Entry information : HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Entry ID 14492
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Name (synonym) HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: Trx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaTrx04
start..stop
S start..stop
ThasTrx04 239 3e-82 7..175 20..184
AtTrx04 236 5e-81 36..175 45..183
PpaTrx05 157 5e-49 3..175 10..190
CbraTrx07 140 1e-43 64..175 16..127
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 116361653..116361859 207 N° 2 116362272..116362394 123 N° 3 116363331..116363411 81 N° 4 116364316..116364432 117
join(116361653..116361859,116362272..116362394,116363331..116363411,116364316..1 16364432)


exon

Literature and cross-references HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr11 (116361653..116364432)
Protein sequence: HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   175
PWM (Da):   %s   19559.07  
PI (pH):   %s   5.29
Sequence 216
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLLAPTPFSFCAPPKLLSSATLSHPLKQRDAVTIFSTTTKSPVSSIQSSPRKLLATPPPGKFLRQDYLVKKYSAKEIQELIKGERNVPLVIDFYATWCGPCILMAQELEMLAVEYESNAMIVKVDTDDEYEFARDMQVRGLPTLYFISPDPNKDAIRTEGLIPLQMMRDIIDNSM

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCTACTCGCACCCACACCCTTTTCATTCTGTGCTCCACCAAAGCTTCTATCTTCTGCAACTCTTTCTCATCCCCTAAAACAAAGAGATGCTGTTACCATATTCTCCACCACAACAAAAT
CCCCTGTTTCTTCCATTCAATCTTCACCAAGAAAGCTGCTTGCTACACCCCCTCCAGGAAAATTTCTCCGACAAGATTATCTTGTT
GTATGTTTTACTCTATACCCACTTCACACTTGTG
TTAATTTTGCATAAAGTTATTGTCTTTTTTATGGGTTTTGTGTATAATTTGAGATATGGTAAACAATATGGCAAAACTCCCACCCTAATTGCTTTAATTCATATGGGTATTGTGGCAATT
TTGACTTTTGAAGTCAATGTTCTGACTTTCTTTAGGAATTTTGATAATTGGTAGTTATAATTTCTGGGTGTTTTGTTTGTTTCTTGAAAATCCCCTTTTGTAGAGTAAAGAGAGGAGAAA
ATGATTTGGAAATTGATGCAAATTTGAAAGTTTTAACTATGTTGGTAGTTTATAGGTTTATATAGTCTTTGTGTATTTGGATTTCTTTGAGGTTATGTTTTTGGTTTAATGGTTTTATGT
TTTGGATTTGTGTTGCAGAAAAAGTATTCTGCTAAAGAGATTCAGGAACTGATAAAAGGAGAAAGAAATGTACCGTTGGTTATAGATTTTTATGCAACATGGTGTGGGCCTTGTATATTG
ATGGCTCAAGAGCTTGAAATG
GTATGGCTATGATTTGCTTATGTATAAGAAGCTATGAAAGCTACACGTATGATATATGTGATGTTCGGTTCGTTTAGGTTGTGTTGACATGAATGTGTC
ATAACGTCATTAACATAATCTTTTTTCTTTGTAACACATTATTTTGAAAACTGTACAAAGTATGGTAGATAGGATCAAACGCTCGATGCAGAAGTTTATTTGTTTAAAGAGTTAAATGCC
ATTTTAGTCCCTGTGGTTTGGTCCATATTGCCAGTTTAGTCCAAAGGTTTCATTTTTCGCCTGCGGATCCAAAAAGGTTTCACTGTTGCCATTTTAGTCCACTGGGTTAACTTCATCCAT
TATTTCTGTTAACGAGCAGGGCAATTCGGTCATTTTATATGGCTGAATTGCCTTTCTAGTAAACAAAATTACATATAAAATGACCGAATTGCCATGCTCGTTAACAAAAATAATGGATGA
AGTTAACCCAGTGGACTAAGATGGCAACAGTGAAACCTTTTTGGATCCGTAGGCGAAAAATGAAACCTTTGGACTAAACTGGCAAAATGGACCAAACCACAGGGACTAAAATGGCATTTA
ACTCTTTTTTAAATATTCGAATTATGTGAAATAATTATTGTGTATTAAATACTTAAGACGATGATGATTATGCCTTTTGACAGGATTGGGATGATTATGGTGTTCTGTTATTAAGTGTTT
TGACTCCATCTATTTTGCTAGTAAATAGGTCCAAAAACCAGTATCACCTAATTTGCTACATGAGTTGTTCATTGTTTAAATACGCGCGTATGATGTATACACAGAATAATATTAATATAG
