Entry information : PpaENODL10Pp3c5_1950
Entry ID 14075
Creation 2016-10-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-26 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PpaENODL10Pp3c5_1950
Name PpaENODL10Pp3c5_1950
Class Early nodulin    [Orthogroup: ENODL001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaENODL10
start..stop
S start..stop
PpaENODL12 209 4.75e-61 19..521 16..502
PpaENODL14 81 6.7e-17 1..151 1..145
HaCRX08 66 0.00000000000155 24..185 18..164
HaCRX07 64 0.00000000000644 16..153 4..135
Literature and cross-references PpaENODL10Pp3c5_1950
Protein sequence: PpaENODL10Pp3c5_1950
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   541 (507)
PWM (Da):   %s   59431.48 (55668.5) Transmb domain:   %s   o178-200i
PI (pH):   %s   8.17 (7.76) Peptide Signal:   %s   cut: 35 range:35-541
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAMKFTAAR CVRVTLNQLI IVLSLQFSSS QAQAKSVRVG GEQGWTSIDS ATGLVRDYAD WAASQVLFVQ DSLEFHFTPG ACSLFRFQSQ VALDGCDFTN GVFLFDLNST SPVKVTLTES  VVHYLGCGRK TASGVSHCQL GQSFAVVVHS SRARRQLADL SPGPGPDEAS TKSSSNNTTT IAAVICVLLI VIGGILVCYC MRNRRIVQNT TLRKRVSNTD LQEVISNITH GNAAVTVFSL  KELEKATENF GEHLVLGLGG FGTVYKGTLR NGMVHVAIKV SNSASKSGKK QLMNEISILS QTSHPNLVKL FGCCVETEVP ILVYEYIPNG NLFEHLHRLR FGVNLNWAKR LQIASETADA  LAYLHFAAQP PIYHRDVKSA NILLSNTFSV KVADFGISRL TSPEKTHVST AVQGTPGYLD PEYFHSYHLT DKSDVYSFGV VLMELITSQK PLDYHRGDEH SLAAYAIPII KEGNIDMIID 
PQLKEPRDEY EKSLPIIQCV AEVAMDCLAE KRKDRPTMRM VADDLQSIKS FARRNVSGRN V* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTAGTCTTG TGGTCGATTC CTCCCAGAGC TTGTGGCTGC TCGCCGCAAC TTGCTGCAAT TGTTGCAGTT CTTTATATCT GGATCGAGAG ATGAGGCATG GAAGCAAGAT GCAACAAATG  GATGCGAAGA AGGGGAGGGA GGGATGATCG TGGAGCTTGG ATTCTGAAAC CCATCTCTTC ATTCCGGAGC AGGACGTGTC CAGCTGCAGC AAGACATGAA TTTGGGGTTT GAGCGGCGCA  TGCGTCCACT CGCGAGAAAC GCCGATGCAC GCGCGAGTCT AAAATAAGGT AACCAGGATG CTATAACCAC ACAGTGCAGC AGGACAGGTT ACAAGAATTG CTGGGAGAGA AAGTTGGCAT  AATTGGTTTC GTGCCCAGCG CCAATTTGAC CTGCTTTCCA GGCGCGGAGA TGTCATATTT GGCACTTGTG ACGCTGCAGG TCCCTAGATC