Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
|
Length (aa):  |
489 |
| PWM (Da): |
53219.06 |
|
| PI (pH):
| 5.39 |
|
Sequence 586
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGVKDVKSKQELDNLVKDGSAVMVHFWASWCEASKHMDQVFNHLSGDFPHAHFVRVEAEEQPEISEAYSVSAVPYFVFLKNGKTVDTLEGAHPSELANKVSKIVGSIHAGEPAAPASLGMAAGPSVLEAIQDLAKIDNSPRGKTQPPAPAGISDSLKTRLEKLTRSHPIMLFMKGNPEAPQCGFSKKAVEILKTENVKFGTFDILSDNEVREGLKKFSNWPTYPQLYCNGELLGGSDILIAMHEGGELKQAFADHGVGNDDVSKSTVAGPDGQQAGVTNSTGLSLALTSRLESLIKSAPVMLFMKGTPDEPRCGFSRKVVDILREEKVDFKTFDILSDDEVRQGLKVYSNWSSYPQLYIKSELIGGSDIVLEMQKSGELEKVLVENGIMSLEDRLKKLVNSKPVMLFMKGTPDAPKCGFSSKVVNALKEEGIKFGSFDILSDEEVRQGLKTFSNWPTFPQVYYKGELIGGCDIILELKSNGELASTLSE* |
Retrieve as FASTA
|
|
| Remarks |
Warnings: The paralog 100013581 is in an intron of the proteins. |
DNA ►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
TTCAATCATCTTTCTGGTGATTTCCCCCATGCCCATTTTGTTAGGGTATGTTTTTCAACTGATTTTGTTACTTATTTTTCAAGCAACTCTCTTTGTGCTTCAATACTGCTTGTAGATATT
TTATTTAATCAAGGGGTTGTTATGTTTTTGAGTTATTATATTCTGGTTTGATGTAAGTGAATAATTGATTTTGGGCAAGAAGGGTTTATGTGGGGTTTTAGTTAGTTTTACACAATGAAA
AAAGGTTACTTTTGGGTTTCAAGAGAGAGCTAAAACTAAGGGTTTAAATTTAAATTTTATTTCTTTTTTTCAAGTTTTTGGTTGTGGTTAGGGCTGTAAACGAACCGAACGAACACGAAC
TTGTTCGTGTTTGTTCGTTAAGGAAATTAAGATGTTCGCGAACTGTTCACACGAACGCGTACCAAACACAAGTTTATGTTCGCGTTAGTTCATTAAGGAAATTCAGTTGTTCACGAACAG
TTCGTGAACACTGGCCTCGAACACAAACGAATGCAAGCAACTAAAAACGAACGCAAATGAACATTCAACTTGAAAATAAAAAAATAAAAACATTGTTATCCTTAAACATTGGATATAAGT
AGTTAAATATAACCATAAAATGATAAATCAAAACACAAGAAGTCTACTACACCACCAAACGATGAATCAAGTTTTACTAACTTAGACATAAGTATCCCCAAAAATGTCTTAGAATGTCCA
AATTTTAGCTAACTAGGGTTTCAAGTTTTCAATATATTTAGATAAAAGGTTTATTATTTATTATTTTTATAATATAATCAAACGAACACGAACGAACGTAACCAAACATATTACTGAACG
TTCACGAACGCAGTCGAACAAACGAGACCTGTGTTCGTGTTCGTTCACTAAGCTGTTCGTTAAGCTAATCGAACGAACATATACGAACTTTCCGCCGAACGGTTCATGAACTGTTCGTTG
AACGTTCGGTTCGTTTACACCCCTAGTTGTGGTTGATTATGTTAAAAGAGACTTTAAATCTCAGATTGACACCTTTATGTTAGGATCAACTATCAAGCACACACGAAACCAAATACGAAA
GCAATTAAGTGACACCGATGATTTAACGTGGTTCTAGAAGGCCTAGGTATTCTTTTGTTGAGGTGATAATCTAATTACAAGTAGGGAGGGGTGTAAACGAGCGGGCTGAGCTCGAGTCGA
GCTTGGCTTGTTATGTTTTTATGAAGCTCGAGCTCGGCTCGGTTCGGTTCGAGCCTACTTCTTTGAGCTCAAGCTTGGTTCGCGAGTAAAACCCAAAGGTCGAGCTCGGCTCAAGCTATT
