Entry information : HaGrxC24HanXRQChr15g0468121
Entry ID 14428
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxC24HanXRQChr15g0468121
Name HaGrxC24HanXRQChr15g0468121
Class CGYC Grx    [Orthogroup: GrxC003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxC24
start..stop
S start..stop
HaGrxC13 223 5e-76 18..164 25..171
ThasGrxC05-2 184 1.84e-60 16..162 39..177
ThasGrxC05-1 180 4.52e-59 63..162 68..167
AtGrxC05 170 4.18e-55 60..162 65..167
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14428' 'complement(join(14162975..14163039,14163434..14163460,14163861..14163935,14165187..14165260,14165369..14165625))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 14165369..14165625 255 N° 2 14165187..14165260 72 N° 3 14163861..14163935 73 N° 4 14163434..14163460 25
N° 5 14162975..14163039 63  
complement(join(14162975..14163039,14163434..14163460,14163861..14163935,1416518 7..14165260,14165369..14165625))


exon

Literature and cross-references HaGrxC24HanXRQChr15g0468121
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr15 (14165625..14162975)
Protein sequence: HaGrxC24HanXRQChr15g0468121
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   165
PWM (Da):   %s   17906.29  
PI (pH):   %s   9.66
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAATSVFSRTFSSVSLSHIPNSPSLPFISRNFSHRKTSSRTCLTIRKHGALKVHSMTASFDSRLEDTVKKTVADNPVVVYSKTWCPYSSEVKSLFNQIGVQPLVVELDEGAQGPQVQKVL
EQLTGQHTVPNVFI
GGKHIGGCTDTVNLHRKGELEALLAEAKNT

