Entry information : Cbra4CxxC03 (g17100/CHBRA207g00130)
Entry ID 13989
Creation 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: Cbra4CxxC03 (g17100/CHBRA207g00130)
Name (synonym) Cbra4CxxC03 (g17100/CHBRA207g00130)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Charophyceae Characeae Chara
Organism Chara braunii    [TaxId: 69332 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Cbra4CxxC03
start..stop
S start..stop
Cbra4CxxC02 255 1e-81 329..487 179..337
Ppa4CxxC01 171 3e-51 332..486 31..187
Mp4CxxC01 179 7e-50 335..486 469..622
Mpal4CxxC01 178 1e-49 335..486 465..618
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 940918..942381 1464  
complement(join(940918..942381)


exon

Literature and cross-references Cbra4CxxC03 (g17100/CHBRA207g00130)
Protein sequence: Cbra4CxxC03 (g17100/CHBRA207g00130)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   487
PWM (Da):   %s   53869.74  
PI (pH):   %s   4.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MASISESQFN GAGASEGFHT PEQREVWRDM WGRYVLSPEV ISLSDGTGST GFLTPPESPV NQDLLCTFSE AVAEMSEEDW NRGRANGDGN FSAYGGRGGF PDRDGQSNWD GDVDELLAAG  NVRSSLGEAG AEPGCTRWAG NGHVLQNSFV SAGVNAGNWE DGIMENGVEE SIGGAEFQSP DENFGEDGIC GAHVENSEEP AAAERTSATG HWKAMKTRHE ARPSPNYVTP QWNRFHPMHR  SSSGKRLRRR GTRVEKLIQQ LERSRQESVR EAEGAEERNS GRQSTLQRIL SSGSSNGYGG SRWSEADMET LPSKWDTVQE EETSRGMYAS VWDSFEVKCP PHGEERIVLY TTKLRAVRKT  YEDCNAIRSL MEGMQVLLDE RDISFSGEFR EELRTLMGRL LPVPRVFIRG RYIGGIDEIR QLNEENLLPK LVEGFEGKKR VPCPQCGDLR YILCSECSGS LKLVVDDDVT RCEKCNENGM 
VRCVACL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron). Prediction confirmed with RNA seq.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCATCAA TATCTGAGAG TCAATTCAAT GGTGCAGGAG CATCAGAGGG GTTTCACACA CCAGAGCAAA GGGAGGTGTG GAGGGATATG TGGGGGCGAT ACGTTCTCTC TCCAGAGGTG  ATCTCTCTGT CTGACGGAAC GGGAAGCACA GGGTTTCTCA CCCCACCGGA ATCTCCTGTG AATCAGGATC TTCTGTGTAC TTTCTCTGAA GCTGTTGCGG AAATGTCCGA GGAGGACTGG  AATCGAGGGC GAGCAAATGG TGATGGAAAT TTTTCTGCAT ATGGGGGTAG GGGAGGGTTT CCAGATAGGG ATGGTCAATC CAACTGGGAC GGAGATGTGG ACGAGTTGTT AGCCGCTGGA  