Entry information : HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Entry ID 14482
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Name (synonym) HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Class Thioredoxin Type CxxS    [Orthogroup: CxxS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaCxxS01
start..stop
S start..stop
ThasCxxS01 153 1.46e-49 5..121 3..121
AtCxxS01 144 6.03e-46 12..121 3..112
PpaTrxH09 99 1.94e-28 16..115 9..108
ThasTrxH09-1 98 1.27e-27 16..120 28..132
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14482' 'complement(join(9736614..9736766,9738485..9738607,9740044..9740148))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 9740044..9740148 103 N° 2 9738485..9738607 121 N° 3 9736614..9736766 151  
complement(join(9736614..9736766,9738485..9738607,9740044..9740148))


exon

Literature and cross-references HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr05 (9740148..9736614)
Protein sequence: HaCxxS01 (HanXRQChr05g0130751)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   126
PWM (Da):   %s   14011.19  
PI (pH):   %s   4.56
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDAADQEPPKPRIVKINSTETWDSHLQQSKSDGTPMVAHFTASWCIPSVAMNPFIEELALVFNDIIFLTVDVDDFKEIANKYEVKAMPTFLLIKEGVVVGRLVGANPDEIKKRIETLLQS
NSQFVV*

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCTGCTGATCAAGAACCCCCAAAACCAAGAATTGTCAAGATTAATTCAACTGAAACATGGGATTCCCATCTTCAACAATCAAAATCTGATGGAACCCCTGTAAGTATTTGCATC
CTCATGATGTTACAAAAACCCTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGGTTACTGCATGAAAAAGTGTTATTCTTTAATCTTTTTTAGGTTTTT
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GTTGCAAAAAACTGTTTTTTTCAGGGTTTTTTTAGCTTGCTTTTATAAACTGTGTAAAGGGTATATTTGGGAATTCTGATTCCAAATGTCTGGAATCAGAATTTGATTGTGTCAGTATAG
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TTAATATAGCTTAACGGAGTTAAGTTTTTTTCCGAATTACAAACCGATGTTTTAGGGCTTTTGATTAGAACGAGGATACGAGTCGATTGATGTAAAACATACCTCGAAATTGTGCTCGAA
ATGGCTTGATTTTTGTTAATTGGAAGTTTAAACCTCCGAATTGAAGCACCGTTTTCGTGGGTTGGGCCTGTATTTCGAGGTAAGTTTTACATCAATCGACTCGTATCCTCGTTCTGATCA
AAAGCCTTAAAACATCGGTTTGAAATTCGGAAAAAAACTTAACTCCGTTAAGCTATTTTAACGGCGGGCTATTTTACAAAAAAAACTGACCAGTTCGGATTATTATCGGCCAATACCCGA
CTTTGGAAGCTAGGTGGAATTATTTATTTCCAATTTGCCTTTTTTGTTTTATTTGATTTTGATATATTCTTCACTTAATGTACTTGTGTTTATGTTTATAGATATGGTGGCACATTTTAC
AGCATCATGGTGCATCCCTTCTGTAGCCATGAACCCTTTTATAGAAGAGTTGGCCTTAGTTTTCAATGACATAATCTTTCTGACTGTTGATGTTGATGATTTTAAG
GTAATTATCGCCGC
TTAAATCCGTTATTTTTTCGATCTAGCTCTTGATCAATATTGTATACTTTGATGGTAATCGATAAACGATTTGATAGTCACACCCACATTGAACTTCTGTTGTACTTGTTGGGCTCGAAT
CGGCTGATTTACACCACTGAGTTAATTGCCATTTTAGTCCTTGTGGTTTGAGCCATTTTGCCAGTTTAGTCCAAATGTTTCATTTTTAACATCTGGATCCAAAAAGGTTTCATCGTTGCC
ATTTTGGTCCAACTGACTTAACTCCATCCATATCTGTTAAGTCTGCCAAGGGCATTTTTGTCATTTCATTTAAAAGAAAATAAAGAAAAAAGGATTAATAAAAAGAAAATGAAATGACAA
AAATGCCCTTGGCAGAATTAACAGATATGGATGGAGTTAAGTCAGTTGGACCAAAATGGTAACGATGAAACCTTTTTGGATCCAGATGTTAAAAATGAAATCTTTGGACTAAACTGGCAA
