Entry information : PpaTrx03 (Pp3c23_21190/NTRC)
Entry ID 14211
Creation 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-11-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PpaTrx03 (Pp3c23_21190/NTRC)
Name (synonym) PpaTrx03 (Pp3c23_21190/NTRC)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: Trx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaTrx03
start..stop
S start..stop
PpaTrx04 992 0 1..571 1..565
AtTrx03 764 0 125..571 83..528
ThasTrx03-1 760 0 99..571 39..507
HaTrx08 758 0 106..571 72..542
Literature and cross-references PpaTrx03 (Pp3c23_21190/NTRC)
Cluster/Prediction ref. Genebank:   5948454 Phytozome Gene 12:   32949550
Protein sequence: PpaTrx03 (Pp3c23_21190/NTRC)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   573
PWM (Da):   %s   61365.1  
PI (pH):   %s   6.84
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVACAASASV YAGASTTLGV ITGGSVVARG ASGAAPGAVF CSCSSSSSSS EAWIGFRQHG ALRSDGVGSI RGLASGVFAR RFRVHVAGQR MGSSSRTGAR SAGVPRADVA AGEKRSGTAE  PVGGVENLVI IGSGPAGYTA AIYAARANLK PVVFEGYQIG GVRGGQLMTT TEVENFPGFP EGVTGPELMD RMRKQAERWG AELRTEDVEY VDVRNRPFTV RSSDSEVKCH SIIIATGATA  KRLGLPREHE FWSRGISACA ICDGASPIFK GQELAVVGGG DTATEESLYL TKYAAHVHLL VRKDKLRASK AMQDRVINNP NITVHFNTET VDIEADDKGQ MGGLRLRDLV TGEGRSLKVR  GLFYGIGHSP NSQLLEGQVE LDDASYVVVE PGTTNTSVEG VYAAGDLQDH EWRQAITAAG SGCMAALSVE RYLAANDLLV EFHQPAQEEV KKKELTKEDI DQKFDITMTK HKGQYALRKL 
YHESPRVIGV LYTAPTCGPC RSLKPILNKV IDEYPNEVHF VEIDIEEDPE IAEAGGIMGT PTVQFFKNKQ MIKSISGVKM KKEYREIIEA NLK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (9 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGT GTGCTGCTTC TGCATCTGTC TATGCAGGGG CAAGCACGAC GTTGGGGGTG ATTACAGGGG GGAGTGTTGT TGCCCGAGGG GCGAGTGGCG CCGCGCCTGG AGCTGTGTTC  TGTAGCTGCT CTTCGTCGTC GTCGTCGTCG GAGGCGTGGA TTGGGTTTCG GCAGCATGGC GCTCTTCGGT CCGATGGAGT GGGCAGCATT AGGGGATTGG CCTCCGGGGT ATTCGCCAGA  AGGTTTAGGG TGCATGTTGC AGGGCAGAGA ATGGGGAGTA GCTCGAGGAC AGGGGCGCGC AGCGCTGGAG TCCCGCGTGC GGACGTTGCT GCTGGGGAGA AGCGGTCTGG CACTGCAGGT  TTAATCGGCC CTCAATTTAG CTGCTGTGTT CGTGGTTCAG AAATTGATTA GCTGGGGGAT TGGTTTGTTT GAGTTTTTGG GTGCCCGCTC AATGGCTGAA TTGGAGTATG CAGCGTGATC  TGATTGGGGG TGGGGGAGTT CGTTGTTCCT TAGAAGGCAA