AATGTTAGAT CGTCGCTCGG TGAAGCAGGT GCAGAGCCAG GTTGTACAAG GTGGGCAGGA AATGGTCATG TACTTCAGAA CTCTTTTGTG TCCGCGGGAG TTAACGCTGG CAATTGGGAA  GATGGGATCA TGGAGAATGG GGTCGAGGAG AGCATCGGTG GTGCAGAGTT CCAGTCCCCA GATGAGAACT TTGGGGAGGA CGGTATTTGT GGAGCGCACG TAGAGAATTC TGAGGAGCCA  GCAGCGGCGG AGCGGACTAG TGCCACAGGC CACTGGAAGG CCATGAAAAC CCGTCATGAA GCAAGGCCCT CCCCTAATTA TGTTACCCCT CAGTGGAACC GGTTTCATCC CATGCACAGG  AGCTCTTCTG GCAAACGCCT GAGACGACGA GGAACGCGCG TCGAGAAGCT TATTCAGCAG TTAGAGAGGT CACGACAAGA ATCGGTGAGA GAGGCAGAAG GCGCAGAAGA GAGGAATTCT  GGACGGCAAA GTACACTGCA ACGGATATTG TCCAGTGGAT CTTCGAATGG ATATGGTGGC TCACGATGGA GCGAGGCTGA TATGGAAACT CTGCCGTCAA AATGGGACAC GGTGCAGGAA  GAAGAAACCA GTCGGGGAAT GTACGCATCG GTGTGGGACT CATTTGAAGT TAAGTGTCCT CCGCACGGGG AAGAGCGGAT TGTCCTGTAC ACGACGAAAC TTCGAGCAGT AAGAAAAACA  TATGAAGACT GCAATGCCAT TCGAAGTCTC ATGGAGGGCA TGCAAGTGTT ACTGGACGAG AGAGACATAT CGTTCTCAGG GGAGTTTCGC GAAGAACTGA GGACGCTTAT GGGTCGTCTG  CTCCCGGTGC CAAGGGTGTT CATCCGGGGT AGGTATATCG GAGGGATAGA TGAGATAAGG CAGTTGAACG AGGAAAATCT ACTTCCAAAA CTTGTGGAAG GATTTGAAGG AAAGAAGAGA  GTACCTTGCC CGCAGTGTGG CGATCTTAGG TACATCCTCT GTTCCGAATG CAGCGGGAGC TTGAAGCTTG TTGTCGATGA TGATGTGACT CGATGCGAGA AATGCAACGA GAACGGCATG 
GTTAGATGTG TTGCCTGTTT GTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCATCAA TATCTGAGAG TCAATTCAAT GGTGCAGGAG CATCAGAGGG GTTTCACACA CCAGAGCAAA GGGAGGTGTG GAGGGATATG TGGGGGCGAT ACGTTCTCTC TCCAGAGGTG  ATCTCTCTGT CTGACGGAAC GGGAAGCACA GGGTTTCTCA CCCCACCGGA ATCTCCTGTG AATCAGGATC TTCTGTGTAC TTTCTCTGAA GCTGTTGCGG AAATGTCCGA GGAGGACTGG  AATCGAGGGC GAGCAAATGG TGATGGAAAT TTTTCTGCAT ATGGGGGTAG GGGAGGGTTT CCAGATAGGG ATGGTCAATC CAACTGGGAC GGAGATGTGG ACGAGTTGTT AGCCGCTGGA  AATGTTAGAT CGTCGCTCGG TGAAGCAGGT GCAGAGCCAG GTTGTACAAG GTGGGCAGGA AATGGTCATG TACTTCAGAA CTCTTTTGTG TCCGCGGGAG TTAACGCTGG CAATTGGGAA  GATGGGATCA TGGAGAATGG GGTCGAGGAG AGCATCGGTG GTGCAGAGTT CCAGTCCCCA GATGAGAACT TTGGGGAGGA CGGTATTTGT GGAGCGCACG TAGAGAATTC TGAGGAGCCA  GCAGCGGCGG AGCGGACTAG TGCCACAGGC CACTGGAAGG CCATGAAAAC CCGTCATGAA GCAAGGCCCT CCCCTAATTA TGTTACCCCT CAGTGGAACC GGTTTCATCC CATGCACAGG  