Entry information : HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Entry ID 14433
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Name (synonym) HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Class CGFS Grx    [Orthogroup: GrxS002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxS02
start..stop
S start..stop
HaGrxS05 303 5e-108 1..156 1..158
ThasGrxS14-2 223 5e-76 16..151 25..160
ThasGrxS14-1 220 6e-75 16..151 25..160
AtGrxS14 208 3e-70 3..151 16..162
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 186943170..186943214 45 N° 2 186943349..186943483 135 N° 3 186943565..186943664 100 N° 4 186944616..186944682 67
N° 5 186945333..186945411 79 N° 6 186945492..186945536 45  
join(186943170..186943214,186943349..186943483,186943565..186943664,186944616..1 86944682,186945333..186945411,186945492..186945536)


exon

Literature and cross-references HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr10 (186943170..186945536)
Protein sequence: HaGrxS02 (HanXRQChr10g0304481)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   156
PWM (Da):   %s   17689.84  
PI (pH):   %s   6.52
Sequence 197
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLFNGFRSMEYTTASASRSFLRHGMRFSTSVPNDPDTHDDFKPTNKLENSEITLKDIVEQDVKDNLVMIYMKGDPEQPRCGFSSLAVRVLSEYRVPIHSRNILEDPELKNAVKAFSMWPTFPQIFINGEFIGGSDIILNMHQNGELKEKLKARSSE

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Remarks
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCTATTTAACGGATTCAGGTCAATGGAGTATACAACTGCATCGGTATGATGTAATTAATCATTTTACTATAAAGATTTCCCCATTAAATCTGACTTTGAATAAATGTTTCATTGTATCT
AGATCGTTTTTGTTAGTTTTTAGATTTTGTTACATGAATTTTGTGCTTCAATTTGCAGGCATCTAGATCGTTCTTGCGACATGGTATGCGATTTTCGACTAGTGTGCCGAATGATCCTGA
TACACATGATGATTTCAAGCCCACAAATAAGCTTGAGAATTCTGAAATCACTCTGAAGGACATTGTTGAGCAG
GTTGTTGGCTGTTGATGAGTGTATATTGTTTCATGAACGTTTTTGTA
CTCGTGTTTTAAAATTTTAATTTGTTATGTGTAGGATGTTAAAGACAACCTTGTGATGATTTACATGAAAGGCGATCCAGAACAACCGCGCTGTGGGTTCAGTTCGTTAGCAGTCAGAGT
ATTGAGTGAATATA
GTAAGCTCTCAAATCATAAAATTGTTCTTTTCCTGAGATATTTTGACACACAGTTAATATTTTAACCTGAATGGTATTTGTTGAATGTATATGCACTTGCAACTAG
GGGTGTTTAGAAACCGTTAAACCGACCGAACCACCTAAATCCTAGCAAGTCGCTGGTTTGAGATCCAAATGGTTCAGTTTTTGCGGTCTAATCTTATATTTTTTATATAAATAGTTTAGT
TTTTTTTAATTTAAATGAGGCAAATGTAACATATATGTGTATTTTTATTACTATTTTGTAAAAAATAACTTACAAATTAATTTGATATAGGAGTTAATAATGAAAAGAAAATTCACCAAA
TAATAACCAAGCTCCATAATTCAATTTAAGTCAAATTGGAAGAAAAAAATAACTAAATGGTAAACGAGATTCACATATGTTTTATTTGCTACACTTAGTTTTTTTTTTTAAGTAAACATT
TATAAAGTTATTATATAAGACTGGAACATGCTATGAAAGTTGGATAACTTTAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTTGAGTGACTTTAGTGA
GACACTTGGGAACCAACCCACCCAACCCAGCTGGTTTGGTTTGTTGTTTCCCGAAACTATAGTTAGTGGTTCGGCCAAATATTTTCGTCAAAAGTCAAAACCAGCCAAATCACCCCTAGT
GGCTTATATAAACCGTTACATCCACAACGTATTTAAATAGTTGGTCATACGTTTGTTGTTTAGTTATCATGAAAAGGTAACAATCAATGCACCTTCTAGACGCGATGTATGCGAAGATGG
TATAAGCTATAAGCAGGCTAATTGCCAAAATTCGTTACATTTTAGCATATGATCTAATTCTACATTTCTACTATATTTTCAAATTGGATCAAGCGTATTTAATCATTTTGTGCGTTGCTG
CACAGGAGTCCCTATACATTCCAGAAACATATTGGAAGATCCAGAGCTTAAGAATGCCGTAAAAGCTTTCAGGTATCATTGTATCAAGCACCTCCTATATGCAAATTAGTTTGCTTAACT
GAACATAAAGCAGTTTCACTTTATCTTCTCCACCCTTTTAGTTATAAAATATATAAGAGTAAATTACGTTTTTGGCCCCTGTGGTTATATCTCTTTTACTATATTAGCCCAAAATAAGAA
TTTTTAACATATCTGCCCCCATGGTCTCTATAACTAACCATTTTGGCCCCTAAGTCTAACCATTTTGGCCCCCATGGTCTCTATAACTAACCATTTTGGCCCTCATGATCTCTAGACTTA
GGGGCTAAAATGGTTAGTTATAGAGACCATGGGGGCAGATATGTTAAAAATTCTTATTTTGGGCTAATATAGTAAAAGTGATATAACCATAGGGGCTAAAAACGTAATTTACTCAATATA
TAATTTATATGTTGTATGATTGCAAATTCTATATCACTACATATATAATAATAATCTATATTATTGCAAATTCTATATCTTGCCCACTTTGGGCGACTTTAGACGTGTTTTGACCCGTTT
CATTTTTTAGTTAAATTATTAGTTTAGCTTGTCTGACCTGTTTTACAGATAGTTACAACCCAAGTTGACATTTGTATATATAGGTAAACAGTATATAATTAGTTTTTACCCTTTATGTGC
AGCATGTGGCCGACATTTCCTCAAATATTCATCAACGGAGAATTCATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAGGTGTTTTTTGGTTTGTTTTTGGCATAGTGTTATGTTTTA
ATGTTCAAAATATGGATTTTAATCTTTTTGGCGTTGTGCAGAATGGTGAACTAAAGGAGAAGCTAAAGGCGAGGTCATCAGAGTAG

