCATACTCAATGGATTCAACTTTAGTGGCAAGAACAACGATCCGGAAGCAGCGTGGATCGCCTTGGAAAAGCGATTTGATGAACTCACTATG
AAAACTGGTGGCTTACTTCCAAGTTCAAGCTTCGGTAAATGCATAG
AGGTAACACAAAATTCATAGCTTGTTCTTTATTTTCTTGATTCATAATAACAATGGGTTTTGTCCTCTTAAAAA
CTTCTTAAACATTTTGGGCACTATTTCCTTATACCAATAATGATCCTTTAAATGGAAGACAATAGTTTGGTTCAATTAATTCTAATAAATTGTATGGACATTTTACCTTAAAAATAAAAG
AAATATCAGCTCACCAACGCCTCTTATCGATCTGGTCTCTCACTCGCGGTCACTTCTCCCCCCTCCCTCTTCCTTCAACGCCACCAGGTTTGAGAGGGGCGTCAAAACCATGGTTTTTAG
CGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGTACGGAGAAAGAATATAGGGATAATATTTTTAATCTCTTAATATAAAAGAGTTAATGTTACTT
TTTTTTCTTACAACAATTTGTTACACCTATATTCCACCTAATGTTGCATTTGAAAGAACACTAGCAAAACCACATGAACATTACTCTTTTTGTAAGTTTGGATTACAATAATTTTACTAA
TGAGTTTCATTGTTTTATTTTTTGAATTTGATAGGAATGAACACAGATTCAGACAAGTTCGCAGAAGATTTGTTTAAATCACTTTGCCAACGTAGAGGTATAACCAGTGATCCGATTAAC
AAAACACTATTTAAGGAATTTTGGGAAGAAATTTCTAATCAGAGCTTTGATTCAAGGCTAAAGATTTACCTGGCAAT
ATGTGAGTATATTAAAATTTTTTGTTTAATAATCATAGTTAAT
TCATATTTTTTTTTTTTGAGGGAAATTTACGTTGAGAAATATAATAAATACAGGATTGATAAAGATAACGACGGTAAGATCACAGAAGAAGAAATCATGGAGAGGTATGTATTAGGAAAT
AAATATTTATTTTATAGGTGTTTCGGAATACAAGAAAGTTGGTTGTAAGAAAACGTGTTTGAGAAGTTGTTCAAAGTTTTCAAAGTTTTGATTAATAAGTTATTGTTTAAGGTTTTGAAA
AAATCTAAGTAGTTGATTATTTACATGTAAAATAACCTAATATGTAATAAAAAAATTAAATTCCACATATTTAAAAATGTTAATATCAGATTAGGTACGATGGGCCAAGAAGTGCTTAAA
GAGTGGTTATGATACGGACATAAAGTATTACATAACATGGTAATTTTGAATATAATTTGAAATTAGGGGGAGATTCATTTGAGAAGAATCTTCTTATAAAAAGAAAAATAAATTAATTTA
GGCCATTTATTTTTTTGATCAATGGTTTTGAATCAAGATATAATTATTGTGAACTTTTAATTAATGATTTAATTAATAAGGGCAGGGTAGACATTTTGACTTAGAATATTAATTTTTTTT
TTGAACAACAAATTTGGAATTTAGAATATTAATAAATGTTATAAAGAGTTACTCAATTATTATTAATGCCATAATAATTTTCTCTTTCACTACTATTAATGTGTTGGTCCTACACCAATT
AGAAGTGACAAAATTTTTTAAAAGTGTTGTGTTCTACACATATTTTATTTTATTATGAGTCAACAAATTATTTAAAAGTGTTGGGGTCCTACACATTCTCTACCTTACACCAAAACATTG
TTTTTATGGTGTAGTAAACGTTGAATATGTAAGAACATGTATATGATTGTTTTTATTGTGTAAGGTGCAAAATTATTTTATAGGATGACTTATTAAATGATTAAGGTTCATTAATTTGAA
