Entry information : Cbra4CxxC04 (g6309/CHBRA141g00450)
Entry ID 13990
Creation 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: Cbra4CxxC04 (g6309/CHBRA141g00450)
Name (synonym) Cbra4CxxC04 (g6309/CHBRA141g00450)
Class 4CxxC Grx    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Charophyceae Characeae Chara
Organism Chara braunii    [TaxId: 69332 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value Cbra4CxxC04
start..stop
S start..stop
Cbra4CxxC01 219 7e-69 353..512 32..198
Mpal4CxxC01 160 4e-43 368..511 476..618
Thas4CxxC11-2 152 1e-42 368..511 132..276
Ppa4CxxC01 148 2e-42 368..512 45..188
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1965367..1966911 1545  
complement(join(1965367..1966911))


exon

Literature and cross-references Cbra4CxxC04 (g6309/CHBRA141g00450)
Protein sequence: Cbra4CxxC04 (g6309/CHBRA141g00450)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   514
PWM (Da):   %s   56350.4  
PI (pH):   %s   4.15
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MVQDKVRRSY SLSKTIGKQH HQYADEYNID AAVDLHSEYY DDDEGDGEVD DAVFDPDSIP PSALDVNTCR DLYNQDDFEM KGIVSLQGSS MSDWEEMIAA DDYNGEVIDD CATSGVQHMC  SKPARAISSE LGERSDEQSG TTGSIVSDQR RCQLPSDDVL LERCANDNAT IDASEPFVLG TRVRRVSDGV EELAMAVLAM AAEDGWSIAD GLQTSTPGHG AAALSDDMSE TDDTDGAYPE  RMCADAFSAC GGDEDEEMHD GGLDVASTFQ TGNVIGTERM DTESAGEVEQ GEWNGSDSSY ELPEVVVKAR KRAPQDWVVV GMGNDLGGHA SKTKRDLSIY AERTGESPFI RPLSREAIQN  ILGDACTKLV FYSTSMRAVR KTFDGCQEVR QILKCHAVEV DERDVSIDSG YREELRKLLG VRTIQLPQVF IKGRYIGGLE EVHQMNETEE LTALLEGMPR RSPYDLCEGC ADLRFLVCTA 
CHGSRKVILP DLSTERCSNC NEYGLERCPI CNHS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTCCAGG ATAAGGTGAG AAGATCTTAT AGCTTGTCGA AGACCATCGG CAAGCAACAT CACCAGTATG CGGATGAATA CAACATAGAT GCGGCAGTCG ATCTCCACAG CGAGTATTAT  GATGACGATG AGGGTGATGG GGAAGTTGAT GATGCTGTGT TCGATCCCGA CAGTATTCCG CCGTCAGCAT TGGACGTGAA CACGTGTCGT GATTTGTACA ATCAAGACGA TTTCGAAATG  AAGGGTATTG TTAGCCTGCA GGGCTCCTCG ATGAGTGACT GGGAGGAGAT GATTGCTGCA GATGACTATA ACGGAGAGGT TATTGATGAT TGTGCAACGA GTGGAGTTCA GCATATGTGC  AGCAAGCCTG CAAGGGCTAT ATCCTCTGAG TTAGGAGAGA GGAGTGACGA GCAAAGTGGA ACAACAGGCT CTATTGTAAG CGACCAGCGT CGATGCCAGT TGCCATCCGA TGATGTCCTT  CTTGAAAGGT GTGCAAATGA TAATGCGACA ATAGACGCTA GTGAACCCTT TGTACTTGGT ACAAGAGTAC GTAGGGTCTC AGATGGAGTA GAGGAACTGG CAATGGCTGT CCTTGCAATG  GCAGCAGAAG ACGGGTGGTC AATCGCGGAT GGCCTCCAGA CGTCTACGCC CGGACATGGG GCTGCTGCAC TTTCCGATGA CATGTCTGAG ACGGATGACA CTGATGGGGC CTACCCTGAA  CGAATGTGTG CAGACGCATT TTCTGCCTGT GGTGGGGACG AAGATGAAGA AATGCACGAT GGGGGCTTAG ATGTTGCAAG TACTTTTCAA ACAGGGAATG TTATCGGAAC AGAACGAATG  