AGCTCTTCTG GCAAACGCCT GAGACGACGA GGAACGCGCG TCGAGAAGCT TATTCAGCAG TTAGAGAGGT CACGACAAGA ATCGGTGAGA GAGGCAGAAG GCGCAGAAGA GAGGAATTCT  GGACGGCAAA GTACACTGCA ACGGATATTG TCCAGTGGAT CTTCGAATGG ATATGGTGGC TCACGATGGA GCGAGGCTGA TATGGAAACT CTGCCGTCAA AATGGGACAC GGTGCAGGAA  GAAGAAACCA GTCGGGGAAT GTACGCATCG GTGTGGGACT CATTTGAAGT TAAGTGTCCT CCGCACGGGG AAGAGCGGAT TGTCCTGTAC ACGACGAAAC TTCGAGCAGT AAGAAAAACA  TATGAAGACT GCAATGCCAT TCGAAGTCTC ATGGAGGGCA TGCAAGTGTT ACTGGACGAG AGAGACATAT CGTTCTCAGG GGAGTTTCGC GAAGAACTGA GGACGCTTAT GGGTCGTCTG  CTCCCGGTGC CAAGGGTGTT CATCCGGGGT AGGTATATCG GAGGGATAGA TGAGATAAGG CAGTTGAACG AGGAAAATCT ACTTCCAAAA CTTGTGGAAG GATTTGAAGG AAAGAAGAGA  GTACCTTGCC CGCAGTGTGG CGATCTTAGG TACATCCTCT GTTCCGAATG CAGCGGGAGC TTGAAGCTTG TTGTCGATGA TGATGTGACT CGATGCGAGA AATGCAACGA GAACGGCATG 
GTTAGATGTG TTGCCTGTTT GTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGCGGGCATA CCAAGGAGGT CAAGGACGAT AGTCTCCCCG AGGGTCTCTG GCGGAATCTC ACAAAGGGAG TGGCCAGTTG ACCCTACGGC CATGGCATCA ATATCTGAGA GTCAATTCAA  TGGTGCAGGA GCATCAGAGG GGTTTCACAC ACCAGAGCAA AGGGAGGTGT GGAGGGATAT GTGGGGGCGA TACGTTCTCT CTCCAGAGGT GATCTCTCTG TCTGACGGAA CGGGAAGCAC  AGGGTTTCTC ACCCCACCGG AATCTCCTGT GAATCAGGAT CTTCTGTGTA CTTTCTCTGA AGCTGTTGCG GAAATGTCCG AGGAGGACTG GAATCGAGGG CGAGCAAATG GTGATGGAAA  TTTTTCTGCA TATGGGGGTA GGGGAGGGTT TCCAGATAGG GATGGTCAAT CCAACTGGGA CGGAGATGTG GACGAGTTGT TAGCCGCTGG AAATGTTAGA TCGTCGCTCG GTGAAGCAGG  TGCAGAGCCA GGTTGTACAA GGTGGGCAGG AAATGGTCAT GTACTTCAGA ACTCTTTTGT GTCCGCGGGA GTTAACGCTG GCAATTGGGA AGATGGGATC ATGGAGAATG GGGTCGAGGA  GAGCATCGGT GGTGCAGAGT TCCAGTCCCC AGATGAGAAC TTTGGGGAGG ACGGTATTTG TGGAGCGCAC GTAGAGAATT CTGAGGAGCC AGCAGCGGCG GAGCGGACTA GTGCCACAGG  CCACTGGAAG GCCATGAAAA CCCGTCATGA AGCAAGGCCC TCCCCTAATT ATGTTACCCC TCAGTGGAAC CGGTTTCATC CCATGCACAG GAGCTCTTCT GGCAAACGCC TGAGACGACG  AGGAACGCGC GTCGAGAAGC TTATTCAGCA GTTAGAGAGG TCACGACAAG AATCGGTGAG AGAGGCAGAA GGCGCAGAAG AGAGGAATTC TGGACGGCAA AGTACACTGC AACGGATATT  GTCCAGTGGA TCTTCGAATG GATATGGTGG CTCACGATGG AGCGAGGCTG ATATGGAAAC TCTGCCGTCA AAATGGGACA CGGTGCAGGA AGAAGAAACC AGTCGGGGAA TGTACGCATC  