CAAATTAGCAGATATGTATTACAATTAGTGAATTGGGATAAAAGGCTTATTTTTGTTGAACCGTATACAATAATGGTTAACACTGATAGGTTCCTTGAATTTAATTCCTTTCTACAGCTT
GCAGTCGAGTACGAAAGTAATGCTATGATAGTGAAGGTGGACACAGATGATGAGTATGAATTCGCACGTGATATGCAG
GCAACTCCCTCATCTCTTCTTGTTTAGTCGTCTACATTATGT
TTCAATCACCTTTTGCTTATTGGTCTTATAAGTATGTCTACTTAACCGTATCTAGTGAAGGCATACTTGTAAGTTACTTTTTATTTTTCATCAGGAGAAATTGATTAAAAAACGATATAA
TAGCAAACTCTTTTTTAGAGTAAATTACAAAAAGCGTCCTTTATGTATGTCACTTATTGCAAACTGTGTCCTTTGTCTTCAATAATTACAGAAAACGTACTCGACGTTTGCAGACCCTTG
CAAGTTATGTTCTTTAGCCCTAACTCAGTTAATTTTTTGTGGTTAAATCTGACCAAATGGACCCCACATGAGGGTATTTTGGTCATTTTACTCTCATGTGAGGTCCATCTGTTCAGATTT
AACCACAAAAATACCCTCATGTGGGGTCCATTTGGTTAGATTTAACCACAAAAATTAACTGAGTTAGGGCTAAAGGACATAACTTGCAAGGGTTTGCAAACATCGAGTACGTTTTCTGTA
GTTATTGAAGACAAAGGACACAATTTGCTGACATACATAAAGGACGATTTTTGTAATTTACTCCTCTTTTTTATTAGTTTAAAGTAATGGGTTTTAATTTGCACTTTGAAACTAGTTTAT
ATGAGCAGTTTTTAGTGTTTGAATAAACAGATTCTGTTTCCCAGTCGTCTTATACTCTTATTATTTACGGGCGATATAATGTTCATATATGCCACCCTTCCTTTCTTGTAATCTAATGTG
ATCGACTTCTCATCCATCTCTTATTTGATTGTGATTAATTGACACTAATAATCACTTTCAGAGAGCATTCCTTTGTTCAAGAACAAACCATAAATATTTTTCATTTGTAGTATAATAAAT
ATGATTGTTACATGACTGACAGGTAAGAGGTCTACCGACATTGTACTTTATTAGTCCCGATCCAAACAAAGACGCAATTAGAACCGAAGGCCTCATTCCGCTTCAAATGATGCGCGATAT
TATTGACAACTCCATGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCTACTCGCACCCACACCCTTTTCATTCTGTGCTCCACCAAAGCTTCTATCTTCTGCAACTCTTTCTCATCCCCTAAAACAAAGAGATGCTGTTACCATATTCTCCACCACAACAAAAT
CCCCTGTTTCTTCCATTCAATCTTCACCAAGAAAGCTGCTTGCTACACCCCCTCCAGGAAAATTTCTCCGACAAGATTATCTTGTT
AAAAAGTATTCTGCTAAAGAGATTCAGGAACTGA
TAAAAGGAGAAAGAAATGTACCGTTGGTTATAGATTTTTATGCAACATGGTGTGGGCCTTGTATATTGATGGCTCAAGAGCTTGAAATG
CTTGCAGTCGAGTACGAAAGTAATGCTATGA
TAGTGAAGGTGGACACAGATGATGAGTATGAATTCGCACGTGATATGCAG
GTAAGAGGTCTACCGACATTGTACTTTATTAGTCCCGATCCAAACAAAGACGCAATTAGAACCGAAGGCC
TCATTCCGCTTCAAATGATGCGCGATATTATTGACAACTCCATGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCAAGTTTG CAAAACCCTC TCTCAAAACC TCTCCTCCCC TCTATCCATC TAAAACATTG AAAAACCCTC TTCAAACCTT CCTCTTTATC CATATCTTCA GGATCATCAA CCAAAATGCT  ACTCGCACCC ACACCCTTTT CATTCTGTGC TCCACCAAAG CTTCTATCTT CTGCAACTCT TTCTCATCCC CTAAAACAAA GAGATGCTGT TACCATATTC TCCACCACAA CAAAATCCCC  TGTTTCTTCC ATTCAATCTT CACCAAGAAA GCTGCTTGCT ACACCCCCTC CAGGAAAATT TCTCCGACAA GATTATCTTG TTAAAAAGTA TTCTGCTAAA GAGATTCAGG AACTGATAAA  AGGAGAAAGA AATGTACCGT TGGTTATAGA TTTTTATGCA ACATGGTGTG GGCCTTGTAT ATTGATGGCT CAAGAGCTTG AAATGCTTGC AGTCGAGTAC GAAAGTAATG CTATGATAGT  GAAGGTGGAC ACAGATGATG AGTATGAATT CGCACGTGAT ATGCAGGTAA GAGGTCTACC GACATTGTAC TTTATTAGTC CCGATCCAAA CAAAGACGCA ATTAGAACCG AAGGCCTCAT  TCCGCTTCAA ATGATGCGCG ATATTATTGA CAACTCCATG TGAAAGAAAG AAACCGAAGA TGAGTGATTA TTTTTTCCTG CATGTGTTGA AAAGTAGAGT AGATATATTA AGTTCATTTG  TTGTTACTTT TAGCACATTA AAGTTGTCAA GTGTATTGAT AAGATTAATA GCACTTTTTG TTAGGTTAAA GACTCTGTAT CAATCTTTGT GAGCGGATTA TTTGTATCGA GAGCAATGTA 
CTTTGGTTTA GAAACCCATC GGTCTACTTA AAAACATCTA GACTATTATG TCCGAAACAT AATATTATGA GCTCTCTAAC GACTTTCGTA TCTTTAT 

Retrieve as FASTA