GACACCGAGT CGGCAGGAGA AGTGGAGCAA GGGGAGTGGA ACGGAAGCGA CTCGTCTTAT GAGCTTCCAG AGGTGGTTGT CAAAGCGCGA AAGAGGGCAC CGCAGGATTG GGTGGTGGTT  GGGATGGGTA ACGACCTGGG GGGGCACGCA AGTAAGACAA AGAGGGATCT GTCCATTTAT GCCGAAAGGA CCGGGGAGAG TCCTTTTATC CGTCCGCTCT CCCGAGAAGC GATACAGAAT  ATTCTGGGAG ATGCATGCAC AAAGTTGGTA TTCTACTCTA CTTCAATGCG GGCTGTACGA AAGACGTTTG ACGGTTGTCA GGAGGTTCGA CAGATACTGA AATGCCACGC CGTGGAAGTC  GACGAGAGAG ATGTCAGCAT CGACTCTGGC TACCGGGAAG AACTGAGGAA GCTGTTGGGG GTGCGAACCA TTCAGCTCCC ACAGGTCTTC ATCAAGGGTC GTTACATTGG TGGCCTTGAA  GAGGTCCATC AGATGAATGA AACAGAGGAA TTGACTGCTC TGCTGGAGGG TATGCCAAGA CGATCCCCTT ATGACCTCTG TGAAGGCTGC GCTGATCTTC GCTTCCTTGT GTGCACCGCT 
TGCCATGGAA GCCGGAAGGT TATCCTTCCT GACTTGTCGA CAGAGCGGTG CTCTAACTGC AATGAGTATG GACTTGAAAG GTGCCCTATC TGTAACCACA GTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTCCAGG ATAAGGTGAG AAGATCTTAT AGCTTGTCGA AGACCATCGG CAAGCAACAT CACCAGTATG CGGATGAATA CAACATAGAT GCGGCAGTCG ATCTCCACAG CGAGTATTAT  GATGACGATG AGGGTGATGG GGAAGTTGAT GATGCTGTGT TCGATCCCGA CAGTATTCCG CCGTCAGCAT TGGACGTGAA CACGTGTCGT GATTTGTACA ATCAAGACGA TTTCGAAATG  AAGGGTATTG TTAGCCTGCA GGGCTCCTCG ATGAGTGACT GGGAGGAGAT GATTGCTGCA GATGACTATA ACGGAGAGGT TATTGATGAT TGTGCAACGA GTGGAGTTCA GCATATGTGC  AGCAAGCCTG CAAGGGCTAT ATCCTCTGAG TTAGGAGAGA GGAGTGACGA GCAAAGTGGA ACAACAGGCT CTATTGTAAG CGACCAGCGT CGATGCCAGT TGCCATCCGA TGATGTCCTT  CTTGAAAGGT GTGCAAATGA TAATGCGACA ATAGACGCTA GTGAACCCTT TGTACTTGGT ACAAGAGTAC GTAGGGTCTC AGATGGAGTA GAGGAACTGG CAATGGCTGT CCTTGCAATG  GCAGCAGAAG ACGGGTGGTC AATCGCGGAT GGCCTCCAGA CGTCTACGCC CGGACATGGG GCTGCTGCAC TTTCCGATGA CATGTCTGAG ACGGATGACA CTGATGGGGC CTACCCTGAA  CGAATGTGTG CAGACGCATT TTCTGCCTGT GGTGGGGACG AAGATGAAGA AATGCACGAT GGGGGCTTAG ATGTTGCAAG TACTTTTCAA ACAGGGAATG TTATCGGAAC AGAACGAATG  GACACCGAGT CGGCAGGAGA AGTGGAGCAA GGGGAGTGGA ACGGAAGCGA CTCGTCTTAT GAGCTTCCAG AGGTGGTTGT CAAAGCGCGA AAGAGGGCAC CGCAGGATTG GGTGGTGGTT  GGGATGGGTA ACGACCTGGG GGGGCACGCA AGTAAGACAA AGAGGGATCT GTCCATTTAT GCCGAAAGGA CCGGGGAGAG TCCTTTTATC CGTCCGCTCT CCCGAGAAGC GATACAGAAT  ATTCTGGGAG ATGCATGCAC AAAGTTGGTA TTCTACTCTA CTTCAATGCG GGCTGTACGA AAGACGTTTG ACGGTTGTCA GGAGGTTCGA CAGATACTGA AATGCCACGC CGTGGAAGTC  GACGAGAGAG ATGTCAGCAT CGACTCTGGC TACCGGGAAG AACTGAGGAA GCTGTTGGGG GTGCGAACCA TTCAGCTCCC ACAGGTCTTC ATCAAGGGTC GTTACATTGG TGGCCTTGAA  GAGGTCCATC AGATGAATGA AACAGAGGAA TTGACTGCTC TGCTGGAGGG TATGCCAAGA CGATCCCCTT ATGACCTCTG TGAAGGCTGC GCTGATCTTC GCTTCCTTGT GTGCACCGCT 
TGCCATGGAA GCCGGAAGGT TATCCTTCCT GACTTGTCGA CAGAGCGGTG CTCTAACTGC AATGAGTATG GACTTGAAAG GTGCCCTATC TGTAACCACA GTTAG 

Retrieve as FASTA