GGTGTGGGAC TCATTTGAAG TTAAGTGTCC TCCGCACGGG GAAGAGCGGA TTGTCCTGTA CACGACGAAA CTTCGAGCAG TAAGAAAAAC ATATGAAGAC TGCAATGCCA TTCGAAGTCT  CATGGAGGGC ATGCAAGTGT TACTGGACGA GAGAGACATA TCGTTCTCAG GGGAGTTTCG CGAAGAACTG AGGACGCTTA TGGGTCGTCT GCTCCCGGTG CCAAGGGTGT TCATCCGGGG  TAGGTATATC GGAGGGATAG ATGAGATAAG GCAGTTGAAC GAGGAAAATC TACTTCCAAA ACTTGTGGAA GGATTTGAAG GAAAGAAGAG AGTACCTTGC CCGCAGTGTG GCGATCTTAG  GTACATCCTC TGTTCCGAAT GCAGCGGGAG CTTGAAGCTT GTTGTCGATG ATGATGTGAC TCGATGCGAG AAATGCAACG AGAACGGCAT GGTTAGATGT GTTGCCTGTT TGTGAAAAAT  TATTTTTGAC GGTTGTACTT GTAGTCCATG AAACGCACCT CAAGGGAGTA AGAGGTGCAT TGCGCTTCAT TTCCGACTTC CGTGCTGACA TTTGTAAGTA TCAGATCTTC AGTTCGTGAT  TAGGTCATCG AGTCACAGCG CACGTGATGA ATCATTCTAT TGAGGGTGAT TGCATTACTC ATCCTCCTCC GGAAGTAGAG TAGCACAGTC TTAGGAGCCT AATCTTCATA GCTGCGAAGC  TTGTGAGAAT TGTTGCATCC GCTGGAGAAG CCGAGATTGT AGAGTCTTGT AGAGAGTGAT CGTGGCTGGA ACTGAGGCCA GGAGTGTAAG CTTGCCACAT TGTAATTTGT TTTTTTGGAT  AGCGTGCTGT GGAAAGAGCT CTTTTCCATG CACATCTCAG AACTCCGTTT ATGTTTAGCA ACAAGGATGG TTTAGTCTAT CTGACTCAGA GATCTGAACA GTAGGATGAC AGATGGCCAC  ATTGAAAGGA CCGCTTCTGA CTCTCTCCAA CTACCCCCTC CATGTTGTTT ACCTCTCCTG GGAGGCCTGG TGTGTTTGTG TGTGTGGAGG GAAGCAGGTG CCCCACAGAC TTTCCGTCTT  CAATGTATTT GACGGAAGAC TGAGGATTTT TGTAACGTAG CTCACGACAT TGTTAGTGAG TGCAAGCTGC AGCAACCTCT TGACATATGA ATCCTACCCG ATGCTCAGTT GCTGTGGTTT  CAAAATTGCT ATTTCCCAAC TCCGATAACA TCTATTGTCG GCGGTCTCAT CTTGAGGGTA CCTGCTTAAC TCACTTAAGG AGAGGAGGAA ATATCTCAGC TGAAGAGAAA TGGCCTTCAT  ACTAGTTTTT ATTTGGAGGA GTTGAGTGAT TGAGTCATGT AAGGTGTGAC TCCAATCTGG TACTGTATCG GAGATCCATG CCAAGGTAAT GCTTTGGAGC ACTACCTCTT GGGAAACGGA  ATGAGCAGGG GACAAGAGCG GTGGAAGAAT GAGAGCAAGC AGTAGGTAAC GATCTCGACT GCCCCCAAAT AAGATCATCC GTGACTCAGT TATTCGTTAC GCATACTTGT GGGAGCGTTG  TTGTTTATTA GAATCTTCCT GCACCTGCTT CCCGCTGCCT TCAAGTAATT GGTTCTCTCT GTTTGTGTGT TAGGTAGGTA CATTGTTATA CGTAACCAGT TCCAGTATTT AGGTTTAATG  AAGACAAGTT AGATTCTTAT AACTGCAGTC CAATTTGGGA TTTCAGCTGT TCCATTGACT ACGAACCAGG AAAACAACTA AGTGATCACC CGACCCTAAA CTCAAAATGA CCCAGAAGGT 
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGn 

Retrieve as FASTA