TGTAGGACGA AAAGAACCCC AGATTCCCTT CTGTGGGTCA ACGGGACGTT CGCCTGGATT AACCCACTTG GTGATAAGTT  TTTCAAAATA TCTTCTATAG GACTCAACTG CAGGGTTGTA ATCTTCAATT GGCCTCATCA ATTCCACAGT AGATTAAGGG ATTCATTTCC AGTCGCTGGT CTTCAGAGGC AGCGCTTGAA  GCCTAACTTC TATTGAAGCT AGGAGCGTGA ATGGTAGTCG ATGTAGTGTA CCATACTACA CTGAAACAAA TTGCCTGGCT GTAGTCAAAT TCGTGAATCT TGGGTGCAGT CCTCAAAAAT  AGATTATAAG ACAATCTGGA AACGATACTT TATGTTGCAA TGCAGTTCCT CGCTTTCTCA TCTTTAAGCC CTTTGTCGTC GACGTGGTAT TTTTAAGGTT GTGATTGTTG GACAAGTCAA  GAAATGAAGA AACGTAGTGG AACTAAGGCT CGGTAGGATG GAACGTGGCT TTGTCTGTTG CCTAACATTA TCCTGAACTC AGGAGTTGAA TTGTTGGTTT TGGTGGATGC CTGACATAGA  TTTGGGCTAG TTTAATTCGT GTTTGGTTTA ATTGCTTGAA AGCTCACTAT CCTCTTCGTA CACTTCAATA CAGAGCCGGT TGGTGGCGTG GAGAACCTAG TTATTATTGG TTCAGGACCA  GCAGGTTACA CAGCAGCAAT TTATGCTGCC AGAGCCAATT TGAAACCAGT AGTTTTTGAA GGGTACCAAA TTGGAGGAGT ACGAGGAGGT CAGCTGATGA CAACCACCGA AGTTGAAAAC  TTTCCAGGTT TCCCTGAAGG GGTTACTGGA CCCGAATTGA TGGACAGGTG CTCTCCTCAC GATGAGATAC AAGATTAGAG ATACAGGAAT TCGATATTAG TGCATCCATT GCTTCTACAC  TGTCTTTGTT GGATTCAAGG TGCCAGAGAA ATTGTTGGGA TATGTTGTAC CCTTACGCAG TTGGGGAAAT ATTTCCACTC CAGTTCACAG GAATCCGTGT CATTTGAAGA AAAATACATG  GGTCTATCGC TAGCTAGGAT GGAATTAAAA TTTGTCGACG TTCCACTGTT GTGTTCTCTA ATTTTGCTGT TCTGTTCTAA TTTTGATGTC AACCCGCACT AAGTTGCTCT TCTTAGACAT  GAGGGATTTT TTCATCTTGT CTAGCATAGT TTCTTCAGTG TCCTTTTCAG AGTTCTTCTA GACACGTACT CTTGTGAGAG TCACTCTTCT TTCCTCTGTT TTCTGAGTTA ACCAATCCCC  TTTTGTCAAT GCACACACCT TTGAGGATTG TGTAGGTTTC CTCCGATGTA CATGTGAACC CGAAAAAGTT TCGTCAGCTG AGCTATGTGG GTGCAGGATG AGAAAGCAAG CTGAGCGATG  GGGTGCGGAA TTAAGAACGG AGGATGTAGA GTATGTGGAT GTTCGAAATC GACCTTTCAC AGTCCGAAGT AGTGATAGTG AGGTGCTTCT AAATCAAACT TGGTGCTGCT TAGATTGTGA  CTTGTGACTA AATGATTGTC TGCACTGAGA TAATGAGTTT CATTTGAGAA TTTACGTGGA AGTTGAGCAA ATGGGCTGAT TCTCATTGTT GGCTTCGTGT GTCATCTATA TCTGTGTTGC  ACTTCTCTCT TTGTTGCTCA TCTTTATTTT TATTTAATCG TTGAGTTGTT CCAGAGTCAT TGAAGGCCTT CAGTGAACAT GTAATTGAAC GGTTATTGTT TATCATGTGT AGTGTGTCAT  TCAGAAATAA ATGCTAAGAG TCTTTAGCAG TTGGGTTTCA GGTTAAGTGT CACAGCATAA TCATTGCGAC GGGTGCCACA GCTAAACGAC TTGGATTGCC TCGAGAGCAT GAATTCTGGA  GCAGGGGTAT CAGCGCTTGT GCAATCTGCG ATGGTGCATC TCCTATTTTT AAAGGTCAAG AGCTAGCAGT GGTGGGCGGA GGTGACACTG