CCTGCTGTCG TGTCTGTCCC GCGTCTTTGC  ATCCAGGTGC ATTTGGGTTT CAAGGCTCCG GGTTTACACC GGTGCGCGCG AGAGAACTGA TCTCAAGCTC TCCGAGCACT GTTGATGATC TAATCGCATG ATGGATCGCT TGGTTTCGTA  AACTTCGACT GCGTGTGTGA CTGCGACGCA AAGATTCTCC TGCACACAGT GTTAGCCTGC TAGATTCTAG AGCCATTACC CTTCTCGAGT GTTCGGCATT AGCTTGGTTT CACGAATAGA  GTAGTGTGCA GTTGATGGTG GTTTGATCTT GAGGATACAA TGGGAGGTTT ATCGCCCGTG GCGTGCACTA GCTTGAAGCT AGAATGTCGA CTATCGTTGT CTGCTTCTAG GATAGGTGCC  ATGGGTTGAT GGATGTGAAG AGGTTCTTGC GCCGCTGCAA CGAGACTGGG TTGGGTCGGT GGAGCTCCTC GCCATCTCCT TGTGCGAGCT CTGATTACAT GCGAGGAGGT GAGACGAGAT  CTGATCGAAT CTAGTGGAAA ATTGTCAGGG ATGTGAATGT TGTTTGGCTC TTTCGGGTTG TGATTCCGCT GGTCATGCCA ATGCACCCTA ATCGCCCTTT TGGAAAGCCT CATCTGCAGT  ATTCCTCACA AAAGGTAGTC TTCAGAAGTG TTGCGCTCAA CAGTCAGCTG TGAACAGTCG CATTCAAATA TCATTTGATC CTCTCACGGT GTTTCTTTTT TGAAACAATT TGGGATTCAT  GCCTCTCTCC CGGCATATGT CCGCAAGATT CGGCAGGTTT AAAATGTCGA ACTAGCAAAC TTACCGCGCC CTTGGGGGAA TCGTGCGCAG AGACGAAATA GCTCCGCCAT GGGTGCCATG  AAATTTACAG CCGCTCGTTG TGTACGAGTT ACGTTGAACC AGTTAATTAT TGTGCTTAGC TTGCAATTTT CAAGCAGCCA GGCGCAGGCA AAGTCGGTGA GGGTAGGAGG GGAACAAGGC  TGGACAAGTA TTGACTCCGC AACAGGACTT GTTCGTGATT ATGCCGATTG GGCTGCTTCT CAAGTTCTGT TCGTTCAAGA CTCACTTGGT ACGAAACTGA TCTTTGTATA CCTCTAAGAC  CCCCGGTTTT ATCTATTTTT GGTTTTGTGT GTTTGTATGT AAAAGCACAC ATTTTCCTGG CTGGTTCCAG AAACAACGAA ACTTGGGATA ACAGGAAGTC AGTATTTTGC TGCATCCTCA  TGTACTGTTT TGATGCAGAA TTCCATTTCA CTCCTGGGGC TTGCAGTTTG TTCCGATTTC AGTCGCAGGT AGCCCTCGAT GGGTGCGATT TTACGAACGG CGTGTTTTTG TTTGATCTTA  ATTCCACCAG CCCTGTCAAG GTGAGAGAAC TCCGCCTCCG CCTTCTCTGA ACTGTCTCAA TAACGGTCTC TCTCCATTGT CCGACGTAGT CTTCCACAAT CTGAAATACC CTATTTGTTA  GATTTAAATT CCGTATCTAG TCACGTCTGA GTAGTGCAAA ATTGTGTTTG AACTCCGTCC GTGTATTGAA GGCATCATCA AAACAGGTCA TGCTTTTCAC TGTTAACTCG CGGTTTCCTC  CAAACAGGTT ACTTTGACAG AATCAGTCGT ACATTATTTA GGATGTGGAA GAAAAACGGC CAGCGGAGTT TCACATTGCC AATTAGGTCA AAGTTTTGCA GTGGTTGTTC ACAGCTCCAG  GGCTCGAAGA CAACTTGCAG ATTTGAGTCC TGGCCCGGGT CCTGATGAGG CATCGACCAA AAGTAGCAGT AACAACACTA CAACAATAGC AGGTTCGAGC ACAGAACCTT TTGAGAGTCC  