Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
144 (157) |
PWM (Da): |
15899.78 (16983.1) |
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PI (pH): |
4.59 (4.57) |
Peptide Signal: |
cut: 33 range:33-189 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGVCLSKYHDDDDESNHQAEFAGGNVTLVTTKDAWDQKLSEANRE HKIVIANFSASWCGPCRMIAPYFIELSLNHTTLMFLSVDVDELPEFSTQWDIKATPTFIFLRDGDQVDRLVGANKPELLKKISGIVNSQPPPPPACSDM* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGAGTATGCTTGTCTAAGGTGAGTTTTCAATTACTTACTAGTAAAACGATTCCATTTTATTATCATTTCAATTACTGAACCTGTCTCATTTTGTGGAGATAAAGAATATTTTTATCA TGATAAGAATACATAGTCGTGGGAAAACATGGATAGTCGGAATTGAACGACTCGGGCATTATAGAGTGAGATTGCATTGCATGATCACCATCATGAATGATATTTATTGAAATTAGATTA AGTGTTTTCTTTAAGGCTTACAGCCTTCCTATCCCGACAGATGGTGTTTTTAATCCTTAATAATATGTGCATGCTCCAACTGTCCCATCATGTGGGTGTTAGGCGTAACATAAATGTATC TTTAGAATTTCGAGACATCGATTGTCTCTCCCAATGGGTAAACAAAAACTAAATCAGTTTGGTGCTGTTTGTTTTTTCTGTGGGAAAAGGTCTGCAGTCTGCGGACCACATCTGCAGGCA TCTGCAGGAGAAAAGGTGGACCAAATGTCTGCAGTCTGCAAGGAAGAGAGGGTTTGTTTTTTTTTATTTTATAAAAACATCTTCTCTTCTCAAACACACACAAACACACTTTCACACACA CACACACATCCCTCGATCTCTCTCCTCTCTGCCTTCATCACCACCACCAAGCACCACCGTCACCACCGCCACCACCGTCACCACCGCCACCACCGTCACCACAAACCTCCCCCGTCGCAA CCACCCACCCCCGTCACACTCTCCTCCCTCGATCTCTCTCTCTGCCTTCATCACCACCGTCACCACCGTCACCACCGTTCTCCGATGATGATGATAATGGTCTCCTGCTGCTCCCCTCTC TCTCTCTCTCTCTAGTCTCTACGGTATCTCTCTCTCATCGATTTGGGGGTTTGTTCGATTTAGGGTTTTGGTTCGATTCAGGGTCGGAGCAGGGGTTCGATTTGGGGGTTTTGATGATGA TGATTTGGGGGTTTTGATGATGATGATTTGGGGTTCGAATTGATGATTTGGGGGTTCGATTTGGGGTCGGAGCAAGGGTTCGATTTGGGGGTTTTGATGATGATGATAACAGATGATGAT GATGATGATGGTGTCGGAGCAGGGGTGTCGGAGGTGGAGTTGGTGGCGGAGTGGAGGTGGTGGCGGAGCAGTGGTGTCGGAGGTGGAGGTGGTGCCAAGAAGAGGTAAACGTTTGCGAGG AGAAGACTTGGGTCCATGTCTGCTCCAAGAAGAGGTCTCGCAGACCTTTTTTAATGAAAGGTCTGCGAGAAAACAAACAAGCTGCAGACATCAAACGTCTGCGCGCGTCTGCGTCGCGCA GACATAAGTGGCCAGAAGTACTTCTGGCCAAAAAACAAACAACACCTTTATCATTAAGCATAAAAATAAATTACAGTTGTAAAGCCCTTTGCATATAGACTGACGAAAATCCATATCCTA ATATAACTAAAACATTGCTCCTAAATAATAAAATACATGTATCTTATATTAATCATCGTAAACGATTGGGGATTATTGTAGCTGTCCCAAAAATTAGAGTTACGATTCCGGATGCTGTTT AAGCTGATGCACCACTAGTGTCATTGATCCTTGAACCAAGACTCCAACCGGTGGAGGTTTGGGTCTATTTTTTGATGGAAGATTTTGCTTATTTGGTAGCCATTTGTGACGATGATCCAT TAAGCCCTAGGTGGTTCAAACTTGGTTGTTTTTATAGCTGGAATTATGGCAAAATTTACATATTTATTTTGATTACGAGGGTTAGGGTTGATTTCGGGCTCGATAGATAAAGGGTTTTAG GCTGTAGGCGAGTTAGTGGGTGGTGTATATGAATCATTTAGTCGGGTCAATACTTTAGTCAATTTATAATCTGGGCCATTCTTGACGATGGCAGTTGCTGTCGGTGTTTGACGAGGAAGT