TTGAGAACAACCTTATACGAGCTAAAAGCTCGGCTTGAGCTCGCTTCAACGTTGCTTAAACGAGCCAAAGCTTGGCTCGAGCTCGGCTCAGCAATATTATCATCATCATTATTCTTATAT
AATATATAAAAAAACTAAAATTTTGTTTGGGCTCGTTTAGTCTCGCGAGCCTAAACGAGCTTTGTATTTCAGGCTCGGGCTCGTTAAGGCTTGGCTCGTTCAAGCTTTTAACCGAGCCAA
TCACGAGTAGCTCTCGAGCCTCTAGGCTTGGCTTGTTTACACCCCTACATTTCCAAGTACATAGATTATATTTGTAGACATTAATTAGGGTTTAGCAAACTTGCCCCCCAAGTTAAGCCC
ATGTAGGGCCTACAAGGCTTACCAACCGAACACTTTGTTCTAGAACGCATCGGATAATAAGATGTTAGAAGCTGGGTTTCAAAAAGCGCGCCTAGGCGCGAGGCGCAAGCCTTGGCGCCT
TAGGTAGCTCGAGGCGCACTTTTAACAAAAAAGCGCAAATTTTGAAGGTTTTTCAGGCCTGAGGCGCGCGCCTCATGTACATAGGGTGTTTTTATACTGTTTTTAAGCATCAAACTGCTG
TACAATAGGTTTTTTGGCTTGTACTTATAGGTAAAATCATATATAAACCTTATTTATAGCTATATTATGAATAAGGGATGCTAAAAACCTAGGGATATATATAAAAAGTTATATAATCAC
TTTGGGCCTTGGGTACGAAAAGCCCGCCGCTTTTGCGCTTCGCGCCTTGGTTTTAGACCCCGTCGCTTTTGTGCGCCTCTCGCTTTTTAAAACCAAGGTTAGAAGTAGATGATCACTTAA
TTATCTTGTACTTACTGTACTATTTGATGATAAAGTGTTGCATCAGTTTCGAGGAAATAGAAATATCAAGTTGTTTGTATAACCTTTATGTAGTCTATATTGATAAATTTGTCTAAAAAT
GATCCTGATACGAGTGCAGAACTATGATATGGATTCAACAAAAAACTTTGTTAGAGAAGAAAATATATCTCGAGGGTAGACAACTTCTCCGAAATCAATAAGGAAAAAAGTAGAGTATGT
AGTATGTTCCTACACGTTGTTACAAGTCGTTTGAAATTAAAACTATAAATAAGTGGTTATCCTTTTGTGGTTTCAAAGTGTGTTTCTTATGTGATCATCTATATGTACTCACTAATGTTT
GGTTTCAAAGTTTCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTAGATAAGTTTTACTATATAAGTATGTAATAATAGAGTTAAATGCCATTTTAGTCCCTGTGGTTCGGGCCATTTTGCC
AGTTTAGTCCAAAGGTTTCATTTTTCGCCTGTGGGTCCAAAAAGGTTTCACCGTTGCCATTTTATTTAGTCTACTGGGTTAACTTCATCCATTTTTTCTGTTAACAAGAAGGGCAATTCG
GTCATTTTATATGTAATTCTGTTAACTAGAAGGGCAATTCGGCCATATAAAATGACCGAATTGCCTTTCTTGTTAACTGAAAAAATGGATGAAGTTAACCCAGTGGACTAAAATGGCAAT
GGTGAAACGTTTTTGGACCCACATGCGAAAAATGAAACCTTTGGACTAAACTGGCAAAATGGCCCAAACCACAGGGACTCAAATGGCATTTAACTCATAATAATATATGCGGAAATGGAA
CCGAACTTAGCAGCATGCGTTGTAACAATCCTGGTTTCTTATGGATTTGGTTGTTAACTGTTACGGAAGAAGGTTACCATGAAATCGAGCTTCTGCACTTGTTTAATTAATTAATTGGAA
TGATAGTGCATTTCTTGTACTTATATTATGGCTAATTTTGTACGATATTCGTGTATGAGAACTGAGAAGTTTCTTCCCTATTGGTGTTTAAACTTTAATTCTCACTTGCCGCTTGCGTAC
TTATGATCTAGTAGCTTAATGAAAGTTCTAGCATCAGAAACACGTAAAAAGATTATTTATTCATAGTGAGTCAGTGACATAATTTGAAAAAAAAAGGTAAGAATACCAATCTGTTTGTTT
TACAGTTTCGCTTATTAGGTTGTGTCACGTTGAGAGCCCACGTTTCGTTAGTTGATATTTTTATATATAATGTTATATTCATGGACAAATCATTGACAACGAGTTACAAATTTATAATCG