CTTCTCACCA ATTTGGACCA GTTGAATGCA GGCTAGTCCA TCTCTAACAA TTGTTCGGTG TTTTTGCAGC CGTCATCTGT GTTTTGCTAA TTGTAATTGG AGGAATCCTT GTATGCTACT  GCATGCGAAA TCGAAGAATA GTGCAGAACA CAACTCTTAG GAAGCGGGTG TCCAATACGG ATCTCCAGGA AGTTATATCT AATATCACTC ATGGGAATGC AGCAGTTACT GTCTTCTCCT  TGAAAGAGCT TGAAAAAGCA ACTGAAAATT TTGGAGAGCA CCTTGTTCTT GGCCTCGGCG GCTTTGGCAC GGTGTATAAG GGCACATTGA GAAACGGCAT GGTTCATGTT GCCATCAAAG  TGTCCAACTC TGCCAGTAAA AGCGGCAAGA AACAGCTCAT GAATGAGATT TCTATTTTGT CGCAGACCAG TCACCCTAAT CTGGTGAAAC TATTCGGGTG CTGTGTTGAG ACGGAGGTCC  CGATTCTTGT GTATGAGTAC ATCCCAAACG GAAATCTATT CGAGCACTTG CATAGACTGA GGTTTGGAGT GAACCTCAAC TGGGCCAAGC GTTTGCAAAT TGCATCTGAG ACTGCTGACG  CACTTGCCTA TCTCCACTTT GCTGCACAGC CTCCTATTTA TCACCGTGAT GTGAAGTCAG CTAACATATT GCTAAGCAAC ACCTTTTCTG TCAAGGTTGC AGACTTTGGC ATATCTCGTT  TGACGAGCCC TGAGAAAACG CATGTCTCCA CAGCCGTTCA GGGCACCCCA GGTTATCTCG ACCCCGAGTA CTTCCACAGC TATCACCTAA CGGACAAAAG CGACGTCTAC AGCTTCGGTG  TGGTCTTAAT GGAGCTTATC ACGTCCCAGA AACCCCTGGA CTACCATAGA GGAGACGAAC ACAGCTTGGC AGCATATGCT ATACCTATCA TCAAGGAAGG AAACATAGAC ATGATCATAG  ATCCTCAGCT TAAGGAGCCG AGGGATGAGT ATGAGAAGTC ATTGCCGATA ATACAGTGCG TGGCCGAGGT AGCTATGGAT TGTTTAGCAG AGAAGAGGAA GGATCGTCCT ACCATGAGGA  TGGTTGCCGA CGACCTTCAA AGCATCAAGA GCTTTGCTCG GCGAAATGTC TCTGGACGGA ACGTGTGAAC CGCGCAACTC AATGACAATC TGAGTTTTTC TGCCAGCATT TAATCAATGC  TCTACTCTTC TCTCACAAGA ACTACATATA CCGGCGGGTC ACTTGAATGG GTTTTGCGAC TCGCCACGTG AAATAGAAGC ATGACGTGAT CATCAATTGC ATGCCCAGAT TATGGCACGA  AGATTACAAT GTAGAGCATA TTTTGTACTT TTAACGAGTT TGTAGTTATA AACAAGTGCA CATGGATAGT GAGTAAGAGT CATCTGACCA CGAACGTCCC CTGCTGCATG AGTTCAGCGA  GCTTTGGCTA TCTGCATTGA AGCTTGCCTA AGAATTCGTT GCAGCAGGTC ATTCAAAGTT CTTAAACTCC ACTTGTCCAT CTCTAGGAGT TATCATCCTC ATAGGTGAGT TGAGTCACAT  TTGTTCTCTT CGATTGAGCG ATTCTCTTGC CAAGATGCTG ACGCATTTTC CATCTTTTTG ACAAATGATG AAGGAATTCT TATCAATGTA GCATGCAGTG TGGATGCAAA AACTGCCGTT  CTCAGTACCA TCGGATGTAC AGGCAATACT AATTTTCTGC ATGTCTTTTC CTGTCAACCG CATTTTGATT TCCAGTCATG ATGTATCATA AGGAATGTTT GGGTGTTCTC ATAGATATTC 
AAG 

Retrieve as FASTA