Entry information : PpaTrx04 (Pp3c20_5530/NTRC)
Entry ID 14212
Creation 2016-10-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-07 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-11-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PpaTrx04 (Pp3c20_5530/NTRC)
Name (synonym) PpaTrx04 (Pp3c20_5530/NTRC)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: Trx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaTrx04
start..stop
S start..stop
PpaTrx03 998 0 1..565 1..571
AtTrx03 768 0 108..566 65..529
ThasTrx03-1 760 0 95..566 35..508
HaTrx08 758 0 119..566 88..543
Literature and cross-references PpaTrx04 (Pp3c20_5530/NTRC)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   32947064
Protein sequence: PpaTrx04 (Pp3c20_5530/NTRC)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   567
PWM (Da):   %s   61044.87  
PI (pH):   %s   6.26
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVACAASLYA GASTALGVIS AGSVAPRLTS SSSSAPPPGG ASLCSCSSSS EVSWIGLRQN GVVRWEGVGF GAVARRFRVH GVGQRMGGNV RTGARGGVAR AELADGERVS ATADPVGGVE  NLVIIGSGPA GYTAAIYAAR ANLKPVVFEG FQVGGVRGGQ LMTTTEVENF PGFPEGVTGP ELMDRMRKQA ERWGAELRTE DVEYVDVRNR PFTVRSSDSE VKCHSIIIAT GATAKRLGLP  REHEFWSRGI SACAICDGAS PIFKGQELAV VGGGDTATEE SLYLTKYAAH VHLLVRRDKL RASKAMQDRV LNNPNITVHF NTETVDVEAD DKGQMGGLRL RNVVSGEERS LQVRGLFYGI  GHSPNSQLLE GQVELDDASY VVVEPGTTNT SVEGVYAAGD LQDHEWRQAV TAAGSGCMAA LSVERYLTAN DLLVEFHQRT QEEVKKKELT KEDIEEKFDI TNTKHKGQYA LRKLYHESPR 
VIGVLYTSPT CGPCRSLKPI LNKVIDEYSN DVHFVEIDIE EDPEIAEAGG VMGTPTVQFF KNKQMIKSIS GVKMKKEYRE IIEANK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGT GCGCTGCATC CCTGTATGCA GGAGCCAGCA CGGCATTGGG GGTGATCTCC GCAGGGAGTG TGGCCCCCCG CCTCACCAGC AGCAGCAGCA GCGCACCCCC CCCTGGTGGT  GCTTCTCTCT GTAGCTGCTC GTCTTCCTCG GAGGTGTCGT GGATTGGGCT GCGGCAGAAT GGTGTTGTTC GGTGGGAGGG CGTGGGTTTT GGAGCCGTGG CCAGGAGGTT TAGGGTGCAT  GGCGTGGGGC AGAGAATGGG AGGGAATGTG AGGACAGGGG CGCGCGGTGG AGTTGCGCGC GCTGAACTTG CTGATGGAGA GAGGGTGTCT GCTACCGCAG GTTGTGTCGC ATTCGAATTC  CGATACTGCT GTGTTTGGGT GGTTTTGGAA TTGCGTTGCT GCGAATTGTT GTTGTGGGCT CTTGGGTGCT AGCCCAATTG ATGAAATTGA AGCATTTGGC GTGGTTTGAT