CAACGGAAGA ATCCCTGTAT TTGACAAAGT  ATGCTGCTCA TGTTCATCTA TTGGTTCGAA AAGATAAACT CCGCGCCTCG AAAGCTATGC AAGACAGGTA TGGTTCTCAT GCATTGAAAC TGTTAGAACT TCGAAACAAA CTTTAGGCAG  ATCTGGTAAC CCTACGTTTT ATTTCTTAGA TCAATTATCT TTTCGGTGAT TTGTTATGTT TCCTGAACAA TAAGGATGTA CTTGCGGATC GTTGTGGATG TTTATTTTTT TTCCTGATGA  ACGTTCTTGT TATGGAATTT CAGAGTTATC AATAATCCAA ATATTACTGT CCACTTCAAC ACAGAGACAG TGGATATCGA GGCTGATGAT AAAGGACAAA TGGGAGGACT CAGGCTTCGA  GATCTGGTTA CTGGCGAAGG GAGATCATTG AAAGTCCGAG GACTGTTTTA CGGCATCGGA CACAGCCCGA ATAGTCAGCT CTTGGAAGGC CAGGTTGAGC TTGATGACGC CAGTTACGTG  GTTGTTGAGC CTGGAACGAC CAATACATCA GTAGAGGGAG TTTATGCTGC TGGAGACCTT CAGGTACTCT ATTAGCTTGC AGCTTGTTGA ATTTCTTTAT CAGAACACTA CCAGTCTGTG  CTTCGTGTGT GTTAGCATTC GTTGTTACCT AGTCTATCTG GTTGAGTATT AAATTATTCG CCACTCTTCA GTTCCGCAAT CTCTTTGATA TTGAGTAAGA TGATGTAGTT TGGATGTGAA  TTCAACATAT TTGTGTGCAC TCTAAATTCT CTTATGATAT TGTAATGCTA TTTGATGCAC TAGGATCATG AGTGGAGACA AGCCATCACA GCTGCTGGAT CAGGTTGTAT GGCAGCATTG  TCTGTTGAAC GATATCTCGC TGCTAATGAC CTCCTTGTGG AGTTCCACCA AGTATGCACC CCTGCTTATG TCTAGGCCTC TATGTCTCTT TTTTTGTTCT ATACGGTTGG ACTTGTCCAA  TATTGGTTTT GACTGTGATT GTCACTTTAT TCTGTTGTTT AGGTACGCAC TTTTCATCAT AGTAATAGTA CTAGTCTTTT TCTCTTGTAA GGGATTTACT TTGGACTGAA GCATAACCAT  GCAACCTTGG AATGCCAGCC TGCTCAGGAG GAAGTCAAGA AGAAAGAGCT TACGAAGGAG GATATCGACC AGAAATTTGA CATAACAATG ACGAAACACA AAGGCCAGGT ACTATTGCTT  GATCGGATCT TTGTATTGCC TTGCGGCTGG ATGAGTTTAA AGTAGTCATA TGGGTCTTTT GTTAATTTGC CGATTTAGTT GCCGCTAGAT AGCAACAATT TACATGGAGA AATTACAACG  TATGTTGGGT TGAGATGATG CATGTGGGTA ATCTGTTCGT GGGTGTATGA ATGCAGTATG CGCTTCGAAA GCTTTACCAT GAGAGTCCCC GCGTGATTGG TGTACTTTAC ACTGCACCGA  CTTGCGGGCC ATGCAGATCT CTGAAGCCAA TTTTGAACAA GGTATCATAC TTTGGAATTT TAAGTTGCAG GGTGTGCAGT AGTCTTATTG TTGTAGGGAG TAGCAGAATT ATCGATCGCA  TAACTGCAGT AATAATCATG TAGAAATCCA AGCAGTCGGA AGTCTTATTT AATTTCATAT TGTAATGAGC TGGTTGGTTT AGAATGTATA AGCAAGCTGT TCGTAGAACT CCAGAGAGTT  GATCTTCGTG AGTTCAAGAT TTCATAAACT TTCAAATTGC AGGTGATTGA CGAGTATCCA AACGAGGTTC ACTTCGTGGA GATAGACATT GAGGAGGACC CTGAAATCGC TGAAGCTGGT  GGTATCATGG GCACACCCAC AGTTCAGTTC TTCAAAAATA AGCAAATGAT TAAGTACGCT TTTGATACAC CTCTTTCATT GTTTATTTAT TTCTTTTCTC ACCACCTTAT TTTTTCTAAC  TTTCTGCATT GAATATTTTT TCTTATCATA CGTTACTTAC GTTTAAATTA CCCCCAGCGA TGGCGAATTT AACTCGTAGC AAAGTTTCTT TTTTCCATCT GGCACAGGTG GCTATGGTTA 