TAACAAAAATAAATGATAAGCTTATTAAATGATTTGTTCTAATTACCTTTGTATCCTTTATTCTTTTTATTCTTAATTTATAATTTCTTTTTATTTGAACTCTCCACTTTGAAATTATTT
TTTTAAAGGGTACATTTCAGAATTCTAGTAATACATAAAGGACAAAAAGTGTAATTTACTCTATTTATATACTACAGTATTAATCAACTATATGTGTTAAAGTATATGAGAATAACTACA
AACAAAAACCAAGTTAAATCATATCTCGTAAGTATAATAAAGATTATTATAATACATTTTTTTAATGCTAACAATTATTCACAATTGATGCACATGTGATGCAGATTATCAAGGCAAGTG
CATCAGCCAACAAGTTACCAACTATTGAAAAGGATGCAGAAAAATATGCAGCATTCATCAAGGAAAAGTTAGACCCGGAAAAACTCGGTTATATCATG
TGGTACAACTTTAGATTACACA
ACACCACTGGTTATAGTTTGGTAGGAAATATATTAGTGATCAAAGCTTAATGTTTAAACAGATTGACAAGTTGGAGAAGTTATTAAAAGATGCAGCAACACGTAACGATATAGGAGAAAC
ACATGACTCAAGCGAATCGTCTAGACAACAGTTCAAACTAACACAATTTTTACATGATAATTGGAAGAGATGTTGGGTGGTTGTACTTTGGATAGGAATAATGGTTGGTTTGTTTACGTG
GAAGTACATTCAATACAAACACCGAGCTGTATATGATGTGTTAGGGCCGTGTGTATGTATAGCGAAAGGTGCAGCTGAGACTTTAAAACTAAACATGGCGATTATGTTATTACCTGTTTG
TCGGAACACAATTACTTGGTTGAGGAACAAGACTAAGTTGGGTGCCGTGGTTCCGTTCGATGACAATATTAATTTCCACCAA
AAGTAAGTCAATATTATCACATTTGAAACATGTCTTGC
TTAATTAGTTCTAAACGAGCTGGACCTTCACTAAATTGTTCGGCGAGAACTTCTTTATATTTTTTTTCTTTAGTAAACGAACAAACACGAACAACCTTTTTTTGTTTAGTTAACTACATG
AACAAAAATAAACATATGTCTTTTGTTTAGTTCGTTCATTTATTTTCATTTACGTTTATTTGTTACTTAATTGATCGATTGTACATTAGCCCATTAGCTCATGAACCTAATCAAATTTTG
AACCTAGCTTTAAGGAATAAAGTGTTCAGCTTTAGGTTGGTTTTGTTTTCTTTTTGCATTAGTAAGTGAATATTGGTATAGAGTTTAACTTATTGGATATTGTTTGCTTAATTTAAAATG
TTGCATATTGTGGAACCATATGATGATGATTGTATTCATACTTGAAAATTGATAATATTGTTTATCTTTAAATTGTGATCGTCTTTCTTCATTTGTGTTTGTGAACCATTCAAAATATGC
CCGTTCTAATGTCCGTGTCGTGTTTACTTGGAATATCTACGAACTAACATAAAGGTACACAACCACGTTCATTTTTTTCTTGACGAACGAACAGTAAAAAAATATTTGTTCATTTATGTG
TTTGTTCATTTATTGTTTGTTCGGTTAATGAACGTGAACAAGCTCAGGCTTGTGTTCATTTGGTTTGTCTATAGGTCTAATGTTGGTTACTAAATTTGGAAAGTTTAAAATGTTTTATTG
TAATTTCAAGTCAAATATACGTTTTTTGTTGTTACTATGTTATAGGTGATTGCAGTGGCGATCGCGATTGGAGTTGGGTTACACGCGATTTCCCATTTAGCATGCGACTTTCCCCGATTA
ATCCACGCAACTGAGGAAGAGTATAAACCGATGCAACAATATTTTGGGGATCAAGCGGAAAATTATTGGCATTTTGTAAAGGAAGTAGAAGGGTACACGGGAATAATAATGCTAGTACTA