AGATTTTATTGGACAACATTTAGTTTTTGCTATTTTTTTTTCTAGGGTAGTATTTTTTTTATATACTTGGGTCATGATCATATCATGCTTGCTATTGATTATTTATCTTTTAAAAATAGG
TTGAAGCTGAAGAACAACCAGAAATTTCTGAGGCATATTCAGTTTCCGCTGTGCCTTATTTCGTTTTTCTTAAGGTAGGTGAACACCATCTCATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAT
TTTTGGATTAAATTGTTGAATCTTGTCCTTTATCGTAATATTAGTATTTCCAGTTTTATTTATAATTTGAGATTAATAAGCTACACTTTTCTTTAGGGGTGTTAAACGGGTCGTGTTTGC
GGGTTGGCGGGTTCAACCCGACCCGAACCCGAACCCGAAAATTTTACACAAACCCGGACCCGAAAATCATATCATACATATGAACCCGAACACGACCCGAAGTTTCGTGGGTTGACCCAA
ACACGACCCGTTCAACCCGAATTTTTAATTTTTTTTTTCTGAAATTAATATACTAAAATTAAAATTTACTTAAGAAACACAAATGTATATAATAATATCATATGTAAATTATAAAATCTA
CGTTAATTTCTCTTATTAAGTTATAATCATGGCATAAAATACACACCCCATTTAATATATGACATTAAATATATTGTAAAAAATATATAATATAGTATAAATGTGTTAAACGGGTCAACC
CGCCAACCCGATGACCCGAACCCGACCTGTTAACCTAAACAGGTTCGCAGGTTCAACCTGAAACTGACCCGAGCCCGTTTAGACTAAACCTAAACCCGCGAATTTCCTGTTAGGTTCTTG
TCGGATTTTCGGGTCGTGTCAGAAATTCACACCCCTACTTTTCTTTGAAAAAACTGTAAATGTATCTTTTTGGTAATTTTATTCTATAGAATGGCAAGACAGTTGATACATTGGAAGGCG
CACATCCATCTGAGCTGGCGAACAAAGTTTCAAAAATCGTGGGGTCAATCCATGCTGGCGAACCGGCTGCACCCGCGAGCTTAGGGATGGCAGCGGGACCCTCGGTTCTCGAAGCAATTC
AAGATCTCGCTAAAATCGACAACTCACCACGTGGGAAAACGCAACCGCCAGCGCCAGCTGGCATTAGCGATTCACTGAAGACCCGTCTCGAAAAACTCACCCGTTCTCACCCCATAATGC
TATTCATGAAAGGAAACCCTGAAGCACCCCAATGCGGATTCAGTAAAAAAGCCGTTGAAATATTGAAAACCGAAAATGTTAAATTTGGTACTTTTGATATCCTTAGTGACAACGAGGTTC
GTGAAGGTTTAAAAAAGTTTTCGAACTGGCCCACTTATCCTCAACTCTATTGTAACGGAGAGCTTCTTGGAGGGTCTGATATTTTAATTGCAATGCATGAGGGGGGTGAATTGAAACAAG
CTTTTGCCGATCATGGGGTCGGAAATGATGATGTCAGCAAGTCAACTGTGGCGGGACCCGATGGTCAACAGGCTGGAGTTACCAATTCCACTGGGTTGAGTTTGGCTTTGACTTCTCGCC
TTGAAAGTCTCATTAAGTCGGCTCCTGTTATGCTTTTTATGAAGGGAACTCCAGATGAACCTAGATGTGGCTTCAGCCGAAAGGTGATTGATTCTTGTTTTTTAGTAAAATGCCATTTTC
GTCCCTGAGGTTTGGCCAGTTTTGCGACTTTCGTCTAAAGGTTTGTTTTTCCGCATCCGGCTACAAAAGGTTTGAAATCTTACAATTTTCATCCGGCTCGCTAACTCCATCTATTTTTCT
CTGGAGTAAACTGCCATTTTGGTCCCTATGGTTTGTCACTTTTGCCACTTTAGTCCAAAACTCAAACTTTTTGCATCTGGTCCCTGTGGTTTCAGTTTATTGCCATTTTGGTCCAAAAAT
GAAACCGGGTCATATTTGTCTTATAAAATTCTGCTATTTTGTCCTTTTCTGTAGGGACAAAATGATCATTTCTTTTTTATAAATAAATACCATATTTTATAAGACAAATATGACCTGATT