CGTTGACATT  CGAGGATAGT ACTGTGGATT GCAATGCAGG GTGGAGACAA CCCTAACTTT TCCCCTGTGA CCCATCTTAC AATAGACCAA GGAATGGATT TATACATGGC CTTCAAAGAC ATTGCCTCGA  GCTCGGAGTT CTCTGGGAAG CTCCGAGCTT GAATAGTCTT CTCTGTAGTA CCATGTCTTT ATTGCATTGC TGAAAGTCGA TTGGTTGGCC TCGTATCCAT GAGGCTGGGG CAGAAAGTAT  CGCAATGGAT TTTACAAAAC AAAAATATGC ATCCTGTTGC TATTCACTTT CTTGCTTATT TTAAGGCCCT TTTAACAGAC AGTTGCCTCT GAGAACATGA TCGGTAATCA AATTAAAGTT  ACGAAAATCT ATGACAACAA TTATGGCTCT AGAGGATCAA TCCTGTAACG AATTTCGGTG GATTTCAAGC ATGATACTTC ATCATCTTCT TAGCTGACTT GATCCTTCTC TAGTTTGCTG  GCTTGGAAGC TGACGATCTT CTTTGTACAC TTCGATGCAG ACCCTGTAGG AGGCGTGGAG AACTTGGTCA TTATTGGCTC AGGACCAGCA GGTTATACGG CGGCAATTTA CGCTGCTAGA  GCTAATCTTA AACCAGTAGT GTTTGAAGGG TTCCAAGTTG GAGGAGTACG TGGTGGTCAG CTCATGACGA CCACCGAAGT AGAAAATTTT CCTGGTTTCC CCGAAGGGGT TACTGGACCC  GAATTGATGG ACAGGTGCTC TCTTCACACT GGGATGCAAA TCTTCTGTCG ACAGCCCCAC ACATAATCAA ATACAACGTG CATTATCTCC GATATGCTCG ATGATACGAA AGGAGTTTGT  GACCTGAACT GTATGGGTGC AGGATGAGGA AGCAAGCTGA ACGATGGGGT GCTGAATTGA GAACGGAGGA CGTGGAGTAT GTGGATGTCC GAAATCGACC TTTCACAGTC CGAAGTAGTG  ATAGTGAGGT ACTTTTTAAT CAAGACTCAT GCTGCTTAGT TTGTGATGGG CGAGTAATTA TCATTAGTAT TATCATAATA ATTTTGCTTA CGCTGAGGCA ACAAGTTTCC CTTCTACAGT  TTTGTGGGTT TTGACGGAAA AGGCTCATAG TCGTTGGTGG TTACTTTGAT TATCTGTTTC TTTTTCTTTC TTTCGTGTCC ATCTTTATCT TGTTTTTGTT CCTCAGCAGC ACAGTGCGGG  ATCTTTAGGG AATATGGAGT ATAGTTTATT GATTCTGGTA TACAGTGCTT TTGCTAGGAT TAGATTCTAA TAGTATTAGC AGTTGGGTTT CAGGTAAAGT GTCACAGCAT AATTATTGCG  ACGGGTGCTA CAGCTAAGCG ACTTGGATTA CCCCGGGAGC ATGAGTTTTG GAGCAGAGGC ATCAGTGCGT GTGCTATCTG TGATGGTGCA TCTCCCATTT TTAAAGGTCA AGAGCTAGCA  GTGGTTGGTG GAGGTGACAC TGCAACGGAG GAATCTCTTT ATTTGACGAA GTATGCTGCT CACGTTCATC TGTTGGTTCG AAGGGATAAA CTCCGTGCCT CGAAAGCCAT GCAAGACAGG  TATTTCTCTG AGCAACATGG CCTATTATAA CTTGTAAGGA TTGAAATTAA ATTTGGATTC ATCTGATATC CTTAGGTCAG TAGGTTCGGA GATTAGTTTC GTTCCTTCTA TGGCGAGGTT  CTGTTTGCTG ATCTGAATGT TTAATGATCA TTTTTGTGAT GGAATTCCAG AGTTCTTAAC AATCCAAATA TTACAGTCCA CTTCAACACA GAGACAGTGG ATGTCGAGGC TGACGACAAG  GGACAAATGG GAGGTCTGAG GCTTCGAAAT GTAGTGTCTG GCGAAGAGAG ATCATTGCAA GTGCGGGGAT TGTTCTATGG GATTGGACAC