ATGATTATAGCTTTTACACTAGCATGGCTAAGAAAAGGCCTCAAACTACCCTCATTAACAAGATTTAAGGCATTCAAGAACTCAAAGTCGTATAATTCCATCGTAAAGAAATTAACAGGA
CCTATTGCTGCTATTAACAAATTAACGGGATTTAATATCTTTTGGTACTCCCACCACCTCTTTGTTATCGTCTACGCACTGCTTATAGTTCACGGGATTAAACTTTATCTCACCAAGGAA
TGGTACAAGAAAACG
CGGTTAGTTCCTTTATGTTATCTCATTTTATAATACCTTTTTTTATATATTAGCTTGATGTAATGTCTTAGTACTAGGTATTCGTAATCTTTAAAGTAAATTATG
CCTTACGGATGCAGACTTGGATGTATTTGGCGGTTCCAATCTTGCTCTACGCTTGCGAGAGACTGAAAAGGACATTTCGATCTCGTTTTGATCCAGCCAAGATACTTAAGAGGTATAATG
TTTATTTTTTTCTAAGCGGTCTAGCAAAGTCATTGGCGTTTTCATAAGGTTTCTGAACTTGTTTTGGTTTCAAGGGAGTTTGCTACTTAAAACCGTAGACTTAATTTGAGTCAACTAGTC
AAAGGAGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTTGACAAGTCAACATATTCACATGAATATCGGGTGTTAGATTTTTTTTTTAAAAAGTAGAAACCAAAACACTTACATAAGCCTC
CTAGAAATAGAAAGGTCTATACTATTATATGCACATGATCTTTTTTAGTAGAAAAATAAACACTTCCACAAAACCTCCTAGAAATAGACAGGTCTCCAATCTTACACACACATGCGTTTT
GGACATCTTACTTTAGCATACGTACGGGTCCATTTAGTTGTGTTTTATCATTGACACATAAGATAAAGACATATCTTAAGATATCGGTTCTGTTAAAGGTGGCTGCTTATCCTGGTCGTG
ACGGGGTATTGGCACTTCGAATGAGGAAGCCTGAAAACTTTAATTACAAGAGTGGAGAATACATGTTTGTCAAGTGTGATGCTGTCTCCCCATTTGAATG
TGGTTTGTTTACATTAAAAG
AATTGAAAACAATATATAAATTATGTAATAGTACAATTAAGTAACTTAACACTTGATACATGTTAATTAACAGGCACCCATTTTCCATTACATCTGCCCCAAGTGATGACTACCTGAGTG
TGCATATCCGGGCTCTTGGTGATTGGACTAAAAAAATTAACAAAATCTATTCAGAG
AGGTATATATGCAACCATTGTTTACTGCTTATAGTCCATGTTGTTAGTTAATTATTATATCACT
TAACATGTGAATTTTCATCTTCGGTAGGCCTGTTTGCCTGATGAAGGAAGTGAGATTCGTAAAGCTGATTTTCCGGAACAAATTCCGAAAAGTAAGTAGAGTATGTCTGTTTCTAGATTC
ACATCATATAGTAAGAAGGATGGTTTGAGCAACAAACCAAAATGAGCTTGGGATTGTCATCTTTTTCGTTCGGGTAAAAATAGTCGATCACGCCAATCCTAAAAACGCTTTTGTCTCGTT
TAAGGCAACTAACTTGTTACTAATGGTTAAACACAATACTATCTCAATATATTATATATTAAAAACTTATTTATTCCCTAAACTGCAAACATATATCTAACATGCAAAATGTTTTATATT
CTAAATTCATGTATTTAAAACATATTAAGAACTTTATATTTTAAGAGAATTGAATATGATTCTTTTGCACGTTTAGAGCCGGGGATACGAAATTCACGTTTAGAATCTTTAAGTGCATTT
