The peroxidases and oxidases database
Entry information : HaTrx08 (HanXRQChr13g0396471)
Entry ID 14496
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaTrx08 (HanXRQChr13g0396471)
Name (synonym) HaTrx08 (HanXRQChr13g0396471)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: Trx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaTrx08
start..stop		 S start..stop
ThasTrx03-1 837 0 70..543 43..508
AtTrx03 817 0 64..543 57..529
ThasTrx03-2 787 0 12..543 7..521
PpaTrx04 758 0 88..543 119..566
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 69478682..69478934 253 N° 2 69476941..69477148 208 N° 3 69474995..69475100 106 N° 4 69473585..69473854 270
N° 5 69471799..69472101 303 N° 6 69470968..69471075 108 N° 7 69470783..69470869 87 N° 8 69469765..69469869 105
N° 9 69469541..69469671 131 N° 10 69469315..69469375 61  
complement(join(69469315..69469375,69469541..69469671,69469765..69469869,6947078 3..69470869,69470968..69471075,69471799..69472101,69473585..69473854,69474995..6 9475100,69476941..69477148,69478682..69478934))


exon

Literature and cross-references HaTrx08 (HanXRQChr13g0396471)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (69478934..69469315)
Protein sequence: HaTrx08 (HanXRQChr13g0396471)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   543
PWM (Da):   %s   59175.89  
PI (pH):   %s   6.45
Sequence 782
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MATTTAQIANGVGIRNSGRPTSAAPSTPALTSNSILLSFTRPRASTLRFHSVVNFAGRFSAFRRSPPPCSLRASASSAEQPTSSGQDVENLVIIGSGPAGYTAAIYAARANLKPVVFEGYQVGGVPGGQLMTTTEVENFPGFPEGITGPDLMDRMRRQAERWGAELHQEDVEFIDANNRPFTVQSTDRVKCHSIIVATGATAKRLNLPREDEFWSRGISACAICDGASPLFKGQVLAVVGGGDTATEEAIYLTKYARHVHLLVRRDQMRASKAMQDRLVDSGECFRVLDNPNITVHYNTETVDVVSNTKGQMSGIKLKKLDTGEESVLEAKGLFYGIGHTPNSQLLQGQIDLDSAGYILVKDGSAETSLEGVFAAGDVQDHEWRQAITAAGSGCVAALSVERYLVGNNLLIEFHQPHTEEVKKELTPRDVQEGFDISLTKHRGQYALRKLYHESPRLICVLYTSPTCGPCRTLKPILGKVIDEFDQNVHFVEIDIEEDPEVAEAANVMGTPCVQFFKNKEMIRTVSGVKMKKEYREFIEANK

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTACAACTACTGCTCAGATTGCCAATGGCGTCGGCATCCGTAACTCCGGCCGCCCTACCTCCGCCGCTCCCTCCACTCCTGCTCTCACTTCAAACAGCATCTTACTCAGTTTCACT
CGTCCACGCGCCTCCACGCTTCGTTTTCACTCCGTAGTTAACTTCGCCGGTCGCTTCTCTGCCTTCCGTCGTTCTCCGCCGCCGTGTTCCTTACGCGCCTCCGCTTCATCCGCCGAACAG