AATGGCCCAAACCACAGGGACTAAAATGGCAATTAACTCTACACCACTGGTTAATAGTTGTACCAAAGTGGCTCTTCTTTTTGTTCAAAAGTTCACTTCTTTATGGGAAACTGATAGGGA
ATACAAATCAATTCTTGATATGTTTATATTCTGTAATTTATTTTGATTCTCAAAACTCTAGAAAATATCAAGCAAATATATCTTTCTTAGTGAAAATTCCTCATTTTTTTTATATGAAAT
TGATGGGAATATATATGAGAGATTTTCTTGATGTGGTGGAGTGTTTTTGGAATATATATTCAATTGTGCATCAGTGTCTGTTACATGTATTGGACTCTAAAGCTTACACTTTTATGATAC
CAACTTTTTAATTCTTGACATTCTATGCATCAAGTGACCACTTCATCATGTAATGTAACTGATAGTTCATGCTGACGTGGCAGCCATAGAAGTTGCCACCTCATCCGTGACATCACCACA
CCACCCGTTCATAAGTCATAGAAGTAGGGCTGCAAACGAATCGAACGTTCAGTGAACAGTTCGTGAATCGTTCGGCGGGAAGTATGTTTGTGTTCGTTCGTTTAATTAAGGAGCGAACAC
GAAGAAATTATTTTTGTTCGTTTAGTTAAATGAACAAACACAACAGAGGCCGCGTTTGTTCATTTCTGTTTGCGAACGTTTGGTAACTTGTTCGTTTTTGTTCGATAGTTCATTATTTAA
TATTTTATTTAAAACTTCAAAACTACTAATAAATAAAATATTAAAAAAATTAGTGTATTGTACATTCCATACTGTTTAACATATGCTCGATTGTACATGTTCATAAACGTTTGTGTTCAT
GAATGTATGTTTGTGTTCATGAGCGTTTGTTTGTGTTCGTTACCTAAAGTTAACAAACGAATACGAACACATTCATTTCTTTAATGAACAAACATGAACAGATAATCTCGTTCGGTAAGT
GTTCATGAACACGTTTATTTCCTTAAGAAACGAACATGAACAAGGCATTGTCCATGTTTGTTTGGTTCATTTGCAGCCTTACATAGAAGGTAAATACATACAAGAGCAAGAACCGGAGCT
TTTGTATGTTAAAATGTCAGATTTAAAGTACAATAGATACAAAAACGATTGGTCGATAACAATTGGCGCAACATTAGATATGTTTCGACACGTTTAACTCTTTTTCTTTTATCTTAAAAA
TTTGAAATTTATAAATATTTGCAGGAGAAATAGCAAACAAATATGAGGTGAAGGCAATGCCAACATTCTTGTTGATAAAAGAAGGTGTTGTAGTTGGGAGACTAGTAGGAGCCAATCCAG
ATGAGATCAAGAAAAGGATTGAGACCCTTCTTCAATCCAACAGTCAGTTTGTGGTCTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGCTGCTGATCAAGAACCCCCAAAACCAAGAATTGTCAAGATTAATTCAACTGAAACATGGGATTCCCATCTTCAACAATCAAAATCTGATGGAACCCCTATGGTGGCACATTTT
ACAGCATCATGGTGCATCCCTTCTGTAGCCATGAACCCTTTTATAGAAGAGTTGGCCTTAGTTTTCAATGACATAATCTTTCTGACTGTTGATGTTGATGATTTTAAG
GAAATAGCAAAC
AAATATGAGGTGAAGGCAATGCCAACATTCTTGTTGATAAAAGAAGGTGTTGTAGTTGGGAGACTAGTAGGAGCCAATCCAGATGAGATCAAGAAAAGGATTGAGACCCTTCTTCAATCC
AACAGTCAGTTTGTGGTCTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TAAAATAAGA AGTCTTGAAG TATTAGTTAA CCATAAATAT GTTGTTTTAA TCATTAAATT ATTAATATTA AATATCTGTG GGCTGTATAT CAAACAAAAG CATCCCATAG GATCAGTGCA  AACGGCAATA CAAATCCCCT GTGACACCTT CAAAGAATGA TTTGAATCTG AATATGGACC CAATTTATGT TTATCCAAAA CCATCTTTAG TCCTATTATA AACCTATTTT TTAGTAAAAT  TATTAGTAAA TCTTTTTAAA AAACAGGGGA GATATGGATG CTGCTGATCA AGAACCCCCA AAACCAAGAA TTGTCAAGAT TAATTCAACT GAAACATGGG ATTCCCATCT TCAACAATCA  AAATCTGATG GAACCCCTAT GGTGGCACAT TTTACAGCAT CATGGTGCAT CCCTTCTGTA GCCATGAACC CTTTTATAGA AGAGTTGGCC TTAGTTTTCA ATGACATAAT CTTTCTGACT  GTTGATGTTG ATGATTTTAA GGAAATAGCA AACAAATATG AGGTGAAGGC AATGCCAACA TTCTTGTTGA TAAAAGAAGG TGTTGTAGTT GGGAGACTAG TAGGAGCCAA TCCAGATGAG  ATCAAGAAAA GGATTGAGAC CCTTCTTCAA TCCAACAGTC AGTTTGTGGT CTAGTGCTAC TCTAACAAGT ACCATGAGTT TGTTTTCTTG TACATTCCTA ATCAATGTGT GCTGCACAAC  ATGGTTTGTG GACCCTTTGT GATTCTTGTT TATACAAAAC TTTTTGTGAG ATTGGTTTGT GTTCACCCAA TTTGATATTT TGTGAGTGGT ACATAAAGCA TATTGTCAAC TCAAATCTTT 
CCATAATATA TGCATATAGT TTTTAACTTC TCATTCAATT CAAAAATTAC AAGCTAAAAA AATCCTTACC TCTTTTTAAT GATTTT 

Retrieve as FASTA