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCTATTTAACGGATTCAGGTCAATGGAGTATACAACTGCATCGGCATCTAGATCGTTCTTGCGACATGGTATGCGATTTTCGACTAGTGTGCCGAATGATCCTGATACACATGATGATT
TCAAGCCCACAAATAAGCTTGAGAATTCTGAAATCACTCTGAAGGACATTGTTGAGCAG
GATGTTAAAGACAACCTTGTGATGATTTACATGAAAGGCGATCCAGAACAACCGCGCTGTG
GGTTCAGTTCGTTAGCAGTCAGAGTATTGAGTGAATATA
GAGTCCCTATACATTCCAGAAACATATTGGAAGATCCAGAGCTTAAGAATGCCGTAAAAGCTTTCAGCATGTGGCCGACAT
TTCCTCAAATATTCATCAACGGAGAATTCATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAG
AATGGTGAACTAAAGGAGAAGCTAAAGGCGAGGTCATCAGAGTAG

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cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ACAGAAAATA AGCGCCGGAA AGGGTAAATC ATCAAAGCAG ACATTTCCCT TTGCTTCGTG GAGGCCAGGA ACATCACTAA CCTTAAACCC TTCTTACATC GTAACACGAT GGCTAGGGTG  TTATTATCAA ACATGCTATT TAACGGATTC AGGTCAATGG AGTATACAAC TGCATCGGCA TCTAGATCGT TCTTGCGACA TGGTATGCGA TTTTCGACTA GTGTGCCGAA TGATCCTGAT  ACACATGATG ATTTCAAGCC CACAAATAAG CTTGAGAATT CTGAAATCAC TCTGAAGGAC ATTGTTGAGC AGGATGTTAA AGACAACCTT GTGATGATTT ACATGAAAGG CGATCCAGAA  CAACCGCGCT GTGGGTTCAG TTCGTTAGCA GTCAGAGTAT TGAGTGAATA TAGAGTCCCT ATACATTCCA GAAACATATT GGAAGATCCA GAGCTTAAGA ATGCCGTAAA AGCTTTCAGC  ATGTGGCCGA CATTTCCTCA AATATTCATC AACGGAGAAT TCATTGGAGG ATCAGACATT ATTCTCAATA TGCATCAGAA TGGTGAACTA AAGGAGAAGC TAAAGGCGAG GTCATCAGAG  TAGACAAGTC TCGTTTGCAT CTCGTGTCGC CAAATTATAT TAGATTTGGG ACGCTTAAGT TTCGAGCCAG TATACGTTAT AAACAGTTTT TAAAGCATTC TTTTTACCGT GAGTGTTGTT  CAAATAATGT TGATGTTACA ATCTACTTTT ACTGAACAAG TTGTGGTCGT TTGCTATATA CTTCTTTACA AACTGCATGA CAAAAAAGTA GACGTAAAAA ATGGCCTTGA TTTTCGATCT 
GAAGTTACCA GATTTGATAT TTCAGGTTGC CCCTACAGGG AAACAAAGAC TCGTTTCAAA TCTTTAC 

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