AGCCCTAATA GTCAGCTCTT GGAAGGCCAA  GTCGAGCTCG ATGATGCTAG TTATGTGGTT GTTGAGCCTG GAACGACCAA TACATCGGTC GAAGGAGTTT ATGCCGCTGG AGATCTTCAG GTACTTGACT GGTCGTTAGT TTCTTGCGTT  CGTTCAATTT GATGCTCTAC ATTGCTTTGC GTTTTCCATG TTGCTCGTCG TTGTTATTTA GTCTATCTGC CAAAAAGACG TCCAATGTAG CATGAAAGTG ATTAAATGCC AGTCACATTG  TGAATCTGTA ATTAGTCTGA TGTTGATGAG TATTAAGAAG CCTTCTACCG AGCTGATTGT TTCAGGATCA TGAGTGGAGG CAAGCTGTCA CAGCTGCCGG ATCAGGCTGT ATGGCAGCAT  TATCTGTTGA GCGTTATCTC ACTGCTAACG ACCTGCTTGT AGAGTTTCAC CAAGTACGAT CACTTTCTTC GTGTGTTACC TTGATCTCTT CTTTTTTTTG CTCAATACGG TTGATTTTCT  TTGTACGTGT CAGTTTGGAT TGTGATTGTT ATTTTAGTTT AATTAATGAG AAGAACCGAT AGTCAGTGTG AAACCTGCTG AACTAAACGC CCATGCTAAC AATTCAAACC TAAAACTTAA  AGCAAAAATC GGAACCCCAA ATCAACTTTA TAATTTATAA TTGTTTTTTT ATAGTTTTAG ATTTTCAAAT CTTAATATGG AATAAAATCT CAAGCAACAA CCTATTCAAA GCATGGGTCT  GCTGATGAAA TATGGGAAGC AGAGGACTTT GCCTAAATTT TTTCCCGTTA CCTTGGCTCC TGTTTTGGCT TGTACGTACC TTCATCGAGT TACTAGAAGT TGTCCTTTTA AGAAGAATAT  AATCGTAGAC TCCATCCTGA CTCTGCAATC TTTGAATGCC AGCGTACTCA AGAGGAAGTC AAGAAAAAAG AACTCACAAA AGAGGATATC GAGGAGAAAT TCGACATCAC AAATACCAAA  CACAAAGGCC AGGTGCTGAA TAAATCCTTG TATCTCTGTA TGGTTATATC AGGGGGATAG GCATATGACG CTTTGGGTAT CTTGCTGGTT ACGTCGTTTT GGATCTCTAA CATAAGTGAC  TTACATGTTA CCGCTGTACT AGTGAGTGGG TTTCGACCAA TGTAGGCGGA GAATACACTG TATAGCTGGT ATTGAGATGA CACATGCAGC CAACCTATAT TGTGGGTATG TGAATGCAGT  ATGCGCTTCG GAAGCTTTAC CACGAGAGTC CTCGCGTCAT TGGTGTACTT TACACTTCAC CGACTTGCGG TCCATGCAGA TCTCTCAAGC CAATTTTGAA TAAGGTAACA ATCCGTGAAA  ATTCTGGATC ACAGAATGTA TGGTAACTAT GTTGCCGAAA TGAACGGAAT TTGTCATCTG ATCCCGCCTG TTCCAATCAA ACAGTAATTT AAGCACTCAT GAGTCCAATC CAATTCCATA  CTGCAATCAT GTTTTATAAC AGTCTAGGTG ACTTGAAGCA ATGTAGAAAT GAATTATTCG AAAAACTGAA GAAGGTTTTT GGAACAATGC ACTGAAAGTC ATGTTGCAAT TTGACATATT  GACATCAATT TCAGTCAATT CCAGTTTTTT TAACCCTAAT GAGCTGTTCG AGTCGCAGGT AATTGACGAA TACTCAAATG ACGTTCATTT CGTGGAGATA GACATTGAGG AGGATCCTGA  GATCGCTGAA GCTGGAGGTG TCATGGGTAC ACCCACCGTT CAGTTTTTCA AGAACAAGCA AATGATAAAG TAAGTCGCCA AATCTCATCT CACACAGTTC AATTTTGATA ATGAGTCTCA  TAACCTTTCT CATGTATGCT ATTACAGGCG CATCACTCAA TCTAAAACGC AAGAAACTAT GATGATCTCA TCTTTTAACA AAGTCTTATG TCGAATGAAT CTGGAAACTG CGGCTGCGAT 