GGGTTAAAAGTAAAGAATTGAGTGTGTTAAACGCATACAATCTCTTAAATCATTTTAATTGATGATAGTAATTAGTGGTTGGTTATTCATAAACATAACAAACCCTTTCGAAATCTAGAA
AAAAGTTTAAGATGAATGAAGCAAAGATGTTTGCGGGTCAATTCTAAGAATATAACTTGTTTCAACCCGAATCCATTTTGATCCAAAGATTTAAACATATATGTATTTGAATAACTTGAT
CAATCTTTTTTACAGTAACCTAAGAGTTCTAAAAATTGACGGTCCATACGGTGCACCCGCACAAGACTACAAAGATTACGAAGTGGTGTTGCTAGTGGGCTTAGGCATTGGAGCAACTCC
AATGGTCAGTGTTGTGAAAGATATTGTGAATAACATTAAAGCCAAAGAAGAAAAACAAAATGCATTGGAAGATGGTACAATATCACAAAAGAACAAACTTAGTCCAACAAGAGAACATGA
GTTTAAAACAAAAAGGGCTTACTTCTATTGGTCCACTAAGGGACAGAATACGTTGGGTTGGTTTAAAGATGTTATGGATGAGGTTGCTGAGATAGGCAAAAATGATGTCATACAGATTCA
CAATTATTGCACAAGTGTTTACGAGGAAGCAGATGCGCGATCGTCTTTAATTACTATGCTTCAGTCACTCTATTATGATGAAAAGGGTGTTGATATTGTATCTGGTACCCGTGTGAAGAC
TCATTTTGCTAGACCGAATTGGCAGAAAGTTTACAAAAGAATTGCGGATACTCACAAAGGTTCCAAAATAG
AGGTTAGTCCTGCTAACTCGTTCTAACTTTAATTCTTTTCGTTATACTT
GAATATTCATATAAAGCATAGCTGGCACAACGGACGGGTTCGGTTAAAACATGTCGCGAGTAATGCATACGGATCATGATGAGCTCGGTTAGGCTGGCATGGTTTCAATTAATTCTTTTG
TCAGTTTTAAAGTTTTATAATGCCCTAAATGTTATTACAAAAACAATAATCTTTGAATAAAAAATTTGATTTAGTTGGAAATTGTATTGGTTAATATTTACATTCAAAACTTTAGATATA
AGTTAACTACAGTATCCGTTCTCATTAGCTCATCAAGTAACATGTTTTAGTTGCGTTTTGTCGCAAATTGTTATAATACTATAAAATAATGAAAAACCGAGTTATTTTAATTGTGTCATG
AATACGCGTTAACGACCTATGGCTGGTGATGGCTCTAAAGGGGTGGTTTTGCTAGAACAGGTGATATATAATGTCGATCATGTGATGTTTTCTAACTTTCATATCATTATAATTCGCAGG
GGTTTTCTATTGTGGATCACCAGTAGTAATAAAAGAGCTAAAAGAATTAGCTTTAGAATTCACTGATTCATCAACCACGTTTGAGTTTCACAAAGAGAATTTCTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCCGATGATGGAAGAAGTGTGTTACCTGAAAATAACAACCATGATCATCACCACTCCGACAAAGCGGCTGTTGGAAGTGGTCCAGTGAACAAAACCGGTGGCTGGAAAACTGTC
CAGCTTAGTGTTCTTGGAGGCGCTAAGGCCGGAAGTAGCAGCGAAGGTGTGACCAAGACGGTCAATGTAGCTGAAGTAGGGAAGAGATTATCGAGAATCCAAGATGTGGCGAAAAAGTTG
ATGTATTTGAATGCCTCCTCAAAACAACCCATACTCAATGGATTCAACTTTAGTGGCAAGAACAACGATCCGGAAGCAGCGTGGATCGCCTTGGAAAAGCGATTTGATGAACTCACTATG
AAAACTGGTGGCTTACTTCCAAGTTCAAGCTTCGGTAAATGCATAG