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCAACTTCTGTATTCTCTAGAACCTTCTCATCTGTTTCTCTTTCTCACATACCTAACTCCCCTTCTCTTCCGTTCATCTCTCGCAACTTTTCTCATCGCAAAACATCATCACGA
ACATGTTTAACGATCAGGAAACATGGTGCTCTCAAGGTTCACTCCATGACTGCTTCCTTTGACTCTCGGTTAGAAGATACTGTCAAGAAAACAGTCGCTGATAATCCCGTTGTTGTCTAC
TCCAAAACCTGGTGTCC
GTAAGTTAATTAGCCTAGGGTTTTATGTTTTTTAATTTATGGTTTGAACTTTGAAGCTTATTATGTTGTTGAAGTGATTTCTTATGTTTTGATTATCGTGTTG
TTAAGGTGTATTCTTCTGAAGTGAAGTCGTTGTTTAATCAGATTGGTGTGCAGCCGCTTGTTGTTGAATTGGATGAAATTGGTGAGGATTTTTTTTATTTTTATTTAATTTGGGGATTTT
TTGGGGGAAGTTGGTAATTCTTTTAGATTGTTAGGGTTACATAAGAGGTGTTTATATAGACATATTTTTGGTACCGAATTTTGGCATTTTTGGTACCCGTACGATATACGGTTCATTACC
GGTATTTGAAGGTTCGGTACCGGTATTTGAAGGTTCAAATACCGGTAATGAACTGTATCGTACTGTGTATTTTCAGGTACCGGTACCCATTTTGGGGATTTTCGGTACCGGGCTCATCCC
TATTTGACGGGATATACCCTGGAATGAGCTATAGCTTGATGAAAACAAGGTCTTGTTGATTAACTGACAAATGAACGGATCCTCCGATGCGTCGTGTTTTGGACAACGGGTTGGTGGATC
AACTCTAGTTACCCAAAAGATCTCGGTCAGCTATATCCAAGTCGAGCCCGGGTGATACGAACCTGGTGCGGGTCAGAACCAATTAATGTGGGTGGCGGGAAAATTGAATGGTGGGGAGCA
GTTAGAAGACCAAGTTTTTAGGAGCAGTTAACACCAGATATTATGTTAAATAGCAGGCTCTGTTTTCCTTTTAGATTGTCTATGTTTATGTTATTAAATTAGGGTTCTTACCTTATAATT
GGAGATCAAGCCTATCTCGAATGTGGCTAATTGTAATCGTTCTCTTAGTAATCAAGGCTTTCAGTTTTTTGGGTTCTATCACCGGGCATCAATAGCCTGACATAACGGTGATCATAAGAT
CGAAGCGCAAAGGAACAAAGGAGTGAGTCGGGTTGGGACTGATGGTGCAGCCGGGCCATAACATACGTTCCGACCACAGACGTAAGATGCGGATGAAGCAGATGTTAAGGCAAGCTGCCA
AGCGTTTAATGCTACGGATTTTGGCAGGGACCAAATCTTTTAGACGTACCAATACCCAGTGGATTAGCTTTACGTCTTTAAACCACTGTGCCACTCCCCTAATTGTTCAGTTATTTGTAA
TTGTAGTCAAGGTTCTTTTGACCAAACCCCACATGTCATATGCTAGTTATCATGATGTTTAGGATCAAATACAAAGGTTCCTAAGAATAAGAAGTCGTACAAAGGGCATCAAATGGACTC
CGATTGACCTCATTCAAGCAGTGGAACTGTCTCATATATGTAGTTAAAGCTGCAATATCTGTGAATAAGTTGTTAGGAACTTAGGGTTTGTAAACACTGCCGAAGGTCACTTTTTAATTT
TTTTTATTTCAGGTGTGCGCAAGGACCACAGGTACAGAAAGTTCTTGAACAGCTAACTGGACAACATACCGTTCCAAATGTTTTTATTGGTATGTAGACTATGCATTAAGAATGTCATAT
ATTTTTTCACTTGATACTTAGCATGGTATAATTTAATTGAACTGATCTCGATCATAAGCAGTTAGCCGCGTACTGCATAGATTTCTAATCATAAGCACCCAACGTGCGTGATATAGAATG
TACTTTCGACTCCTTTAGTATAAGTGGGCCTAGTTGAGTTATGTTTTATCTCAAACGTGTCGAATGGGTTGTAAGTCACAGTGTCTCACAAAGTGTAAAAGGTAATGGAAGGGTCCGCAC
TCACGGTGTGACTATTGCTGAAAGTGCTGACCTTCCATCTTCTTTTACAATATCAACAACACTAAAGAAGAAACTATGAAATAAAAAATAAACATAATTTCTGAGCTCATTTATCGTTTT
TTCTAACAGGGGGGGCAAGCACATAGGCGGTTGTACAGGTACCTTCTTTACCAGTTCCTTTAGCTCATTCTTCTCGTATGTGGATTCTGATTTGGGTTACATTTAATAATATATTAGTAC
TTTCTTACACCGGTTTTGTATAAACAAGTCGGGTTGGTGGAACACGTAATGGGCCAAAACTGCTATGGTTTAGTATGTATTCTGTTGACCTGATACACTTGTTGACCTTTTCCGATTTTT
ATACATAAATAATGTTACGACTACAAAATTATATTATTATTGAGATAGTCTAATCGTAAGATAAAGCGATTTAGGAGGTTGTATACTTGTATCATTAATTAAAGACACTTGGGTTAACTT
ACGTCCCGTTTCCCTTTAAAGTAAATTGTTTTCGGATGTTTTTGTATAATGTTGATTTGTGATTTGGCGCAGATATACTGTCAATTTACATAGGAAGGGGGAACTTGAAGCTTTGCTGGC
TGAGGCGAAAAACACCTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGCAACTTCTGTATTCTCTAGAACCTTCTCATCTGTTTCTCTTTCTCACATACCTAACTCCCCTTCTCTTCCGTTCATCTCTCGCAACTTTTCTCATCGCAAAACATCATCACGA
ACATGTTTAACGATCAGGAAACATGGTGCTCTCAAGGTTCACTCCATGACTGCTTCCTTTGACTCTCGGTTAGAAGATACTGTCAAGAAAACAGTCGCTGATAATCCCGTTGTTGTCTAC
TCCAAAACCTGGTGTCC
GTATTCTTCTGAAGTGAAGTCGTTGTTTAATCAGATTGGTGTGCAGCCGCTTGTTGTTGAATTGGATGAAATTGGTGCGCAAGGACCACAGGTACAGAAAGTT
CTTGAACAGCTAACTGGACAACATACCGTTCCAAATGTTTTTATTG
GGGGCAAGCACATAGGCGGTTGTACAGATACTGTCAATTTACATAGGAAGGGGGAACTTGAAGCTTTGCTGGCT
GAGGCGAAAAACACCTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTGTATAC ATAAACACGA AACACAGAGG ACCAAAGGAG CAAGCAAGCA TCAATGGCAG CAACTTCTGT ATTCTCTAGA ACCTTCTCAT CTGTTTCTCT TTCTCACATA CCTAACTCCC  CTTCTCTTCC GTTCATCTCT CGCAACTTTT CTCATCGCAA AACATCATCA CGAACATGTT TAACGATCAG GAAACATGGT GCTCTCAAGG TTCACTCCAT GACTGCTTCC TTTGACTCTC  GGTTAGAAGA TACTGTCAAG AAAACAGTCG CTGATAATCC CGTTGTTGTC TACTCCAAAA CCTGGTGTCC GTATTCTTCT GAAGTGAAGT CGTTGTTTAA TCAGATTGGT GTGCAGCCGC  TTGTTGTTGA ATTGGATGAA ATTGGTGCGC AAGGACCACA GGTACAGAAA GTTCTTGAAC AGCTAACTGG ACAACATACC GTTCCAAATG TTTTTATTGG GGGCAAGCAC ATAGGCGGTT  GTACAGATAC TGTCAATTTA CATAGGAAGG GGGAACTTGA AGCTTTGCTG GCTGAGGCGA AAAACACCTA ACTCGATATT GCTCAACTGT TTTGATGCAC AACCTTATTT TCTGAATTGT  TGTGATGCAC AAAAAATGAT ATATATTTTT TTGCTGTTTT GTTGGCCAAA CTTGACTAAT TTTGATGTAA TCTTGTTGAT CTTGTGATAT AACTGGATTA AAAGGATGAG TAGCATGCTA  AATTGCTAAT GACATCTCAT GTGCATGAGT AGAGATTAGA AAAACCGAAT AACATAACTA GGGGTGTAAA CGAGCTAGAC TGAGCTCTCC ACTAGAAAAA CTGAATAAAA TAACTCGAGG 
GTGTAAATGA 

Retrieve as FASTA