TCTGCCATGCTGATGATGGTGGCTACCGACATGCCTGACGAGTGACGATGGTGTTTGTTGGCAATGTTTTCGGCTTATATGTCTAATTACAAATTGAGTCTATCTAAGGTTTATTTTTAA GAAAAAAGTAAATAAATATTTGAAATTAACTTTTATATTCAAATATACATATATAATAAGTGAGTTTGTTCATCTGTTTAGATTGTTTGGGTTGTGGGTCAGATCAAAATCCAGTAACTA ATGGGTCAGATCAGGCTTCCTTTAGTCGGGTCATGGGTCAGGGTCAGATCATATAATCAACTACTAAGCTTAACTACTTCCTAGACCAAGAACACACCTGACTATGTATCTTCTAAATCA CACACATCCTAGTATCCTATTTCAAGTACAGTGAGAGAACAACTACTACCTCTACAACAATTGGATGTCTGATATCTAGTTCTGTCGGTAACCAATCATATCGGTTACATTTTTCTTGAA TGGAGAAGCTGTAAACCTCTGTTCGATTTGGTTACACATAAACCAATAATATGTATTTTATTGATGAATACATGTCCAGGAATTGATTATACAAAGTAATTAACTAAAGCAAATACTTTC TGACCTAATTTAGTTATCCAAATCCTAAAACATTGTACATATAAGTAGAAAATATATAAAACTAGATACAGTTTTAGATAACAAGAATCAAACTTTTAGTTCTCCGTTTTTTTTTTATTT ATTCAAGAGCTTCCTTTATATCATAAAGAGAGGCTAAAAAAGAAAGGATACTATAATTTTTTTTTTCTTTTTTTGTAAATAGACTGAAATTGAGGACCGATATTATCGGTGATATATCGG TCCCTTAGTAAAATATCAGCGTCAAATATCGGTACCGATATTATCGGCGATATTGACCGATATAACCCATATATCGCCTATATTTGACCGATATATCACCGATATTTGACCGATATAACA 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CCCAAAGTTACAAAATTATATCCTGGATATTAAAGTCACACCATCTAACCCAAACAAGGCTTACGTATTTAGATCTACTAGAAATCCAATAAAAAGCGTTTTCCTTGATAGTGTCCGCCA TTTTATTAAACTAATTGTTAGATGCAAAGGTACTTTGAGTACAGCAATGCAATATCTTTTCTAAATTGTCCATAATTAATATGTTAGGCTATAGGGTGTGAGGGGCATGGTTGGGTCATC AATCGTCACGTAGGATCATTAATGGATTGCTACACCACCCCCTTGTCTCATCCACCATGATTCCCATGGATTAAACCATGACAACCATGAGCCTCCTTTCCTTATTCAATATCTCCTTTC CTTTTCACAAAAATAAATTGAAATAAGATAATAGTGGTTTGAGTCATGACCACACCCTTAGGGTAGTGGTTTTGGATGATCGATTAGAAGCAGGTGACATGATGCTAATGTGGAGGGTCA TGGTGATCATGAGGGTCATGACCACACCCTATAGCCTTACTTTAATAGGGTAACTCTAGAGAAATGTAGCCATGTTTGGCAAGTGTTCTAAATTAAGTCATTAAAGCTTTTTTTTTTGTC TCTTTAAAGTCACTAAACTTTAATTTAATGTTCTAATCCCATGTAATTATCAGGTTACCAGGTAACAATGATGATTTGTCAGGTTTCATTATTTTTTTAATTATTAAAATGATTAGGAAA AAAATATCGCTTCATTCTCAAATACTGAAAATAAATGGCAAGATTTAGTGGATTGTTTTTTTAATCATAAAATTTATTTACTTATCCTCTTAACAAGCTTCTTCTTCATCCTACTTACAC AGTGGAAGAACACCATGGCTAAACTAAGTTCTTCTCTCCCTTTTTGTTTTATAGATTTTTTTACTTCATATTAATTTCCCACCTTATTCATCCTACGTTACATTTTACAAAAATGAAAGA ACTGGTTTTGTTGTCAAGCCAGTGCCACCGTCAACCACCGTATTCCGCCACCACCGGGGACGGTTCTTCCACCACAAAGTTTAAAAAACTCTCTCTCCTCGACTGGACTTCTACCGATGA CGCCCGATTCCGGCGAGGATCTGTTTTAAAGCCGACGATGGTGGCTGCGGTACGTAGCGGAGGAGATGAGTATTTCTGCACTTACGTTCAGAACTGGATTTCGGCTAGAAAGGTTGATTA