TTGTAACAGA TTGGCTGTTT TATCTGCAGA AGTATATCAG GTGTCAAAAT GAAAAAGGAG TACCGAGAGA TAATTGAGGC CAACAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGT GCGCTGCATC CCTGTATGCA GGAGCCAGCA CGGCATTGGG GGTGATCTCC GCAGGGAGTG TGGCCCCCCG CCTCACCAGC AGCAGCAGCA GCGCACCCCC CCCTGGTGGT  GCTTCTCTCT GTAGCTGCTC GTCTTCCTCG GAGGTGTCGT GGATTGGGCT GCGGCAGAAT GGTGTTGTTC GGTGGGAGGG CGTGGGTTTT GGAGCCGTGG CCAGGAGGTT TAGGGTGCAT  GGCGTGGGGC AGAGAATGGG AGGGAATGTG AGGACAGGGG CGCGCGGTGG AGTTGCGCGC GCTGAACTTG CTGATGGAGA GAGGGTGTCT GCTACCGCAG ACCCTGTAGG AGGCGTGGAG  AACTTGGTCA TTATTGGCTC AGGACCAGCA GGTTATACGG CGGCAATTTA CGCTGCTAGA GCTAATCTTA AACCAGTAGT GTTTGAAGGG TTCCAAGTTG GAGGAGTACG TGGTGGTCAG  CTCATGACGA CCACCGAAGT AGAAAATTTT CCTGGTTTCC CCGAAGGGGT TACTGGACCC GAATTGATGG ACAGGATGAG GAAGCAAGCT GAACGATGGG GTGCTGAATT GAGAACGGAG  GACGTGGAGT ATGTGGATGT CCGAAATCGA CCTTTCACAG TCCGAAGTAG TGATAGTGAG GTAAAGTGTC ACAGCATAAT TATTGCGACG GGTGCTACAG CTAAGCGACT TGGATTACCC  CGGGAGCATG AGTTTTGGAG CAGAGGCATC AGTGCGTGTG CTATCTGTGA TGGTGCATCT CCCATTTTTA AAGGTCAAGA GCTAGCAGTG GTTGGTGGAG GTGACACTGC AACGGAGGAA  TCTCTTTATT TGACGAAGTA TGCTGCTCAC GTTCATCTGT TGGTTCGAAG GGATAAACTC CGTGCCTCGA AAGCCATGCA AGACAGAGTT CTTAACAATC CAAATATTAC AGTCCACTTC  AACACAGAGA CAGTGGATGT CGAGGCTGAC GACAAGGGAC AAATGGGAGG TCTGAGGCTT CGAAATGTAG TGTCTGGCGA AGAGAGATCA TTGCAAGTGC GGGGATTGTT CTATGGGATT  GGACACAGCC CTAATAGTCA GCTCTTGGAA GGCCAAGTCG AGCTCGATGA TGCTAGTTAT GTGGTTGTTG AGCCTGGAAC GACCAATACA TCGGTCGAAG GAGTTTATGC CGCTGGAGAT  CTTCAGGATC ATGAGTGGAG GCAAGCTGTC ACAGCTGCCG GATCAGGCTG TATGGCAGCA TTATCTGTTG AGCGTTATCT CACTGCTAAC GACCTGCTTG TAGAGTTTCA CCAACGTACT  CAAGAGGAAG TCAAGAAAAA AGAACTCACA AAAGAGGATA TCGAGGAGAA ATTCGACATC ACAAATACCA AACACAAAGG CCAGTATGCG CTTCGGAAGC TTTACCACGA GAGTCCTCGC  GTCATTGGTG TACTTTACAC TTCACCGACT TGCGGTCCAT GCAGATCTCT CAAGCCAATT TTGAATAAGG TAATTGACGA ATACTCAAAT GACGTTCATT TCGTGGAGAT AGACATTGAG  GAGGATCCTG AGATCGCTGA AGCTGGAGGT GTCATGGGTA CACCCACCGT TCAGTTTTTC AAGAACAAGC AAATGATAAA AAGTATATCA GGTGTCAAAA TGAAAAAGGA GTACCGAGAG 
ATAATTGAGG CCAACAAGTG A 

Retrieve as FASTA