Entry information : HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Entry ID 14248
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Name (synonym) HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Class Dehydroascorbate Reductase    [Orthogroup: DHAR001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaDHAR12
start..stop
S start..stop
HaDHAR11 374 3e-134 1..208 1..214
ThasDHAR01 329 1e-116 1..207 1..212
AtDHAR04 310 3e-109 1..207 1..213
AtDHAR02 295 3e-103 1..206 1..212
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 66497411..66497468 58 N° 2 66497555..66497645 91 N° 3 66497757..66497900 144 N° 4 66499106..66499223 118
N° 5 66499337..66499477 141 N° 6 66500292..66500366 75  
join(66497411..66497468,66497555..66497645,66497757..66497900,66499106..66499223 ,66499337..66499477,66500292..66500366)


exon

Literature and cross-references HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr12 (66497411..66500366)
Protein sequence: HaDHAR12 (HanXRQChr12g0371001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   208
PWM (Da):   %s   22983.13  
PI (pH):   %s   6.8
Sequence 249
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAIEICVKAATGAPDVLGDCPFSQRILLTLEEKKVAFKTHLINLDNKPKWFLEVNPDGKVPLAKFDENWISDSDVIVGLIEEKYPHPSLATPPELASVGSKIFPKFVVFLKSKDANDGTEQALLDELNALDEHLKSKGPYVTGKTITAVDLSLAPKLYHLEVALGHFKKWTVPESLTHVRNYMKSFEKTKPAKEEYVVAGWAPKVNSA

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGGCGATTGAGATCTGTGTCAAAGCTGCTACGGGTGCCCCTGATGTTCTTGGCGACTGTAATTAATCTCCCCTTCAAAGATTTCACTTTAATTTCATTGGGGTTTCTTGATCATCAATTT
TTGTGGGTTGTGTTTGATTTTAGGTCCATTTTCCCAAAGGATTCTTTTGACTTTGGAAGAGAAGAAAGTCGCTTTCAAAACCCATCTCATTAACTTAGACAACAAACCTAAATGGTGATT
ATTATTAGTATTATTGTCAGAGAATCTTGAATTTACACATGAAACGTTTGGTTGTTCGTGGCCTCGTGGGATTTTAATATAATTTTTTTTTTTGTGTTTGTGTAGGTTTCTTGAAGTGAA
CCCAGATGGGAAAGTTCCTTTGGCCAAATTTGATGAGAATTGGATATCTGATTCTGATGTTATTGTGGGTCTTATTGAAGAGAAGTACCCTCACCCTTCACTTGCCACTCCCCCTGAACT
TGCCTCTGT
GTATGCTCTGCCTGGCTCTGTATATATGTCATATGATACAGGTTTATTACGAAATCGGTGGGTTTGAGTTTAGTCTAATTGGGTTTGGGTCGGTTTTAGGCAAATCCTTGA
ACATGTTTAGCTAAACTGGTCCTGCTTGGGTTGTTTTGTCAGTTTGCGGGTTGATCGGTTTAACTCTTCTCTCATAAATTTTTAAAAATATAAAAAACAGACATATGGTGTACAGCTCAG
ATGAAATTATTTTATTTATATTTGTTTACATGGTTGTAATATGTTATTGTCAGGTAAGGATATTTCAAAAAAAAAAAATAAATAAAAATAAAAATAAAATAAAAATATTGGGTTCAATAG
GGATGGCAAAAAAACCAGAACCCGATGGGTATACCCGAAATCCGAAACATATGGGACGGGTACCCAAACCCCGACGGGTAATGGACGGGTATAATACGTAGTTGTGCTTGATTTTTCCCT
CGACATTCTGTTATATGTTTTTGTTAAAAACGAAGTTGTACTTAAAATAAAATATTTCTTTGGTAGCATAAAACAGTACGATGATCAATTAAACCGTTCTAATGGTTTGGCTTTCTAAAC
AACATGCTTTATTTTCAAATCACGTTTGTTTTACATTATCATTTGTTCGGTTTCGTCGCAACGCGCGACTTCAAAAAAACTAGTAGTAATAAAAATGTATTTGAAAATTTCAATCGGTAT
CTTTTAACAGATTAATGGGTATACCCGATACCCGCGGGTATGCCCAATACCCGACAGGTATTGGGCCGGGTATCGGACACGATTTTACAACCGGGTATGGGTATGAGATTACCAATACCC
GCCCCGAACCCGACCCATTGCCATCCCTACGGTTCAACGGGCCGTGTTTGTGTCGATCCATGAAAACTTGTGTTGTATTGTATCTGGGTTCATGTGTTTGATTTTGAATTCTTGTCACGT
TCGGGTTGTTAAATTTTCACGTTAGTGTAGGGTTTGACCCGCTAATCTGTAAGCACGCCCCGTTAAACACCCCTAAATAGTATATAATTACCACCTATAAGATGGCAAATTCAAGTTGTT
TATGAAAAATTTGCATTTCTAAACTCAAATGACCATTTATGAAATTTTGATTTATTTCATAAACATAAGTTTAGATTTTCCCAAATTGACCAATTAATTGCACAATTATAATACTTCTAA
TTGTGAAATTGTAGGGGGTCAAAGATTTTCCCTAAATTTGTGGTATTTCTAAAGAGCAAGGATGCTAATGATGGGACTGAACAAGCTTTGCTTGATGAATTGAATGCATTAGATGAACAC
CTCAAGAGTAAA
GTACGTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAAATGATTGTTTTTTTTGCTCTATTTGGTTGATACAAAAATATGTGTTTTTATTTGAATAATAACTAACCTTTATGTTAACAT
GTTAGGGGCCTTATGTTACTGGGAAAACGATCACAGCTGTTGATTTGAGTCTGGCACCAAAGCTATACCATCTTGAGGTGGCTCTTGGCCATTTTAAGAAGTGGACTGTTCCCGAAAGTC
TGACTCATGTGCGTAACTACATGAAG
GTATGACTCTCGCGTATTGAAAGTGATGGTCTGATTATTGAGTTTATAGTGTTGGGTGTGCAAGTGTATAACAAACCCTTTCTGAGTTTTTAAA
TAACCAGTGTTTGTCGATTAGTTGCTCATTTTGTACAATTAGCAGTAGTTTGTTTAAATTTATATATAAACATATTGACTAAATCATTACAATGAAATTTAGAAGTACAAAAATTTGAAT
TATATTGTGTCTTATACGGGCTTGATTGACTCGAGTTTTGTTAGTTTGATTAAGCTTGGGTCGGTTCAGGTCAGGTCCTTTTGGCTTAGTTTTGCCTCACTTTTCGTGAATCAGTCCGTG
TTGTCTTACATGTAGGGTTGTAAATGAGTGTGTCAACTCACAAGTTACTCAATACCAACTATAAATTTGAAACTTGCTCGATTGAAGAAAAGTTGAGCTTGAGCTACTGGAGTAGACTTT
CAAGTTGAGCTTTAGTATTAAAGTCTCCGCTTGTAAAAGTCGCTAGCATTATATTGCCATTTTACATTTTTACCCATTGTGTATATGTGAACTTACATAATTGCAGGCCAGTACTATCTA
GTGAGTCGATCCAAGCGGAGCTCAAAAGTATCTAGTCGAGTCAGTCTTAGCTCATCAAATGATATGACACTAATTACTAACCTTGATTATTATTATTGTTATTATTTTAACTTTGATAAT
CTTGTATACACAAGTCAAGCCTGATCTTGGCATTGTGTTGAATCGGTCAAGACCAAATTACCCCCCATCTTTTTTTTTTTAATACTTATTATGTTAATGCAGTTACTCTTTTCAAGGGAG