GTAACAGGTT GGAGTGTTCT GTGTGCAGGA GTATATCGGG TGTTAAAATG AAAAAGGAGT ACCGGGAGAT AATTGAGGCC AACCTCAAGT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGT GTGCTGCTTC TGCATCTGTC TATGCAGGGG CAAGCACGAC GTTGGGGGTG ATTACAGGGG GGAGTGTTGT TGCCCGAGGG GCGAGTGGCG CCGCGCCTGG AGCTGTGTTC  TGTAGCTGCT CTTCGTCGTC GTCGTCGTCG GAGGCGTGGA TTGGGTTTCG GCAGCATGGC GCTCTTCGGT CCGATGGAGT GGGCAGCATT AGGGGATTGG CCTCCGGGGT ATTCGCCAGA  AGGTTTAGGG TGCATGTTGC AGGGCAGAGA ATGGGGAGTA GCTCGAGGAC AGGGGCGCGC AGCGCTGGAG TCCCGCGTGC GGACGTTGCT GCTGGGGAGA AGCGGTCTGG CACTGCAGAG  CCGGTTGGTG GCGTGGAGAA CCTAGTTATT ATTGGTTCAG GACCAGCAGG TTACACAGCA GCAATTTATG CTGCCAGAGC CAATTTGAAA CCAGTAGTTT TTGAAGGGTA CCAAATTGGA  GGAGTACGAG GAGGTCAGCT GATGACAACC ACCGAAGTTG AAAACTTTCC AGGTTTCCCT GAAGGGGTTA CTGGACCCGA ATTGATGGAC AGGATGAGAA AGCAAGCTGA GCGATGGGGT  GCGGAATTAA GAACGGAGGA TGTAGAGTAT GTGGATGTTC GAAATCGACC TTTCACAGTC CGAAGTAGTG ATAGTGAGGT TAAGTGTCAC AGCATAATCA TTGCGACGGG TGCCACAGCT  AAACGACTTG GATTGCCTCG AGAGCATGAA TTCTGGAGCA GGGGTATCAG CGCTTGTGCA ATCTGCGATG GTGCATCTCC TATTTTTAAA GGTCAAGAGC TAGCAGTGGT GGGCGGAGGT  GACACTGCAA CGGAAGAATC CCTGTATTTG ACAAAGTATG CTGCTCATGT TCATCTATTG GTTCGAAAAG ATAAACTCCG CGCCTCGAAA GCTATGCAAG ACAGAGTTAT CAATAATCCA  AATATTACTG TCCACTTCAA CACAGAGACA GTGGATATCG AGGCTGATGA TAAAGGACAA ATGGGAGGAC TCAGGCTTCG AGATCTGGTT ACTGGCGAAG GGAGATCATT GAAAGTCCGA  GGACTGTTTT ACGGCATCGG ACACAGCCCG AATAGTCAGC TCTTGGAAGG CCAGGTTGAG CTTGATGACG CCAGTTACGT GGTTGTTGAG CCTGGAACGA CCAATACATC AGTAGAGGGA  GTTTATGCTG CTGGAGACCT TCAGGATCAT GAGTGGAGAC AAGCCATCAC AGCTGCTGGA TCAGGTTGTA TGGCAGCATT GTCTGTTGAA CGATATCTCG CTGCTAATGA CCTCCTTGTG  GAGTTCCACC AACCTGCTCA GGAGGAAGTC AAGAAGAAAG AGCTTACGAA GGAGGATATC GACCAGAAAT TTGACATAAC AATGACGAAA CACAAAGGCC AGTATGCGCT TCGAAAGCTT  TACCATGAGA GTCCCCGCGT GATTGGTGTA CTTTACACTG CACCGACTTG CGGGCCATGC AGATCTCTGA AGCCAATTTT GAACAAGGTG ATTGACGAGT ATCCAAACGA GGTTCACTTC  GTGGAGATAG ACATTGAGGA GGACCCTGAA ATCGCTGAAG CTGGTGGTAT CATGGGCACA CCCACAGTTC AGTTCTTCAA AAATAAGCAA ATGATTAAGA GTATATCGGG TGTTAAAATG 
AAAAAGGAGT ACCGGGAGAT AATTGAGGCC AACCTCAAGT AA 

Retrieve as FASTA