Entry information : MpalAPx03(LFVP-2012428/IHWO-2002266)
Entry ID 13841
Creation 0000-00-00 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2018-04-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-04-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpalAPx03(LFVP-2012428/IHWO-2002266)
Name MpalAPx03(LFVP-2012428/IHWO-2002266)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia paleacea    [TaxId: 56867 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpalAPx03
start..stop
S start..stop
MpAPx03 499 0 1..250 1..250
EdiAPx01 417 3e-150 3..249 2..248
CmAPx01 416 1e-149 4..249 3..248
AcvAPx01 416 1e-149 4..249 3..248
Literature and cross-references MpalAPx03(LFVP-2012428/IHWO-2002266)
Protein sequence: MpalAPx03(LFVP-2012428/IHWO-2002266)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27549.94  
PI (pH):   %s   5.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAKIYPEVS EEYKVAVEKC KRKLRGFIAE KNCSPLMVRL AWHSAGTFDH KTKTGGPYGT MKNAEELAHG ANAGLNIAVN LLEPIYQQFP ILSYADFVQL AGVVAVEITG GPTIDFHPGR  QDKKESPPEG RLPDATKGPS HLRDIFYAYG LTDKEIVALS GAHTLGRAHK ERSGFDGPWT SNPLIFDNSY FTELLTGEKE GLLQLPSDKA LLEDPKFREF VELYAKDEDA FFADYAEAHQ 
KLSELGFAEE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence genomic and from RNA seq. 1 kP : HWO-2002266 and IHWO-2002265 (Marchantia_paleacea-mycorrizal), HMHL-2004001 and HMHL-2004002 (Marchantia_paleacea-non_mycorrizal)). RNA seq (isotig06446 to isotig064555).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTGCCA AGATATACCC CGAGGTGAGC GAGGAGTACA AGGTCGCCGT CGAGAAGTGT AAGAGAAAGT TGAGGGGCTT CATTGCAGAG AAGAACTGTT CACCTCTGAT GGTTCGATTG  GCATGGCACT CTGCTGGAAC TTTTGACCAC AAGACCAAGA CCGGAGGTCC ATACGGAACC ATGAAGAATG CCGAAGAGTT GGCCCATGGA GCTAACGCAG GTCTGAACAT CGCCGTCAAC  CTGCTCGAGC CTATCTACCA ACAATTCCCC ATCCTCTCGT ACGCCGACTT CGTCCAGCTC GCCGGAGTCG TTGCCGTCGA AATCACTGGA GGACCAACCA TCGACTTCCA CCCCGGTCGT  CAGGACAAGA AGGAATCTCC CCCAGAAGGC AGACTTCCCG ACGCCACCAA GGGCCCAAGC CACTTGCGCG ACATTTTCTA CGCCTATGGA TTGACCGACA AGGAGATCGT TGCACTTTCT  GGTGCTCACA CCTTGGGACG CGCCCACAAG GAACGCTCTG GATTCGATGG ACCCTGGACT TCCAACCCAC TCATCTTCGA CAACTCCTAC TTCACTGAAT TGCTGACCGG AGAGAAGGAA  GGACTTTTGC AGCTGCCTTC AGATAAGGCT CTTCTTGAGG ATCCCAAGTT CCGAGAGTTC GTTGAGTTGT ATGCAAAGGA CGAGGACGCA TTCTTCGCTG ACTACGCTGA AGCGCACCAA 