GAATGAACACAGATTCAGACAAGTTCGCAGAAGATTTGTTTAAATCACTTTGCCAACGTAGAGGTATAACCAGT
GATCCGATTAACAAAACACTATTTAAGGAATTTTGGGAAGAAATTTCTAATCAGAGCTTTGATTCAAGGCTAAAGATTTACCTGGCAAT
GATTGATAAAGATAACGACGGTAAGATCACA
GAAGAAGAAATCATGGAG
ATTATCAAGGCAAGTGCATCAGCCAACAAGTTACCAACTATTGAAAAGGATGCAGAAAAATATGCAGCATTCATCAAGGAAAAGTTAGACCCGGAAAAACTC
GGTTATATCATG
ATTGACAAGTTGGAGAAGTTATTAAAAGATGCAGCAACACGTAACGATATAGGAGAAACACATGACTCAAGCGAATCGTCTAGACAACAGTTCAAACTAACACAATTT
TTACATGATAATTGGAAGAGATGTTGGGTGGTTGTACTTTGGATAGGAATAATGGTTGGTTTGTTTACGTGGAAGTACATTCAATACAAACACCGAGCTGTATATGATGTGTTAGGGCCG
TGTGTATGTATAGCGAAAGGTGCAGCTGAGACTTTAAAACTAAACATGGCGATTATGTTATTACCTGTTTGTCGGAACACAATTACTTGGTTGAGGAACAAGACTAAGTTGGGTGCCGTG
GTTCCGTTCGATGACAATATTAATTTCCACCAA
GTGATTGCAGTGGCGATCGCGATTGGAGTTGGGTTACACGCGATTTCCCATTTAGCATGCGACTTTCCCCGATTAATCCACGCAACT
GAGGAAGAGTATAAACCGATGCAACAATATTTTGGGGATCAAGCGGAAAATTATTGGCATTTTGTAAAGGAAGTAGAAGGGTACACGGGAATAATAATGCTAGTACTAATGATTATAGCT
TTTACACTAGCATGGCTAAGAAAAGGCCTCAAACTACCCTCATTAACAAGATTTAAGGCATTCAAGAACTCAAAGTCGTATAATTCCATCGTAAAGAAATTAACAGGACCTATTGCTGCT
ATTAACAAATTAACGGGATTTAATATCTTTTGGTACTCCCACCACCTCTTTGTTATCGTCTACGCACTGCTTATAGTTCACGGGATTAAACTTTATCTCACCAAGGAATGGTACAAGAAA
ACG
ACTTGGATGTATTTGGCGGTTCCAATCTTGCTCTACGCTTGCGAGAGACTGAAAAGGACATTTCGATCTCGTTTTGATCCAGCCAAGATACTTAAGGTGGCTGCTTATCCTGGTCGT
GACGGGGTATTGGCACTTCGAATGAGGAAGCCTGAAAACTTTAATTACAAGAGTGGAGAATACATGTTTGTCAAGTGTGATGCTGTCTCCCCATTTGAATG
GCACCCATTTTCCATTACA
TCTGCCCCAAGTGATGACTACCTGAGTGTGCATATCCGGGCTCTTGGTGATTGGACTAAAAAAATTAACAAAATCTATTCAGAG
GCCTGTTTGCCTGATGAAGGAAGTGAGATTCGTAAA
GCTGATTTTCCGGAACAAATTCCGAA
TAACCTAAGAGTTCTAAAAATTGACGGTCCATACGGTGCACCCGCACAAGACTACAAAGATTACGAAGTGGTGTTGCTAGTGGGCTTAGGCATT
GGAGCAACTCCAATGGTCAGTGTTGTGAAAGATATTGTGAATAACATTAAAGCCAAAGAAGAAAAACAAAATGCATTGGAAGATGGTACAATATCACAAAAGAACAAACTTAGTCCAACA
AGAGAACATGAGTTTAAAACAAAAAGGGCTTACTTCTATTGGTCCACTAAGGGACAGAATACGTTGGGTTGGTTTAAAGATGTTATGGATGAGGTTGCTGAGATAGGCAAAAATGATGTC