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AATGTTGTATTTGATGCGAACATTGTGTGAGCCGTATGGCTATCCAAAATTGAAATATAGCACCATGAATTAGGTTATGGATAGAATATAAACCAATTAATGCTGTATTTGTAGTTTATC
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AGCAGCACTAATGCGTGTCACGTTTATAATCTTGAATTTTAGTTTTTTTAAGTTTAAAGAGATCTATTGATGATGTACTATCTGACTTAATCTTTTGTTTTAGCAGGGCAAGATGTTGAA
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TTTCTCATGAATGGGTAGGGTCTGTAAACGAACCGAATGTTCATGAACTTGTTCGGTGGGAAGTTCGTTTATTTAATAAACGAACGGACATGAACACAATTTTCTGCTCATTTAATTAAA
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GAGCTTTCTAACTACATAAATTATATATATCTTAAAAACCATGGTCGGTGGACCATGGTTTGAAATTGTCTTTTTTTGACCCTCAAATTTACACACTTTACACATCCAACCCCAATCTTT
TGGTAAGTAACACATTGATCCTTAACTTTTGTTATTTAACAACTTTGACCCCTTATATATATATCTTAAAAACCATGGTCGGTGGACCATGGTTTGAAATTGTCTTTTTTGACCCTCAAA
TTTACACACTTTACACATCCAACCCCAATTTTTTGGTAAGTAACACATTGATCCTTAACTTTTGTTATTTAACAACTTTGACCCCTGATTTATTTCTACTTAATAATTTCACACCTCATC
TTCCCCGACACTTCAATTCTTTTGTTTAAATTACTTAACTTTACACTACAACGTGCGAGACGTTTTACTTTTTTTAATCTATGCCTAACCACATTAATGTCACTATTGTAATGTTTGTAA
CAAAGTAAAATACCTGTCACGTCACGCGTGGGCACCACACGTTAATGTCATCATCGTATCGCATGTAACGAAGTCACAACCGTGACGTTGCCGCCGCAACGCGCGGCATGGGTAAAAATC
TAGTAATAAATATAACTAATTGGTAATTGGGCTTTCTAGTAATAAAAATGGGGTTTCCAATGGAATTTATCGTAATTAATCACTAATTTATATAAAAAATTACTTTATGTTTGGTCAATT
ATGTTCATTTGTGTTTGTTCAATTATGTTCATTTGTGTTGTTTATTGTTAAATTATGTTCGTTTAAGTTTGTTTGTTTACGTTCGTGAACTTTTCGTTTAAATTTTAAATGAACGAACAT
AAACGAACACTAACATGCCCATTTTCTTAATAAACGAACATGAACAAAAAAATGTACTCGATTATATGTACATGTTCGTTCGATTCATTTATAGGCCTATGAATGGGTCAATATGAGTTG
TCGGTTGTGTTTACCTTTAACTAGACAAACAGGTAAAATCAAGAAAGTTAGGGTAAATGGGAACAAGTTGAACGGTTGAAAGTCATCCAAAGTATGTCTTTTGGAAGCATAAAACTTCTT
AAATTGTTTTTATCCAGTGAATATAGATGTTCTGTGCATATAATACCAACATACCTTATCATTTGTTCCGTTTTAGTGATTGTACTCTTGTTTGTATATTCAAGTCGTCAAAAGATGATT
TTACGTCCTGTTTGGGTCTTTCTGTATGCAAAAAATGGTTGTAAAAAATGATTATGTTTATATAAAGATGTTTATGTTTAGATAGATTTATGTATAGTGTTAACTTTATATAATGATATA
TTATTTAACGCAGCACACAACATTTTAAAGTGACTCATGATTCAAATGTACAAAAAAGTGCAATGACTAAATTGGGACAAATGTAAAGGTCCGTTGATATGTTGTGCAAAAACCCTACTG
ATATAATTTTTGTAATCATATGGTTGGCACTTTAATTATTTATATAAAAATGTTTGTTTTTTTGACAAAACAATAGGGGTTATCGAGCTTAATTTTTGATGTTTGTATTTATAGGATGCG
CCGTCAAGCTGAGCGTTGGGGAGCAGAACTTCATCAGGAGGATGTAGAATTTATTGATGCGAATAACCGTCCTTTTACTGTGCAAAGCACTGACCGCAAGGTGATGCTTAATCTTATTAG
CATGTGAATCTTCCAATTTATTAGCTAGTGTAATGTAATAAATAGAAATGAACAAAAAAAATGGGATAATATATACATAGGCCACCTAAGTATTTAAACAACTTAAGAGGCCACTCAAAT