AAGCTTTCTG AGCTAGGATT CGCTGAGGAG TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTGCCA AGATATACCC CGAGGTGAGC GAGGAGTACA AGGTCGCCGT CGAGAAGTGT AAGAGAAAGT TGAGGGGCTT CATTGCAGAG AAGAACTGTT CACCTCTGAT GGTTCGATTG  GCATGGCACT CTGCTGGAAC TTTTGACCAC AAGACCAAGA CCGGAGGTCC ATACGGAACC ATGAAGAATG CCGAAGAGTT GGCCCATGGA GCTAACGCAG GTCTGAACAT CGCCGTCAAC  CTGCTCGAGC CTATCTACCA ACAATTCCCC ATCCTCTCGT ACGCCGACTT CGTCCAGCTC GCCGGAGTCG TTGCCGTCGA AATCACTGGA GGACCAACCA TCGACTTCCA CCCCGGTCGT  CAGGACAAGA AGGAATCTCC CCCAGAAGGC AGACTTCCCG ACGCCACCAA GGGCCCAAGC CACTTGCGCG ACATTTTCTA CGCCTATGGA TTGACCGACA AGGAGATCGT TGCACTTTCT  GGTGCTCACA CCTTGGGACG CGCCCACAAG GAACGCTCTG GATTCGATGG ACCCTGGACT TCCAACCCAC TCATCTTCGA CAACTCCTAC TTCACTGAAT TGCTGACCGG AGAGAAGGAA  GGACTTTTGC AGCTGCCTTC AGATAAGGCT CTTCTTGAGG ATCCCAAGTT CCGAGAGTTC GTTGAGTTGT ATGCAAAGGA CGAGGACGCA TTCTTCGCTG ACTACGCTGA AGCGCACCAA 
AAGCTTTCTG AGCTAGGATT CGCTGAGGAG TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTCTTGCCC TCTCGTCTCT CCGTCACTGC GTCCTCGTTT GACTCTTCTT CCCCGTTGAG GTTAAAATCG CACATTCTCT CGTGCTATTG GAAACTCGTT CCGTCATCCT GTGTAAAGCT  GATAGTTGAA AGTCTATTGG AAACCCTTGC TCATCAGATC AATCATCAGT AGAGGTTTTC TCAGCTCTGA AGATCAGCCG TCTCGCCTGT CTGTCAACAT GGGTGCCAAG ATATACCCCG  AGGTGAGCGA GGAGTACAAG GTCGCCGTCG AGAAGTGTAA GAGAAAGTTG AGGGGCTTCA TTGCAGAGAA GAACTGTTCA CCTCTGATGG TTCGATTGGC ATGGCACTCT GCTGGAACTT  TTGACCACAA GACCAAGACC GGAGGTCCAT ACGGAACCAT GAAGAATGCC GAAGAGTTGG CCCATGGAGC TAACGCAGGT CTGAACATCG CCGTCAACCT GCTCGAGCCT ATCTACCAAC  AATTCCCCAT CCTCTCGTAC GCCGACTTCG TCCAGCTCGC CGGAGTCGTT GCCGTCGAAA TCACTGGAGG ACCAACCATC GACTTCCACC CCGGTCGTCA GGACAAGAAG GAATCTCCCC  CAGAAGGCAG ACTTCCCGAC GCCACCAAGG GCCCAAGCCA CTTGCGCGAC ATTTTCTACG CCTATGGATT GACCGACAAG GAGATCGTTG CACTTTCTGG TGCTCACACC TTGGGACGCG  CCCACAAGGA ACGCTCTGGA TTCGATGGAC CCTGGACTTC CAACCCACTC ATCTTCGACA ACTCCTACTT CACTGAATTG CTGACCGGAG AGAAGGAAGG ACTTTTGCAG CTGCCTTCAG  ATAAGGCTCT TCTTGAGGAT CCCAAGTTCC GAGAGTTCGT TGAGTTGTAT GCAAAGGACG AGGACGCATT CTTCGCTGAC TACGCTGAAG CGCACCAAAA GCTTTCTGAG CTAGGATTCG  CTGAGGAGTA GAGAAGTCTG AAAACTTACC GTCGCCCAAC TCAGTTCTTA CGTACACTAC TCCTACAGCT ACCTGTGAGA CCATTCGAGC TCTCCAAGAA CACTCTTGAA ATGAAGTCAT  GGCTTCCGGG TACAGATGAC AGCACGTCAA CTTCACCTGT GATTATCTTC GCCCAGATTC ACATACTTAT ATATTCTTAG AACGACACAC ATTTTTAAGT TGTGCCCGAT