ATACAGATTCACAATTATTGCACAAGTGTTTACGAGGAAGCAGATGCGCGATCGTCTTTAATTACTATGCTTCAGTCACTCTATTATGATGAAAAGGGTGTTGATATTGTATCTGGTACC
CGTGTGAAGACTCATTTTGCTAGACCGAATTGGCAGAAAGTTTACAAAAGAATTGCGGATACTCACAAAGGTTCCAAAATAG
GGGTTTTCTATTGTGGATCACCAGTAGTAATAAAAGAG
CTAAAAGAATTAGCTTTAGAATTCACTGATTCATCAACCACGTTTGAGTTTCACAAAGAGAATTTCTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCGTTGACT TGCTTAATCC TAATGAGCTT TCACACTCCA TATAAGTGGG TGCCTTCTCT ATATAATTCC ACCATTGTTC TTCACATTTT TTTAAAAAAC ATCCACCCTT TCTTAAAATA  AAATTCAGTT CATTTGGTTG GTTAGTTTTG GGTGAAAAGG CATAAGATGG ATGCCGATGA TGGAAGAAGT GTGTTACCTG AAAATAACAA CCATGATCAT CACCACTCCG ACAAAGCGGC  TGTTGGAAGT GGTCCAGTGA ACAAAACCGG TGGCTGGAAA ACTGTCCAGC TTAGTGTTCT TGGAGGCGCT AAGGCCGGAA GTAGCAGCGA AGGTGTGACC AAGACGGTCA ATGTAGCTGA  AGTAGGGAAG AGATTATCGA GAATCCAAGA TGTGGCGAAA AAGTTGATGT ATTTGAATGC CTCCTCAAAA CAACCCATAC TCAATGGATT CAACTTTAGT GGCAAGAACA ACGATCCGGA  AGCAGCGTGG ATCGCCTTGG AAAAGCGATT TGATGAACTC ACTATGAAAA CTGGTGGCTT ACTTCCAAGT TCAAGCTTCG GTAAATGCAT AGGAATGAAC ACAGATTCAG ACAAGTTCGC  AGAAGATTTG TTTAAATCAC TTTGCCAACG TAGAGGTATA ACCAGTGATC CGATTAACAA AACACTATTT AAGGAATTTT GGGAAGAAAT TTCTAATCAG AGCTTTGATT CAAGGCTAAA  GATTTACCTG GCAATGATTG ATAAAGATAA CGACGGTAAG ATCACAGAAG AAGAAATCAT GGAGATTATC AAGGCAAGTG CATCAGCCAA CAAGTTACCA ACTATTGAAA AGGATGCAGA  AAAATATGCA GCATTCATCA AGGAAAAGTT AGACCCGGAA AAACTCGGTT ATATCATGAT TGACAAGTTG GAGAAGTTAT TAAAAGATGC AGCAACACGT AACGATATAG GAGAAACACA  TGACTCAAGC GAATCGTCTA GACAACAGTT CAAACTAACA CAATTTTTAC ATGATAATTG GAAGAGATGT TGGGTGGTTG TACTTTGGAT AGGAATAATG GTTGGTTTGT TTACGTGGAA  GTACATTCAA TACAAACACC GAGCTGTATA TGATGTGTTA GGGCCGTGTG TATGTATAGC GAAAGGTGCA GCTGAGACTT TAAAACTAAA CATGGCGATT ATGTTATTAC CTGTTTGTCG  GAACACAATT ACTTGGTTGA GGAACAAGAC TAAGTTGGGT GCCGTGGTTC CGTTCGATGA CAATATTAAT TTCCACCAAG TGATTGCAGT GGCGATCGCG ATTGGAGTTG GGTTACACGC  GATTTCCCAT TTAGCATGCG ACTTTCCCCG ATTAATCCAC GCAACTGAGG AAGAGTATAA ACCGATGCAA CAATATTTTG GGGATCAAGC GGAAAATTAT