TGCCCTTGAGGAACATGACAAAATTGCAGGATTTTATAAGACAAATATGACCTGATTTCATTTTTGGACCAAAATGGCAATAAAACTGAAACCACAGGGACCCAGATGCAAAAAGTTTGA
GTTTTGGACTAAAGTGGCAAAAGTGACCAAACCTCAGGGACCAAAATGGCAGTTTACTCTTTTCTCTGTTAAGTCAGGGGTATAGTTAGGGGTGTTTCCGTCTTTTTTTGTTAACTTAAA
GGGGAATTCAGTCTTTTTCAAGGGTATTCGGACTTTTTACATATAGTGAAAAAGACTGAATTGCCGTTTAAGTTAACAAAAAAGACGAAAATACCCCTAGCTTAACAGAGAAAAATGGAT
GGAGTTAACGAGTCGGATGAAAATGGCAAGACTTCAAACCTTTTGGATCCAGATGCGGAAAAACAAACCTTTGTATGAAAGTCGCAAAACTGGCAAATCTCAGGGACGGAAATGGCATTT
TACTCATTGTTCTTTATATGTGATTTTGTTGTTATAACTTTATGAGTTTCTTTGAACTATAACTTGCTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGATTCATCAATC
TTGATAATCTATCAGGTAGTCGATATTCTCAGAGAAGAAAAGGTTGATTTCAAGACTTTCGATATACTCTCAGATGATGAAGTAAGGCAAGGTCTAAAAGTATACTCAAACTGGTCAAGT
TACCCGCAACTCTACATAAAAAGCGAACTCATTGGCGGATCAGATATCGTTTTAGAAATGCAAAAGAGCGGAGAACTTGAAAAAGTCTTGGTTGAAAATGGTATCATGTCTCTCGAAGAT
CGTTTGAAGAAATTAGTTAATTCCAAACCCGTGATGCTCTTTATGAAGGGCACCCCAGATGCCCCAAAATGCGGTTTTAGCTCAAAGGTCGTAAATGCCCTTAAGGAGGAAGGTATAAAG
TTTGGATCTTTTGACATTTTGAGCGACGAGGAAGTTCGACAAGGGTTGAAAACATTCTCAAACTGGCCTACTTTCCCTCAAGTTTATTATAAAGGTGAGTTGATTGGAGGATGTGATATC
ATTTTGGAGCTTAAAAGCAATGGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
TTCAATCATCTTTCTGGTGATTTCCCCCATGCCCATTTTGTTAGGGTTGAAGCTGAAGAACAACCAGAAATTTCTGAGGCATATTCAGTTTCCGCTGTGCCTTATTTCGTTTTTCTTAAG
AATGGCAAGACAGTTGATACATTGGAAGGCGCACATCCATCTGAGCTGGCGAACAAAGTTTCAAAAATCGTGGGGTCAATCCATGCTGGCGAACCGGCTGCACCCGCGAGCTTAGGGATG
GCAGCGGGACCCTCGGTTCTCGAAGCAATTCAAGATCTCGCTAAAATCGACAACTCACCACGTGGGAAAACGCAACCGCCAGCGCCAGCTGGCATTAGCGATTCACTGAAGACCCGTCTC
GAAAAACTCACCCGTTCTCACCCCATAATGCTATTCATGAAAGGAAACCCTGAAGCACCCCAATGCGGATTCAGTAAAAAAGCCGTTGAAATATTGAAAACCGAAAATGTTAAATTTGGT
ACTTTTGATATCCTTAGTGACAACGAGGTTCGTGAAGGTTTAAAAAAGTTTTCGAACTGGCCCACTTATCCTCAACTCTATTGTAACGGAGAGCTTCTTGGAGGGTCTGATATTTTAATT
GCAATGCATGAGGGGGGTGAATTGAAACAAGCTTTTGCCGATCATGGGGTCGGAAATGATGATGTCAGCAAGTCAACTGTGGCGGGACCCGATGGTCAACAGGCTGGAGTTACCAATTCC
ACTGGGTTGAGTTTGGCTTTGACTTCTCGCCTTGAAAGTCTCATTAAGTCGGCTCCTGTTATGCTTTTTATGAAGGGAACTCCAGATGAACCTAGATGTGGCTTCAGCCGAAAGGTAGTC
GATATTCTCAGAGAAGAAAAGGTTGATTTCAAGACTTTCGATATACTCTCAGATGATGAAGTAAGGCAAGGTCTAAAAGTATACTCAAACTGGTCAAGTTACCCGCAACTCTACATAAAA
AGCGAACTCATTGGCGGATCAGATATCGTTTTAGAAATGCAAAAGAGCGGAGAACTTGAAAAAGTCTTGGTTGAAAATGGTATCATGTCTCTCGAAGATCGTTTGAAGAAATTAGTTAAT