TTTCGTGTAG  TCGATGAGGT GTACTGAAAG TCCACGGATG GTTTGAGTAC CTTTTTTGTC CTTCACAGAC TTTCGCCAAT AATACGAAAG CTACTCAGCC GCCGACCTTG GTGTATATGA ATATCTTCGC  ATAAATGTGG TCGTATATTC CTTCCGGACT CTGCATATGT TCGTTGTCGT TGGATTTCCG TTCATCTCTA TGTACGAATA CCCATTTTTT AAGAACGAAA TATGTCAAAG ATCTGGATGG  ATTTAGTTTG CCATCGGTAG ATATACTTCG GAACACGGCG CTTAACTGTA TGAACGGTCA GTTTTATCAC AGTAGATTTG AGGTATGAGT AGAAGCTATG AGGAATAATT ATATTTGCTC  GCTCGCGATG TTACTTGCAT TATAATTTGG ACTGATGGTC TTTTAGATTT GATCTCTAGT CTTGCCCTCT CGTCTCTCCG TCACTGCGTC CTCGTTTGAC TCTTCTTCCC CGTTGAGGTT  AAAATCGCAC ATTCTCTCGT GCTATTGGAA ACTCGTTCCG TCATCCTGTG TAAAGCTGAT AGTTGAAAGT CTATTGGAAA CCCTTGCTCA TCAGATCAAT CATCAGTAGA GGTTTTCTCA  GCTCTGAAGA TCAGCCGTCT CGCCTGTCTG TCAACATGGG TGCCAAGATA TACCCCGAGG TGAGCGAGGA GTACAAGGTC GCCGTCGAGA AGTGTAAGAG AAAGTTGAGG GGCTTCATTG  CAGAGAAGAA CTGTTCACCT CTGATGGTTC GATTGGCATG GCACTCTGCT GGAACTTTTG ACCACAAGAC CAAGACCGGA GGTCCATACG GAACCATGAA GAATGCCGAA GAGTTGGCCC  ATGGAGCTAA CGCAGGTCTG AACATCGCCG TCAACCTGCT CGAGCCTATC TACCAACAAT TCCCCATCCT CTCGTACGCC GACTTCGTCC AGCTCGCCGG AGTCGTTGCC GTCGAAATCA  CTGGAGGACC AACCATCGAC TTCCACCCCG GTCGTCAGGA CAAGAAGGAA TCTCCCCCAG AAGGCAGACT TCCCGACGCC ACCAAGGGCC CAAGCCACTT GCGCGACATT TTCTACGCCT  ATGGATTGAC CGACAAGGAG ATCGTTGCAC TTTCTGGTGC TCACACCTTG GGACGCGCCC ACAAGGAACG CTCTGGATTC GATGGACCCT GGACTTCCAA CCCACTCATC TTCGACAACT  CCTACTTCAC TGAATTGCTG ACCGGAGAGA AGGAAGGACT TTTGCAGCTG CCTTCAGATA AGGCTCTTCT TGAGGATCCC AAGTTCCGAG AGTTCGTTGA GTTGTATGCA AAGGACGAGG  ACGCATTCTT CGCTGACTAC GCTGAAGCGC ACCAAAAGCT TTCTGAGCTA GGATTCGCTG AGGAGTAGAG AAGTCTGAAA ACTTACCGTC GCCCAACTCA GTTCTTACGT ACACTACTCC  TACAGCTACC TGTGAGACCA TTCGAGCTCT CCAAGAACAC TCTTGAAATG AAGTCATGGC TTCCGGGTAC AGATGACAGC ACGTCAACTT CACCTGTGAT TATCTTCGCC CAGATTCACA  TACTTATATA TTCTTAGAAC GACACACATT TTTAAGTTGT GCCCGATTTT CGTGTAGTCG ATGAGGTGTA CTGAAAGTCC ACGGATGGTT TGAGTACCTT TTTTGTCCTT CACAGACTTT  CGCCAATAAT ACGAAAGCTA CTCAGCCGCC GACCTTGGTG TATATGAATA TCTTCGCATA AATGTGGTCG TATATTCCTT CCGGACTCTG CATATGTTCG TTGTCGTTGG ATTTCCGTTC  ATCTCTATGT ACGAATACCC ATTTTTTAAG AACGAAATAT GTCAAAGATC TGGATGGATT TAGTTTGCCA TCGGTAGATA TACTTCGGAA CACGGCGCTT AACTGTATGA ACGGTCAGTT 
TTATCACAGT AGATTTGAGG TATGAGTAGA AGCTATGAGG AATAATTATA TTTGCTCGCT CGCGATGTTA CTTGCATTAT AATTTGGACT GATGGTCTTT TAGATTTGAT CTCT 

Retrieve as FASTA