ATCAATGGGTTTTGTTTATTTTACCAGTTTCGACAAAAAATATGCAGACAATTTGGAAAAATGACAAATGCTTCTAAGTTAGAAGTTTTTGTCACATCTAGCGTTGTAAGAATGACAAAT
GCCCCTAAATCTACTATAAACATATAATGGGTAGGTCCATGCCATTTTACAACTCTAGATGTAACAAAAAACTTTAAATGTAGGGGCAATTTTGTCACTTCACAACTATGCAGTTAATGC
GGTAAAATATAGGATATCGGTCAAGGACCGATATTTGAGATATAGGATATCACGGTGGGATATTGGTAATTTTAATATCATGCAAAATTTATATATATAGCAATTTAACATGAACAATTC
AGTATACTCTCCTACCATTAACAATTAACCTTTTGCAACTTGCAAAACACCAACAATTGTAGCAAGTAGGTACTGATTAAGACTTAAAACACTAACACTAATAATTAACAATCAAGACTT
AAAACACTAATAGCAGCAATAAGAAGAAAGACGAATGGTAGAACTAAGAAGAAGGTACTGATATTGGGAAAATTGGTGATATGACCGATATTCCGATCGATATTTGACACCGATATTGTA
CATGGGGACCGATAACCGATATCACCGATATTACCGATATTTTACATTGGGATCAATACTTTCTACCAGTATTTTACCAGTTTTTACCTTCAGATACCAACCGTACCGAGCATTTTCGCT
ACCGGTACCCAATTTTGGCGATTTTCGGGATTGGTACTTTTGGTACTGGTATGGTTCGGAACCGGTACGGTACTGAGCTCATCATATTCACATTTGTAAAGATTTAATATCTTCATTTCT
TTGATCCAAGGGCCCTGATGAGTGCTTTCATTTTCAACTTTTTTTGTGGTTCTCAAATGAACTTTCATCTATCTGATGAAACATCATATATAGTCCTAATGAAGAACTTCAAAATTTTTA
TTTTCTTAATTGTTTTTATTTATTTTCTATACATTTTCAGGTGAAATGCCATAGTATTATAGTAGCTACAGGAGCAACTGCCAAAAGATTGAATTTACCTCGCGAAGATGAGTTTTGGAG
TAGGGGAATCAGTGCATGCGCAATTTGTGATGGAGCTTCACCGCTTTTCAAGGGTCAAGTTCTTGCAGTTGTTGGTGGAGGTGATACAGCTACTGAGGAAGCAATATATTTGACTAAATA
CGCTCGACATGTTCATTTACTTGTACGCAGGGACCAAATGAGGGCATCGAAAGCTATGCAAGATAGGTTAGTTATAATGCCGTTTCATCTACATTTAATTATATTATTATAATATTTGAA
TTTGTTTGGTTCGTAGGTGTTGTGTAGAGATGTGCAGTTTGAATGGCAATTGCTTAGTATGGGTTGAAAAAGGGCGGGGTCACCTTTTTGTCCATTGTTGAAAAGAATTTGTTACGAAGT
AATTAACTACGTAAAAAGTATAATTACAGTAATGATCTAAATCTTTAAATTAAGTGTTTTTCTAACTCTAGCCGTTAGGATGGTTAAGAGCCTAATTTCCCATAACCACCAATAGGATGT
GTAGGTAATGCGTTAAAAATCGGATATCGGTCAAGGACCTATATTTGAGATTTAGGTTATCGCGGTGGGATATCGGTAATTTTATTATCATGCATAGCAATTTAACACTAACAACTCAGT
ATACTCTCAGTTTCTCCTACCCACTAACAATTGTAGCAAGTAGGAACTCATTAAGTCTTAAAACACTAACAATTAAGACTTAAAACACTAGTAGCAGCAATAAGAAAGATGAATGGTAGA
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TATATCACCGATGTTAACTGCATAGCCACTGGGTAATTGGAATCTAACTTTTATTGATGATCCTTTCCGAATCATCTGGTAGTTAAAAAACCAACTAGTGGTTGTTATCACTATGTTTTA
TTTTCTAAAACGGGTGGAAGTTAGACTTTTAACCTTAGCCCTAAACCCTTGACTAGAATGATCTAGGTAGTTGTGAAGAAGCCCCTATTAGCTTAATTGTTTGCTTTGACTTATTGGACT
TGTTTTTAAGATGTAACACAACCCAAATTAACCCGTTTATAACTAAATGGGTCGAAAGAGTGACTCAAGTGTTATATGCTTAATTCTTCTTACTATTTGCATTGTTTTTAACTTTTATTA
ATATGCATTTATATTACAGTAGAATGATTCGTATAAGTTTGTCCATAAATAGGATGCTTGTTAACCAGAATAGAAAGCAGAGACTAACTTTGGTCACCTTTTGATGAAATTACCCCTACT