TGGCATTTTG TAAAGGAAGT  AGAAGGGTAC ACGGGAATAA TAATGCTAGT ACTAATGATT ATAGCTTTTA CACTAGCATG GCTAAGAAAA GGCCTCAAAC TACCCTCATT AACAAGATTT AAGGCATTCA AGAACTCAAA  GTCGTATAAT TCCATCGTAA AGAAATTAAC AGGACCTATT GCTGCTATTA ACAAATTAAC GGGATTTAAT ATCTTTTGGT ACTCCCACCA CCTCTTTGTT ATCGTCTACG CACTGCTTAT  AGTTCACGGG ATTAAACTTT ATCTCACCAA GGAATGGTAC AAGAAAACGA CTTGGATGTA TTTGGCGGTT CCAATCTTGC TCTACGCTTG CGAGAGACTG AAAAGGACAT TTCGATCTCG  TTTTGATCCA GCCAAGATAC TTAAGGTGGC TGCTTATCCT GGTCGTGACG GGGTATTGGC ACTTCGAATG AGGAAGCCTG AAAACTTTAA TTACAAGAGT GGAGAATACA TGTTTGTCAA  GTGTGATGCT GTCTCCCCAT TTGAATGGCA CCCATTTTCC ATTACATCTG CCCCAAGTGA TGACTACCTG AGTGTGCATA TCCGGGCTCT TGGTGATTGG ACTAAAAAAA TTAACAAAAT  CTATTCAGAG GCCTGTTTGC CTGATGAAGG AAGTGAGATT CGTAAAGCTG ATTTTCCGGA ACAAATTCCG AATAACCTAA GAGTTCTAAA AATTGACGGT CCATACGGTG CACCCGCACA  AGACTACAAA GATTACGAAG TGGTGTTGCT AGTGGGCTTA GGCATTGGAG CAACTCCAAT GGTCAGTGTT GTGAAAGATA TTGTGAATAA CATTAAAGCC AAAGAAGAAA AACAAAATGC  ATTGGAAGAT GGTACAATAT CACAAAAGAA CAAACTTAGT CCAACAAGAG AACATGAGTT TAAAACAAAA AGGGCTTACT TCTATTGGTC CACTAAGGGA CAGAATACGT TGGGTTGGTT  TAAAGATGTT ATGGATGAGG TTGCTGAGAT AGGCAAAAAT GATGTCATAC AGATTCACAA TTATTGCACA AGTGTTTACG AGGAAGCAGA TGCGCGATCG TCTTTAATTA CTATGCTTCA  GTCACTCTAT TATGATGAAA AGGGTGTTGA TATTGTATCT GGTACCCGTG TGAAGACTCA TTTTGCTAGA CCGAATTGGC AGAAAGTTTA CAAAAGAATT GCGGATACTC ACAAAGGTTC  CAAAATAGGG GTTTTCTATT GTGGATCACC AGTAGTAATA AAAGAGCTAA AAGAATTAGC TTTAGAATTC ACTGATTCAT CAACCACGTT TGAGTTTCAC AAAGAGAATT TCTAAGAAAA  CTTTCCTTTC TGCCCTTCAA GAAAGAATTT CTAATATTTT ATGTTTTGTG TTTTTTATGC ATATATCCTT ATATAGTATC AGAGTTGTAA ATTAATGATT GAAGACATCC ATGATTGTTG  TCATCCCTCA ATCATGCTGG TTAGTTTGTT GTAAAATTAA GTAAATTTAA TTTATTCAAT TAAACCTTAA TTTCTTGTTG AAAAATGTTT ATGATCTTTT ATACACGTGG GTGACAAGTA  CATTTCTTTT AAAATTTTGA AATGCAGATG CATTCATTGT ATGCAAACAG GGGATGAGAA ACCATTCGAA AGTAGGCAAT TCTAATCAAA GTAGGCCATT CGAAACCAAA AGTCACATAA 
AAA 

Retrieve as FASTA