CAAGCTTATCAGCGCCGGGGTTGTCGGGCGGCGTGCGGTTGTTTGCAGGTGTCGGGCGAAAGGCGTCGAGTCTCATGTCTTCAATATCAAAGAACAAGTCTCATGTGTTTCAAAAAAACA CCCACAGAGTACACGTACATCTAAAAAATATATTTTATCTTTTTATTATCATTATTATTATTAAACAAAAATAAATGATAACCTGATAACCTGGTAATTTACACACTGTTAGAACATAAA TTTAAAGTTTAATTACTTTAGAGAAACAAAAAAAGTTTGAATGATTTAATCAAAACACTTGACAAACTTGATTACATTTTTGTGGCATTTTCCCTACTTTAATTACATATATTCTAATTG TTAAAATTTTGTTAAACTTTATTTCTTTATAGGAGTTTGTTAAATTTTGATTTATAGAAAGATATTTTTTTTTCCGGGTGTTAATGCAGGAGAATTCAGCACACAATGGGATATAAAAGC GACTCCAACGTTCATATTCCTTAGAGACGGAGACCAGGTTGATAGGCTTGTGGGAGCCAACAAACCGGAGCTCCTAAAAAAGATAAGCGGTATTGTCAATTCCCAGCCTCCTCCTCCTCC TGCTTGTTCTGACATGTAA |
Retrieve as FASTA
|
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CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGAGTATGCTTGTCTAAGTATCATGACGACGATGATGAGTCGAACCATCAGGCTGAATTTGCTGGAGGTAATGTGACACTTGTCACTACTAAGGATGCTTGGGATCAAAAGCTATCA GAAGCAAATAGGGAACACAAAATAGTAATTGCCAACTTCAGTGCATCCTGGTGCGGGCCATGTAGAATGATCGCACCATACTTCATCGAGCTTTCTCTGAATCACACTACTCTTATGTTT CTATCAGTGGACGTTGATGAATTACCAGAATTCAGCACACAATGGGATATAAAAGCGACTCCAACGTTCATATTCCTTAGAGACGGAGACCAGGTTGATAGGCTTGTGGGAGCCAACAAA CCGGAGCTCCTAAAAAAGATAAGCGGTATTGTCAATTCCCAGCCTCCTCCTCCTCCTGCTTGTTCTGACATGTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTAAAGGACG AAAGGTGCAA TGGATAAATA CGTTTCCCTA TCTAAGAAAG AAAATCTTAA AAAAAAAAAA AGAATTGGTG GCGATATCTT GTGCTCCTCT GCAACTACAG GTTTATGCTT
ATGAATGATA GATTGAGGTG TTAGCTGAAT AAGGGAAGTT CAGCTCTTCA ACCGTCTCGG ACAACCTAGC TTTTCAGCGG AGTAGAGTGG AAGTTTTTCA TACATCAGAT CAGGATGGGA
GTATGCTTGT CTAAGTATCA TGACGACGAT GATGAGTCGA ACCATCAGGC TGAATTTGCT GGAGGTAATG TGACACTTGT CACTACTAAG GATGCTTGGG ATCAAAAGCT ATCAGAAGCA
AATAGGGAAC ACAAAATAGT AATTGCCAAC TTCAGTGCAT CCTGGTGCGG GCCATGTAGA ATGATCGCAC CATACTTCAT CGAGCTTTCT CTGAATCACA CTACTCTTAT GTTTCTATCA
GTGGACGTTG ATGAATTACC AGAATTCAGC ACACAATGGG ATATAAAAGC GACTCCAACG TTCATATTCC TTAGAGACGG AGACCAGGTT GATAGGCTTG TGGGAGCCAA CAAACCGGAG
CTCCTAAAAA AGATAAGCGG TATTGTCAAT TCCCAGCCTC CTCCTCCTCC TGCTTGTTCT GACATGTAAT GCAACCGTAT ATAACTTTCC CTATGGTGTT TATGTATTTT CGTAACAATC
GTTATGAATA TGAATGTTGA CATTGTATTG TTAGGTTGGT ATTTCTAAAA GAAACTTATA GATCACATAC ATGCTTAGGC CCCTCTATGG CCTAGAAAGC TAACATAGAC TCTAAAATGT
TTTAACCACA CATGAGAATT TGTTTTTTTC TCCTTCTAGA AATATAAAAG TTTTATAAAA AATTATGCAT ACGATAAATA ATAGTATATG TATGTGTATA TATAAC
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Retrieve as FASTA
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