GAAAAGGCCTAACATTGCTTGTTAATATTTTCAAATAGTTGTTTTTATCAGTTAACAACCGTAGTCCACTTTTTCCTTTCAGTAAATGAAAAACTTTGAGGTTTAACAAGCAAGTCTAAG
ATTCGTAGGTTTTAGGGTTTATTTCTTAGGTTTTAGGGATTAAGGTTTAGAGTTTAGGGTTTAATTTTTTTGGGGTTTAGGGTTTAGTAATGATTAGATAGAGTTTTATGGAGTTTTCTC
ACAAAAAGGAGTTTTCTCATGATCCGTCCCCTATTACAATTTAGGTCAACCAAAATTTAGAGAATTTAATTAATGCATTTTAGTTTTGAACTCCCTGAATGTTTGTTTAACAGGTTGATT
CTGGCGAATGTTTCAGAGTTCTTGACAATCCAAATATCACAGTGCACTACAACACAGAGACGGTGGATGTTGTCAGCAACACAAAAGGACAAATGTCTGGCATAAAACTCAAGAAACTTG
ATACCGGTGAGGAATCAGTGCTGGAAGCTAAGGGCTTGTTCTATGGAATCGGTCATACCCCAAACAGCCAGTTGTTACAAGGTCAAATTGACCTTGATAGCGCCGGTTATATATTGGTCA
AAGATGGAAGTGCAGAGACTTCCTTAGAAGGTGTGTTTGCTGCTGGAGATGTTCAGGTAATATTATATACCAAAATTCTTATTATTCTGTTTACGTTTGATACCTTGTTTTTGTCAATAT
ACGACTTTTTTTTTCATCGGGACCTTTATATCCTTATCGTTTTATGAATATTTTTTTTTTAAATATATATTTAAATCAAAAGCATTTGATAACTTATTTTTTTATTTTCCAAAACAGAAT
TTAATTTAAAAAGTTTAATAACATGTAAATCATAGTTATCAAGTATAAAGAATGTGGCGTAGAAATTTTGTCTGCTTGGGTGACCTCTATAATACTAGATAGTAGATACAATATCTCTTT
TTTATAACAACCGCTCCGCAACGGGTTCGAAATGTAGATAAAAATAAGCAATTCGTGAGAGTTAAAGTTGTTTGATGTTTTAGTTAAGGGGCTAAACATGTCATTACTAAAGTTGTGGGA
CTACACATGTCTTAATTAAAGCTGAGGGGCTAAAGTTGTTTGATGTAGTTAAGTAGCTAAACATGTCATTACTAAAGTTGAGGGACTAAAGTTTTATAGTTAAAGGGCTGAACATGTCAT
TACCAAAGTTGAGGGGCTAAACCTGTCATTATTAAAGTTGAGGGGCTAAAGTTGATTAATGCCAAAGTTGGTTGATGTGAGTATGTGACATAATAGCATATTTATATAGTATATATAATA
TAAACCTTGTATTAATTTGTAACCATCTTCATATGTTCAATTTAAAATTTATTGGTAAGGATCATGAATGGAGGCAAGCAATAACTGCAGCTGGATCAGGATGCGTTGCTGCGCTCTCAG
TGGAAAGATATCTTGTCGGCAATAATCTTCTTATTGAATTTCACCAGGTATTTACCAAAACTAGTTTATTATCATTTACATGAAAATGAACGTATAAAATGGTCAATAACTTACATTTAA
CCTTTATATCTTGTGATTTTTACAGCCACATACTGAAGAAGTTAAGAAAGAGCTCACGCCAAGAGACGTACAGGAAGGATTTGACATTTCGCTTACTAAGCACAGGGGCCAGGTATTTAA
AATGGGCGTCTTCATATATATCCACATAAAAGTTTGAAATTTATTATATGTTATGAGTTTTTATACATTTACCCTTTTAAACACTCAAAATAACATATTTACCCCTTGCATGGTAAATAA
TGTAAAATAATGCTATGTGTTGAGATGTTTCACAATAATAAAGTTGTTTTCCTGTTTGTTTATTCAGTAACTAGGTTAGAAACCTGTCTATTACACGGGTGAATCAAAGAAATATTAAAT
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TTAAATTTGACGAGTTTTGTCCTTTATGTTTAAAAATTAAGCACGTTTTGTCCTTTATGCTTGATTTTTAAGGACAAAACGTGCTTGATTTTTTAAACATAAAGGACAAAACGTGTTTGA
TTTTTAAACATAAAGGGTAAAACGTGCTTGATTTTTAAACATAAAGGACAAAACTCGTCAAATTTAAACATAAAGGACAAAACTTGCAAAATGACCTAAAGATAAGGGACAAAACTTGCA