TCCAAACCCGTGATGCTCTTTATGAAGGGCACCCCAGATGCCCCAAAATGCGGTTTTAGCTCAAAGGTCGTAAATGCCCTTAAGGAGGAAGGTATAAAGTTTGGATCTTTTGACATTTTG
AGCGACGAGGAAGTTCGACAAGGGTTGAAAACATTCTCAAACTGGCCTACTTTCCCTCAAGTTTATTATAAAGGTGAGTTGATTGGAGGATGTGATATCATTTTGGAGCTTAAAAGCAAT
GGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
CAAAAAGCAG CGTATTTCCT CGGTAGGTTT TCGTTTCTTT GCTCCCCAAG GCATCCATCG TCTTCTGCAA TTCAGATCAG TATCCCCTTT AGAAAGAAAG CAAAAATGGG TGTGAAAGAT
GTGAAGTCAA AGCAAGAACT TGATAATCTT GTGAAAGATG GGTCAGCTGT TATGGTTCAC TTCTGGGCTT CGTGGTGTGA AGCTTCTAAG CACATGGATC AAGTTTTCAA TCATCTTTCT
GGTGATTTCC CCCATGCCCA TTTTGTTAGG GTTGAAGCTG AAGAACAACC AGAAATTTCT GAGGCATATT CAGTTTCCGC TGTGCCTTAT TTCGTTTTTC TTAAGAATGG CAAGACAGTT
GATACATTGG AAGGCGCACA TCCATCTGAG CTGGCGAACA AAGTTTCAAA AATCGTGGGG TCAATCCATG CTGGCGAACC GGCTGCACCC GCGAGCTTAG GGATGGCAGC GGGACCCTCG
GTTCTCGAAG CAATTCAAGA TCTCGCTAAA ATCGACAACT CACCACGTGG GAAAACGCAA CCGCCAGCGC CAGCTGGCAT TAGCGATTCA CTGAAGACCC GTCTCGAAAA ACTCACCCGT
TCTCACCCCA TAATGCTATT CATGAAAGGA AACCCTGAAG CACCCCAATG CGGATTCAGT AAAAAAGCCG TTGAAATATT GAAAACCGAA AATGTTAAAT TTGGTACTTT TGATATCCTT
AGTGACAACG AGGTTCGTGA AGGTTTAAAA AAGTTTTCGA ACTGGCCCAC TTATCCTCAA CTCTATTGTA ACGGAGAGCT TCTTGGAGGG TCTGATATTT TAATTGCAAT GCATGAGGGG
GGTGAATTGA AACAAGCTTT TGCCGATCAT GGGGTCGGAA ATGATGATGT CAGCAAGTCA ACTGTGGCGG GACCCGATGG TCAACAGGCT GGAGTTACCA ATTCCACTGG GTTGAGTTTG
GCTTTGACTT CTCGCCTTGA AAGTCTCATT AAGTCGGCTC CTGTTATGCT TTTTATGAAG GGAACTCCAG ATGAACCTAG ATGTGGCTTC AGCCGAAAGG TAGTCGATAT TCTCAGAGAA
GAAAAGGTTG ATTTCAAGAC TTTCGATATA CTCTCAGATG ATGAAGTAAG GCAAGGTCTA AAAGTATACT CAAACTGGTC AAGTTACCCG CAACTCTACA TAAAAAGCGA ACTCATTGGC
GGATCAGATA TCGTTTTAGA AATGCAAAAG AGCGGAGAAC TTGAAAAAGT CTTGGTTGAA AATGGTATCA TGTCTCTCGA AGATCGTTTG AAGAAATTAG TTAATTCCAA ACCCGTGATG
CTCTTTATGA AGGGCACCCC AGATGCCCCA AAATGCGGTT TTAGCTCAAA GGTCGTAAAT GCCCTTAAGG AGGAAGGTAT AAAGTTTGGA TCTTTTGACA TTTTGAGCGA CGAGGAAGTT
CGACAAGGGT TGAAAACATT CTCAAACTGG CCTACTTTCC CTCAAGTTTA TTATAAAGGT GAGTTGATTG GAGGATGTGA TATCATTTTG GAGCTTAAAA GCAATGGTGA GCTTGCATCT
ACCTTATCAG AGTAAAAGGT AAGACTTTTA TCAGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTT
|
Retrieve as FASTA
|
|