TCGTTTGAGAAAACCAAACCTGCTAAAGAAGAATACGTCGTTGCTGGATGGGCGCCAAAGGTTAATAGCGCATGA

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGGCGATTGAGATCTGTGTCAAAGCTGCTACGGGTGCCCCTGATGTTCTTGGCGACTGTCCATTTTCCCAAAGGATTCTTTTGACTTTGGAAGAGAAGAAAGTCGCTTTCAAAACCCATC
TCATTAACTTAGACAACAAACCTAAATG
GTTTCTTGAAGTGAACCCAGATGGGAAAGTTCCTTTGGCCAAATTTGATGAGAATTGGATATCTGATTCTGATGTTATTGTGGGTCTTATTG
AAGAGAAGTACCCTCACCCTTCACTTGCCACTCCCCCTGAACTTGCCTCTGT
GGGGTCAAAGATTTTCCCTAAATTTGTGGTATTTCTAAAGAGCAAGGATGCTAATGATGGGACTGAAC
AAGCTTTGCTTGATGAATTGAATGCATTAGATGAACACCTCAAGAGTAAA
GGGCCTTATGTTACTGGGAAAACGATCACAGCTGTTGATTTGAGTCTGGCACCAAAGCTATACCATCTTG
AGGTGGCTCTTGGCCATTTTAAGAAGTGGACTGTTCCCGAAAGTCTGACTCATGTGCGTAACTACATGAAG
TCGTTTGAGAAAACCAAACCTGCTAAAGAAGAATACGTCGTTGCTGGAT
GGGCGCCAAAGGTTAATAGCGCATGA

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATTG AGATCTGTGT CAAAGCTGCT ACGGGTGCCC CTGATGTTCT TGGCGACTGT CCATTTTCCC AAAGGATTCT TTTGACTTTG GAAGAGAAGA AAGTCGCTTT CAAAACCCAT  CTCATTAACT TAGACAACAA ACCTAAATGG TTTCTTGAAG TGAACCCAGA TGGGAAAGTT CCTTTGGCCA AATTTGATGA GAATTGGATA TCTGATTCTG ATGTTATTGT GGGTCTTATT  GAAGAGAAGT ACCCTCACCC TTCACTTGCC ACTCCCCCTG AACTTGCCTC TGTGGGGTCA AAGATTTTCC CTAAATTTGT GGTATTTCTA AAGAGCAAGG ATGCTAATGA TGGGACTGAA  CAAGCTTTGC TTGATGAATT GAATGCATTA GATGAACACC TCAAGAGTAA AGGGCCTTAT GTTACTGGGA AAACGATCAC AGCTGTTGAT TTGAGTCTGG CACCAAAGCT ATACCATCTT  GAGGTGGCTC TTGGCCATTT TAAGAAGTGG ACTGTTCCCG AAAGTCTGAC TCATGTGCGT AACTACATGA AGTCGTTTGA GAAAACCAAA CCTGCTAAAG AAGAATACGT CGTTGCTGGA 
TGGGCGCCAA AGGTTAATAG CGCATGA 

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