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CATCACCAACCTGCGGTCCATGTAGGACATTAAAGCCAATTTTGGGAAAGGTAATGTTAATCCTTTTCGTATTTATATATTTTTTCTTATGTTAACTTTTGATCTGATGTGGACTAATAT
TATTAAACTTTAATTAATGGCAGGTTATAGATGAGTTTGATCAGAATGTTCATTTTGTTGAGATCGATATTGAAGAAGATCCCGAGGTTGCTGAAGCCGCAAATGTTATGGGTACACCAT
GTGTACAGTTCTTTAAGAACAAAGAAATGATCAGGTTTGTAGTTTCCTTTTTTTTCTTTTAAGGGGCAATTACATATGAAGTTATGTGTTATTTCACTATTATCTGAAACAACTTATTCA
CAAGTGAATGGGTCGAAATGCGTCTAGTGTTGTTAACTTAATCTGTGATACGTTATTACATATATGAATGAATATGCAGGACTGTATCAGGGGTGAAAATGAAGAAAGAGTACAGAGAAT
TTATTGAAGCAAATAAGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
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CGTCCACGCGCCTCCACGCTTCGTTTTCACTCCGTAGTTAACTTCGCCGGTCGCTTCTCTGCCTTCCGTCGTTCTCCGCCGCCGTGTTCCTTACGCGCCTCCGCTTCATCCGCCGAACAG
CCTACATCTTCAGGGCAAGATGTTGAAAATTTGGTAATCATAGGATCGGGTCCCGCGGGATACACAGCAGCCATTTATGCAGCGCGTGCGAATTTGAAGCCTGTAGTGTTTGAGGGGTAT
CAAGTTGGCGGTGTTCCTGGTGGACAATTGATGACCACCACTGAAGTGGAGAACTTTCCAGGTTTCCCGGAGGGAATTACTGGTCCAGACTTGATGGATAGGATGCGCCGTCAAGCTGAG
CGTTGGGGAGCAGAACTTCATCAGGAGGATGTAGAATTTATTGATGCGAATAACCGTCCTTTTACTGTGCAAAGCACTGACCGCAAGGTGAAATGCCATAGTATTATAGTAGCTACAGGA
GCAACTGCCAAAAGATTGAATTTACCTCGCGAAGATGAGTTTTGGAGTAGGGGAATCAGTGCATGCGCAATTTGTGATGGAGCTTCACCGCTTTTCAAGGGTCAAGTTCTTGCAGTTGTT
GGTGGAGGTGATACAGCTACTGAGGAAGCAATATATTTGACTAAATACGCTCGACATGTTCATTTACTTGTACGCAGGGACCAAATGAGGGCATCGAAAGCTATGCAAGATAGGTTAGTT
GATTCTGGCGAATGTTTCAGAGTTCTTGACAATCCAAATATCACAGTGCACTACAACACAGAGACGGTGGATGTTGTCAGCAACACAAAAGGACAAATGTCTGGCATAAAACTCAAGAAA
CTTGATACCGGTGAGGAATCAGTGCTGGAAGCTAAGGGCTTGTTCTATGGAATCGGTCATACCCCAAACAGCCAGTTGTTACAAGGTCAAATTGACCTTGATAGCGCCGGTTATATATTG
GTCAAAGATGGAAGTGCAGAGACTTCCTTAGAAGGTGTGTTTGCTGCTGGAGATGTTCAGGATCATGAATGGAGGCAAGCAATAACTGCAGCTGGATCAGGATGCGTTGCTGCGCTCTCA
GTGGAAAGATATCTTGTCGGCAATAATCTTCTTATTGAATTTCACCAGCCACATACTGAAGAAGTTAAGAAAGAGCTCACGCCAAGAGACGTACAGGAAGGATTTGACATTTCGCTTACT
AAGCACAGGGGCCAGTATGCATTGCGAAAATTGTATCACGAAAGTCCTAGACTCATTTGTGTACTATATACATCACCAACCTGCGGTCCATGTAGGACATTAAAGCCAATTTTGGGAAAG
GTTATAGATGAGTTTGATCAGAATGTTCATTTTGTTGAGATCGATATTGAAGAAGATCCCGAGGTTGCTGAAGCCGCAAATGTTATGGGTACACCATGTGTACAGTTCTTTAAGAACAAA
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cDNA►
Send to BLAST
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AGGAATGAGA GGTGGAATGG AGTGGACCAT TGTGAGGGAA TGAAGAAAAG AGTGTTTGGT TG 

Retrieve as FASTA